Bakteri endofit F4 yang diisolasi dari daun pepaya teridentifikasi secara fenotipik sebagai bakteri Gram positif berbentuk basil. Secara genotipik, bakteri ini memiliki kekerabatan terdekat dengan Bacillus paramycoides strain MCCC 1A04098 dan Bacillus albus strain MCCC 1A02146 berdasarkan analisis filogenetik gen 16S rRNA.
Materi Pajak Untuk BOS tahun 2024 untuk madrasah MI,MTS, dan MA
PPT TR Lindawati Setiadi edit.pptx
1. IDENTIFIKASI GENOTIPIK BAKTERI ENDOFIT F4
DAUN PEPAYA (Carica papaya L.)
Disusun oleh :
Lindawati Setiadi
24030114140088
Dosen Pembimbing I
Purbowatiningrum Ria S., S.Si, M.Si
SEMINAR TUGAS RISET II
Dosen Pembimbing II
Dr. Mukhammad Asy’ari M.Si
2. Latar Belakang
Alkaloid, saponin, tannin, flavonoid (Juarez-Rojop dkk, 2014)
Antimicrobial (Hertanti dkk., 2017)
Antiinflamasi (Santi, 2015)
Antioksidan (Andi, 2014)
Siklus hidup
lebih singkat
Tidak memerlukan
tempat yang luas
Dapat ditumbuhkan
dalam skala besar
Kelestarian tanaman
obat terjaga
Identifikasi
Fenotipik Genotipik
3. Ramadhan
(2016)
Bakteri endofit
daun papaya
F1, F2, F3, F4, F5
F4?
Latar Belakang
Aktivitas antibakteri bakteri endofit
F4 menghasilkan KHM 15,5 terhadap
E. coli dan 16,5 mg/mL terhadap
Bacilus subtilis dan Candida albicans
(Silvia, 2018)
Yunita (2019)
Sarah (2019)
Isolat F1-B memiliki hubungan kekerabatan
terdekat dengan Pseudomonas brenneri strain
CFML 97-391, Pseudomonas proteolytica
strain CMS 64 dan Pseudomonas panacis
strain CG 2010
Isolat F3-B memiliki hubungan
kekerabatan terdekat dengan
Lysinibacillus macroides LGM
18474
4. Tujuan Penelitian
Memperoleh konfirmasi identitas bakteri endofit
F4 secara fenotipik
Menentukan identitas bakteri endofit F4 secara
genotipik berdasarkan analisis filogenetik gen
16S rRNA
1.
2.
5. Metode Penelitian
Peremajaan Isolat bakteri Endofit F4
Uji Pewarnaan Gram Isolat Bakteri F4
Isolasi dan Pemurnian DNA dengan Metode
Chelex
Uji konsentrasi dan kemurnian DNA dengan
ThermoScientific NanoDrop 2000
Amplifikasi Gen 16S rRNA dengan PCR
Elektroforesis Fragmen Gen 16S rRNA
Analisis Sekuensing
Konstruksi Pohon Filogeni
Stok bakteri
endofit F4
(Silvia, 2018)
7. Isolat
Morfologi Koloni Morfologi Sel
Warna Bentuk Elevasi Tepi Bentuk Gram
F4 Putih Bulat Cembung Halus Basil Positif
Hasil Penelitian
Isolat
Morfologi Koloni Morfologi Sel
Warna Bentuk Elevasi Tepi Bentuk Gram
F4 Putih Bulat Cembung Halus Basil Positif
Identifikasi fenotipik bakteri endofit F4 (Silvia, 2018) Identifikasi fenotipik bakteri endofit F4 penelitian ini
8. Elektroforegram gen 16S rRNA bakteri endofit F4
Sampel
Konsentrasi Asam
Nukleat (ng/µL)
A (nm)
260/280
A (nm)
260/230
F4 51,3 1,97 1,84
Hasil Penelitian
Hasil Nanodrop isolasi DNA bakteri endofit F4 asal daun papaya
Hasil elektroforesis fragmen DNA
bakteri endofit F4
9. Bagian konstruksi pohon filogeni dengan 50 data pembanding
Bakteri endofit F4 memiliki kekerabatan yang lebih dekat
dengan Bacilus albus strain MCCC 1A02146 dan Bacilus
paramycoides strain MCC 1A04098
Hasil Penelitian
10. Mikroorganisme Habitat Karakter
Isolat bakteri endofit F4 Daun pepaya
Gram positif, bentuk basil,
mesofil
Bacillus paramycoides strain
MCCC 1A04098
Sedimen laut Cina Selatan
(Yang L dkk., 2017)
Gram positif, bentuk basil,
mesofil, memiliki aktivitas enzim
katalase, sitokrom oksidase dan
gelatinase, tumbuh pada suhu
optimum 30℃ dan pH optimum 7
Bacillus albus strain
MCCC 1A02146
Sedimen laut China Selatan
(Yang L dkk., 2017)
Gram positif, bentuk basil,
mesofil, memproduksi asetoin,
memiliki aktivitas enzim arginine
dihidrolase, katalase dan
gelatinase, tumbuh pada suhu
optimum 30℃ dan pH optimum 7
Hasil Penelitian
11. Mikroorganisme Habitat Karakter
Bacillus paramycoides
Daun teh (Camellia sinensis L.)
di Assam, India
(Borah dkk, 2019)
Gram positif, bentuk basil,
memiliki aktivitas enzim
protease, melarutkan fosfat,
memproduksi asam indol-3-asetat
dan ammonia.
Akar dan batang jewawut
(Pennisetum glaucum)
(Kushwaha dkk., 2019)
Memiliki ketahanan pada logam
berat Cr, Co dan Ni,
memproduksi asam indol-3-
asetat, mampu melarutkan fosfat,
memiliki aktivitas enzim amilase,
protease, lipase dan selulase.
Bacillus albus
Akar batang jewawut
(Pennisetum glaucum)
(Kushwaha dkk., 2019)
Gram positif, bentuk basil,
mesofil, memiliki ketahanan pada
logam berat Cu, Cr, Ni dan Co,
mampu melarutkan kalium dan
zink, memiliki aktivitas enzim
amilase, lipase, protease
Hasil Penelitian
12. Bakteri yang diteliti terkonfirmasi secara fenotipik
merupakan bakteri endofit F4 yang termasuk bakteri
Gram positif dengan bentuk sel basil
Isolat bakteri F4 memiliki hubungan kekerabatan
terdekat dengan Bacillus paramycoides strain MCCC
1A04098 dan Bacillus albus strain MCCC 1A02146
1.
2.
Kesimpulan
