Mikroorganisme tanah memiliki peran penting dalam menjaga kesuburan tanah melalui siklus energi, siklus hara, dan pembentukan agregat tanah. Keberadaan berbagai spesies mikrob yang berinteraksi dalam tanah mendukung proses perombakan bahan organik menjadi nutrisi yang diperlukan tumbuhan. Dinamika populasi mikroba dipengaruhi oleh kondisi fisik dan kimia tanah, di mana perubahan lingkungan dapat menentukan jenis mikroba yang dominan.