PACKAGE INCLUDE
05 nights accommodation sharing based on double occupancy
02 nights accommodation Lakaz Chamarel on Lakaz Formula basis
Transfer Airport – Hotel – Lodge – Airport
Tours North & South & Sunset cruise
PACKAGE EXCLUDES
International Air Ticket
Travel Insurance
Lunch (except Heritage Awali) & Drinks
Personal Expenses
Any item NOT mention in the package
EXCURSION INCLUDES:
Full Day Excursion to discover North Tour:
Visite Garden of Pamplemousses, Château de Labourdonnais
Lunch at Tante Atalie (Table d’Hôte)
Full Day Excursion to discover South Tour:
Chamarel, Crocodile Park , Souillac, Grand Bassin, Trou aux Cerfs
Lunch at Andrea Lodge , Quad at Exil (upon request)
Sunset Cruise
Car accidents can be a serious and a problematic situation for the victim. Damage to self and property and the vehicle can cause a lot of trouble and tension. It is important to make sure that the victim gets prompt treatment without getting into financial troubles of medical expenses, car repairs and insurance. If you get into a car accident you should avoid doing certain mistakes.
Word-A-Holic-Z 007- Vocab Masters (Edu Right Foundation)Amit Kumar
Flip Through These 50+ Words...Quick Revision..Helpful For Competitive Examinations..& Especially Vocab Masters Of Jamshedpur..The Vocabulary Contest Being Promoted By Edu Right Foundation Jamshedpur
Sample Booklet-Vocab Masters Of JamshedpurAmit Kumar
This Booklet Gives You A Preview Of Our Teaching Methodology, And The Science Behind Learning Through The Mnemonics & Visual Methods Followed At Word-A-Holic-Z.
Happy Learning !!
PACKAGE INCLUDE
05 nights accommodation sharing based on double occupancy
02 nights accommodation Lakaz Chamarel on Lakaz Formula basis
Transfer Airport – Hotel – Lodge – Airport
Tours North & South & Sunset cruise
PACKAGE EXCLUDES
International Air Ticket
Travel Insurance
Lunch (except Heritage Awali) & Drinks
Personal Expenses
Any item NOT mention in the package
EXCURSION INCLUDES:
Full Day Excursion to discover North Tour:
Visite Garden of Pamplemousses, Château de Labourdonnais
Lunch at Tante Atalie (Table d’Hôte)
Full Day Excursion to discover South Tour:
Chamarel, Crocodile Park , Souillac, Grand Bassin, Trou aux Cerfs
Lunch at Andrea Lodge , Quad at Exil (upon request)
Sunset Cruise
Car accidents can be a serious and a problematic situation for the victim. Damage to self and property and the vehicle can cause a lot of trouble and tension. It is important to make sure that the victim gets prompt treatment without getting into financial troubles of medical expenses, car repairs and insurance. If you get into a car accident you should avoid doing certain mistakes.
Word-A-Holic-Z 007- Vocab Masters (Edu Right Foundation)Amit Kumar
Flip Through These 50+ Words...Quick Revision..Helpful For Competitive Examinations..& Especially Vocab Masters Of Jamshedpur..The Vocabulary Contest Being Promoted By Edu Right Foundation Jamshedpur
Sample Booklet-Vocab Masters Of JamshedpurAmit Kumar
This Booklet Gives You A Preview Of Our Teaching Methodology, And The Science Behind Learning Through The Mnemonics & Visual Methods Followed At Word-A-Holic-Z.
Happy Learning !!
Outline the pictures on the paper - motorskillss_y_l_w_i
The European Commission support for the production of this publication does not constitute endorsement of the contents which reflects the views only of the authors, and the Commission cannot be held responsible for any use which may be made of the information contained therein.
