loeng

1. О роли Эстонского Генного
фонда и внедрении
персональной медицины в
Эстонии
Neeme Tõnisson MD, PhD

2. Персональная медицина
Реактивный Проактивный
Personalised
Participatory
Predictive
Preventive
Patients
Professionals
Payers
Policians
- Медицина всегда была персональной – врач лечит
конкретного пациента
- Использование как наследственной, так и тканевой
генетеческой информации для предотвращения и
лечения заболеваний

3. 200 000 генных карт к 2020
G

4. 
Гены Среда образ жизни…Возраст
 Возраст

haigus
 
Уровень рисков заболеваний
состоит из разных компонентов…
Автор: Проф. Криста Фишер

5. Генетический риск разнится
у людейГенетический риск
vs 
Люди с более высоким
генетическим риском,
зачастую, заболевают
в более молодом
возрасте. Факторы
риска, связанные с
образом жизни, ведут к
еще более быстрому
проявлению болезни.
Автор: Проф. Криста Фишер

6. Частота генетицеских вариантов в
сравнений с их ефектом на заболеваний
Mark I, et al. Nat Rev Genet 9, 356-369 (2008)
doi:10.1038/nrg2344

7. Семейная гиперхолестеринемия
(FH)
Nordestgaard BG, et al. European Heart Journal (2013)
34, 3478–3490

8. Khera AV, et al. J Am Coll
Cardiol. 2016
Семейная гиперхолестеринемия vs полигенная дислипидемия
<3.5
mmol/
L
≥5.7
mmol/
L

9. Характеристики участников
исследования
Alver M, Genet Med 2018 Oct 1
• Носители 20 FH-связанных
вариантов (49%) показали
субклинический атеросклероз
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
0 2 4 6 8 10 12
LDL mmol/L
density
FH mutation
no
yes
Statin-corrected values

10. Клиническое исследование
Alver M, Genet Med 2018 Oct 1

11. 11
Kuchenbaecker KB, et al. JAMA 2017
20.10.2017
Кумулятивный риск развития
рака груди и яичников

12. 12
Пример генеалогического древа при наличии мутации
по женской линии
• Стрелочками указаны индивиды, у которых на время
консультации было известно наличие BRCA1 мутации
59
28 2231
35
õnnetus
38
62
75
35
64
85
55
22
geenidoonori
põlvkond
vanemad
vanavanemad
naine mees
60
rinnavähk 45
rinnavähk teises
rinnas 52
munasarjavähk 45
surnud 48
soovitav konsultatsioon,
BRCA1 mutatsioonanalüüs

13. 13
Пример генеалогического древа при наличии мутации
по мужской линии
• Ainult noolekesega märgitud isikul on nõustamise hetkel teada BRCA1
mutatsioon
60
28 2231
35
õnnetus
38
munasarjavähk 42-a
surnud 46-a
62
75
35
64
88 rinnavähk 47
surnud 50
55
22
geenidoonori
põlvkond
vanemad
vanavanemad
naine mees
soovitav konsultatsioon,
BRCA1 mutatsioonanalüüs

14. График распределения женщин по возрасту в
группе с мутациями, связанными с риском
развития рака груди
14

15. Генетические мутации, связанные с
риском развития рака груди, 56 женщин
• BRCA1 (18, 32,7%)
• BRCA2 (14, 25,5%)
• CHEK2 (14, 25,5%)
• NBN (2, 3,6%)
• NF1 (1, 1,8%)
• TP53 (0, 0,0%)
• STK11 (0, 0,0%)
• PTEN (0, 0,0%)
• CDH1 (0, 0,0%)
• ATM (6, 10,9%)
• PALB2 (0, 0,0%)

