This document provides a table that lists 20 amino acids and some of their key properties including hydropathy, log P value, acid/base properties, hydrophilicity/hydrophobicity, and more. Each amino acid is listed with its single letter abbreviation, three letter abbreviation, and values for various physicochemical properties. The table helps characterize different amino acids based on factors like their solubility in water and interactions with lipids.

1. 本間善夫（ecosci.jp）
Twitter ID : @ecochem Facebook ID : ecochem
第7回日本化学連合シンポジウム, 2014/03/17
http://www.ecosci.jp/
化学コミュニケーション賞2013

2. 化学コミュニケーション賞2013
http://www.ecosci.jp/
今後はエコサイと読んでいただければ…

3. 化学コミュニケーション賞2013
これまでecosci.jpのURL・コンテンツや著書などが
紹介された書籍例（共著書含む）

4. 化学コミュニケーション賞2011

5. 化学コミュニケーション賞2011
2014/04/19開催

6. 化学コミュニケーション賞2012

7. 化学コミュニケーション賞2013
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
2013
サイエンスアゴラ出展

8. 化学コミュニケーション賞2013
2009
2010
2011
2012
2007
2013
運営を協力している
公民館カフェ記事
2008

9. ◆分子とエネルギー http://special.nikkeibp.co.jp/ts/
article/a00h/106150/p4.html
http://www.jogmec.go.jp/
library/oilgas_009.html
http://park.itc.u-
tokyo.ac.jp/pls/research_4.html
【参考】公民館サイエンスカフェ『藻類からの燃料で
ジャンボ飛行機を飛ばせるか?』（2012/01/28）
http://www.ecosci.jp/sck/cafe120128.html
http://unit.aist.go.jp/hydrogenius/
ci/hydrogen/
http://escc.frcer.t.u-
tokyo.ac.jp/kenkyu_naiyou.html

10. https://www.facebook.com/media/set/
?set=a.416653278358070.87786.1322
46190132115
◆分子となかよく !
https://www.googlesciencefair.com
/ja_ALL/2013/
世界結晶年2014
http://www.3dmoleculardesigns.com/
3DMD.htm
https://student.societyforscience.org
/intel-sts

11. ◆極小物質を数千万倍してみれば…
モル・タロウ
1億2500万倍
タンパク質模型と付属分子
は混ぜないようにお願いしま
す!
無理な力も加えないように
扱ってください。

12. “水と油”で見る20種類のアミノ酸
アミノ酸
特性基 R hydropathy
極性 log P
酸性・
塩基性
極性・非極性 Cleftの分類 等電点
O I I/O index
Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1.70 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.02
Leu L ロイシン 70 0 0 3.8 4.9 -1.52 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.98
Val V バリン 50 0 0 4.2 5.9 -2.26 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.96
Ala A アラニン 20 0 0 1.8 8.1 -2.85 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.00
Phe F フェニルアラニン 140 15 0.107 2.8 5.2 -1.38 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.48
Pro P プロリン 60 10 0.167 -1.6 8.0 -2.54 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 6.30
Met M メチオニン 100 20 0.200 1.9 5.7 -1.87 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.74
Cys C システイン 60 20 0.333 2.5 5.5 -2.49 中性 極性（中性） Cysteine 5.07
Trp W トリプトファン 180 130 0.722 -0.9 5.4 -1.05 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.89
Tyr Y チロシン 140 115 0.821 -1.3 6.2 -2.26 中性 極性（中性） Aromatic 5.66
Lys K リシン 80 70 0.875 -3.9 11.3 -3.05 塩基性 極性（塩基性） Positive 9.74
Gly G グリシン 0 0 － -0.4 9.0 -3.21 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 5.97
His H ヒスチジン 80 152 1.900 -3.2 10.4 -3.32 塩基性 極性（塩基性） Positive 7.59
Arg R アルギニン 80 190 2.375 -4.5 10.5 -4.20 塩基性 極性（塩基性） Positive 10.76
Thr T トレオニン 40 100 2.500 -0.7 8.6 -2.94 中性 極性（中性） Neutral 6.16
Glu E グルタミン酸 60 150 2.500 -3.5 12.3 -3.69 酸性 極性（酸性） Negative 3.22
Gln Q グルタミン 60 200 3.333 -3.5 10.5 -3.64 中性 極性（中性） Neutral 5.65
Asp D アスパラギン酸 40 150 3.750 -3.5 13.0 -3.89 酸性 極性（酸性） Negative 2.77
Ser S セリン 20 100 5.000 -0.8 9.2 -3.07 中性 極性（中性） Neutral 5.68
Asn N アスパラギン 40 200 5.000 -3.5 11.6 -3.82 中性 極性（中性） Neutral 5.41
http://www.ecosci.jp/amino/amino2j.html