1. Tüberkülozda
Yeni Tanı Yöntemleri
Dr. Ali Fidan
Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi
Göğüs Hastalıkları Kliniği
SOLUNUM 2010 22.10.2010 - Antalya
2. Tüberküloz
• Dünyada enfeksiyona bağlı ölümlerin ana nedenlerinden
• Dünya nüfusunun 1/3’ü enfekte
• 9 milyon yeni olgu / yıl
• 2 milyon/yıl tedavi olamıyor
• Enfeksiyon kaynaklı önlenebilir ölümlerin ¼’ü
• 1.3 milyon ölüm/yıl (2007)
• Ölümlerin tamamına yakını orta ve düşük gelir düzeyli
ülkeler
• Tedavi olmamış akc TB = 10-15 yeni enfeksiyon
WHO Report 2009. Global Tuberculosis Control
3. TB insidans (2007)
• Dünyada: 139/100.000
• Ülkemizde: 30/100.000
WHO Report 2009. Global Tuberculosis Control
5. Tanı yoksa tedavi yok…
• Bireysel
• Toplumsal
• Küresel
Tanı varsa her zaman tedavi var mı?…
6. TB tanısında
laboratuvar
Direk yöntem İndirek yötem
Radyoloji
Mikobakakteri ve türevleri
Direk Mikroscopi (ZN, Kinyoun, Floresan)
Kültür (Geleneksel, Hızlı metodlar)
Mikobakteri kaynaklı DNA veya RNA tespiti
( PCR, LAMP, TAA / NAA, LCR, Fast Plaque)
Mikobakteriye karşı gelişmiş
Antikorlar
Antikor tespiti (TB STAT-PAK, ELISA)
Antijen tespiti
(TB MPB 64 patch test, Quantiferon-GOLD test)
Biokimyasal analizler
(ADA, Bromide Partition, Gas Kromatografi)
7. Yeni nedir?
1 . Kullanılmamış olan, eski karşıtı:
"Yeni giysi. Yeni ayakkabı."- .
2 . Oluş veya çıkışından beri çok zaman geçmemiş olan:
"Yeni haber. Yeni moda."- .
3 . En son edinilen:
"Yeni eve taşındık."- .
4 . İşe henüz başlamış:
"Yeni öğrenci. Yeni asker."- .
5 . O güne kadar söylenmemiş, görülmemiş, gösterilmemiş, düşünülmemiş olan:
"Yeni bir buluş. Yeni bir düşünce."- .
6 . Tanınmayan, bilinmeyen:
"Yeni imzalara rastlıyoruz."- .
7 . Daha öncekilerden farklı olan:
"Yeni ihtiyaçlarımız var."- .
8 . zarf Biraz önce, çok zaman geçmeden:
"Yeni tanıştığım orman uzmanları çok nazik ve kibar insanlardı."- Ç. Altan.
• new
• recent
• latest
• fresh
• incoming
• newly
• recently
• just
10. • Stop TB Partnership’s Retooling Task Force (RTF)
• Foundation for Innovative New Diagnostics (FIND)
• Stop TB Partnership’s New Diagnostics Working Group
(NDWG)
• Global Laboratory Initiative (GLI)
• World Health Organization (WHO)
• Special Program for Research and Training in Tropical
Diseases (TDR)
11. • >1000 çalışma
• 30 derleme, meta-analiz
• Tanı değeri (sens., spe.)
• Güncel pratiğe etkileri?
– Algoritmada yeri?
– Klinik tanıda yeri?
– Tedavi planına etkisi?
http://www.tbevidence.org
12. TB tanısında altın standart: Kültür
• Balgam, bronş lavajı, doku biyopsileri…
• Mikroskopiden daha duyarlı
• Bakteri elde edilmesi (ilaç direnci, genotip)
TB tanısında hızlı/ucuz/kolay: Mikroskopi
13. Mikroskopi
• Ziehl-Neelsen yöntemi ile boyanmış balgam
yayma
– Hızlı, ucuz, kolay
– Spesifisite yüksek (%98)
– Sensitivite düşük (%45-75) (5.000-10.000 /mL)
– Çocuklar, yaşlılar, kavitesiz (HIV+) olgularda tanı
güçlüğü
14. Direk mikroskopide yenilikler…
• Sodyum hipoklorit ile muamele, santrifüj
– *1675 balgam yaymasında: Direk ve ağartıcı metodu ile
mikroskopide sırasıyla 206(%12.3) ve 275(16.4%) (p=0.0007)
• Seri yayma incelemeleri
– 3. yaymada sensitivite %2-5 artar
• Floresan mikroskopi
– Auramine
– Auramine-O ve Rhodamine kombinasyonu
– **Her ikisi de ZN, Kinyoun metoduna üstün (~%10)
– Pahalı, özel mikroskop gerektirir
*Ongkhammy S. Int J Tuberc Lung Dis. 2009 Sep;13(9):1124-9.
