Handling Spesimen COVID-19

1. Penatalaksanaan
Spesimen
dan Pemeriksaan
COVID-19
Disampaikan pada :
Pertemuan RS Rujukan Jateng - Bersama Hadapi COVID-19
Semarang, 4 Maret 2020
BALAI LABORATORIUM KESEHATAN DAN PENGUJIAN ALAT KESEHATAN JAWA TENGAH

2. The Quality Assurance Cycle
Sumber : Laboratory Quality Management System Handbook, WHO, 2011
2

3. Proporsi Kesalahan Pemeriksaan
Laboratorium

4. Alur kegiatan di laboratorium
• Dinas Kesehatan / RS
• Nasofaring / Orofaring /BAL
• Sputum
Penerimaan
spesimen
Pemeriksaan
spesimen
• Terfokus untuk Molekuler saja
• Merujuk pada petunjuk WHO
Pelaporan

5. Definisi Kasus
5

6. Definisi Kasus
6

7. Samples to be collected (see Table 1 for details on sample
collection and storage):
Laboratorytestingfor2019novelcoronavirus
1. Respiratory material" (nasopharyngeal and
oropharyngeal swab in ambulatory patients and
sputum (ifproduced) and/or endotracheal aspirate
or bronchoalveolar lavage in patients with more
severe respiratory disease)
Serum for serological testing, acute sample and
convalescent sample (this is additional to
respiratory materials and can support the
identification of the true agent, once serologic
assay is available)
(2019-nCoV)
Interimguidance
17January2020
in susoectedhuman
(. World Health i
cases
?I Organzation
WH0/2019-
nCoV/laboratory/2020.3 2.
•Modifiable with information on whether upper or lower
respiratory material is better for coronavirus detection.
Reference 2, 3, 7
A single negative test result, particularly ifthis isfrom an
upper respiratory tract specimen, does not exclude infection.
Repeat sampling and testing, lower respiratory specimen is
strongly recommended in severe orprogressive disease. A
positive alternate pathogen does not necessarily rule out
either, as little is yet known about the role ofcoinfections.

8. Jenis Spesimen
8
Jenis Spesimen Bahan Suhu Penyimpanan Keterangan
Pengambilan Pengiri
man
Usap Nasopharing
atau Orofaring
Sputum
Bronchoalveolar
Lavage
Swab Dacron atau 4oC ≤5 hari: 4 °C Kedua Swab harus WAJIB
Flocked Swab + >5 hari: -70 °C ditempatkan di DIAMBIL
Virus Transport tabung yang sama
Medium (VTM) untuk
meningkatkan viral
load.
Kontainer Steril 4oC ≤48 jam: 4 °C Pastikan Sputum WAJIB
>48 jam: –70 berasal dari DIAMBIL
°C Saluran Pernafasan
bawah (BUKAN air
liur)
Kontainer Steril 4oC ≤48 jam: 4 °C
>48 jam: –70
°C

9. 9
Jenis Spesimen Bahan Suhu Penyimpan Keterangan
Pengambilan Pengirima an
n
Tracheal aspirate,
nasopharyngeal
aspirate atau
nasal wash
Jaringan biopsi
atau autopsi
termasuk dari
paru-paru.
Serum (2 sampel
yaitu akut dan
konvalesen)
UNTUK SEROLOGI
Kontainer Steril 4oC ≤48 jam: 4
°C
>48 jam: –
70 °C
Kontainer Steril 4oC ≤24 jam: 4
+ Saline °C
>24 jam: –
70 °C
Serum 4oC ≤5 hari: 4 °C Pengambilan 2
separator >5 hari: -70 Sampel :
tubes (Dewasa °C • Akut –
3-5 ml whole minggu
Blood) pertama saat
sakit
• Konvalesen –
2 s.d. 3 minggu
setelahnya

10. Persiapan Pengambilan
Spesimen COVID-19
1.
2.
3.
Dokumen : Formulir Form COVID-19
Peralatan Pelindung diri (APD)
Peralatan Pengiriman Spesimen Saluran Pernapasan
a. Virus Transport Media (VTM)
Dapat digunakan dengan beberapa merk komersil yang sudah siap
pakai atau dengan mencampur beberapa bahan (Hanks BBS;
Antifungal dan Antibiotik dengan komposisi tertentu) untuk
disatukan dalam 1 wadah steril.
Swab Dacron atau Flocked Swab
Tongue Spatel
Kontainer Steril untuk Sputum
Parafilm
Plastik Klip
Marker atau Label
b.
c.
d.
e.
f.
g.

