Venezia 31 marzo 2009 Venice Sessions 2 presso il Future Centre di Telecom Italia Ilaria Capua presenta: Riflessioni sulla scienza Open-Source: il singolo e il sistema

1. Riflessioni sulla
scienza Open-Source:
il singolo e il sistema
Ilaria Capua
OIE and FAO Reference Laboratory for Newcastle Disease
and Avian Influenza,
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie
Legnaro –Padova, Italy

4. Highly Pathogenic Avian Influenza,
Italy 1999-2000

5. Spanish influenza 1918-1919
20-40 million dead

6. Panzoozia H5N1- rilevanza
mondiale
• H5N1 è endemica in diversi
paesi (aree) del mondo
• Il virus è in grado di infettare
circa 50 specie di volatili e
oltre 10 specie di mammiferi
• Per ogni essere umano
infettato ci sono circa 1
milione di animali infetti
• H5N1 sta riducendo la fonte
di proteine animali in alcuni
paesi in via di sviluppo

7. Inizio 2006 – H5N1 raggiunge l’Africa

10. Attività di rilevanza internazionale
IZSVe – crisi H5N1
• Formazione presso il Centro di Referenza
– 30 stagisti ricevuti nel periodo 2005-2007
– 3 corsi di formazione (FAO, EPIZONE)
• Attività di formazione in loco (TCP/FAO)
– per Africa, Balcani e Asia Centrale, Medio Oriente
(Circa 60 paesi beneficiari, 22 settimane lavorative all’estero nel 2006)
• Sviluppo di un sistema di vaccinazione
• Supporto diagnostico ai paesi colpiti
(@ 10.000 campioni nel 2006)
• Missioni di intervento in laboratori veterinari
• 2005: Kazakhstan, Bulgaria, Ucraina e Crimea
• 2006: Mauritania, Vietnam
• 2007: Russia, Kuwait, Libano, Qatar, Nigeria, Ucraina
• Partecipazione a 7 progetti EU su formazione, controllo, diagnosi e patogenesi

11. H5N1 in Africa
• Riduzione fonte di proteine nobili in
popolazioni affette da malnutrizione
• Si sarebbe diffusa in maniera incontrollata
(10 paesi in un anno)
• Implicazioni di salute pubblica aggravate da
infezione da HIV-AIDS, e situazioni di
povertà estrema

12. Prima incursione H5N1 in Africa
• L’Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle
Venezie è stato il primo laboratorio al mondo a
isolare il virus H5N1 africano
• Lo studio delle caratteristiche genetiche del virus
potevano permettere una maggiore comprensione
dell’epidemiologia e patogenicità del virus
• Abbiamo declinato l’offerta di depositare la
sequenza genetica in un database ad accesso
limitato (accesso a solo 15 laboratori) e abbiamo
depositato l’intera sequenza in GenBank, un
database pubblico

15. MONDAY, MARCH 13, 2006
Scientist Rebels Against WHO Over Bird Flu
Scientists around the world, racing to discover how avian influenza is spreading and whether it is evolving toward a pandemic strain,
face a dilemma: Should they share their interim findings widely, show them only to a select set of peers, or keep them to themselves
until they can publish papers, often critical to their careers?
Now, a lone Italian researcher has cast a harsh spotlight on the WHO's system, suggesting that it places academic pride over public
health - and snubbing it by posting prized bird-flu data in plain view.
Ilaria Capua, a 39-year-old Italian veterinarian working on avian influenza in a government lab, last month
received a sample of the virus in the mail from Nigerian health authorities. The virus had just attacked
birds in Nigeria, the first confirmed case of the disease in Africa. The sample was something of a prize, a
chance to study a specimen and explore how it spread from its stronghold in Asia.
Within days of isolating the virus, Dr. Capua says, she got an offer from a senior scientist at the WHO in
Geneva, whom she declined to name, to enter her finding in the closed system. She could submit the
virus's genetic information, or sequence, to the database. In exchange, she would be given the password to
the WHO's massive stash of data. A spokesman for the WHO confirmed that the offer was made.
Instead, Dr. Capua posted the gene sequence in a public database accessible on the Internet. She also sent
a letter on Feb. 16 to around 50 of her colleagues urging them to do the same with their bird-flu samples.
quot;If I had agreedquot; to the WHO's request, she said in an interview, quot;it would have been another secret
sequence.quot;

16. EDITORIAL
Secret Avian Flu Archive
Published: March 15, 2006
At a time when health authorities are racing to head off a possible avian flu
pandemic, it is distressing to learn that the World Health Organization is
operating a secret database that holds the virus's genetic information. A lone
Italian scientist has challenged the system by refusing to send her own data to
the password-protected archive. Instead, she released the information publicly
and urged her colleagues to do the same. She is surely right. The limited-access
archive should be opened or bypassed immediately to encourage research on
this looming health menace.
The campaign by Ilaria Capua, an Italian veterinarian who works on avian
influenza, was spotlighted in recent articles in the journal Science and The Wall
Street Journal. The hidden data could be of immense value in determining how
the virus is evolving and in developing effective vaccines or drugs. The
possibility of breakthroughs can increase only if many more scientists can
analyze the data.

17. GISAID- Global Initiative
on Sharing Avian
Influenza Data
www.gisaid.org
Nature Correspondence 24 Aug, 2006
firmatari: 70 virologi medici e veterinari e
6 vincitori di premio Nobel
Database “open access”
gratuito che conterrà le
sequenze geniche dei
virus influenzali umani
ed animali e protegge la
proprietà intellettuale

18. Perché è così importante?
Perché può servire da modello per la
gestione di nuove emergenze sanitarie che
minacciano l’umanità. Si potrà disporre di
uno strumento rodato per reagire
immediatamente ed in maniera sinergica
alle infezioni con potenziale pandemico

20. Pandemia influenzale
•Nel 20° secolo ci sono state 3 pandemie influenzali
sostenute da virus H1, H2, H3
•La storia ci insegna che ogni 20-40 anni emerge un
nuovo virus pandemico influenzale
•Non è possibile prevederne l’aggressività, la virulenza o
il sottotipo (H?)
•E’ verosimile che il progenitore sarà un virus aviario
•E’ ipotizzabile che si diffonderà in tutto il mondo

21. “One Health”
L’unione fa la forza,
soprattutto in sanità
pubblica

22. 2007, Premio Scientific
American 50 assegnato
ai 50 ricercatori migliori
dell’anno
Bird Flu Research for All
Until recently, laboratories doing bird flu research often kept their findings private, with access to
many avian influenza gene sequences confined to just 15 facilities globally, potentially hindering them
from doing research that could provide new insight into the virus. Instead of entering her avian
influenza findings into this database, Ilaria Capua of Viale University in Padua, Italy, disclosed the
results of her studies in the publicly accessible GenBank and boldly rallied her colleagues to follow.
Her efforts helped to pave the way for the Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data, a
consortium through which findings can be freely shared while giving credit to researchers involved.
—Charles Q. Choi

23. 2008, Una delle 5 “Revolutionary
Minds” della rivista americana
SEED