**Somoskövi A. Chest 2001;120:250-7
15. Direk mikroskopide yenilikler…
• LED (Light-Emmittig Diode) tabanlı Floresan mikroskopi
Adapted from Minion J, Sohn H, Pai M. Light emitting diode technologies for TB diagnosis: what’s on the market?
Expert Rev Med Devices 2009;6(4):341–45
16. • Elektromanyetik işaretleme tekniği
– M.tb’a özgü antikorla kaplı manyetik kürecikler örneğe
eklenir
– Basiller kürelere yapışır
– Floresan mikroskopla görülür
– Araştırma düzeyinde kalmış
• Computer-Directed otomatize mikroskop
17. Kültür
• Altın standart!...
• 10-100 basil/mL yeterli
• Sensitivite %80-85; Spesifisite %98
• Basil identifikasyonu
• Direnç testi imkanı
18. Kültür
• 3 farklı tipte vasat:
– Yumurta bazlı: LJ, Petragnani, ATS (American
Trudeau Society)
– Agar bazlı: Middlebrook 7H10 veya 7H11
– Sıvı bazlı: Kirschner, Middlebrook 7H9
• 6-8 haftalık süre
19. • BACTEC radyometrik sistem (BACTEC TB 460)BACTEC radyometrik sistem (BACTEC TB 460)
– Carbon-14 işaretli palmitic asid içeren MiddlebrookCarbon-14 işaretli palmitic asid içeren Middlebrook
7H127H12
– Hızlı sonuçHızlı sonuç
• Yayma (+):Yayma (+): ~~ 8 gün8 gün
• Yayma (-):Yayma (-): ~~ 14 gün14 gün
– p-nitro-α-acetylamino-β-hydroxypropiophenone (NAP)p-nitro-α-acetylamino-β-hydroxypropiophenone (NAP)
ile M.tb complex inhibisyonu ve NTM ayrımıile M.tb complex inhibisyonu ve NTM ayrımı
– Radyoizotop kullanımıRadyoizotop kullanımı
– PahalıPahalı
– Sensitivite:Sensitivite:
• Mycb. için %84-99.4Mycb. için %84-99.4
• M.tb için %91-100M.tb için %91-100
20. • MGIT (Mycobacterial Growth Indicator Tube)
– Modifiye Middlebrook 7H9
– O2 kullanımı UV ile flosesans
– Kontaminasyon BACTEC’den fazla
• BACTEC MGIT 960: otomatik, kompakt sistem
– Hızlı sonuç
– Radyoizotop kullanmaması
– Yüksek hacimli lab için maliyet-etkin
– Pahalı
21. MB-Redox (Heipha Diagnostika Biotest, Heidelberg, Germany)
• Mikobakterilerin izolasyonu amacıyla antibiyotik karışımı
ve renksiz tetrazolium tuzu içeren modifiye Kirchner BY
– üreme sonucu oluşan mikrokoloniler renkli partiküller şeklinde
makroskobik olarak görülebilir
– Cihaz gerektirmez
– MTB ayırt etmez
– sensitivite % 69 - 87
– Ortalama üreme süresi 15 – 19 gün
Cambau E et al. , J Clin Microbiol 1999; 37: 2013–2015
22. MB/ BacT system (Organon Teknika, Boxtel, Holland)
• Otomatik cihaz
• Kapalı bir sistemde Mycb üremesi ile oluşan CO2’nin
kolorimetrik tespiti
– 1,830 örnek (% 75.7 respiratuar ve % 24.3 non respiratuar)
• Üreme (Tüm Mycb) MB/BacT: %96.5, BACTEC 460 TB: % 99.4, LJ:
% 95.9
• Üreme (M.tb) MB/BacT: 99.1, BACTEC 460 TB: 100, LJ : 98.2%
• BACTEC 460 TB, MB/BacT sisteminden daha hızlı
– Yayma (+) olgularda 8 vs 11.8 gün, p < 0.01
– Yayma (-) olgularda 18 vs 21 gün, p < 0.05)
• Kontaminasyon riski
Rohner P et al. J Clin Microbiol 1997; 35: 3127–3131
Brunello F et al. J Clin Microbiol. 1999; 37: 1206–1209
23. ESP (Extra Sensing Power) culture system II
(Trek Diagnostics, Inc., Cleveland, OH, USA)
• O2 tüketimi sonucu oluşan basınç değişikliğinin takibi
– Middlebrook 7H9
– Otomatik
– MAC için iyi bir seçenek
– Duyarlılık testi için FDA onaylı
• 2,283 örnek, (% 70.7 respiratuar), 149 (%6.5) mikobakteri
– Tüm Mycb için üreme; ESP II: %89, BACTEC: %92, Middlebrook agar:
%89
– MAC için ESP II ile anlamlı düzeyde daha fazla üreme
Woods GL et al. Clinical J Clin Microbiol 1997; 35: 121–124.
