「十一人劇場」第1回『3Dプリンタ分子模型を体験する！』（2017/05/13，市民科学研究室）
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市民科学研究室「十一人劇場」第1回『3Dプリンタ分子模型を体験する！』（2017/05/13，千駄木） http://www.shiminkagaku.org/20100020170427/
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- 10. ◆ビッグヒストリー；コレクティブ・ラーニング #元素 第31回 公民館サイエンスカフェ『元素名決定！ 113番元素ニホニウム』（2017/02/04） http://www.fuzambo- intl.com/index.php?main_page=page&id=239 http://www.ecosci.jp/sck/cafe170204.html https://www.chart.co.jp/goods/item/ rika/23303.php http://www.jst.go.jp/csc/scienceagora/ reports/2015/program/booth/aa_051/
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- 13. 第1スレッショルド ビッグバン：宇宙の起源 第2スレッショルド 恒星 第3スレッショルド より重い化学元素 第4スレッショルド 恒星 第5スレッショルド 生命の誕生 第6スレッショルド ホモ・サピエンス 第7スレッショルド 農業 第8スレッショルド 現代社会／アントロポシー ン http://www.akashi.co.jp/ book/b251054.html http://www1.nhk.or.jp/asaichi/ archive/161216/2.html https://www.chart.co.jp/goods/item/ rika/23303.php ◆ビッグヒストリー；スレッショルド（大跳躍） #歴 史
- 17. ◆スレッショルド3 より重い化学元素 http://www.akashi.co.jp/book/b251054.html http://www.ecosci.jp/BigHistory/ http://stw.mext.go.jp/series.html 30 + 83 = ? 「ビッグヒストリー」本 p.28 周期表
- 19. ※生体分子の構造決定に用いる機器の例（X線回折法） …日本コンピュータ化学会年会2007秋季年会で見学し たSPring-8で撮影 ◆スレッショルド5 生命の誕生 《DNA》 「ビッグヒストリー」本 p.71ほか にDNA タンパク質の1次構造から高次構造までを参照できるサ イト例 http://themedicalbiochemistrypage.org/protein -structure.html ロザリンド・フランクリンら によるX線回折写真 Molecular Configuration in Sodium Thymonucleate Franklin R. and Gosling R.G. Nature 171, 740-741 (1953)
- 20. ◆スレッショルド5 生命の誕生 生物と無生物 「ビッグヒストリー」本 p.64“生命 とは?” 「ビッグヒストリー」本 p.76の『最 初の細胞はどこでどのように誕生した のか？』にはブラックスモーカー。 http://www.ecosci.jp/life/ https://www.bighistory project.com/chapters/3 #life-begins 長沼 毅「生命の始まりを 探して 僕は生物学者に なった」p.73に“硫化鉄 が黄鉄鉱になる過程で出 てくる化学エネルギーを 使って…” https://www.amazon. co.jp/dp/4309617018 http://www.ecosci.jp/km/ km_ligand.html
- 21. ゾウの時間 ネズミの時間 ◆ヘモグロビンはいろいろな生物に マンモスのヘモグロビン ハツカネズミのヘモグロビン http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
- 23. ◆スレッショルド5 生命の誕生；チューブワーム #深海 チューブワーム由来ヘモグロビンとヒトのヘモグロビン の比較http://www.ecosci.jp/s/bm_tubeworm.html http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html https://www.youtube.com/watch?v= NUKX2zN77HA …2010/04/07公開 http://www.nts- book.co.jp/item/detail/summar y/bio/20051225_42bk.html https://www.jstage.jst.go.jp/ article/kagakutoseibutsu/46/ 4/46_4_291/_article/-char/ja/
