Активный центр ферментов
При изучении механизма химической реакции, катализируемой ферментами, исследователя всегда интересует не только определение промежуточных и конечных продуктов и выяснение отдельных стадий реакции, но и природа техфункциональных групп в молекуле фермента, которые обеспечивают специфичность действия фермента на данныйсубстрат (субстраты) и высокую каталитическую активность. Речь идет, следовательно, о точном знании геометрии и третичной структуры фермента, а также химической природы того участка (участков) молекулы фермента, который обеспечивает высокую скорость каталитической реакции. Участвующие в ферментативных реакциях молекулысубстратов часто имеют небольшие размеры по сравнению с молекулами ферментов, поэтому было высказано предположение, что при образовании фермент-субстратных комплексов в непосредственный контакт с молекулойсубстрата, очевидно, вступает ограниченная часть аминокислот пептидной цепи. Отсюда возникло представление об активном центре фермента. Под активным центром подразумевают уникальную комбинацию аминокислотных остатков в молекуле фермента, обеспечивающую непосредственное связывание ее с молекулой субстрата и прямое участие в акте катализа . Установлено, что у сложных ферментов в состав активного центра входят также простетические группы.
Ферменты.Структура активного центрав ферментах – присоединение субстрата к ферменту в активном центре. Б – положение аминокислотных остатков, формирующих активный центр фермента в первичной структуре белка.
В – активный центр фермента условно разделяется на участок связывания и каталитический участок. Участок связывания представлен радикалами аминокислот, функциональные группы которых обеспечивают связывание субстрата. Каталитический участок образован радикалами аминокислотных остатков, функциональные группы которых обеспечивают химические превращения субстрата
Ферменты.Структура активного центрав ферментах – присоединение субстрата к ферменту в активном центре. Б – положение аминокислотных остатков, формирующих активный центр фермента в первичной структуре белка.
В – активный центр фермента условно разделяется на участок связывания и каталитический участок. Участок связывания представлен радикалами аминокислот, функциональные группы которых обеспечивают связывание субстрата. Каталитический участок образован радикалами аминокислотных остатков, функциональные группы которых обеспечивают химические превращения субстрата
Новые радиофармпрепараты на основе 99mTc
с применением бифункциональных хелатирующих агентов
В настоящее время основным радионуклидом для приготовления радиофармпрепаратов (РФП) во
всем мире является 99mTc, обладающий оптимальными ядерно-физическими характеристиками и высо-
кой доступностью. Для введения этого радионуклида в биомолекулы (пептиды, антитела и др.) исполь-
зуется несколько подходов, один из которых связан с применением так называемых бифункциональных
хелатирующих агентов (БХА). Эти соединения способны как связывать 99mТс, так и присоединяться к
биомолекулам. Среди БХА на сегодняшний день наиболее часто используются ДТПА, MAG3 и HYNIC.
В обзоре содержится описание и сравнение этих соединений в качестве БХА, а также краткое описание
и сравнение наиболее часто применяемых пептидов, с которыми эти агенты используются. Обсуждают-
ся также литературные данные по выбору солиганда при использовании HYNIC.
Новые радиофармпрепараты на основе 99mTc
с применением бифункциональных хелатирующих агентов
В настоящее время основным радионуклидом для приготовления радиофармпрепаратов (РФП) во
всем мире является 99mTc, обладающий оптимальными ядерно-физическими характеристиками и высо-
кой доступностью. Для введения этого радионуклида в биомолекулы (пептиды, антитела и др.) исполь-
зуется несколько подходов, один из которых связан с применением так называемых бифункциональных
хелатирующих агентов (БХА). Эти соединения способны как связывать 99mТс, так и присоединяться к
биомолекулам. Среди БХА на сегодняшний день наиболее часто используются ДТПА, MAG3 и HYNIC.