24. Septicheck AFB
• Sıvı ve katı besiyeri birarada (bifazik kültür)
– modifiye Middlebrook 7H9 (CO2’den zengin)
– Middlebrook 7H11 / Middlebrook 7H11 – NAP
– Kan dışında tüm örnekler
• Üreme: 20 gün
• Sensitivite: %80-95
– MTB, NTM, diğer ajanlar (respiratuar patojen & kontaminasyon)
Lysis-centrifugation System (Shandon Instruments, Sewickley, PA)
– Kanda basil arama, intrasellüler basiller
– İmmun yetmezlikli hastada MAC izolasyonu
25. MYCOLOR TK® Gelişmiş Otomatize Mikobakteri Kültür Sistemi
• TK MEDIUM® ’a ekilen örnek mikobakteri içeriyorsa, besiyerinin
rengi kırmızıdan sarıya döner
• Mantar veya Gram (-) bakteri kontaminasyonu durumunda
kırmızıdan yeşile döner
• İki saatte bir tüplerin rengini değerlendirir.
• Renk değişikliklerini üreme grafiklerine dönüştürür
27. PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu)
• Nükleik asitlerin, sentetik oligonükleotid primerleri
kullanılarak, in vitro ortamda kopyalanması
• Hedef olarak rRNA veya genomik DNA’nın ayırıcı özellik
taşıyan farklı bölgeleri
• Kopyalama işlemi kısa sürer
• Picogram (pg) seviyesinde hedef molekül, 10 basil/mL
yeterli
• Pahalı (216 TL, Kasım 2010)
28. PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu)
• DNA kontaminasyonu yalancı pozitiflik yaratabilir
– Anti-TB tedavi gören, Yayma (+) temaslısında YP fazla!
• PCR’ın inhibe olması ile yalancı negatiflik
• Sonuçlar klinik bulgular ve diğer laboratuvar yöntemleri
ile birlikte değerlendirilmelidir.
29. Pulmoner TB’de PCR rolü :
• ~ Tüm yayma(+) ve Kültür (+) olguları tespit eder
• yayma(-) aktif TB olgularında hızlı tanı
• yayma(-) olguların % 50-60’nı belirler, invaziv örnek alma
işlemlerinden kurtarır
• yayma(+) olgularda MTB’yi NTM’den (IS6110 sekansı yok) ayırır
• Sensitivite: %83.5, spesifisite: %99, PPV: %94.2
Ekstrapulmoner TB’de PCR rolü :
• Sınırlı
• Yeterli sayıda çalışma yok
• Tanı güçlüğü çekilen TB menenjit, plörezi, perikardial TB vb.
durumlarda yardımcı test
ASLA balgam mikroskopisinin yerini almamalı
30. LAMP
Loop-mediated isothermal amplification
• Yeni bir NAA metodu
– Yüksek spesifite, etkinlik, tekrarlanabilirlik
– Direk balgam veya sıvı (MGIT) ya da katı (Ogawa) BY’deki
üremelerden MTB kompleks, M.avium ve M.intracellulare
identifikasyonu
– Türe spesifik primer, gyrB geni hedeflemek üzere dizayn edilmiş
– Sofistike cihaz gerekmez, küçük ölçekli hastaneye uygun
– Örnek hazırlama, nükleik asid ekstraksiyonu zor, kontaminasyon
riski
Iwamoto T et al J Clin Microbiol 2003;41 :2616-2619
31. TMA / NAA
Transcription Mediated Amplification (TMA)
Nucleic Acid Amplification (NAA)
• Bu teknikler biyolojik değil daha çok kimyasal amplifikasyon ile NA
oluştururlar
• Test saatler içinde tamamlanır
• Halen sadece respiratuar örnekler için
32. Mycobacterium Tuberculosis Direct Test (MTDT)
(Gen-Probe Inc., San Diego, CA)
• Trancription-mediated amplification (TMA) sistemi ile çalışır.
