Сулаєва О.М. - Молекулярна патологія раку сечового міхураAlinaPokhilko
Навчальний курс: «Молекулярна онкологія, патологія та генетика»
Медична лабораторія CSD спільно з Center for research and education of translational biology and medicine (www.tbm.center ) пропонує безкоштовний курс навчальних лекцій для усіх бажаючих.
http://bioinformaticsinstitute.ru/guests
В пятницу 10 октября в 19.00 Мария Шутова (ИоГЕН РАН) выступала в Институте биоинформатики с открытой лекцией, посвященной изучению рака.
Рак -- одна из наиболее распространенных причин смерти по всему миру. В лекции рассматривается, как знания об эволюции, работе генома, репрограммировании, а также использование биоинформатических методов помогли лучше понять, как развивается раковая опухоль и предложить новые методы лечения разнообразных типов рака. Рассмотрены мышиные модели развития рака и интересные результаты, которые были получены с их помощью.
http://bioinformaticsinstitute.ru/lectures
Гостевая лекция Института биоинформатики, 9 октября 2014. Лектор -- Мария Шутова (ИоГЕН РАН).
За последние десять лет плюрипонтентные клетки стали героями двух Нобелевских премий и многих тысяч научных и научно-популярных статей. Их уникальная возможность превращаться в любую клетку взрослого организма до сих пор дает пищу для ума как биологам развития, так и ученым, ищущим способы лечения генетических заболеваний. В лекции будет рассказано о двух типах плюрипотентных клеток: "естественных" (эмбриональные стволовые клетки) и "искусственных" (индуцированные плюрипотентные стволовые клетки). Отдельно мы остановимся на том, как знания о работе транскрипционных факторов помогли репрограммировать клетки, и как эти "искусственные" плюрипотентные клетки можно использовать в медицине.
Сулаєва О.М. - Молекулярна патологія раку сечового міхураAlinaPokhilko
Навчальний курс: «Молекулярна онкологія, патологія та генетика»
Медична лабораторія CSD спільно з Center for research and education of translational biology and medicine (www.tbm.center ) пропонує безкоштовний курс навчальних лекцій для усіх бажаючих.
http://bioinformaticsinstitute.ru/guests
В пятницу 10 октября в 19.00 Мария Шутова (ИоГЕН РАН) выступала в Институте биоинформатики с открытой лекцией, посвященной изучению рака.
Рак -- одна из наиболее распространенных причин смерти по всему миру. В лекции рассматривается, как знания об эволюции, работе генома, репрограммировании, а также использование биоинформатических методов помогли лучше понять, как развивается раковая опухоль и предложить новые методы лечения разнообразных типов рака. Рассмотрены мышиные модели развития рака и интересные результаты, которые были получены с их помощью.
http://bioinformaticsinstitute.ru/lectures
Гостевая лекция Института биоинформатики, 9 октября 2014. Лектор -- Мария Шутова (ИоГЕН РАН).
За последние десять лет плюрипонтентные клетки стали героями двух Нобелевских премий и многих тысяч научных и научно-популярных статей. Их уникальная возможность превращаться в любую клетку взрослого организма до сих пор дает пищу для ума как биологам развития, так и ученым, ищущим способы лечения генетических заболеваний. В лекции будет рассказано о двух типах плюрипотентных клеток: "естественных" (эмбриональные стволовые клетки) и "искусственных" (индуцированные плюрипотентные стволовые клетки). Отдельно мы остановимся на том, как знания о работе транскрипционных факторов помогли репрограммировать клетки, и как эти "искусственные" плюрипотентные клетки можно использовать в медицине.
Сулаєва О.М. - BRCA-мутації при раку яєчників: тестування та клінічне значенняAlinaPokhilko
Навчальний курс: «Молекулярна онкологія, патологія та генетика»
Медична лабораторія CSD спільно з Center for research and education of translational biology and medicine (www.tbm.center ) пропонує безкоштовний курс навчальних лекцій для усіх бажаючих.
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МИШЕНИ В ПРОФИЛАКТИКЕ И ЛЕЧЕНИИ ГИПЕРПЛАЗИИ И РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНО...Игорь Шадеркин
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МИШЕНИ В ПРОФИЛАКТИКЕ И ЛЕЧЕНИИ ГИПЕРПЛАЗИИ И РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
НИИ МОЛЕКУЛЯРНОЙ МЕДИЦИНЫ ММА им.И.М.СЕЧЕНОВА
Зам. директора по науке профессор КИСЕЛЕВ В.И.