В обзоре содержится описание и сравнение этих соединений в качестве БХА, а также краткое описание
и сравнение наиболее часто применяемых пептидов, с которыми эти агенты используются. Обсуждают-
ся также литературные данные по выбору солиганда при использовании HYNIC.
MACROMOLECULAR COMPOUNDS AND GELS. A manual for students and graduate students of biotechnology training and medical universities (in Russian) Authors: Belova EV, German KE, Afanasyev AV, Slyusar OI, Solodova EV
2018 History of technetium studies in Russia Anna KuzinaKonstantin German
Lecture is about the History of technetium studies in Russia and Anna Kuzina 100 anniversary of birthday
Technetium separation in milligram, gram and kilogram ammounts 1957 - 1993
Proceedings and selected lectures 10th intern symp technetium rheniumKonstantin German
Proceedings and selected lectures of the 10th International Symposium on Technetium and Rhenium – Science and Utilization, October 3-6, 2018 - Moscow – Russia, Eds: K. German, X. Gaona, M. Ozawa, Ya. Obruchnikova, E. Johnstone, A. Maruk, M. Chotkowski, I. Troshkina, A. Safonov. Moscow: Publishing House Granica, 2018, 518 p.
ISBN 978-5-9933-0132-7 December 2018
Aleksey Buryak. WELCOME ADDRESS FROM IPCE - RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES Andrey Romanov. WELCOME ADDRESS FROM THE MINISTRY OF SCIENCE AND HIGHER EDUCATION OF RUSSIAN FEDERATION Mikhail Igorevich Panasyuk. ANNA KUZINA: BIOGRAPHY. K.E. German. PROF. ANNA FEDOROVNA KUZINA – 100TH ANNIVERSARY OF BIRTHDAY T. Yoshimura, M. Seike, H. Ikeda, K. Nagata, A. Ito, E. Sakuda, N. Kitamura, A. Shinohara PHOTOLUMINESCENCE SWITCHING OF NITRIDORHENIUM(V) COMPLEXES B. Grambow, X. Gaona, W. Runde, R. Konings, A.V. Plyasunov, L. Rao, A.L. Smith, E. Moore, M.-E. Ragoussi, J. Martinez-Gonzalez, I. Grenthe. CHEMICAL THERMODYNAMICS OF TECHNETIUM IN THE OECD/NEA UPDATE VOLUME E.S. Kulikova, Zh.K. Majed, D.V. Drobot, E.I. Efremova. HIGHLY SELECTIVE CATALYSTS BASED ON BIMETALLIC RHENIUM-RUTHENIUM COMPLEXES OBTAINED BY ALKOXYTECHNOLOGY E.S. Kulikova, D.V. Drobot, E.I. Efremova. THE FIRST EXAMPLE OF BI AND THREEMETALLIC ALKOXIDES CONTAINING RHENIUM AND RUTHENIUM T. Matsuzaki, H. Sakurai. A NEW PRODUCTION METHOD OF 99Mo BY MUON NUCLEAR TRANSMUTATION N. Budantseva, G. Andreev, A. Fedoseev THE U(VI), NP(VI) AND PU(VI) COMPLEXES WITH TcO4-, ReO4-. THE DIFFICULTIES IN ASSIGNING OF AnO22+ GROUPS VIBRATIONAL FREQUENCIES. J.S. McCloy, C. Soderquist, J. Weaver, Jason Lonergan. SPECTROSCOPIC STUDIES OF ALKALI PERTECHNETATES
Молекулы белков лежат в основе почти всех биологических процессов. Ученым всегда были любопытны как белки, участвующие в метаболических путях, так и молекулярные основы их функционирования. Однако в эру системной биологии еще больше внимание уделяется полному пониманию работы всей совокупности белков организма, его протеома. Все более важно, что мы не только понимаем все стороны данной функции, или функций, какого-либо белка, но и то, что наше знание распространяется на все компоненты изучаемой системы или организма и так далеко, насколько это возможно. Без всестороннего анализа информации попытки синтеза и расчетов не смогут выйти за рамки приближенной реальности.