• Hedef 16s ribosomal RNA(rRNA)
• Bir mikobakteri içinde de 2000' in üzerinde rRNA bulunur. Bu nedenle,
1 basil/ml olması tanı için yeterlidir
• Testin sensitivitesi yüksek
• Tüm işlemin tek bir tüpte olması kontaminasyon riskini azaltır
• Hedef rRNA olduğu ve RNA dış ortamda DNA’ dan daha labil olduğu
için kros-kontaminasyon riski de azdır
• Yalancı negatiflik ve pozitiflik oranı PCR’ dan düşüktür
• 5 saatte sonuçlanır
33. Xpert MTB/RIF assay (Cepheid, Sunnyvale, CA, USA)
• Xpert MTB/RIF
• Tam otomatik NAAT platformu
• TB basili tespit eder ve rifampisin direncini belirler.
• CE onaylı, >%95 tanı değeri
[SS-02] Real time PCR yöntemi ile yayma negatif olgularda M. Tuberculosis complex tanısı ve yayma negatif ve pozitif olgularda Rifampisin direncinin erken
saptanması
Suna Türk Şahin1, Meltem Çoban Ağca1, Oğuz Aktaş1, Kadriye Terzioğlu1, Derya Derince Zorlu1, Mualla Partal2, Nurhan İnce3, Ahmet Turan Karagöz1
SONUÇLAR: İki saat gibi kısa bir süre içinde güvenilir sonuçların alındığı Xpert MTB/Rif yönteminin yayma negatif tüberküloz tanısında, özgüllüğünün yüksek olması,
deneyimli ve moleküler test bilgisine sahip personel gerektirmemesi, kolay uygulanabilir olması ile yakın zamanda sık başvurulacak tanısal yöntemler arasında kabul
göreceği görüşündeyiz.
34. Amplicor M. tuberculosis Test
(Roche Diagnostic Systems, Branchburg, NJ)
• PCR sistemi ile çalışır
• Kontaminasyon riski daha çoktur
• ml’ de birden fazla basil bulunmasına ihtiyaç duyar
• 6-7 saatte sonuçlanır.
Q – Beta Replicase Assay (Vysis, Downers Grove IL)
• 23s rRNA’ nın yakalanması ve Q beta replicase
enzimiyle birlikte çoğalabilen bir probun amplifikasyonu
• İnhibisyona rastlanmayışı PCR’ a göre bir üstünlüktür.
35. Farklı örneklerde NAA metodlarının
tanısal etkinliği
• Spesifisite yüksek
• Yayma (+) akc TB’de ise sensitivite yüksek
• EPTB’de AMTD daha sensitif
Eur Respir J 2005; 26: 339–350
36. LCR - Ligase Chain Reaction Test
(Abbott Laboratories Diagnostic Division, Abbott Park, IL)
• İki küçük DNA primeri ve onları birleştiren ligaz enzimi kullanarak,
DNA kopyalarını hızla oluşturmak
• PCR’a göre daha özgüldür ve otomatik saptama sistemi vardır.
• Yayma (+) ve (-) örneklerde sensitivite ve spesifisite yüksek
• Kontaminasyon kontrol sisteminin olmayışı dezavantaj
• LCR ile örnekte 7-8 bakteri/ml bulunması pozitif sonuç almak için
yeterli
37. SDA
Strand Displacement Amplification (SDA)
• PCR’a benzer
• İzotermal bir amplifikasyon metodudur
• Yöntemin spesifitesi aranan etkene özgü DNA dizilerini tanıyacak
primerlerin kullanılmasına bağlıdır.
• 10 basil/ml den az mikobakteri tanı için yeterli
38. Line probe assays (LPA)
• MTB kompleks dahil mikobakterilerin eşzamanlı tespit ve
identifikasyonu
• 16S–23S spacer bölgesinin amplifikasyonu (reverse hybridisation
line-probe assay)
• Yayma (+) örneklerde ilaç direnci tespiti
• 2 ticari LPA mevcut:
INNO-LiPA Rif.TB (Innogenetics NV, Gent, Belgium)
GenoType MTBDRplus (Hain Lifescience GmbH, Nehren, Germany)
• 2008’de WHO LPA testlerini Hızlı MDR-TB tanısı için onayladı
39. FASTPlaque TB assay (BIOTEC, Ipswich, UK)
• M.tb’nin mikobaktreriofaj üremesini desteklemesi esasına dayanır
– Canlı MTB sayısını ifade eden endojen fajlar M. smegmatis gibi hızlı üreyen
mikobakteri içinde tespit edilir.
