Fibronektin etkisisayesinde 50 yaş ve üzerinde beta laktamaz üreten suşlarda daha az üreme olduğu düşünülmekte**Tanaka, I., K. Suzuki, E. Tanaka, and S. Baba. 1996 Acta Otolaryngol. Suppl. 525:44–50.6
Hastalığın mümkün olanen erken döneminde ,antibiyotiktedavisi başlamadan önce 2 kankültürüalınmalı 2
42.
1 Bishara, J., L. Leibovici, S. Ashkenazi, Z. Samra, and S. Pitlik. 2000. Eur.J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 19:926–931.
43.
2 Waterer, G. W., and R. G. Wunderink. 2001. The influence of the severityof community-acquired pneumonia on the usefulness of blood cultures.Respir. Med. 95:78–82.12
44.
Pnömoni ciddiyeti indeksiKlinisyenlerintoplumdan kazanılmış pnömoni hastalarının morbidite ve mortalite ihtimallerini hesaplamalarını sağlayan bir indeksHastaları risk gruplarına ayırmayı sağlıyor.* *http://pda.ahrq.gov/clinic/psi/psicalc.asp13
Erken kan kültürüalmanın önemiİlksemptomdansonraki 4 güniçindealınankankültürlerinde pozitiflik %34 , daha sonraalınanlarda %12
47.
Pozitifkültürlerin %60’ı S.pneumoniae,%2- 13’ü H.influenzae* *Kalin, M., and A. A. Lindberg. 1983. Diagnosis of pneumococcal pneumonia:Scand. J. Infect. Dis. 15:247–255.15
Etyolojisibilinmeyen 55 hastanın36’sına (%65) TİA ilemikrobiyolojiktanı 21 Skerrett, S. J. 1999. Clin. Chest Med. 20:531–548.2 * Ruiz-Gonzalez, A., M. Falguera, A. Nogues, and M. Rubio-Caballero. 1999.Am. J. Med. 106:385–390.19
BAL kültürlerinde 10⁴CFU/ml pozitif kabul edildiğinde ,ASYE etkenlerinisaptama özgüllüğü%100olmuştur** Cantral, D. E., T. G. Tape, E. C. Reed, J. R. Spurzem, S. I. Rennard, and A. B. Thompson. 1993. Am. J. Med. 95:601–60726
Red kriteri: Mikroskobik incelemede 10’luk büyütmede, her alanda ≥10 yassı epitel hücresi ve ≤25 PNLhücresayısının bulunmasıdır.İyikalitelibalgameldeetmekzor
Geckler,gençaskerlerde %90’lık oranyakalamıştır.(Gramboyama ve Nomarskimikroskobi kriterlerine uygun olan balgamları kabul ederek)**Geckler, R. W., D. H. Gremillion, C. K. McAllister, and C. Ellenbogen. 1977.. J. Clin. Microbiol. 6:396–399. (YIL ???)28
89.
Nomarskimikroskobi kriterleriGram boyamaalternatif olarak yıllar önce önerilmişFaz yoğunluğuna göre çalışmaktaIşık prizmalarla dağıtılmakta, mercekten geçmekte ve mercekteki lens tarafından yeniden şekillendirilerek üç boyutlu bir görüntü elde edilmekteAvantajları: Hazırlaması daha kolay ve daha hızlıIsı fiksasyonu olmadığı için hücre tahribatı yokKapsül şişme testi direk yapılabilmekteDezavantajları:Görülen mikroorganizmalar sınıflandırılamamakta**LARRY G. REIMER* AND ATHENA KEPAS,JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, Feb. 1986, p. 377-37829
Plevralsıvı,T İA vekankültürügibi kommensal flora ile kontaminasyon riski olmayan kültürsonuçlarıylakıyaslanmalı ve uyumlu olduğu takdirde anlamlı kabul edilmeli**Reed, W. W., G. S. Byrd, R. H. Gates, Jr., R. S. Howard, and M. J. Weaver.1996. West. J. Med. 165:197–204.30
Bu hastalarınkankültürlerinden %85'indebu morfotiple uyumlu birorganizmaüretilmiştir.** Gleckman, R., J. DeVita, D. Hibert, C. Pelletier, and R. Martin. 1988. J. Clin. Microbiol. 26:846–849.31
H.influenza :42.8 99.4* Roson, B., J. Carratala, R. Verdaguer, J. Dorca, F. Manresa, and F. Gudiol. 2000. Clin. Infect. Dis. 31:869–874.32
103.