- 26. “水と油”で見る20種類のアミノ酸 アミノ酸 特性基 R hydropathy 極性 log P 酸性・ 塩基性 極性・非極性 Cleftの分類 等電点 O I I/O index Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1.70 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.02 Leu L ロイシン 70 0 0 3.8 4.9 -1.52 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.98 Val V バリン 50 0 0 4.2 5.9 -2.26 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.96 Ala A アラニン 20 0 0 1.8 8.1 -2.85 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 6.00 Phe F フェニルアラニン 140 15 0.107 2.8 5.2 -1.38 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.48 Pro P プロリン 60 10 0.167 -1.6 8.0 -2.54 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 6.30 Met M メチオニン 100 20 0.200 1.9 5.7 -1.87 中性 非極性（疎水性） Aliphatic 5.74 Cys C システイン 60 20 0.333 2.5 5.5 -2.49 中性 極性（中性） Cysteine 5.07 Trp W トリプトファン 180 130 0.722 -0.9 5.4 -1.05 中性 非極性（疎水性） Aromatic 5.89 Tyr Y チロシン 140 115 0.821 -1.3 6.2 -2.26 中性 極性（中性） Aromatic 5.66 Lys K リシン 80 70 0.875 -3.9 11.3 -3.05 塩基性 極性（塩基性） Positive 9.74 Gly G グリシン 0 0 － -0.4 9.0 -3.21 中性 非極性（疎水性） Pro & Gly 5.97 His H ヒスチジン 80 152 1.900 -3.2 10.4 -3.32 塩基性 極性（塩基性） Positive 7.59 Arg R アルギニン 80 190 2.375 -4.5 10.5 -4.20 塩基性 極性（塩基性） Positive 10.76 Thr T トレオニン 40 100 2.500 -0.7 8.6 -2.94 中性 極性（中性） Neutral 6.16 Glu E グルタミン酸 60 150 2.500 -3.5 12.3 -3.69 酸性 極性（酸性） Negative 3.22 Gln Q グルタミン 60 200 3.333 -3.5 10.5 -3.64 中性 極性（中性） Neutral 5.65 Asp D アスパラギン酸 40 150 3.750 -3.5 13.0 -3.89 酸性 極性（酸性） Negative 2.77 Ser S セリン 20 100 5.000 -0.8 9.2 -3.07 中性 極性（中性） Neutral 5.68 Asn N アスパラギン 40 200 5.000 -3.5 11.6 -3.82 中性 極性（中性） Neutral 5.41 http://www.ecosci.jp/amino/amino2j.html
- 27. ◆スレッショルド8 現代社会／アントロポシーン #生物 #環境 #国際 http://www.gizmodo.jp/2017/01/weight- of-humanitys-footprint.html 環境問題はp.314ほか多数 http://www.natureasia.com/ja- jp/research/highlight/10450/ http://www.ecosci.jp/chem13/ topics13e.html#10 有機水銀分解酵素（アルキル水銀リアー ゼ，EC.4.99.1.2）MerB構造例PDB 3F0P http://www.ecosci.jp/chem11/pcb _deg.html https://www.env.go.jp/earth/g7toyama_ emm/japanese/meeting_overview.html
- 29. ◆スレッショルド8 現代社会／アントロポシーン “分子”が社会で果たす役割 …“鍵と鍵穴”で見る 「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペニシリン 抗生物質分子データ集 http://www.ecosci.jp/ab/ab_jmol.html http://www.ecosci.jp/ab/ab_pdb_j.html 有機概念図 http://www.ecosci.jp/ocd/ http://winmostar.com/jp/
- 31. 画期的分子模型； Oct1/Sox2/DNA複合体 PDB 1GT0 http://www.ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.html DNAを含むデータとして選んだのが，iPS細胞の山中4 因子（Oct3/4・Sox2・Klf4・c-Myc）関連として， Sox2およびOct4類似のOct1タンパク質がDNAに結 合した構造である。なおOct4は2014年7月に Nature論文が撤回されたSTAP細胞研究でも登場す る。今回の発注ではDNAについてもタンパク同様，シリ コーン樹脂に球棒モデルで石膏構造を内包するよう特 注し，初の試みとして実現していただけた。これにより塩 基対などDNAの2重らせん構造を目の当たりにすること ができた。 ◆脳の発達を戦略としたヒト／人間の誕生 - DNA，iPS，ゲノム編集， Nh， … http://www.ecosci.jp/ CRISPR/ http://blog.miraikan.jst.go.jp/ event/20160824part-1.html