Мединар "Интерактивный анализ случая "Применение новых антиретровирусных препаратов для лечения пациента с опытом приема АРТ" (автор и ведущий П. Хайкин)
This case report describes a rare case of primary adrenal lymphoma presenting as Addison's disease in a 56-year-old male patient. Imaging and biopsy revealed bilateral adrenal involvement by mantle cell lymphoma. The patient was treated with R-CHOP chemotherapy and achieved complete remission, with restoration of adrenal function. Primary adrenal lymphoma is an uncommon and aggressive malignancy, but outcomes have improved with rituximab-containing regimens like R-CHOP. This case highlights an unusual presentation of primary adrenal lymphoma as Addison's disease from mantle cell histology.
This study evaluated quality of life and symptoms in 102 chronic myeloid leukemia patients receiving first- or second-line treatment with dasatinib in real-world clinical settings. For first-line dasatinib patients, quality of life improved in several domains after 12 months, and common symptom severity decreased. For second-line dasatinib patients after imatinib failure, quality of life and symptoms also improved over 12 months. Clinical responses to dasatinib were consistent with previous trials. Real-world data provided additional evidence for dasatinib's effectiveness outside of clinical trials.
Сулаєва О.М. - BRCA-мутації при раку яєчників: тестування та клінічне значенняAlinaPokhilko
Навчальний курс: «Молекулярна онкологія, патологія та генетика»
Медична лабораторія CSD спільно з Center for research and education of translational biology and medicine (www.tbm.center ) пропонує безкоштовний курс навчальних лекцій для усіх бажаючих.
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МИШЕНИ В ПРОФИЛАКТИКЕ И ЛЕЧЕНИИ ГИПЕРПЛАЗИИ И РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНО...Игорь Шадеркин
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МИШЕНИ В ПРОФИЛАКТИКЕ И ЛЕЧЕНИИ ГИПЕРПЛАЗИИ И РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
НИИ МОЛЕКУЛЯРНОЙ МЕДИЦИНЫ ММА им.И.М.СЕЧЕНОВА
Зам. директора по науке профессор КИСЕЛЕВ В.И.
Мединар "Интерактивный анализ случая "Применение новых антиретровирусных препаратов для лечения пациента с опытом приема АРТ" (автор и ведущий П. Хайкин)
This case report describes a rare case of primary adrenal lymphoma presenting as Addison's disease in a 56-year-old male patient. Imaging and biopsy revealed bilateral adrenal involvement by mantle cell lymphoma. The patient was treated with R-CHOP chemotherapy and achieved complete remission, with restoration of adrenal function. Primary adrenal lymphoma is an uncommon and aggressive malignancy, but outcomes have improved with rituximab-containing regimens like R-CHOP. This case highlights an unusual presentation of primary adrenal lymphoma as Addison's disease from mantle cell histology.
This study evaluated quality of life and symptoms in 102 chronic myeloid leukemia patients receiving first- or second-line treatment with dasatinib in real-world clinical settings. For first-line dasatinib patients, quality of life improved in several domains after 12 months, and common symptom severity decreased. For second-line dasatinib patients after imatinib failure, quality of life and symptoms also improved over 12 months. Clinical responses to dasatinib were consistent with previous trials. Real-world data provided additional evidence for dasatinib's effectiveness outside of clinical trials.
This study examined quality of life (QoL) in 124 Hodgkin's lymphoma patients undergoing autologous hematopoietic stem cell transplantation to determine if pretreatment QoL has prognostic value. QoL was significantly worse in patients compared to controls, especially in physical, role-physical, emotional, and social functioning. Patients with severe or critical QoL impairment before transplantation had significantly lower overall survival rates than those with no or mild impairment. While event-free survival was also lower in the more impaired group, the difference was not significant. This suggests pretreatment QoL may be a feasible prognostic factor for Hodgkin's lymphoma patients undergoing this procedure.
This document summarizes a medical case involving a 27-year-old African American female patient who presents with migraines, fatigue, and dysmennorhea. Her medical history and lab results are presented. The assistant recommends switching the patient's migraine medication from oral tablets to nasal spray, adjusting a pain medication, treating her anemia with iron supplements, addressing her obesity through diet and exercise, and considering preventative migraine treatments.
Глубокоуважаемые коллеги!
От имени научного комитета проекта "ГистоЛогика" рады сообщить, что в Вестнике РОНЦ им. Н. Н. Блохина РАМН, т. 23, №1, 2012 опубликована статья "СОВРЕМЕННЫЕ ПРИНЦИПЫ МОРФОЛОГИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКОГО НА МАЛОМ БИОПСИЙНОМ И ЦИТОЛОГИЧЕСКОМ МАТЕРИАЛЕ", в которой приведены пошаговый алгоритм диагностики рака легкого на малом материале, трактовка возможных результатов иммуноморфохимических исследований и обсуждение спорных моментов.