Книга "Структура и функционирование белков: Применение методов биоинформатики" представляет собой уникальный обзор современного состояния вопросов моделирования структуры белков и предсказания их функции. Книга написана ведущими специалистами в своей области, прекрасно иллюстрирована и содержит ссылки на доступные серверы и другие ресурсы, которые читатель, возможно, захочет использовать в своей научной работе. В конце каждой главы описываются перспективы развития и наиболее актуальные проблемы соответствующих областей науки.
Физико-химические методы исследования в медицине и биологии: Учебное пособие / Медицинский университет Реавиз. Москва, Издательство «Граница», 2016. 120 с.
Данное учебное пособие написано в соответствии с содержанием Государственных образо-вательных стандартов и программой дисциплины “Физико-химические методы анализа” по специальности “Медицина”, направлению и программой большого практикума (раздел “Физикохимические методы анализа”), который выполняется студентами по специальности “Биология”.
В нем изложены основы физико-химических методов анализа. Рассмотрены условия и области применения методов, их достоинства и недостатки, ограничения, перспективы развития и другие особенности и характеристики.
В конце каждой главы дано описание практических работ, приведены контрольные вопросы.
Предназначено для студентов-медиков, биологов, химиков, аспирантов, научных работников и учителей школ.
2016 rsc-advance-tc-c-qinggao wang - 6 pp 16197-16202Konstantin German
We analyze the formation of transition metal (TM) carbides, as determined by the strength of TM–TM and
TM–C bonds, as well as lattice distortions induced by C interstitials. With increasing filling of the d-band of
TMs, TM–C bonds become increasingly weak from the left of the periodic table to the right, with fewer and
fewer C atoms entering the TMs lattice. Technetium (Tc) turns out to be a critical point for the formation of
carbides, guiding us to resolve a long-standing dispute. The predicted Tc carbides, agreeing with measured
X-ray absorption spectra, should decompose to cubic Tc and graphite above 2000 K. Consequently, we
show that what has been claimed as TcC (with rocksalt structure) is actually a high-temperature cubic
phase of elemental technetium.
своевременная диагностика и терапия данного заболевания до сих пор являются нерешенной клинической задачей. По данным на 2011 г., заболе-
ваемость раком простаты в России составила 10,7% (40 тыс. первичных случаев) мужского населения, причем в 60% случаев заболевание диа-
гностировали на поздней (III–IV) стадии, когда неизбежен процесс активного роста и распространения метастазов. Методы анатомической
визуализации при диагностике данного заболевания имеют низкую чувствительность и специфичность. Методы метаболической визуализации,
использующие в качестве маркера простатспецифический антиген (ПСА), также малоэффективны. В качестве маркера для диагностики и
лечения метастатического рака простаты предлагается рассматривать простатспецифический мембранный антиген (ПСМА). За рубежом
проходят клинические испытания наиболее перспективные диагностические радиофармпрепараты на основе малых пептидных молекул, моди-
фицированных мочевиной, которые отличаются наибольшим сродством к ПСМА. Отличительной особенностью этих соединений является их
благоприятная фармакокинетика, высокое и длительное накопление в опухоли и метастазах, быстрое выведение из организма.
Ключевые слова: метастатический рак предстательной железы, простатспецифический мембранный антиген, радиофармпрепараты.
(Для цитирования: Власова О.П., Герман К.Э., Крылов В.В., Петриев В.М., Эпштейн Н.Б. Новые радиофармпрепараты для диагности-
ки и терапии метастатического рака предстательной железы на основе ингибиторов простатспецифического мембранного антигена.
Вестник РАМН. 2015; 70 (3): 360–365. Doi: 10.15690/vramn.v70i3.1334)
4. Свойства ферментов
1. Специфичность.
2. Каталитическая эффективность.
3. Лабильность ферментов.
4. Способность ферментов к регуляции.
