Repàs a les diferents tècniques de recollida de mostres biològiques. Medis de cultiu i transport.

1. 26 Febrer 2019
Albert Bernet Sanchez
Metge adjunt de Microbiologia.
Hospital Universitari Arnau de Vilanova
Recollida de mostres
biològiques: com i per a què?

2. . La interpretació dels resultats microbiològics depèn de la qualitat de les
mostres rebudes per al seu estudi.
. El síndrome clínic i els possibles agents etiològics implicats condicionen:
- el tipus de mostra a enviar
- la forma de obtenir la mostra
- el contenidor de la mostra
Consideracions generals

3. . Molt important especificar el
motiu de la petició i/o el
diagnòstic per interpretar
correctament els resultats
Consideracions generals

4. . Obtindre les mostres en la fase aguda de la malaltia, preferiblement
abans d’iniciar tractament antimicrobià.
. Recollir: - amb les màximes condicions d'asèpsia
- del lloc exacte de la lesió: la zona més purulenta
- evitant el contacte amb antisèptics
- evitant contaminacions amb microbiota comensal
. Mostres molt ben identificades i amb seu volant (3%)
Consideracions generals

5. Tub Universal Viral transport
(Chlamydia, Mycoplasma, Ureaplasma)
amb medi de transport
Tap vermell
Tub amb medi de transport Amies
Tap blau

6. Tècniques de PCR
Escovilló en un tub amb medi de
transport per a garantir la
supervivència dels microorganismes
Contenidors/envasos de transport de mostres
Cultiu microbiològic convencional
Escovillons en un tub amb medi de
transport per frenar el creixement
bacterià

7. Important distingir entre:
- diagnòstic per tècniques de PCR:
. virus
. bacteris no cultivables o de creixement difícil
. aquells en els que volem un augment de sensibilitat o rapidesa
- diagnòstic per cultiu microbiològic convencional:
. permet fer ANTIBIOGRAMA
Contenidors/envasos de transport de mostres
VIRUS
BACTERIS

8. . Estèrils
. Tancament a proba de fugues
. Enviar el més ràpidament possible al laboratori de Microbiologia.
Mentrestant conservar en:
- FRED:
. la majoria de mostres bacterianes
. TOTES les mostres amb detecció per PCR
Contenidors/envasos de transport de mostres

9. Contenidor Conservació
Biologia molecular
(PCR)
Nevera
Cultiu
Nevera
(excepte mostres genitals i
conjuntivals)

10. Mostres que s’han de conservar a TEMPERATURA AMBIENT:
Contenidors/envasos de transport de mostres
. Paràsits en femta
. Cultiu dermatòfits
. Exsudat conjuntival
. Mostres genitals per a cultiu bacterià
. Exsudat faringi per a cultiu bacterià en cas de sospita de ITS
. LCR
. Hemocultius

11. Orina: tubs específics
- Tub tap BLANC (sense conservant):
. Per a tira bioquímica i sediment
- Tub tap BLAU (conservant: àcid bòric):
. Per a cultiu d’orina
Conservar en nevera

12. Orina: Schistosoma spp
- Primera orina del matí post-exercici (pujar
escales, córrer...)
- Ideal: orina de 24 hores (augmentar la
sensibilitat)
Conservar en nevera

13. Femta: en pot estèril
. Estudi bacteriològic: NO en femtes sòlides
. Estudi de virus intestinals: NO en femtes sòlides
. Estudi C.difficile: NO en femtes sòlides
. Estudi H.pylori
Conservar en nevera

14. . Estudi bacteriològic: NO en femtes sòlides
- Salmonella enterocolitica
- Yersinia enterocolitica
- Shigella spp
- Campylobacter spp
- Aeromonas spp
- E.coli enteropatogènics (O157:H7)
Femta en pot estèril

15. Astrovirus
Sapovirus
Rotavirus A
Norovirus (GG1,GG2)
Adenovirus
. Estudi de virus intestinals: NO en femtes sòlides
Femta en pot estèril

16. Femta en pot estèril
. Estudi C.difficile:
- NO en femtes sòlides
- MAI en menors 1 any
- indicat si ha pres antibiòtics
. Estudi H.pylori:
- demanar sempre amb sospita clínica indicant-ho a la petició
- evitar la frase “estudi bàsic de salut”

17. Femta per detecció de paràsits
Enviar almenys 3 mostres en
dies alterns.
Enroscar bé el tub (molt cops
venen oberts)
Conservar a
temperatura
ambient