– Sensitivitesi direk mikroskopiden yüksek
– Manuel, Hızlı
• Takiff H, Heifets L
– Yayma (+)’lerin %13’ünde FASTPlaque TB (-) (YN)
– Yayma (-)’lerin %8-19’unda FASTPlaque TB (+) (YP)
Pozitif: >20 leke Negatif: lekelenme yokTakiff H, Heifets L. Int J Tuberc Lung Dis 2002; 6: 560–561
40. Lusiferase Reporter Phages ( Biotec Laboratories Ltd, Ipswic )
• Lusiferaz enzimini kodlayan geni içeren bakteriofajları canlı
mikobakterileri tespit etmek
• Canlı mikobakteri varsa mikobakteri ile birlikte çoğalır,
• Işık veren hücreler fotometre ile tespit edilir
• Örnekte 500-5000 basil/ml olması yeterli
• Yaklaşık 4 saatte sonuç alınabilir
41. Tür Tayini Metodları
• Konvansiyonel Metodlar
• Immünolojik Yöntemler
• DNA probları ve Hibridizasyon
• Bactec NAP testi
• High Performance Liquid Chromatography (HPLC)
• Gaz Likid Kromatografisi (GLC)
• PCR – RFLP
• LİPA MYCOBACTERiA Test
• DNA sequencing Sistemi
• Mycobacterium tuberculosis’ in moleküler tiplendirmesi
• DNA Chip Teknolojisi
42. Konvansiyonel İdantifikasyon Metodu
• Nitrat redüktaz, katalaz, tween hidroliz
• 2-3 hafta gibi uzun süre
Immünolojik Yöntemler
• MTB complex, MAC, M kansasii’ ye ait
monoklonal antikorlar ile ELİSA
– Rutinde kullanılmamaktadırlar
43. DNA Probları ve Hibridizasyon
• Mikobakteri genomuna özel işaretli DNA parçaları= prob
• Ortamda hedeflenen rRNA varsa, DNA probu hedef RNA
ile birleşir=hibridizasyon
– 1000 - 10000 basil/ml olması gerekmektedir, bu nedenle
kültürde üremiş mikobakteriler için uygun
– tip tayini 2 saatte mümkün
– Pahalı, az sayıda mikobakteriyi isimlendirebilir
– Sonuçların kültür ve biyokimyasal tekniklerle konfirme edilmesini
öneren yayınlar var
• Ticari olarak bulunan problar:
– Accuprobes (GenProbe Inc., san Diego, CA)
– BDProbe Tec ET system (Becton-Dickinson Diagnostic
Systems, Sparks, MD)
– DDH Mycobacteria (Kyokuto Pharmaceutical Industrial Co.,
Tokyo, Japan)
44. BACTEC NAP(ρ-nitro-α-asetilamino-β-hidroksipropiofenon) Testi
• MTB kompleks mikobakterilerinin üremesini inhibe
eder. Diğer mikobakterileri etkilemez
High Performance Liquid Chromatography (HPLC)
• Hücre duvarındaki uzun zincirli yağ asidi (mikolik asid)
tespiti
– Bu yöntem ile 75 mikobakteri isimlendirilebilir.
– Kullanılan aletler çok pahalı
– MTB kompleks içindeki mikobakterileri idantifiye etmek için de
kullanılır
45. Gaz Likid Kromatografisi (GLC)
• Mikobakteri hücre duvarındaki kısa zincirli yağ asitleri saptanması
• 2 saatte 29 mikobakterinin tip ayrımı
• Pahalı
Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length
Polymorphism (PCR – RFLP)
• mikobakterilerde ortak olan hedef bölgesinin PCR ile çoğaltılması,
jel matriksinde elektroforez ile tip tayinini
• Hedef hsp65, rpoB, dnaJ, 16S rRNA, 16S-23S DNA gen bölgeleri
• 75’e yakın mikobakteri tür seviyesinde isimlendirilebilir
• 1 günde sonuçlanır
• Diğer yöntemlerden daha ucuz ve güvenilir
46. Lipa Mycobacteria Test (Innogenetics NV, Ghent, Belgium )
• PCR için hedef 16-23S rRNA
• PCR ve gel elektroforezden sonra 3 saat içinde
sonuçlanır
• Major avantajı birden fazla Mikobakteri çeşidinin varlığını
tespit edebilmesi
MicroSeq 500 System (PE Applied Biosystems)
• PCR için hedef 16S rRNA
• PCR ve gel elektroforezden sonra 4 saat içinde
sonuçlanır
47. DNA Sequencing Sistem
• Son yıllarda en yaygın kullanım alanı
• 16S rRNA’ yı kodlayan DNA bölgesi, PCR ile çoğaltılır ve
bu bölgenin dizisi saptanarak bilgisayar yardımıyla tip
tayini yapılır.
