Recommended
More Related Content
What's hot
What's hot (20)
Similar to EPIGENETIK
Similar to EPIGENETIK (20)
Recently uploaded
Recently uploaded (20)
EPIGENETIK
- 1. EPIGENETIK dr. Mitayani, M.Si. Med.
- 2. TUJUAN PEMBELAJARAN • Mahasiswa diharapkan mampu memahami dan menjelaskan mengenai epigenetik. • Mahasiswa diharapkan mampu memahami dan menjelaskan manfaat epigenetik bagi kehidupan.
- 3. • Aktor/aktris • Naskah film • Kata-kata dalam naskah • Kalimat penting dalam naskah • Proses penulisan naskah • Pengarahan/directing • sel tubuh manusia • DNA • sekuens DNA • Gen • Genetik • epigenetik
- 4. EPIGENETIK • Adalah suatu studi yang mempelajari perubahan aktivitas gen yang bukan disebabkan oleh perubahan pada sekuens DNA • Perubahan fenotipe TANPA perubahan genotipe.
- 7. MEKANISME EPIGENETIK Ada 3 mekanisme pada proses epigenetik: 1. Metilasi DNA 2. Modifikasi histon 3. Non-coding RNA
- 8. METILASI DNA • Adalah proses penambahan gugus methyl pada cincin C5 cytosine 5-methylcytosine menghambat transkripsi. • https://www.dnalc.org/view/17011-DNA- Methylation.html
- 9. METILASI DNA • CpG island di bagian promoter gen mengalami metilasi penekanan ekspresi gen (it is turned off). • Metilasi DNA berperan penting dalam pengaturan ekspresi gen pada jaringan spesifik, imprinting genom, dan inaktivasi kromosom X.
- 10. X chromosome inactivation • http://www.hhmi.org/biointeractive/x- inactivation
- 11. METILASI DNA • Penambahan gugus metil dibantu oleh enzim DNA methyltransferase (DNMT) • Ada 3 macam enzim untuk mempertahankan pola metilasi DNA tubuh yaitu: 1. DNMT1: mempertahankan pola metilasi DNA yang standar 2. DNMT3a 3. DNMT3b Mempertahankan pola metilasi DNA yang baru
- 12. METILASI DNA • Ada 2 enzim tambahan: - DNMT2 - DNMT3L
- 14. DEMETILASI DNA • Enzim penghapus metilasi (Erasers) modifikasi dan menghapus gugus metil dari DNA demetilasi DNA gen aktif (turned on).
- 15. MODIFIKASI HISTON • Kromatin terdiri dari nukleosom- nukleosom yang tersusun oleh 146 pasang basa DNA dan dibungkus oleh 4 protein histon (H3, H4, H2A dan H2B)
- 16. www.nature.com
- 17. MEKANISME MODIFIKASI HISTON 1. Modifikasi langsung mempengaruhi struktur kromatin . 2. Modifikasi yang mengatur pengikatan molekul efektor. Perubahan pada modifikasi histon dikaitkan dengan instabilitas genom, gangguan segregasi kromosom, dan kanker.
- 18. MACAM-MACAM MODIFIKASI HISTON 1. Asetilasi histon 2. Fosforilasi histon 3. Metilasi histon (https://www.dnalc.org/view/17012--Histone- Methylation.html) 4. Deiminasi 5. Beta N asetilglukosamin 6. Ribosilasi ADP 7. Ubiquitilasi 8. Sumoylasi 9. Histon tail clipping
- 19. ASETILASI HISTON • Terjadi akibat penambahan grup asetil dari asetil CoA. • Enzim yang berperan dalam proses ini adalah histone asetiltransferase mengontrol asetilasi H3 dan H4. • Asetilasi histon berperan dalam banyak proses misalnya gene silencing, apoptosis, dan replikasi DNA.
- 20. ASETILASI HISTON • Histone deacetylaces (HDACs) mengatalisis pembuangan gugus asetil dari residu histone lysine. • Gangguan keseimbangan proses asetilasi histon dihubungkan dengan tumorigenesis dan progresivitas kanker.
- 21. METILASI HISTON • Adalah proses transfer 1 atau 2 atau 3 gugus metil dari S-adenosyl-L-methionine menjadi lysine atau arginine dari protein histon. • Difasilitasi oleh enzim histone methyltransferases (HMTs). • HMTs berfungsi mengontrol metilasi DNA . • Metilasi histon dapat mengaktifkan atau menonaktifkan gen tertentu.
- 22. DEMETILASI HISTON • Adalah suatu proses pembuangan gugus metil pada protein histon. • Difasilitasi oleh enzim histone demethylase.
- 23. Non coding RNA • Adalah suatu molekul RNA fungsional yang ditranskripsikan oleh DNA namun tidak ditranslasikan menjadi protein. • Non coding RNA terdiri dari miRNA, siRNA, piRNA, dan lncRNA. • Berperan meregulasi ekspresi gen pada proses transkripsi dan post transkripsi.
- 24. Non-coding RNA • Non coding RNA (ncRNA) dapat dibagi menjadi ncRNA pendek (< 30 nukleotida) serta ncRNA panjang (> 200 nukleotida). • ncRNA pendek terbagi menjadi 3 kelas utama yaitu microRNAs (miRNAs), short interfering RNAs (siRNAs), dan piwi-interacting RNAs (piRNAs).
- 25. MIKRO RNA (miRNA) • Non-coding protein • Berukuran kecil (± 22 nukelotida) • Berfungsi sebagai regulator negatif bagi suatu gen • Ditemukan di dalam semua sel eukariotik. • Mekanisme: berikatan secara komplementer pada mRNA target sehingga terjadi represi translasi dan gene silencing.
- 26. Micro RNA • secara umum berikatan dengan mesenger RNA yang spesifik.
- 27. CONTOH mRNA • Contoh: miRNA genes mir-127 and mir-136 ditemukan terlibat dalam regulasi imprinting genetik Rtl1, sebuah gen kunci dalam perkembangan plasenta tikus. • Metilasi pada regio yang spesifik pada krosomom ayah menyebabkan ekspresi gen Rtl1. • Jika kromosom ayah tidak termetilasi mir-127 dan mir-136 akan diproduksi dan berikatan dengan mRNA dari gen Rtl1 menginduksi degradasi. • Rendahnya ekspresi protein Rtl1 kematian janin tikus.
- 28. Kaitan miRNA dengan kasus klinis
- 29. MANFAAT EPIGENETIK Epigenetik dapat dimanipulasi sehingga menjadi target terapi bagi kasus-kasus yang terbukti melibatkan mekanisme epigenetik.
- 30. MANFAAT EPIGENETIK • Sebuah studi oleh Feinberg and Vogelstein (1983), menemukan bahwa gen-gen pada sel kanker kolorektal lebih banyak yang mengalami hipometilasi daripada sel normal.
- 31. MANFAAT EPIGENETIK • Hipometilasi DNA activasi onkogen menginisiasi instabilitas kromosom. • Hipermetilasi DNA menginisiasi dinonaktifkannya tumor suppressor genes.
- 34. REFERENSI • Weinhold B. Epigenetics: the science of change. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): 160-167. • Epigenomics Help [internet]. Bethesda (MD): National center for biotechnology information (US); 2010-. Epigenomics Scientific Background. 2010 Aug 31 [updated 2011 Jan 20].
- 35. TERIMA KASIH