materi ppi tentang mikrobiologi di lingkungan rumah sakit atau fasyankes

1. MIKROBIOLOGI DASAR
& PENGAMBILAN SPESIMEN
dr. Cahyarini, SpMK.
KURSUS PPI DASAR

2. Mikroorganisme
jamur
virus
bakteri

3. Habitat
M.O

4. Daerah Steril DalamTubuh
Darah, KGB
Cairan tubuh:
LCS
Corpus Vitreum
Cairan Sendi
Cairan retroperineum
Jaringan:
Alveolus
Ureter
Ovarium/ uterus

5. Morfologi Sel Bakteri
Bentuk:
Batang
Kokus
Spiral
Filamen
Populasi sel bakteri
Individual
Diplo-
Staphylo-
Strepto-
Filamen

6. Kurva Pertumbuhan Bakteri
• Tergantung nutrisi di
lingkungan
• E.coli: waktu pembelahan
sel 20-30 menit di dalam
medium yang kaya nutrisi
• M.tuberculosis : 16-24 jam

7. Prinsip Mikroorganisme

8. Media Transport

10. SALURAN NAPAS BAWAH
SPUTUM
 Bukan saliva !!!
 Mukolitik dan inhalasi sebelumnya
 Bangun tidur – berkumur – batuk dalam
 Wadah steril

11. Saliva vs sputum
Sputum + Pewarnaan Gram

12. Lain2 :
› Bronchial washing
› Bronchial brushing
0 Dilakukan oleh dokter dengan bronkoskopi
0 Bronchial brushing lebih baik daripada bronchial washing
› Bronchoalveolar lavage
› Transtracheal aspiration
› Tracheal aspiration
… saluran napas bawah

13. Untuk beberapa bakteri seperti:
› Corynebacterium diphteriae,
› Bordetella pertussis,
› N. gonorrhoeae,
› Legionella spp.,
› Chlamydia,
› Mycoplasma
Dokter pengirim hendaknya menghubungi
laboratorium mikrobiologi terlebih dahulu sebelum
mengambil spesimen.
… saluran napas bawah

14. 0
30
60
Waktu (min)
Temp
Demam Biakan Darah
Bacteremia
Level
DARAH
Ambil spesimen darah sedekat mungkin
dengan waktu demam.
Jumlah bakteri menurun ketika suhu tubuh
menurun.

15. Sampling darah
Volume Jumlah sampling
Bayi 1 – 3 ml 2 x/ set pemeriksaan
Anak-anak 3 – 5 ml 2 x/ set pemeriksaan
Dewasa 10 – 20 ml 2 x/ set pemeriksaan

16. Darah
• 2-3 set spesimen akan dapat meningkatkan
angka deteksi~99% episode sepsis.
• JANGAN hanya menggunakan 1 set
spesimen untuk diagnosis sepsis pertama
kali

17. Lokasi pengambilan :
 Pada vena perifer, bukan pada ujung kateter
Cara pengambilan :
 Proses aseptik dan antiseptik ->
langsung ke botol Bactec/ BacTalert
Penyimpanan : < 24-48 jam , suhu ruang
… darah

19. SALURAN KEMIH: URIN
 Pemeriksaan semikuantitatif
 Transport :
› minimal 2 jam setelah pengumpulan
spesimen
› > 2 jam : lemari es (bukan freezer)

20. Cara pengumpulan spesimen urin
1. Mid stream urine ( Clean
catch urine )
JELASKAN PADA PASIEN:
urine pertama pagi hari
spesimen dikumpulkan di
pertengahan urine
dikeluarkan
Penis / vulva dibersihkan
dengan air sabun atau
tissue basah steril
Hindari kemih mengenai
kulit

21. 2. Urin Kateter
 bukan dari catheter bag
 kumpulkan dari selang indwelling catheter
melalui sampling port setelah dibersihkan
dengan swab alkohol terlebih dahulu
Cara pengumpulan spesimen urin

22. Cara pengumpulan spesimen urin

23. 3. Urine Aspirasi Suprapubik
Spesimen urine paling
baik
Invasif
Tindakan secara
aseptik
Dikerjakan bila urin
porsi tengah sulit
didapatkan
Cara pengumpulan spesimen urine

24. FESES
• Feses segar sebanyak + 10 gram/ 1
sendok teh, taruh dalam wadah
bersih, jangan tercampur dengan
urine atau air kloset.
• Jika ada, ambil bagian berdarah/
berlendir
SPESIMEN SALURAN CERNA

25. • Bayi, konstipasi
• memasukkan lidi kapas
steril sepanjang 1 inchi/ 2,5
cm ke dalam sfingter anus.
Secara hati-hati, putar lidi
kapas pada kripte anus
searah jarum jam dan putar
balik lidi kapas.
• Bila tidak langsung ditanam,
masukkan ke dalam media
transport Carey-Blair.
… spesimen saluran cerna
• USAP DUBUR (rectal swab)

26. untuk mengisolasi :
• Shigellae,
• Salmonella,
• E. Coli patogen,
• permintaan khusus: Clostridium
difficile, Vibrio, dan Yersinia.
… spesimen saluran cerna
Tujuan Pemeriksaan Feses

27. LUKA / ABSES
Cara :
› biopsi (terbaik): aerob & anaerob
› Aspirasi: aerob & anaerob
› Swab: aerob
Tidak dianjurkan untuk mengambil pus
yang berasal dari drain

28. BIOPSI DAN ASPIRASI
Aspirasi untuk :
• Abses tertutup
• Luka bergaung dengan cairan di dalamnya yang tertutup
debris superfisial
… luka / abses

29. SWAB
… luka / abses

30. PEMERIKSAAN ANAEROB
Kriteria spesimen:
– aspirasi atau biopsi jaringan swab
– Tidak tercemar oleh mikroba yang tidak
diinginkan
– Terhindar dari kontak dengan udara.
– Menggunakan media transport anaerob
masukkan dalam anaerobic bag

31. PENYIMPANAN & PENGIRIMAN ANAEROB
• Sampel penderita dalam
spuit -> tidak dianjurkan
• Jangan dimasukkan
dalam lemari es
… pemeriksaan anaerob

32. Spesimen yang bukan untuk kultur
anaerob
Eksudat atau material lain yang diambil dari luka di
permukaan, abses, luka bakar, kista, ulkus
Swab vagina, serviks dan uretra
Spesimen saluran nafas yang diambil dengan swab, suction
nasotrakeal atau orotrakeal, sputum, bronkoskopi
Feses, usap dubur
(kecuali sampel feses dengan permintaan spesifik :
C.difficile, C. botulinum)
Urin porsi tengah atau urin dari kateter
… pemeriksaan anaerob

33. Spesimen ditolak atau
diterima dengan catatan bila :
 Penderita memakai antibiotik
 Ada kemungkinan bahan terkontaminasi
 Jumlah kurang
 Penyimpanan dan pengiriman tidak
memenuhi syarat
 Bahan untuk pemeriksaan anaerob tidak
dikirim dalam suasana anaerob.

34. GOOD QUALITY SPECIMENS
ARE NEEDED FOR RELIABLE
MICROBIOLOGIC
DIAGNOSES