11. VTM (Viral Transport Medium)
•
•
•
•
•
•
Steril
Larutan Isotonik
Mengandung Protein
Mengandung Antibiotik
Buffer pH
Indikator (Phenol Red)*
Contoh VTM :
Hanks Balanced Salt Solution (HBSS), Virocult, MEM, UTM, dll

12. VTM (Virus Transport Medium)
• Disimpan dalam Freezer -20oC
(dalam kondisi beku, VTM
berwarna kuning = normal)
Jika akan digunakan Dicairkan
terlebih dahulu
Hindari Beku-Cair (Frezze-Thaw)
 VTM Rusak
•
•
VTM dalam keadaan Beku

13. Virus Transport Medium
Masih Bisa digunakan Tidak Bisa digunakan

14. Alat/Bahan Pengambilan Spesimen
Swab Dacron/Rayon

15. Tahap Pengambilan Nasofaring (1)
1. Persiapkan cryotube yang berisi 1,5 ml media transport virus (Hanks
BSS + Antibiotika), dapat juga digunakan VTM komersil yang siap pakai
(Pabrikan).
Berikan label yang berisi Nama Pasien dan Kode Nomer Spesimen. Jika
label bernomer tidak tersedia maka Penamaan menggunakan
Marker/Pulpen pada bagian berwarna putih di dinding cryotube.
Gunakan swab yang terbuat dari Dacron/rayon steril dengan tangkai
plastic atau jenis Flocked Swab (tangkai lebih lentur). Jangan
menggunakan swab kapas atau swab yang mengandung Calcium
2.
3.
Alginat atau Swab kapas dengan tangkai kayu, karena dapat
menghambat proses pemeriksaan secara molekuler.
4.
5.
Pastikan tidak ada Obstruksi (hambatan pada lubang hidung).
Masukkan secara perlahan swab ke dalam hidung, pastikan posisi swab
pada septum bawah hidung.
Masukkan swab secara perlahan-lahan ke bagian nasofaring.
6.

16. Tahap Pengambilan Nasofaring (2)

17. Tahap Pengambilan Nasofaring (3)
7.
8.
Swab kemudian dilakukan gerak memutar secara perlahan.
Kemudian masukkan sesegera mungkin ke dalam cryotube yang
berisi VTM
Putuskan tangkai plastik di daerah mulut cryotube agar cryotube
dapat ditutup dengan rapat.
9.

18. Tahap Pengambilan Nasofaring (4)
10. Pastikan label kode spesimen sesuai dengan kode yang ada di
formulir/Kuesioner.
Cryotube kemudian dililit parafilm dan masukkan ke dalam Plastik
Klip. Jika ada lebih dari 1 pasien, maka Plastik Klip
dibedakan/terpisah. Untuk menghindari kontaminasi silang.
Simpan pada suhu 4-8 ° C sebelum dikirim. Jangan dibekukan
dalam Freezer.
11.
12.

19. Pengambilan Spesimen Usap Orofaring
1.
2.
Gunakan APD sesuai standar
Persiapkan cryotube yang berisi 1,5 ml media
transport virus
Gunakan swab yang terbuat dari Dacron/rayon
steril dengan tangkai plastik.
Lakukan usap pada belakang tonsil dan hindarkan
swab menyentuh bagian lidah.
3.
4.

20. Pengambilan spesimen Usap Orofaring

21. Pengambilan Spesimen Usap Orofaring
5. Kemudian masukkan swab orofaring sesegera mungkin ke
dalam cryotube yang berisi virus transport medium.
Putuskan tangkai plastik di daerah mulut cryotube agar
cryotube dapat ditutup dengan rapat.
6.

22. Pengambilan Spesimen Usap Orofaring
7.
8.
Cryotube kemudian dililit parafilm.
Cryotube yang sudah berisi swab dibungkus dalam tisu bersih lalu
dimasukan ke dalam plastik klip.
9. Simpan dalam suhu 4-8°C sebelum
dalam Freezer.
dikirim. Jangan dibekukan

23. Spesimen swab saluran napas
Vial
Usap Nasofaring
Usap Orofaring

24. Pengambilan Spesimen Sputum
1.
2.
3.
Container steril spesimen
Plastik Klip atau Plastik pembungkus container
Sputum di tampung dalam container Steril