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Uploaded byYoshio Honma
『３Dプリンタで見るタンパク質と分子の【鍵と鍵穴の関係】』＠オンライン版サイエンスアゴラ2020（2020/11/13-22）
『３Dプリンタで見るタンパク質と分子の【鍵と鍵穴の関係】』＠オンライン版サイエンスアゴラ2020（2020/11/13-22） http://www.ecosci.jp/sccj_sa2020/
『３Dプリンタで見るタンパク質と分子の【鍵と鍵穴の関係】』＠オンライン版サイエンスアゴラ2020（2020/11/13-22）
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- 2. ★動画を見た後は以下で体験を!! 3Dプリンタで見るタンパク質と分子の『鍵と鍵穴の関係』 ★本スライドへのリンクも掲載します。 ★分子モデル表示はInternet Explorerでのみ可能ですが，画像も多数 http://www.ecosci.jp/km/km_pdbsum.html 分子は形が大事!! ；水に溶ける?溶けない? http://www.ecosci.jp/ocd-app/ …アプリ版開発：相馬 稔（サイエンスカフェにいがたスタッフ） ★Winmostarクラウドで多数の分子構造を参照できます！ https://winmostar.com/canvas/index0_ch.html
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- 7. “水と油”で見る20種類のアミノ酸 アミノ酸 特性基 R 酸性・塩基性 極性・非極性等電点 O I I/O Ile I イソロイシン 80 0 0.000 中性 非極性（疎水性） 6.02 Leu L ロイシン 70 0 0.000 中性 非極性（疎水性） 5.98 Val V バリン 50 0 0.000 中性 非極性（疎水性） 5.96 Ala A アラニン 20 0 0.000 中性 非極性（疎水性） 6.00 Phe F フェニルアラニン 140 15 0.107 中性 非極性（疎水性） 5.48 Pro P プロリン 60 10 0.167 中性 非極性（疎水性） 6.30 Met M メチオニン 100 20 0.200 中性 非極性（疎水性） 5.74 Cys C システイン 60 20 0.333 中性 極性（中性） 5.07 Trp W トリプトファン 180 130 0.722 中性 非極性（疎水性） 5.89 Tyr Y チロシン 140 115 0.821 中性 極性（中性） 5.66 Lys K リシン 80 70 0.875 塩基性 極性（塩基性） 9.74 Gly G グリシン 0 0 － 中性 非極性（疎水性） 5.97 His H ヒスチジン 80 152 1.900 塩基性 極性（塩基性） 7.59 Arg R アルギニン 80 190 2.375 塩基性 極性（塩基性） 10.76 Thr T トレオニン 40 100 2.500 中性 極性（中性） 6.16 Glu E グルタミン酸 60 150 2.500 酸性 極性（酸性） 3.22 Gln Q グルタミン 60 200 3.333 中性 極性（中性） 5.65 Asp D アスパラギン酸 40 150 3.750 酸性 極性（酸性） 2.77 Ser S セリン 20 100 5.000 中性 極性（中性） 5.68 Asn N アスパラギン 40 200 5.000 中性 極性（中性） 5.41 ◆水に溶ける? 溶けない? タンパク質を構成するアミノ酸で も重要!!
- 8. http://www.ecosci.jp/km/km_pdbsum.html http://www.ecosci.jp/ocd/ “鍵と鍵穴”の構造情報を提供しているのがPDBsumサイト https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi- bin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=index.html ◆川上モデル「鍵と鍵穴」模型 画期的3Dプリンタ模型，川上モデル 生物の多彩な機能を担うタンパク質の設計図が DNA http://www.ecosci.jp/ocd/ ●川上勝，生物物理 55,104-107 (2015) https://www.jstage.jst.go.jp/article/ biophys/55/2/55_104/_pdf ●川上モデル製作：スタジオミダス http://studio-midas.com/bunshi/
- 9. http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html ◆水に溶ける? 溶けない? タンパク質の1次構造～4次構造 ヘモグロビンを例に RCSBPDB http://www.pdb.org/pdb/ http://www.youtube.com/ watch?v=qBRFIMcxZNM
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- 13. ◆川上モデル「鍵と鍵穴」模型； 医薬 ＆GPCR http://www.ecosci.jp/km/km_pdbsum.html Alexander Fleming - Wikipedia https://en.wikipedia.org/wiki/Alexan der_Fleming https://www.tokyo- np.co.jp/article/national/list/201910/ CK2019101202000139.html http://www.ecosci.jp/ocd-app/ http://www.ecosci.jp/ab/ http://www.ecosci.jp/GPCR/ “元素・分子が登場 する本を読もう！”
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- 20. 日本コンピュータ化学会＠オンライン版サイエンスアゴラ2020動画公開！ （2020/11/13-22） 3Dプリンタで見るタンパク質と分子の『鍵と鍵穴の関係』 ★本スライドへのリンクも掲載します。 ★分子モデル表示はInternet Explorerでのみ可能 ですが，画像も多数 http://www.ecosci.jp/km/km_pdbsum.html 分子は形が大事!! ；水に溶ける?溶けない? http://www.ecosci.jp/ocd-app/ 『やっぱり見たい！原子や分子！！』 - YouTube https://www.youtube.com/watch?v=xJRBnf-lDJQ 動画内容についての感想・質問書き込みページ https://sites.google.com/view/sccj2020 ★動画は5編あり，最後が本スライドについてのものです。その内容については以下もご参照くださ い（再掲）。