18. Recomanacions recollida de mostra:
. 3 dies abans de la recollida de femta ha de suprimir-se:
- Medicaments que continguin carbó vegetal, sals de bismut, magnesi, caolin
- Productes de control radiològic (papilla de bari), tant via oral com enemes
- Antiàcids
- Substàncies greixoses, sobretot laxants i supositoris
- Llegums seques, llegums verdes
- Fruita de cutícula resistent (tomàquets, préssecs, albercocs)
- Fruita de grans nombrosos petits i durs (maduixes, figues i peres)
- Pa integral
- Pol·len
Femta per detecció de paràsits

19. Paràsits: formes adultes
Conservar a
temperatura
ambient
Pot estèril
Amb suero fisiològic

20. Test de Graham
Tècnica d’elecció per al diagnòstic de Enterobius vermicularis
Procediment: anar amb molt de compte i rentar-se molt bé les
mans i ungles. Aquest paràsit és molt infecciós.
1. Aplicar cinta de celo transparent al marge anal a primera
hora del matí (la femella del cuc surt al anus a posar els ous per la nit)
2. Desenganxar el celo i enganxar-lo en un portaobjectes
3. Col·locar el portaobjectes en un pot estèril estàndard de
transport de mostres biològiques

21. Test de Graham
Tècnica d’elecció per al diagnòstic de Enterobius vermicularis
Conservar a temperatura ambient

22. Mostra Indicacions Contenidor Conservació
Orina
Sediment Nevera
Cultiu Nevera
Schistosoma spp Nevera
Femta
Cultiu bacteris
Detecció virus
C.difficile
H.pylori
Altres PCR
Nevera
Paràsits/formes
adultes
Temperatura ambient
Graham Paràsit Temperatura ambient

23. Mostres per a detecció ITS/genitals
Mostres genitals: ENVIAR ELS 2 TIPUS DE CONTENIDOR
. PCR: augment sensibilitat i patògens no cultivables : nevera
. Cultiu: important per l’antibiograma: temperatura ambient
Exsudat faringi:
. ITS per a PCR: nevera
. ITS per a cultiu: temperatura ambient
. Detecció S.pyogenes: transport bacteris: nevera

24. Mostres per a detecció ITS/genitals
PCR múltiple
Es detecta material genètic dels següents microorganismes en 2 reaccions i
peticions diferents:
Panell ITS
Virus herpes simple 1
Virus herpes simple 2
Virus varicela zoster
Citomegalovirus
Limfogranuloma veneri (CT servar L)
Treponema pallidum
Haemophilus ducreyi
Panell úlceres genitals
Chlamydia trachomatis
Neisseria gonorrhoeae
Trichomonas vaginalis
Mycoplasma genitalium
Mycoplasma hominis
Ureaplasma urealyticum
Ureaplama parvum

25. Mostres per a detecció de virus respiratoris
1 sola mostra !!!!
PCR múltiple
. Grip, VRS
. Resta de virus respiratoris
. Bacteris pneumònia atípica
. Bordetella pertussis i B.parapertussis
Exsudat/aspirat nasofaringi
. Un escovilló: nasal
. Un escovilló faringi
. Important rascar bé per agafar cèl·lules epitelials
. Agitar una mica el tub
Conservar en nevera

26. Grip A
Grip B
VRS
Adenovirus
Bocavirus
Rinovirus
Virus parainfluenza (1,2,3,4)
Coronavirus (OC43,NL63,229E,Orf1a,HKU,MERS)
Parechovirus
Enterovirus
Metaneumovirus
Grip A
Grip B
VRS
PCR múltiple URGENT
RutinaPCR múltiple
Mostres per a detecció de virus respiratoris
1 sola mostra !!!!

27. PCR múltiple
Coxiella burnetii
Mycoplasma pneumoniae
Chlamydia pneumoniae
Chlamydia psittaci
Bordetella pertussis
Bordetella parapertussis
Mostres per a detecció de bacteris respiratoris
Amb la mateixa
mostra que els
virus respiratoris
Atípics
Bacteris convencionals
(S.pneumoniae, H.influenze,
M.catarrhalis...)
Gram
Cultiu
Antibiograma
Conservar
en nevera
Conservar
en nevera

28. Mostra Indicacions Contenidor Conservació
ITS
(genitals i
faringis)
PCR Nevera
Cultiu Temperatura ambient
Exsudat faringi
Detecció
S.pyogenes
Nevera
Virus
respiratoris
Bordetella spp
PCR Nevera
Bacteris
respiratoris
Atípics: PCR Nevera
Típics: cultiu Nevera