Yıkanmış balgam örnekleriÜniversitemizdeyapılan bir araştırmada,ASYE’li çocuklarda yıkanmış balgam örneklerinin tanısal değeri araştırılmıştır.Önceki bazı araştırmalarda balgamlarda bakteriyel kontaminasyonu azaltmak için balgam örneklerinin yıkanması ve belirli miktarlarda ekilmesi önerilmiş,Bu çalışmada ASYE şüpheli çocuklardan alınan balgam örnekleri bu yöntemle incelenmiş Her alanda >10 yassı epitel hücresi içeren örnekler işleme alınmamış, >25 PNL içeren örnekler işleme alınmış,KK,McKonkey,çikolata agara ekildikten sonra fizyolojik salinle karıştırılmış(1/10), vortexlenmiş, santrifüj edilmiş, homojenizasyon için eşit hacimde N-asetilsistein ilave edildikten sonra 37°C’de 15 dakika inkübe edilmişDaha sonra yıkanmış örnekler 1/10 salinledilüe edilmiş ve 10 µl’lik sıvı aynı şekilde ekilmişPetriler 37°C’de 48 saat inkübe edilmiş ve koloni sayısı ≥ 10⁶ kob/ml olan mikroorganizmalar patojen olarak kabul edilmişYıkanmış örneklerde, H.influenza,S.pneumonia ve Moraxellacatarrhalis izole edilmiş.Sonuç olarak, yıkanmış balgam örneği kullanmanın kontaminasyonu100-1000 kat azalttığı ve balgam örneklerinin tanısal değerini arttırdığı gösterilmiş.*Nihan Ziyade, Burak Aksu andAysegulYagci,PediatricsInternational (2009)33
104.
Pürülan bir örnekolduğu takdirde;Gram boyama %80 vakadaolası tanı sağlamaktadır.
Doğrulanankültürle saptanabilir.1 Miyashita, N., H. Shimizu, K. Ouchi, K. Kawasaki, Y. Kawai, Y. Obase, Y. Kobashi, and M. Oka. 2008.Med. Sci. Monit. 14:CR171–CR176. 2 Butler, J. C., S. C. Bosshardt, M. Phelan, S. M. Moroney, M. L. Tondella, M. M. Farley, A. Schuchat, and B. S. Fields. 2003. J. Infect. Dis. 187:1416–1423.34
Hastaneye yatırılan 455çocuktan alınan NFS örneklerindeAbu-Diab, A., M. Azzeh, R. Ghneim, R. Ghneim, M. Zoughbi, S. Turkuman, N. Rishmawi, A.-E.-R. Issa, I. Siriani, R. Dauodi, R. Kattan, and M. Y.Hindiyeh. 2008. J. Clin. Microbiol. 46:2414–2417.37
119.
NFA-NFS kıyaslaması381Chan, K.H., J. S. Peiris, W. Lim, J. M. Nicholls, and S. S. Chiu. 2008.J.Clin. Virol. 42:65–69.2Walsh, P., C. L. Overmyer, K. Pham, S. Michaelson, L. Gofman, L. De- Salvia, T. Tran, D. Gonzalez, J. Pusavat, M. Feola, K. T. Iacono, E.Mordechai, and M. E. Adelson. 2008. J. Clin. Microbiol. 46:2374–2376.
120.
ASYE etkenlerinin izolasyonundaoptimal örneklerStreptococcuspneumoniaeBalgam kültürü duyarlılık ve özgüllüğü, flora kontaminasyonu ve kolonizasyonu nedeniyle düşükYatan hastalar da pozitiflik <%20 - >%90 Kan kültürleri pozitif olan hastalardan alınan balgam örneklerinde %94’e kadar pozitiflik saptanmış 1Pulmoner patolojisi olmayanlardan da pürülan balgam elde edilebilir 2Bir çalışmada, balgam ve kan kültürleri pozitifliği %47 Başka bir çalışmada %49 uyumlu bulunmuş.31-Drew, W. L. 1977 J. Clin. Microbiol.2-Lentino, J. R., and D. A. Lucks. 1987. J. Clin. Microbiol. 25: 758–762.3Barrett-Connor, E. 1971 Am. Rev. Respir. Dis. 103:845–848.39
121.
Streptococcuspneumoniae Gram boyamada görülen organizmaların %90‘ından fazlası izole edilen mikroorganizma ile uyumlu olduğunda balgam kültürü anlamlıdır.40
Mycoplasma pneumoniaeZor üreyenbir bakteri olduğu için rutin olarak solunum yolları örneklerinde kültürü yapılmamaktaÇoğu çalışma PCR’a dayalıPCR’laM.pneumoniae tanısında OFS ve NFS ile alınan örneklerden toplam 7 hasta pozitif ( % 10 )Bunlardan 6 tanesi OFS2 tanesi NFS ile pozitifÖrnek sayısı az, bu yüzden istatiksel olarak anlamlı değil **Gnarpe, J., A. Lundback, H. Gnarpe, and B. Sundelof. 1997 J. Infect. Dis.43
125.