5. Высокий коэффициент полезного
действия (100 %).
4
5. Строение активного центра фермента
А – присоединение субстрата к ферменту в
активном центре. Б – положение
аминокислотных остатков, формирующих
активный центр фермента в первичной
структуре белка.
В – активный центр фермента условно
разделяется на участок связывания и
каталитический участок. Участок
связывания представлен радикалами
аминокислот, функциональные группы
которых обеспечивают связывание
субстрата. Каталитический участок
образован радикалами аминокислотных
остатков, функциональные группы
которых обеспечивают химические
превращения субстрата.
5
6. 6
Активный центр ферментов
Изучение механизма химической реакции, катализируемой ферментом
наряду с определением промежуточных и конечных продуктов на разных
стадиях реакции подразумевает точное знание геометрии третичной
структуры фермента, природы функциональных групп его молекулы,
обеспечивающих специфичность действия и высокую каталитическую
активность на данный субстрат, а также химической природы участка
(участков) молекулы фермента, который обеспечивает высокую скорость
каталитической реакции.
Обычно молекулы субстрата, участвующие в ферментативных реакциях,
по сравнению с молекулами ферментов имеют относительно небольшие
размеры.
Таким образом, при образовании фермент-субстратных комплексов в
непосредственное химическое взаимодействие вступают лишь
ограниченные фрагменты аминокислотной последовательности
полипептидной цепи — «активный центр» — уникальная комбинация
остатков аминокислот в молекуле фермента, обеспечивающая
непосредственное взаимодействие с молекулой субстрата и прямое
участие в акте катализа[10].
7. 7
Наиболее реалистичная ситуация в случае
индуцированного соответствия.
Неправильные субстраты — слишком
большие или слишком маленькие — не
подходят к активному центру
8. В PDB много других примеров сериновых протеаз,
построенные для пищеварения, активизации гормонов,
свертывания крови, активации иммунной системы и
многих других функций.
Они входят в необычную коллекцию производных
аминокислот, предназначенных для оказания помощи в
реакции резки белков, которые были подобраны
природой снова и снова в процессе эволюции
9. Серин в ферментах
Центром этой «машины» является аминокислота
серин, которая активируется с помощью гистидина
и аспартата.
Вместе эти три аминокислоты были названы
«системой передачи заряда).
Гистидин и аспарат помогают в удалении атома
водорода от серина (белого цвета), что делает его
более реакционноспособным при атаке на цепь
целевого белка.
14. Кофакторы (металлы)
Участие ионов магния в присоединении субстрата
в активном центре гексокиназы
14
В активном центре
гексокиназы есть
участки связывания
для молекулы
глюкозы и
комплекса Mg2+ -
АТФ.
В результате
ферментативной
реакции происходит
перенос концевого
γ-фосфатного
остатка молекулы
АТФ на глюкозу с
образованием
глюкозо-6-фосфата.
17. Фермент активируется после
димеризации.
Кальций играет важную роль в
катализе. Каждый из двух ионов
кальция (зеленые шарики) связаны
как OMPLA мономеров, таких, что
отдельные молекулы OMPLA не
может связать кальций
эффективно.
Два субстрата аналогов приведены
расширения вниз от ионов кальция.
Эти аналоги зажатой между двумя
OMPLA monomers.
до сих пор неизвестно, что вызывает
образование активного OMPLA
димера. Скорее всего мембрана
возмущение играет важную роль.
Следует отметить, что активный
центр ориентирован по
направлению к внешней грани
наружной мембраны.