13. “水と油”で見る20種類のアミノ酸
アミノ酸
特性基 R hydropathy
極性 log P
酸性・
塩基性
極性・非極性 Cleftの分類 等電点
O I I/O index
Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1.70 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.02
Leu L ロイシン 70 0 0 3.8 4.9 -1.52 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.98
Val V バリン 50 0 0 4.2 5.9 -2.26 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.96
Ala A アラニン 20 0 0 1.8 8.1 -2.85 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.00
Phe F フェニルアラニン 140 15 0.107 2.8 5.2 -1.38 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.48
Pro P プロリン 60 10 0.167 -1.6 8.0 -2.54 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 6.30
Met M メチオニン 100 20 0.200 1.9 5.7 -1.87 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.74
Cys C システイン 60 20 0.333 2.5 5.5 -2.49 中性 極性（中性） Cysteine 5.07
Trp W トリプトファン 180 130 0.722 -0.9 5.4 -1.05 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.89
Tyr Y チロシン 140 115 0.821 -1.3 6.2 -2.26 中性 極性（中性） Aromatic 5.66
Lys K リシン 80 70 0.875 -3.9 11.3 -3.05 塩基性 極性（塩基性） Positive 9.74
Gly G グリシン 0 0 － -0.4 9.0 -3.21 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 5.97
His H ヒスチジン 80 152 1.900 -3.2 10.4 -3.32 塩基性 極性（塩基性） Positive 7.59
Arg R アルギニン 80 190 2.375 -4.5 10.5 -4.20 塩基性 極性（塩基性） Positive 10.76
Thr T トレオニン 40 100 2.500 -0.7 8.6 -2.94 中性 極性（中性） Neutral 6.16
Glu E グルタミン酸 60 150 2.500 -3.5 12.3 -3.69 酸性 極性（酸性） Negative 3.22
Gln Q グルタミン 60 200 3.333 -3.5 10.5 -3.64 中性 極性（中性） Neutral 5.65
Asp D アスパラギン酸 40 150 3.750 -3.5 13.0 -3.89 酸性 極性（酸性） Negative 2.77
Ser S セリン 20 100 5.000 -0.8 9.2 -3.07 中性 極性（中性） Neutral 5.68
Asn N アスパラギン 40 200 5.000 -3.5 11.6 -3.82 中性 極性（中性） Neutral 5.41
http://www.ecosci.jp/amino/amino2j.html

14. ◆ 生体分子の構成元素例
このスライドに示した生体分子や
模型に含まれているのは以下の
元素だけです。

15. ◆タンパク質をJmolで見る
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
●Jmolスクリプトの例
<script>jmolRadio("select asn or ser; colour
atoms [255,60,120]; select asp or gln; colour
atoms [255,120,160]; select glu or thr; colour
atoms [255,160,200]; select arg or his; colour
atoms [255,200,220]; select gly; colour atoms
[255,255,50]; select lys or tyr or trp; colour
atoms [170,255,170]; select cys or met; colour
atoms [130,255,130]; select pro or phe; colour
atoms [100,255,100]; select ala or val or ile or
leu; colour atoms [0,255,0];","");
</script>I/O値順
PDBj 今月の分子
http://pdbj.org/mom?id=41

16. ◆タンパク質の1次構造～4次構造
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html

17. ◆ヘモグロビンくらべ
マンモスのヘモグロビン ハツカネズミのヘモグロビン
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
Genetics/生命の連続性 - データベース高度利用者養成
http://togodb.sel.is.ocha.ac.jp/pukiwiki/Genetics/%C0%B8%CC%BF%A4%C
E%CF%A2%C2%B3%C0%AD.html

18. ◆光合成 ；光化学系I・II
光化学系II
光化学系I
画像はWikipediaおよび東京大学生命科学教育
用画像集LS-EDI UT http://csls-db.c.u-
tokyo.ac.jp/ より
光化学系II複合体の全体構造
http://www.spring8.or.jp/ja/news_
publications/press_release/2011/
110418
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_
ps2.html
光合成光化学系IIの構造例3ARC
3ARCのChain A
光合成光化学系Iの構造例3PCQの
36量体（Chain A-M・X×3）

19. http://www.nicovideo.jp/watch/
1334128459
◆光合成 ；光化学系II
http://www.asahi.com/news/intro/
TKY201212310392.html
酸素発生中心の詳細な化学構造
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps2.html
光合成光化学系IIの構造例3ARCのChain A

20. ◆2012年 ノーベル化学賞；GPCR
http://www.nobelprize.org/
Gタンパク質共役受容体
http://gpcr.scripps.edu/
http://www.ecosci.jp/moldic/
http://www.ecosci.jp/GPCR/

21. http://www.nobelprize.org/nobel_prizes/
chemistry/laureates/2013/
◆2013年ノーベル化学賞；計算化学

22. http://www.zcorp.com/jp/Products/3D-
Printers/ZPrinter-450/spage.aspx
㊙スタジオミダス提供の
分子模型製作中の写真
◆ 研究・教育分野でも広がる3Dプリンタ利用
サイエンスセミナー in 江戸川大学（2013/08/23）
http://www.edogawa-u.ac.jp/news/130710_2.html

23. 化学コミュニケーション賞2013
迅速性
協調・連携・双方向性
継続性
今後はエコサイと読んでいただければ…