Başka bir çalışmadaPCR‘la M.pneumonia tanısı için NFS ve OFS eşit derecede etkili bulundu.Ancak her iki yöntem birlikte kullanıldığında en yüksek duyarlılık elde edildi. 1Diğer bir çalışmada NFS ve NFA arasında PCR yöntemiyle M.pneumonia saptanmasında bir fark bulunamadı .2Sonuç olarak M.pneumonia için en iyi örnek balgamNFA,NFS ve OFS ikinci seçenek1Michelow, I. C., K. Olsen, J. Lozano, L. B. Duffy, G. H. McCracken, and R. D. Hardy. 2004. J. Clin. Microbiol.2Reznikov, M., T. K. Blackmore, J. J. Finlay-Jones, and D. L. Gordon. 1995J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.44
126.
Chlamydophila pneumoniae3-12 yaşarası çocuklarNFA ile OFS kıyaslamasıNFA, C. pneumoniaeizole edilen tüm hasta çocuklarda pozitifOFS aynı çocukların %50’sinde pozitif **Block, S., J. Hedrick, M. R. Hammerschlag, G. H. Cassell, and J. C. Craft. 1995. Pediatr. Infect. Dis. J.45
127.
C. pneumoniaesalgını sırasında;SYEolan 116 hastaBalgam, OFS, NFS örnekleriTüm örneklerin alındığı 61 hastadan PCR, kültür ve antijen tanımlama performans kıyaslamasında,20 hasta C. pneumoniaeile enfekte düşünüldü7 NFS10 OFS20 balgam örneği pozitif **Boman, J., A. Allard, K. Persson, M. Lundborg, P. Juto, and G. Wadell. 1997. EIA. J. Infect. Dis.46
Legionella pneumophilaGenel olarakBALGAM en iyi örnekİlk PCR çalışmalarında OFS uygun örnek olarak bulunurken; 1Daha büyük,242 toplumdan kazanılmış pnömonili hastayla yapılan çalışmada OFS için 2 farklı PCR yapılmışSadece 3/11 onaylanmış legionella vakası 2 1Ramirez, J. A., S. Ahkee, A. Tolentino, R. D. Miller, and J. T. Summersgill. 1996. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2 Diederen, B. M., and M. F. Peeters. 2007 J. Clin. Microbiol.49
Antijenik tespiti değerlendirmedeiki ana problem Çalışılan örnek ve Hasta yaşıİnfluenza A ve İnfluenza B tespitindeÇalışılan örnek tipine göre Duyarlılıkta önemli değişiklikler saptanmakta. 51
133.
Diğer Örneklerİdrarda antijentestiS. pneumoniaeurinaryimmünokromatografikmembran test (ICT)15 dakika yoğunlaştırılmamış idrar kullanılarakErişkin bakteremikpnömonideDuyarlılık: % 70- 80Özgüllük > % 9552
134.
Diğer çalışmaların sonuçlarınagöre;İdrarda pnömokokal antijen testi, ciddi derecede hasta ve düzgün gram boyanabilen balgam örneği veremeyen hastalara yapılmalı 1Pnömokokalpnömonili 149 erişkin hastada yapılan araştırmada idrarda antijen testi için duyarlılık % 77- 78 özgüllük % 67 - 71 olarak saptanmış. 2Başka bir çalışmada,Pnömokokpnömonisi olan 68 hastada idrar antijen testi % 100 pozitif saptanırken,Muhtemel pnömokokpnömonili 52 hastanın 36'sında ( % 69.2) pozitif saptanırken,Pnömokokalpnömonisi olmayan 277 hastanın 50'sinde (% 18) pozitiflik saptanmıştır.31 Roson et al. (86), Van der Eerdenet al. (101), and Ortega et al. (73)2 Jay C. Butler Journal of Infectious Disease, May 1,20033M.A. Marcos, M.T. JimenezEuropeanRespiratoryJournal,Feb 1, 200353
135.
İdrar Antijen TestiLegionellaenfeksiyonlarındaen hızlı yardımcı testTanı konamayan pnömoniliYoğun bakımda yatan, hospitalizeB laktam antibiyotiklere yanıt vermeyen durumlarda tavsiye edilmekte.54
136.