Это фосфолипаза OMPLA
(белок бета-баррель) встроен в
наружную мембрану, содержащую
в основном липополисахариды
(ЛПС) на наружной поверхности и
фосфолипиды на внутренней
поверхности.
http://mbb.science.uu.nl/research/researchofegmond.html
Outer membrane phospholipase A1 (OMPLA)
18. Цифры соответствуют фактической последо-
вательности и положении аминокислот. Эти
аминокислоты находятся на петлевых областей
двумя доменами, и представляют собой
«систему передачи заряда» для активного
сайта. Специфика карман также находится в
петлях двумя доменами. Эти две области
ствола структур важны, поскольку они обеспе-
чивают каркас, на котором конкретные амино-
кислотные связи могут взаимодействовать с
образованием субстрата конкретных активный
сайт. Связь между доменами менее плотно в
активном центре и может позволить более
жесткие движения внутри доменов, которые
могут способствовать катализа. Эти жесткие
движения тела фермента являются основной
причиной его каталитического действия.
Фермент : трипсин - в семье серин-протеазы. Активный сайт Трипсина имеет две области,
а активный центр - между ними. В центре каждой области имеются полости со структурой
ствола. Полярные регионы структуры гидрофильны.
Активный сайт трипсина содержит аминокислотную последовательность
Asp 102, His 57, Ser 195 (аспарагиновая кислота, гистидин, серин и, соответственно).
19. Охота на вирус
СПИДа
A Handy Enzyme
This ribbon representation of the
RT active domain illustrates its
hand-like structure, showing
fingers (blue), palm (pink) and
thumb (green). The active site (red
atoms), where DNA is elongated, is
in the palm region. Also shown is
an RT-inhibitor drug (yellow) in the
pocket where it binds.
http://www.psc.edu/science/2000/madrid/getting_a_grip_on_aids.html
20. То же
Flexibility of HIV-1 Reverse Transcriptase
The crystal structure of RT with DNA (orange). Coil thickness corresponds to the
crystallographic B-factors and simulated movements. The entire molecule is
represented, with the active-site subunit shown in red (crystal structure) and pink
(simulation) and RT's other subunit in corresponding dark and light green. Analysis of
these simulations finds a pattern of motions among regions in concert with other.
21. Транскетолазы (ТКТ) –
фермент микобактерий туберкулеза
Транскетолазы (ТКТ) - фермент микобактерий туберкулеза представляет
собой препарат нового поколения для лечения туберкулеза и имеет низкую
гомологию с ортологичными ферментами человека. Структурная
характеристике транскетолазы от микобактерий туберкулеза (TBTKT),
гомодимера которого мономеры каждый из которых содержит 700
аминокислот. TBTKT катализирует окисление сахаров доноров ксилулозо-5-
фосфат и фруктозо-6-фосфата, а также снижение акцептором сахара рибозы-
5-фосфата. Инвариант остаток консенсусной последовательности ТКТ,
необходимых для тиамина кофактора связывания мутирует в TBTKT; пока его
каталитическая активность не влияет, и разрешение структура 2,5 Å
полноразмерного TBTKT дает объяснение этого. Основные структурные
различия между ферментами человека и микобактерий TKT, которые влияют
как субстрат и кофактора признание и связывание были раскрыты. Эти
изменения объясняют кинетические различия между TBTKT и его
человеческого коллегой и их дифференциальной торможения от малых
молекул.
22. Структура сайта кофактора связывания в TBTKT.
ТЭЦ кофактор – голубые палочки, Mg2 + в голубой области, а также отдельных
аминокислотных остатков в представлении палкой.
Аминокислоты предоставлены различных мономеров обозначены разным
цветом кодирования. (б) При наложении TBTKT (зеленый) к человеческому ТКТ
(серебро) с Кофакторы ТЭС и Mg2 +, и выбранные остатки в представлении
палкой.
23. Structure of the cofactor-binding site in TBTKT. (a)
Illustration showing TPP cofactor as cyan sticks, Mg2+
as a cyan sphere as well as selected amino acid
residues in stick representation. Amino acids
contributed by different monomers are indicated by
different colour-coding. (b) Superposition of the
TBTKT (green) to human TKT (silver) with cofactors
TPP and Mg2+, and selected residues in stick
representation.