Репринт статьи во вложении.
Работа выполнена в рамках проекта «ГистоЛогика», направленного на улучшение диагностики рака легкого в Российской Федерации и разработанного Евразийской федерацией онкологии в партнерстве с компанией «Эли Лилли».
Презентация представлена на сателитный симпозиум в рамках ежегодного конгресса Армянской Ассоциации Урологов в октябре 2010 года. Спонсорская поддержка представительства компании Пфайзер в Армении,- Левон Кантарджян. Использованы материалы Пятого Европейского Симпозиума по Раку Почки, Лондон май 2010 года.
Что можно узнать о себе с помощью генетического тестирования? Sciencehit.by
Предрасположенность к физическим нагрузкам, к спорту высоких достижений? Риски каких заболеваний стоит исследовать? Как и где пройти генетическое тестирование? Когда и кому оно нужно?
Лектор: Моссэ Ирма Борисовна, профессор, доктор биологических наук, заведующая лаб. генетики человека Института генетики и цитологии НАН Беларуси.
This document discusses the molecular genetics and cytogenetics of acute lymphoblastic leukemia (ALL) and how characterization has improved over time. Key points include:
- Identification of genetic subgroups like Ph+ ALL has allowed for biologically-based prognostic stratification and targeted therapies.
- The GIMEMA network in Italy has characterized over 5,000 ALL cases since the 1980s using techniques like cytogenetics, FISH, and molecular genetics to define subgroups.
- Specific mutations like BCR-ABL, IKZF1 deletions, and CRLF2 deregulation are associated with poorer outcomes in certain ALL subgroups.
Oliva esther aml eurasian st. petersburg 2016EAFO2014
This document summarizes treatment strategies and quality of life considerations for elderly patients with acute myeloid leukemia (AML). It finds that while intensive chemotherapy can achieve complete remissions and improve quality of life, outcomes are poorer with age. Options for older patients include low-dose chemotherapy, hypomethylating agents like azacitidine and decitabine, and allogeneic stem cell transplant with reduced-intensity conditioning. Ongoing clinical trials are exploring post-remission azacitidine to maintain remission and quality of life achieved with initial intensive chemotherapy. Preliminary results show improved leukemia-free survival with azacitidine compared to best supportive care alone.
Oliva esther qol symposium eurasian st. petersburg 2016EAFO2014
Patients with hematological malignancies experience quality of life issues related to their disease and treatment. Common problems include fatigue, pain, and disruptions to daily activities and social relationships. Conditions like multiple myeloma, myelodysplastic syndromes, and chronic myeloid leukemia are associated with fatigue, while neutropenia from treatments can cause weakness and infections. Transfusions for anemia in myelodysplastic syndromes negatively impact quality of life. Younger patients with chronic myeloid leukemia have greater impairments. Assessments of quality of life and symptoms provide important information for evaluating patients' disease status and response to treatment over time in clinical practice.
This document discusses modern treatment strategies for diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL). It summarizes that DLBCL is molecularly distinct diseases with different biological characteristics and outcomes. Targeted therapies like ibrutinib and lenalidomide show promise for the activated B-cell (ABC) subtype of DLBCL. Monitoring circulating tumor DNA is presented as a very promising tool for early detection of treatment failure or recurrence, which can allow for pre-emptive treatment changes or early intervention.
Sam Salek eurasian conference 040316 st petersburgEAFO2014
The document discusses the importance of using patient-reported outcome information to aid treatment decision-making for patients with hematological malignancies. It summarizes discussions and meetings from the European Hematology Association's Scientific Working Group on Quality of Life and Symptoms over several years on developing guidelines and tools to measure important issues for patients, including fatigue, physical appearance changes, cognitive impacts, emotional impacts, and long-term effects. The goal is to develop a new tool that can be used at any stage of the disease to incorporate the patient perspective into treatment decisions.
Fedorenko_Denis_A.novik memorial lecture iv hematology forum_2016_st.pEAFO2014
AHSCT is a promising therapy for MS that can provide both clinical and patient-reported benefits. AHSCT using a BEAM-like conditioning regimen followed by mitoxantrone consolidation therapy resulted in 100% MRI response at 6 months, 55-68% improvement on EDSS scores, and improved quality of life outcomes based on SF-36 scores. The addition of mitoxantrone consolidation therapy after AHSCT may further improve event-free survival rates compared to AHSCT alone. Long-term follow up of patients undergoing AHSCT continues to show stabilization or improvement in neurological function for the majority of patients.
