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Uploaded byYoshio Honma
原子→分子→生体分子が湧き出すビッグヒストリー（2015/11/03-06 日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ，日本科学未来館）
原子→分子→生体分子が湧き出すビッグヒストリー（2015/11/03-06 日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ，日本科学未来館） http://www.ecosci.jp/sccj_sa2016/ http://www.ecosci.jp/BigHistory/
原子→分子→生体分子が湧き出すビッグヒストリー（2015/11/03-06 日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ，日本科学未来館）
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- 2. ◆近刊「ビッグヒストリー：われわれはどこか ら来て、どこへ行くのか」（明石書店） 第1スレッショルド ビッグバン：宇宙の起 源 第2スレッショルド 恒星 第3スレッショルドより重い化学元素 第4スレッショルド 恒星 第5スレッショルド 生命の誕生 第6スレッショルド ホモ・サピエンス 第7スレッショルド 農業 第8スレッショルド 現代社会／アントロポ シーン https://www.facebook.com/events/1641114792867344/ １ http://www.akashi.co.jp/book/b251054.html
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- 9. ※生体分子の構造決定に用いる機器の例（X線回折法） …日本コンピュータ化学会年会2007秋季年会で見学し たSPring-8で撮影 タンパク質の1次構造から高次構造までを参照できるサイト例 http://themedicalbiochemistrypage.org/protein- structure.html ロザリンド・フランクリンら によるX線回折写真 Molecular Configuration in SodiumThymonucleate Franklin R. and Gosling R.G. Nature 171, 740-741 (1953) ◆スレッショルド5 生命の誕生 《DNA》 「ビッグヒストリー」本 p.71ほか にDNA
- 10. ◆スレッショルド5 生命の誕生 生物と無 生物「ビッグヒストリー」本p.64“生命 とは?” 「ビッグヒストリー」本 p.76の『最 初の細胞はどこでどのように誕生した のか？』にはブラックスモーカー。 http://www.ecosci.jp/life/
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- 15. “水と油”で見る20種類のアミノ酸 アミノ酸 特性基 R hydropathy 極性log P 酸性・ 塩基性 極性・非極性 Cleftの分類 等電点 O I I/O index Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1.70 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.02 Leu L ロイシン 70 0 0 3.8 4.9 -1.52 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.98 Val V バリン 50 0 0 4.2 5.9 -2.26 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.96 Ala A アラニン 20 0 0 1.8 8.1 -2.85 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.00 Phe F フェニルアラニン 140 15 0.107 2.8 5.2 -1.38 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.48 Pro P プロリン 60 10 0.167 -1.6 8.0 -2.54 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 6.30 Met M メチオニン 100 20 0.200 1.9 5.7 -1.87 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.74 Cys C システイン 60 20 0.333 2.5 5.5 -2.49 中性 極性（中性） Cysteine 5.07 Trp W トリプトファン 180 130 0.722 -0.9 5.4 -1.05 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.89 Tyr Y チロシン 140 115 0.821 -1.3 6.2 -2.26 中性 極性（中性） Aromatic 5.66 Lys K リシン 80 70 0.875 -3.9 11.3 -3.05 塩基性 極性（塩基性） Positive 9.74 Gly G グリシン 0 0 － -0.4 9.0 -3.21 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 5.97 His H ヒスチジン 80 152 1.900 -3.2 10.4 -3.32 塩基性 極性（塩基性） Positive 7.59 Arg R アルギニン 80 190 2.375 -4.5 10.5 -4.20 塩基性 極性（塩基性） Positive 10.76 Thr T トレオニン 40 100 2.500 -0.7 8.6 -2.94 中性 極性（中性） Neutral 6.16 Glu E グルタミン酸 60 150 2.500 -3.5 12.3 -3.69 酸性 極性（酸性） Negative 3.22 Gln Q グルタミン 60 200 3.333 -3.5 10.5 -3.64 中性 極性（中性） Neutral 5.65 Asp D アスパラギン酸 40 150 3.750 -3.5 13.0 -3.89 酸性 極性（酸性） Negative 2.77 Ser S セリン 20 100 5.000 -0.8 9.2 -3.07 中性 極性（中性） Neutral 5.68 Asn N アスパラギン 40 200 5.000 -3.5 11.6 -3.82 中性 極性（中性） Neutral 5.41 http://www.ecosci.jp/amino/amino2j.html
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- 17. ◆スレッショルド8 現代社会／アントロポ シーン “分子”が社会で果たす役割 …“鍵と鍵穴”で見る「ビッグヒストリー」本p.83・332にペニシリン 抗生物質分子データ集 http://www.ecosci.jp/ab/ab_jmol.html http://www.ecosci.jp/ab/ab_pdb_j.html 有機概念図 http://www.ecosci.jp/ocd/ http://winmostar.com/jp/
- 18. ◆スレッショルド8 現代社会／アントロポ シーン “分子”が社会で果たす役割 …“鍵と鍵穴”で見る「ビッグヒストリー」本p.83・332にペニシリン 抗生物質分子データ集 http://www.ecosci.jp/ab/ab_jmol.html http://www.ecosci.jp/ab/ab_pdb_j.html 有機概念図 http://www.ecosci.jp/ocd/ http://winmostar.com/jp/ ★元素合成と並んでゲノム編集により生命の操作も始まりつつある sgRNAおよび2本鎖DNAと結合したCRISPR-Cas9の構造 PDB 5F9R http://www.ecosci.jp/CRISPR/
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