29. Lesions cutànies
Infecció vírica
Cultiu
Antibiograma
Infecció bacteriana
Infecció per llevats
Virus herpes simple 1
Virus herpes simple 2
Virus varicela zoster
Infecció fúngica
(excepte Candida sp)
Conservar
en nevera
Conservar
en nevera
Conservar a
temperatura
ambient

30. . Anar amb molt de compte i sempre fer servir sempre
guants: els dermatòfits son microorganismes molt
contagiosos
. Recollir la mostra sempre amb un pot estèril a sota per
tal d’anar recollint totes les escames que van caient.
Estudi fongs: dermatòfits i altres
Conservar a
temperatura
ambient

31. . Raspat de pell:
- raspar amb un bisturí o si no és possible
amb la cantonada d’un portaobjectes
- enviar al laboratori en un pot estèril
. Ungles:
- raspar amb un bisturí i/o retallar un tros i
enviar al laboratori en un pot estèril
. Cabells:
- enviar al laboratori en un pot estèril
Estudi fongs: dermatòfits i altres

32. Resta de mostres: pot estèril
. Esput, biòpsies, resta de mostres
en general...
Conservar
en nevera

33. Líquids estèrils: tub estèril
. Líquids estèrils en general:
. LCR
. pleural
. articular...
Intentar evitar
(transport)
Conservar
en nevera
LCR i mostres
oculars: conservar a
temperatura ambient

34. Escherichia coli
Streptoccus agalactiae
Listeria monocytogenes
N.meningitidis
Streptococcus pneumoniae
Coriomeningitis limfocitària
Toscana
West Nile
Haemophilus influenzae
Virus herpes simple 1
Virus herpes simple 2
Virus varicela zòster
Citomegalovirus
Epstein-barr
Virus herpes 6
Enterovirus
Parechovirus
Parvovirus B19
Toxoplasma gondii
Mycobacterium tuberculosis
Líquids estèrils: tub estèril

35. VIH
VHB
VHC
Citomegalovirus
Epstein-barr
Virus herpes 6
Plasmodium spp
Dengue
Chikungunya
Zika
Leishmania donovani
Toxoplasma gondii
Mostres de sang: tub EDTA (anticoagulant)
Parvovirus B19Conservar
en nevera
Hemocultius:
conservar a
temperatura
ambient

36. Mostra Indicacions Contenidor Conservació
Lesions
cutànies
Infecció vírica Nevera
Infecció bacteriana
Infecció llevats
Nevera
Infecció fúngica
(excepte càndida)
Temperatura ambient
Resta de
mostres
Cultiu bacterià o
PCR
Nevera
Líquids estèrils
Cultiu bacterià o
PCR
Nevera
Cultiu LCR
Cultiu mostres
oculars
Temperatura ambient
Sang
EDTA Nevera
Hemocultiu Temperatura ambient

37. Resum

38. Mostres que s’han de conservar a TEMPERATURA AMBIENT:
Contenidors/envasos de transport de mostres
. Paràsits en femta
. Cultiu dermatòfits
. Exsudat conjuntival
. Mostres genitals per a cultiu bacterià
. Exsudat faringi per a cultiu bacterià en cas de sospita de ITS
. LCR
. Hemocultius

39. Mostra Indicacions Contenidor Conservació
Orina
Sediment Nevera
Cultiu Nevera
Schistosoma spp Nevera
Femta
Cultiu bacteris
Detecció virus
C.difficile
H.pylori
Altres PCR
Nevera
Paràsits/formes
adultes
Temperatura ambient
Graham Paràsit Temperatura ambient

40. Mostra Indicacions Contenidor Conservació
ITS
(genitals i
faringis)
PCR Nevera
Cultiu Temperatura ambient
Exsudat faringi
Detecció
S.pyogenes
Nevera
Virus
respiratoris
Bordetella spp
PCR Nevera
Bacteris
respiratoris
Atípics: PCR Nevera
Típics: cultiu Nevera

41. Mostra Indicacions Contenidor Conservació
Lesions
cutànies
Infecció vírica Nevera
Infecció bacteriana
Infecció llevats
Nevera
Infecció fúngica
(excepte càndida)
Temperatura ambient
Resta de
mostres
Cultiu bacterià o
PCR
Nevera
Líquids estèrils
Cultiu bacterià o
PCR
Nevera
Cultiu LCR
Cultiu mostres
oculars
Temperatura ambient
Sang
EDTA Nevera
Hemocultiu Temperatura ambient

42. abernet.lleida.ics@gencat.cat