Fedorenko_Denis iv hematology forum_2016_st.pEAFO2014
This study examined quality of life (QoL) in 124 Hodgkin's lymphoma patients before autologous hematopoietic stem cell transplantation (AHSCT) and analyzed its prognostic value. QoL was assessed using the SF-36 questionnaire and compared to a control population. Patients had worse QoL than controls, especially in physical, role physical, emotional, and social functioning. While no differences in QoL were found between clinical response groups, overall survival at 19 months was lower in patients with severe/critical QoL impairment before AHSCT (66.7%) compared to those with no/mild impairment (78%). The results suggest QoL may be a prognostic factor for Hodgkin's
This document summarizes molecular genetics guiding treatment of acute myeloid leukemia (AML). Over 100 genetic lesions have been identified in AML. New molecular markers do not currently impact clinical practice due to heterogeneity, study design limitations, and lack of predictive value. Genomic profiling of over 1,500 AML patients identified 11 non-overlapping molecular classes and over 5,000 driver mutations involving 77 loci. Certain mutations like FLT3, KIT, IDH1/2 inform targeted therapy approaches in clinical trials. Phase III trials are investigating chemotherapy with or without targeted agents like midostaurin, dasatinib and quizartinib in genetically defined AML patient subgroups.
This document discusses bridging the gap between laboratory diagnostics and patient care. It provides several case studies where the hematologist was able to identify additional information or the correct diagnosis by reviewing blood test results in the context of the patient's clinical presentation. This allowed conditions to be correctly identified and managed, avoiding missed diagnoses. The document emphasizes the importance of bi-directional communication between laboratory specialists and clinicians to ensure test results are fully validated and applied to improve patient outcomes.
1. Статус гена TP53 у больных
диффузной В-крупноклеточной лимфомой
Воропаева Е.Н., Поспелова Т.И., Воевода М.И.,
Максимов В.Н., Агеева Т.А.
ФГНБУ НИИ терапии и профилактической медицины,
ГБОУ ВПО Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава России
Санкт-Петербург - 2016
2. АКТУАЛЬНОСТЬ ИССЛЕДОВАНИЯ
В настоящее время отсутствует комплексное описание изменчивости гена ТР53 при
диффузной В-крупноклеточной лимфоме (ДВККЛ).
Возможные молекулярные механизмы, на уровне молекулы ДНК приводящие к
дефициту ТР53, представлены в таблице 1.
Тип изменения Эффект
Мутации в кодирующей последовательности гена Потеря опухоль-супрессорных функций или
приобретение про-онкогенных свойств
Мутации в интронных последовательностях Нарушение альтернативного сплайсинга м-РНК
Мутации в 5/ и 3/-некодирующих
последовательностях
Снижение эффективности трансляции белка,
нарушение посттрансляционных модификаций
Потеря гетерозиготности Создание аллельного дисбаланса,
фенотипическая манифестация рецессивных
мутаций
Метилирование промотора Снижение экспрессии, вплоть до «выключения»
гена
Генетический полиморфизм Дефицит функции или стабильности белка
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ
Описать частоту гиперметилирования и потери гетерозиготности, а также
частоту, спектр и функциональную значимость мутаций в кодирующих и интронных
участках гена ТР53 у больных ДВККЛ г. Новосибирска.
Таблица 1
3. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ
Группу обследования составили 74 пациента с ДВККЛ.
Геномная ДНК выделена из парафиновых блоков, срезы которых содержали не менее
80-90% опухолевых клеток.
Методом прямого секвенирования по Сэнгеру выполнен анализ кодирующей
последовательности гена ТР53 и примыкающих участков интронов, согласно IARC
protocol (2010 update). Прескрининг мутаций не проводился.
Анализ статуса метилирования промотора гена ТР53 проводился методом метил-
специфической ПЦР на бисульфит-конвертированной ДНК (рис. 1).
Оценка потери гетерозиготности в гене ТР53 проводилась по микросателлитному
локусу D17S796 методом ПЦР (рис. 2).
М НМ М НМ М НМ М НМ М НМ М
НМ
1 2 3 К 4 5
Рис. 1. Результаты метил-специфической ПЦР
М – ПЦР с праймерами, специфичными к метилир.
аллелю (166 п.н.),
НМ – ПЦР с праймерами, специфичными к неметил.
аллелю (170 п.н.).
1, 2, 4 – норма; 3, 5 – метилирование;
К – контрольные ДНК.
Рис. 2. Анализ микросателлитной нестабильности
в локусе D17S796 (144-174 п.н.)