24. Superposition of active sites of TBTKT (pdb code 3RIM), human TKT (pdb code 3MOS) and yeast
TKT (pdb code 1ngs). (a) Illustration of the three structures with sphere representation of
substrate erythrose-4-phosphate (E4P) and cofactors TPP and Mg2+ as found in the active site of
yeast TKT. Amino acid residues (amino acid numbering: TBTKT/human TKT/yeast TKT) involved in
the binding of E4P to yeast TKT (light blue orange) as well as the corresponding TBTKT (green
and pink) and human TKT (dark blue/yellow) amino acid residues are shown in stick
representation. (b) Illustration of TBTKT and human TKT with selected amino acid residues of
TBTKT (magenta) and human TKT (yellow). Cofactors TPP and Mg2+ are represented as spheres.
26. Структура Субтилизина
Carlsberg из Сенной палочки
(оранжевая)
в комплексе с ингибитором
Eglin C (серый). Данные
взяты из Банк данных
белков 1 cse.pdb.
Ингибитор для
предотвращения
автоматического протеолиза
в процессе кристаллизации
Это также хороший пример
взаимодействия между
протеазой и белковым
субстратом.
27. Crystal structure of human aromatase, the estrogen factory.
A bound androstenedione molecule at the active site is shown
within its electron density surface.
A 3D, animated view of the structure of aromatase can be seen here.
28. Изоцитрат-дегидрогеназа
• (IDH) (ЕС 1.1.1.42) представляет собой фермент, который
катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата,
производство альфа-кетоглютарата и CO2.
• Двухступенчатый процесс : включает окисление изоцитрата
(вторичный спирт), до оксалосукцината (кетон), а затем
декарбоксилирования карбоксильной группы бета до кетона,
образуя альфакетоглютарат.
• У людей, IDH существует в трех изоформ: IDH 3 катализирует 3-й
шаг цикла лимонной кислоты при преобразовании NAD +, чтобы
обеспечить NADH в митохондриях.
• Изоформы IDH1 и IDH2 катализируют такую же реакцию, вне
цикла лимонной кислоты и используют NADP + в качестве
кофактора, вместо NAD +. Они локализуются в цитозоле, а
также митохондрии и пероксисомы.
29.
30. Дегидрогеназа изоцитрата из E. coli
Кристаллографическая структура Дегидрогеназа изоцитрата из
E. coli . В ней три активных сайта в активном центре.
Three isocitrates, one isocitrate in the binding site for NADP+.
31. Изоцитрат-дегидрогеназа (ИДГ)
• Большинство изоцитратдегидрогеназ димеры, точнее,
Гомодимеры (два одинаковых мономерных субъединиц,
образующих один димерную блок).
• При сравнении C. glutamicum и кишечной палочки, мономера и
димера, соответственно, было обнаружено , что оба фермента
"эффективно катализируют идентичные реакции."
• Тем не менее, ИДГ С. Glutamicum имела в десять раз больше
активности, чем ИДГ кишечной палочки и в семь раз больше
способность к связыванию
33. Изоцитрат- дегидрогеназа : Один активный участок в аналогичном
ферменте НАДФ у свиней (зеленый). Свиной фермент - гомодимер
и имеет другой активный сайт с другой стороны
35. Характеристика взаимодействия между Asp141 и Phe236
и Mn2 +связываемого в L-малате яблочного-фермента,
выделен из печени голубей ( pigeon liver malic enzyme)
Biochem. J. (2003) 374 (633–637)
36. Ленточная структура (слева) изображает металло-бета-лактамаз
фермент. Два иона цинка (фиолетовый сферы) находятся в
активном сайте фермента (с аминокислотами координации
металлы, представленные в виде палочек).
Бета-лактамным антибиотиком связаны в активном центре представлен в виде космических заполнено шариками.
38. Adenine Phosphoribosyltransferase that
catalyzes the formation of AMP from
Adenine and PRPP.
Это симметричный гомодимер.