16. Ранние случаи рака, 56 генных доноров
Gene Cancer dgn Dgn year Age when cancer dgn
BRCA2 Malignant neoplasm of breast (C50) 2008 61
BRCA1 Malignant neoplasm of breast (C50) 2014 62
BRCA1 Malignant neoplasm of breast (C50) 1986 36
BRCA1 Malignant neoplasm of breast (C50) 2014 54
CHEK2
Malignant neoplasm of upper-outer quadrant of
breast (C50.4) 2013 40
BRCA1 Malignant neoplasm of ovary (C56) 2002 51
BRCA1
Malignant neoplasm of kidney, except renal pelvis
(C64) 2000 47
BRCA1 Malignant neoplasm of ovary (C56) 2018 60
CHEK2
Malignant neoplasm overlapping major salivary
gland site (C08.8) 2012 60
5 ранних случаев рака груди; 3/5 <50 лет, 2/5 >50 лет
16

17. Предварительная генетическая
консультация, индивид или семья
Да (5, 9.6%),
Нет (47, 90.4%)

18. Полигенная шкала рисков
• Каждого единичного варианта влияние очень
маленькое
• При суммировании всех вариантов получается
шкала рисков
Teist tüüpi diabeedi riskiskoori jaotus
geenidoonoritel
Riskiskoor
Frequency
3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5
050010001500
Kõrge geneetilise
riskiga indiviidid
Dr Krista Fischer, Dr Aet Saar,
Kristi Läll, Maris Alver

19. 2005

20. 2010

21. На данный момент...

22. Khera AV et al. Nature Genetics vol 50, pages1219–1224 (2018)
Полигенная
шкала рисков –
уровень рисков
зависящий от
процентиля

23. KardioKompassi®
интерактивный компас риск развития сердечно-
сосудистых заболеваний
Разработчик: FIMM, Университет Хельсинки
Интерактивные
переменные
позволяют
следить за
изменением
рисков в
реальном
времени
ССЗ
личностная
оценка рисков
ССЗ
изменение
риска
заболевания
по времени
популяционный
риск ССЗ
elisabeth.widen@helsinki.f
i

24. Полигенная шкала рисков рака груди
Prof Krista Fischer, Kristi Läll

25. В ходе проекта диагностированные
случаи рака груди, 334 женщин с
высоким полигенным риском
4 случая - St IA (2), IB (1), IIA (1)
1 1 2 3 4

26. Prevalence in biobank
2017 Mar;19(3):322-329.

27. ТУ ЭГФ пример рапорта по
диабету 2 типа

28. ТУ ЭГФ пример рапорта по
диабету 2 типа

29. Значимость фармакогенетики
98% европейцев имеют ≥ 1
фармакогенетически значимой мутации
Фармакогенетическое
исследование
ADR
diagnoses
Drug
prescriptions
WGS +
genome-wide
genotyping
Kristi Krebs, Tõnis Tasa,
Mattis Jaama, Pauliine Ranne

30. Фармакогенетика
Одна из причин почему люди по-разному реагируют на лекарства – различные
варианты в их генах, которые необходимы для усвоения лекарства в организме.
На сегодняшний день найдены многочисленные генетические маркеры,
связанные с определенными лекарствами. В данной таблице показаны 6 генных
маркеров, которые влияют на усваиваемость 16 различных лекарств.

31. Антидепрессанты и побочные эффекты
• 33-л женщина с
диагностированной
депрессией
• CYP2C19 медленный
метаболайзер, снижение
дозы до 50% от
реккомендуемой
• Sertralin и escitalopram были
выписаны ранее
• Оба отменены, из-за
побочных эффектов –
возбуждение, агрессивность,
фарингит, и пр.
31

32. Что будет дальше?
• Новые исследования и продолжение старых,
• Проспективный сбор данных здоровья
• Улучшение модели рисков
• Организация постоянного процесса передачи данных в
систему Э-здоровья (E-Tervis)
• Открытие медицинского портала и своевременное
информироание

33. TÜ Eesti Geenivaramu
koostööpartnerid
Geenidoonorid,
pere- ja eriarstid… ja paljud teised