К – ДНК крови,
О – ДНК опухолевой ткани.
К О К О К О
1 2 3
4. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
Распределение мутаций, выявленных в группе обследования
3%
6%
3%
37%
33%
18%
сплайсинг
интронные
миссенс
сайлент
нонсенс
сдвиг рамки
Примечание: # - мутации, встреченные в группе обследования дважды
Гетерозигота по p.R213* Гомозигота по p.T155I Гетерозигота по IVS6-36G>C
Тип мутации
5. Тип замены
нуклеотида
Частота при ДВККЛ (%)
Значение
рВыборка
больных
IARC TP53
mutation
database
GC>AT в CpG 15,6 26
>0,05
GC>AT 34,4 25
GC>CG 3,1 8
GC>TA 9,4 10
AT>GC 12,5 13
AT>CG 12,5 5
AT>TA 12,5 8
Сравнение спектра выявленных мутаций
Множественные мутации в гене
ТР53 имели 4 пациента (6,8%).
«Hot-spot»
мутации в
выборке
«Hot-spot»
кодоны в IARC
TP53 mutation
database
p.W146R 248, 273, 175,
245, 281, 244,
305, 249 и 297
p.T155I
p.V272E
p.R213*
Гомозигота по p.A189Pfs
А - АК последовательность белка в норме,
В - АК последовательность белка при p.A189Pfs.
Сдвиг рамки считывания и формирование стоп-кодона
в результате p.A189Рfs в гене ТР53
6. Мутация
Биоинформационный прогноз Активность белка р53 в
экспериментах in vitro
(по данным литературы)PolyРhen-2 SIFT Mut_ass
p.L130F Probably damaging Deleterious High Не активен
p.W146R Benign Neutral Low Незначительно снижена
p.T155I Possibly damaging Deleterious Medium Не активен
p.R156C Benign Neutral Low Гиперактивен
p.R196Q Probably damaging Deleterious High Не активен
p.G244S Probably damaging Deleterious Medium Не активен
p.V272E Probably damaging Deleterious High Не активен
p.A276V Probably damaging Deleterious Medium Не активен
p.G293R Benign Neutral Medium Незначительно снижена
Функциональный анализ выявленных миссенс мутаций гена ТР53
p.W146Rp.T155I
Согласно прогнозу TP53 Mut_ass (release 1.00, 2012), сеймсенс мутация р.A307A
находится в сайте сплайсинга молекулы РНК.
7. Распределение мутаций в интронных и кодирующих участках гена ТР53
Анализ статуса метилирования промотора
и потери гетерозиготности в гене ТР53
Частота метилирования промотора гена ТР53 в группе обследования составила 5,8%
и значимо не различалась (р>0,5) в подгруппах с мутантной и нормальной структурой
гена (4,2% против 6,7%, соответственно) и данных Amara K. et al. (3,7%)*.
Частота ПГ в гене ТР53 составила 25%. В ходе секвенирования у этих больных были
выявлены мутации в 5-8 экзонах и интронах гена ТР53.
В единственном случае ПГ у больного ДВККЛ без мутаций в ТР53 обнаружено
метилирование промотора гена.
* K. Amara, M. Trimeche, S. Ziadi, A. Laatiri, M. Hachana, B. Sriha, M. Mokni, S. Korbi. Presence of simian virus 40 DNA sequences in diffuse large B-cell lymphomas in Tunisia
correlates with aberrant promoter hypermethylation of multiple tumor suppressor genes. // Int. J. Cancer: 121, 2693–2702 (2007).
9. ВЫВОДЫ
1. Полученные результаты свидетельствуют о функциональной селекции при
ДВККЛ мутации в 5-8 экзонах TP53, кодирующих ДНК-связывающий регион
гена.
2. Локализация «горячих точек» мутаций в обследованной выборке пациентов
с ДВККЛ отличалась от данных, представленных в IARC TP53 mutation
database.
3. Спектр однонуклеотидных замен в гене ТР53 в группе обследования
соответствовал спектру, описанному при ДВККЛ в IARC TP53 mutation
database.
4. Показано, наличие при ДВККЛ патогенетически значимых интронных и
сеймсенс замен, что свидетельствует о важности как анализа прилегающих к
экзонам некодирующих участков гена, так и биоинформационного анализа
выявленных синонимичных мутаций.
5. Комплексный анализ статуса ТР53 дает большее представление о
возможных механизмах участия изменчивости данного гена в патогенезе
ДВККЛ. Показано, что дефицит ТР53 при ДВККЛ может формироваться по
«двух-ударному» принципу.