Elektroforesis kapiler adalah metode pemisahan berdasarkan perbedaan mobilitas molekul dalam medan listrik yang dilakukan pada pipa kapiler. Metode ini digunakan untuk memisahkan berbagai biomolekul seperti protein, asam nukleat, dan karbohidrat dengan resolusi tinggi. Elektroforesis kapiler memanfaatkan tegangan listrik tinggi untuk memindahkan molekul bermuatan ke katoda.