5. Variazione Antigenica in T. brucei African trypanosome -- sleeping sickness Ha diverse caratteristiche -- variazione antigenica trans-splicing RNA policistronici (eukaryote) RNA editing DNA -- 20 cromosomi (100 - 1000 kb) >100 mini cromosomi (50 - 150 kb)
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9. Variazione Antigenica Semi-programmata in T. brucei Tsetse fly Rabbit 1: A B C D E etc. Rabbit 2: A B D E etc. Non si conosco i meccanismi di questi controlli………….. passage
10. Glicoproteine variabili di superfici Coprono completamente la forma del sangue di Tryp (10 7 /cell). ad eccezione della parte basale del flagello. Glycolipid anchor (rilasciata dalla fosfolipasi C). VSG protein -- ~450 amino acidi C-term è più conservato (non esposto) N-term la seq altamente variabile Le strutture 3-D sono molto simili fra loro Almeno 1000 geni VSG sono presenti nel genoma Viene espresso un gene alla volta
11. VSG locus types in T. brucei Horn and Barry. 2205. Chrom. Res. 13:525
12. Siti di Espressione VSG Circa 20 siti di espressione per genoma Sono tutti vicini ai telomeri E’ espresso un solo sito alla volta 50 bp repeats 70 bp repeats Expression site associated genes (ESAGs) VSG Telomeric repeats 40 - 60 kb
13. Meccanismi di VSG Gene Switching 1 . Trasposizione Duplicativa da un VSG telomerico viene sostituito il vecchio gene ( cassette mechanism ) 5’ end della trasposizione- 70 bp repeats poche copie al sito donatore 100aia di copie al sito di espressione 3’ end of della trasposizione- - VSGs simili a C-terminus 3’ regioni non tradotte repeats telomerici
14. Meccanismi di VSG Gene Switching 2. Conversione Telomerica-- l’intera parte terminale del cromosoma viene convertita non necessita dei repeats di 70 bp 3. Scambio reciproco di telomeri (tra VSG e promotere) 4. In situ switch - il vecchio sito di espressione viene spento un nuovo sito viene attivato
15. Expression Sites and ESAGs 20 different expression sites. Different alleles at different expression sites. All transcribed at the same rate BUT mRNAs differ greatly (VSG = 10% of all mRNA). 2 ESAGs - transferrin receptor (flagellar pocket) 1 ESAG - adenylate cyclase other ESAGS -- also expressed in the flagellar pocket? 50 bp repeats 70 bp repeats Expression site associated genes (ESAGs) VSG Telomeric repeats 40 - 60 kb
![Tripanosomi & Sleeping Sickness ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)