– Özel bir sistem gerektirmektedir, pahalı
– 2 günde sonuçlanabilir
DNA Chip Teknolojisi
• Moleküler biyoloji ile bilgisayar teknolojisi birleştiren bir
sistemdir.
49. Antikor tespiti
• Suboptimal etkinlik
• Pahalı
• Birden çok ag kullanımı sensitiviteyi artırır
• IgG Ab tespitine dayalı birçok test mevcut
• IgM Ab düzeyleri çok düşük, ölçüm zor
• Saf olmayan Ag ile yapılan testlerde YP oranı yüksek
Rutin kullanımda yeri az
50. Antikor tespiti
• MTB ve NTM ayrımında zorluk
• AIDS varlığında ELISA tanı güçlüğü
• Ab titreleri uzun sürede arttığından seroloji
ekstrapulmoner TB (kemik-eklem) tanısında akut
(miliyer) TB’ye oranla daha etkin
• Serodiagnostik testlerin, yayma (-) akc TB, çocukluk TB
ve endemik bölgelerde değeri sınırlı
51. Yeni testler
Mycobact Superoxide Dismutase Ab
– Düşük prevalanslı ülkelerde PPV(93-94%), endemik
bölgeleredekine kıyasla (77-88%) yüksek
TB enfeksiyonundan çok aktif hastalıkla ilişkili
– TB STAT-PAK
• Immuno-chromatographic test
• Plazma veya serumda, aktif veya dormant TB infeksiyonunu
değerlendirme
• Etkinliği?
– Insta test TB
• Aktif TB hastasında kanda antikor tespiti
• Kolloidal altın partiküllerine konjuge edilmiş Ab-bağlayıcı protein ve
membranda sabitlenmiş TB antijenleri
Chan et al Tuberc lung disease 2000
Ramachandranet al, IndJ TB 2003
53. Antigen tespiti
TB MPB 64 patch test
• MPB 64 M.tb complex için spesifik ag
• 3-4 günde pozitifleşir, 1 hf ( +) kalır
– Sensitivite: %~98.1, Spesifisite:~%100
TB MPB 64 ICA test (The Capilia TB Test Kit, TAUNS, Numazu, Japan)
• İmmunochromatographic yöntem
• M.tb – NTB ayrımında hızlı, etkin
– 15 dk’da sonuç
Ind J Tuberc Lung Dis 1998;2: 541
J Clin microbiol 2002, 908–912
54. Clearview TB (ELISA)
• Üriner lipoarabinomannan (LAM)
(Mycb hücre duvarı lipoglycanı)
– Özellikle HIV(+) kişide önemli
– Sensitivite düşük
J Tuberc Lung Dis 2009;13(10):1253–9
55. Interferon gama release assays
(IGRAs)
• in vitro testler
• Antijen ile T-hücre stimülasyonu sonrası IFN-γ salınımı
• Antijenler:
– Early Secretory Antigen Target 6 (ESAT-6),
– Culture Filtrate Protein (CFP-10)
– M.tb genomunun “region of difference 1” (RD1) bölgesinde kodlanmıştır
– BCG ve çoğu NTM (M. kansasii, M. szulgai, M. marinum and
nonpathogenic M.bovis hariç) ile ortak böge değil
– M.tb’a daha spesifik (PPD’ye kıyasla)
• Kesin kanıt olmamakla birlikte çocuk TB tanısında iyi bir yardımcı
test (semptom, radyoloji, temas, mikrobiyolojik analiz)
56. Ticari olarak 2 farklı test:
FDA ve CE onayları var
QuantiFERON-TB Gold® In-Tube (QFT) assay (Cellestis
Ltd., Carnegie, Australia).
