وهو التدقيق الذي يقوم به مدقق داخلي بهدف تقديم تطوير خدمات الأداء من خلال التأكد من الكفاءة التي يعمل بها النظام المحاسبي، ومدى دقة البيانات، لذا يعتبر التدقيق المحاسبي أحد فروع الرقابة الداخلية، وأداة فاعلة تمد الإدارة بالمعلومات المستمرة بهدف اكتشاف الأخطاء والتلاعب والانحراف عن الخطة المحددة.
استطاع التدقيق الداخلي أن يحد من الخسائر الكبيرة التي كانت تواجه المؤسسات العالمية نتيجة لسوء الإدارة والاحتيال والفساد حيث استطاع إبراز الضعف في نظم الرقابة الداخلية، وكشف مواضع الخلل في النظام الإداري، وعمل على تحسين إدارة المخاطر بفاعلية وكفاءة، بالرغم من أن إدارة التدقيق الداخلي ليست من الإدارات ذات العائد المادي، لكنها أصبحت جزءاً مهماً مكملاً للهيكل الإداري التنظيمي، بل أصبحت من أهم الإدارات في المؤسسات.