DezavantajıSadece Legionellapneumophilaserogrup 1 antijenini tespit edebilmekteBu serogruplegionellapnömonisinin en sık sebebiAvantajıLegionellaspp. Kültürleri 3-4 gün gibi uzun sürebildiği için legionella enfeksiyonlarında kullanışlı ve hızlı bir test55
137.
DuyarlılıklarıKonsantre idrarda;%86.6 ile % 91.6 arasıKonsantre olmamış idrarda;% 55.5 ile % 66.6 arası (1 , 2) 1 Dominguez, J., N. Gali, L. Matas, P. Pedroso, A. Hernandez, E. Padilla,and V. Ausina. 1999.Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 18:896–898. 2 Dominguez, J. A., N. Gali, P. Pedroso, A. Fargas, E. Padilla, J. M. Manterola, and L. Matas. 1998. J. Clin. Microbiol.56
138.
Test ilk 5gün bazı hastalarda negatif olabilir6 - 14. günler arası pozitif kalabilir .** Bernander, S., B. Gastrin, S. Lofgren, and A. M. Olinder-Nielsen. 1994.Scand. J. Infect. Dis.57
139.
Sonuç olarak,Toplum kaynaklıpnömonilerdelegionella idrar antijen testi;Mortaliteyi,Yoğun bakım ihtiyacını azaltmakta,Gereksiz ve uygunsuz antibiyotik kullanımına engel olmaktadır.58
140.
Solunum enfeksiyonlarında serolojiZor veya yavaş üreyen mikroorganizmalar için yapılmaktaÖzellikle;Mycoplasmapneumoniae, Chlamydiapneumoniae,ve Legionella enfeksiyonları vevirüsler59
141.
Mevcut enfeksiyon içinen güvenilir serolojik kanıt7 - 10 gün aralıklaveya Ig M antikor varlığında alınan iki serum örneğinde ;Enfeksiyonun yayılması sırasındaIg G antikor titresindeki (veya Ig G + Ig M) dört katlık bir artış olması60
142.
Tek başına IgG yüksekliğinin tanısal bir anlamı yoktur.M. pneumonia’ e karşı Ig M antikorlarının tanısal değere ulaşması için 1 hafta veya bazen çok daha fazla süre gerekmekteChlamydia ve Legionellatürlerine karşı daha fazla süre gerekmekte61
143.
PCR ‘ınserolojiye üstünlüğükanıtlanmış durumda *M. pneumoniae, C. pneumoniae, ve Legionella türlerine karşı seroloji rutinden ziyade salgın sırasında faydalı olabilir.* Nilsson, A. C., P. Bjorkman, and K. Persson. 2008. BMC Microbiol. 8:93.62
144.
Soğuk aglütinasyon testiSoğukaglütininlerin bulunduğu hastalıkların tanısında kullanılır.Bu hastalarda çoğunlukla IgM yapısındaki antikorlar eritrositlere bağlanarak kronik anemi ve lokal staza neden olur. Atipik pnömoniler (mycoplasma pneumonia, influenza A, influenza B, parainfluenza, adenovirüs vb. kaynaklı) ve bazı hemolitik anemilerde aglütinasyon gözlenir. 37°C inkübasyonda aglütinasyonda düzelme olmuyorsa reaksiyon soğuk aglütinasyon değildir. Mycoplasma pneumonia enfeksiyonunda çocuklarda %50, erişkinlerde %70 oranında aglütinasyon gözlenir.63
145.
GRACE ARAŞTIRMASIGRACE: Avrupa’da Toplum Kaynaklı ASYE (TK-ASYE)’ lerde Antibiyotiklere Dirence Karşı Savaşan GenomlarHedefi 3000 ASYE ‘li hastanın araştırılmasıEşleştirilmeli kontrollerle ASYE etkenlerinin, NAAT ve geleneksel yöntemlerle saptanmasıEn büyük TK-ASYE araştırmasıBu yüzden, TK-ASYE’ lerin optimal mikrobiyolojik tanı metoduna yardımcı olması beklenmekte64
Amaçları:Antibiyotik kullanımına nedenolan TK-ASYE etken araştırmasıTK-ASYE’ de atipik bakteri ve virüslerin rollerinin araştırılmasıTK-ASYE’lilerde dirençli S. pneumoniae ve H. İnfluenzae enfeksiyonu için risk faktörlerinin saptanmasıAntibiyotik kullanımıyla direnç seviyesi ilişkisinin araştırılmasıDaha hızlı gen tabanlı tanı koydurucu testler geliştirme* *https://www.grace-lrti.org/portal/en-gb/about/objectives/index66