• IFN-γ miktarı ölçümü (ELISA)
• Önceleri PPD kullanılmış (TDT ile benzer sorunlar)
• Şimdilerde ESAT-6 and CFP-10
T-SPOT.TB® assay (Oxford Immunotec, Oxford, UK).
• QFR’a benzer.
• Reaktif lenfosit sayısını ölçer
62. Adenosine Deaminaz (ADA)
• Pürin metabolizması ürünü
• Lenfositlerde fazla (T hücre >B hücre)
Bromide Partition Test
• TB Menenjit tanısında
• herpes simplex, listeria, kabakulak, kızamık, piyojenik menenjit ve
hipotiroidizm varlığında YP
Cut-off Sensitivite Spesifisite
Plevral sıvı 50 IU/ml % 95 % 100
Ascites 32.3 IU/ml 89% 98%
BOS 9 IU/ml 100% 100%
63. Tuberculostearic Acid (TBSA)
• TBSA Mycb. hücre duvarında bulunur
• Pahalı
• Özellikle BOS ve balgam
• Sensitivity >95%,Specificity>99%
French M et al. J Clin Microbiol 1998; 54: 987-990
66. Aktif TB tanısıAktif TB tanısı
• Balgam yayma
– Akc TB
• Floresan mikroskopi (sens %10+, kısa süre)
• Santrifüj, kimyasal muamele (sens+, spe aynı)
• Seri örnekleme (sens %2-5+)
• NAAT
– Akc TB, EPTB
• Spe ve PPV yüksek, sens düşük (öz. yayma neg ve EPTB)
• Serolojik Ab tespiti
– Akc TB, EPTB
• Uyumsuz sonuçlar, mikroskopiye anternatif olamaz
67. Aktif TB tanısıAktif TB tanısı
• ADA
– EPTB
• Plevra, perikard, ascites sıvısında yüksek sens ve spe
• INF- γ
– Plevra TB
• Sens ve spe iyi
• Phage amplification assay
– Akc TB
• Spe yüksek, sens düşük (balgam yayma gibi)
• Otomatik sıvı kültürleri
– Akc TB
• Katı kültürlere göre sens yüksek ve hızlı sonuç
68. Latent TB tanısıLatent TB tanısı
• TCT
– LTBI
• BCG’lilerde daha yüksek (+) 15 yılda BCG etkisi azalıyor, 15
mm üzeri aşıdan çok infeksiyona bağlı
• infantil dönem sonrası aşılanmanın etkisi daha uzun ve
kalıcı
• NTM düşük TB prevalansı dışında önemli bir YP nedeni değil
• IGRA
– LTBI
• Mükemmel spe, BCG’den etkilenmez
69. İlaç direnci tanısıİlaç direnci tanısı
• Phage amplification assay
– Hızlı Rifampisin direnci tespiti
• Kültür izolatlarında RIF direnç tespitinde sens yüksek, spe
düşük, direk balgam örneklerinde yeterli veri yok
• LPA (Line Prob Assays) (INNO-LIPA Rif TB, GenoTypeMTBDR)
– Hızlı Rifampisin direnci tespiti
• LIPA: Kültür izolatlarında RIF direnç tespitinde sens ve spe
yüksek, klinik örneklerde sens düşük
• GenoTypeMTBDR assay: Klinik örneklerde de sens ve spe
yüksek
• Kolorimetrik redox-indikatör metodlar ve
NRA (nitrate reductase assay)
– Hızlı Rifampisin direnci tespiti
• Kültür izolatlarında RIF ve INH direnç tespitinde yüksek sens
ve spe
70. ‘‘Evidence-based TB Diagnosis,’’ http://www.tbevidence.org.
(Courtesy of the Stop TB Partnership’s New Diagnostics Working Group; with permission.
Available at: http://www.tbevidence.org.)
Tuberculosis Diagnostics Pipeline
71. • İdeal bir tanı yöntemi:
– Yayma(+) sens ≥%85
– Yayma(-) spe ≥%85
– Elektrik, temiz su, soğuk
zincir!..- hayır
– Eğitim gereksinimi!..- hayır
– Sonuç 1 saatte
Keeler E, Perkins MD, Small P et al., Reducing the global burden of tuberculosis:
the contribution of improved diagnostics Nature S1 49-57 (2006)