Крышка-капот (hood)состоит из альфа 1, 2 и бета
1, 2;
Ядро состоит из остальных альфа-спиралей и
бета-лент. При фиксации каталитического остатка
на петле в течение активного кармана на
площадке, цикл будет закрыт, когда субстрат
связывается с активным сайтом. Этот фермент
действует совместно с 9-deazaadenosine (9DA),
Mg-ион, ФРПФ
39. Мономер справа имеет замкнутый гибкий контур (II),
который выделен толстым. Этот фермент имеет активный
участок, расположенный между центром и концом домена
Активный участок
окружен четырьмя
петлями (I-IV).
На этой фигуре,
ионы
гидратированные
металлов
приведены в
стандартном
представлении
атома ван-дер-
Ваальса
40. 1L1R
The monomer
six alpha-helices
nine beta-strands
The enzyme's
catalytic loop
(beta5 and beta6)
is closed onto the
active site.
9dA - Adenine is
shown in green,
and PRPP is shown
in red.
http://publications.csail.mit.edu/abstracts/abstracts05/chunsrivirot/chunsrivirot.html
41. Фермент
метилентетрагидрофолатредуктаза
Структура активного сайта фермента
метилентетрагидрофолатредуктазы бактерий
(E.coli), который аналогичен по структуре
дрожжевого фермента MTHFR.
Пять-сайтов, помеченных красным цветом - места,
где общие мутации происходят влияния на
активность фермента;
мутации в зеленой меченных сайта не повлиять на
деятельность фермента. Geoff Хорнер
43. At the top is an enzyme that uses NAD as the cofactor
to perform the oxidation reaction (PDB entry 1gco), and
the enzyme at the bottom (PDB entry 1cq1) uses ...
44.
45. Изоцитрат-дегидрогеназа
• (IDH) (ЕС 1.1.1.42) представляет собой фермент, который
катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата,
производство альфа-кетоглютарата и CO2.
• Двухступенчатый процесс : включает окисление изоцитрата
(вторичный спирт), до оксалосукцината (кетон), а затем
декарбоксилирования карбоксильной группы бета до кетона,
образуя альфакетоглютарат.
• У людей, IDH существует в трех изоформ: IDH 3 катализирует
третий шаг цикла лимонной кислоты при преобразовании NAD
+, чтобы NADH в митохондриях.
• Изоформы IDH1 и IDH2 катализируют такую же реакцию, вне
цикла лимонной кислоты и используют NADP + в качестве
кофактора, вместо NAD +. Они локализуются в цитозоле, а
также митохондрии и пероксисомы. [2]
46. Дегидрогеназа изоцитрата из E. coli
Кристаллографическая структура Дегидрогеназа изоцитрата из
E. coli . В ней три активных сайта в активном центре.
Three isocitrates, one isocitrate in the binding site for NADP+.
47. Изоцитрат-дегидрогеназа
• (IDH) (ЕС 1.1.1.42) представляет собой фермент, который
катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата,
производство альфа-кетоглютарата и CO2.
• Двухступенчатый процесс : включает окисление изоцитрата
(вторичный спирт), до оксалосукцината (кетон), а затем
декарбоксилирования карбоксильной группы бета до кетона,
образуя альфакетоглютарат.
• У людей, IDH существует в трех изоформ: IDH 3 катализирует
третий шаг цикла лимонной кислоты при преобразовании NAD
+, чтобы NADH в митохондриях.
• Изоформы IDH1 и IDH2 катализируют такую же реакцию, вне
цикла лимонной кислоты и используют NADP + в качестве
кофактора, вместо NAD +. Они локализуются в цитозоле, а
также митохондрии и пероксисомы. [2]
48. Дегидрогеназа изоцитрата из E. coli
Кристаллографическая структура Дегидрогеназа изоцитрата из
E. coli . В ней три активных сайта в активном центре.
Three isocitrates, one isocitrate in the binding site for NADP+.