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- 1. 先人に学ぼう！ -系統的な文献検索と批判的吟味- 事前学習 兵庫県立尼崎総合医療センター Hospital Care Research Unit 片岡裕貴、辻本啓、辻本康
- 4. 4週間後
- 5. ところが、先行研究のRelated citationsに Ha YE, Song J-H, Kang WK, Peck KR, Chung DR, Kang C-I, et al. Clinical factors predicting bacteremia in low-risk febrile neutropenia after anti-cancer chemotherapy. Support Care. 2011;19(11):1761–7.
- 7. 7
- 8. Step 2: 先人に学ぶ わかっていること 先行研究の系統的検索と吟味 わかっていないこと →何を明らかにしたいのか？
- 9. 構造化された疑問から どのデータベースで どんな検索式を使って文献を検索し どんな条件で該当する文献を選択するか を定義する Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions Version 5.1.0. The Cochrane Collaboration; 2011 系統的検索(Systematic Search)
- 12. PubMed検索式について正しいものを全て選べ • PubMedではアスタリスク "*"を用いることで前 方一致検索を行うことができる • フレーズ検索 (熟語検索)を行う場合は、フレー ズを「」でくくる • PubMed Advancedで検索式を掛け合わせるとき にANDやORを用いる場合、ANDやORはアル ファベットの大文字でも小文字でもどちらでも良 い • PubMed Advancedにおいて検索語の語尾の [tiab]といったサーチタグは主にMeSHを用いた 検索のために使用される 12
- 13. 統制語について正しいものを全て選べ • 統制語には上位概念と下位概念がある • PubMed検索する際に用いられている統制語は MeSHと呼ばれる • 統制語は更新され付け替えられることがある • 検索したい概念の統制語がないことがある • ぴったり合った統制語があると網羅性と適合率が ともに上昇する • 心不全 (Heart Failure)のMEDLINEでの統制語に heart failure syndrome [mh]がある 13
- 16. 発見的検索と系統的検索 発見的検索 系統的検索 目的 適当な情報を一本釣りする 全体像を把握する 日常の検索 向く 不向き 問に対する 答え １つあれば十分 他に何があるか、は問題ではな い 該当するものすべてが必 要 やり方 より答えの出る確率の高い 検索ワードを選ぶ 該当するものの一部だけを見て 選ぶ ？ 記録 残らない 必ず残す (検索日、データベース 検索ワード) 16 諏訪, 2013
- 20. 検索システムごとの差 命令そのまま • Cochrane Library • PubMed(Advanced) • Ovid Medline • 医中誌 裏でいろいろと気を回してくれる • PubMed • Google Scholar 20
- 21. 検索システムごとの差 命令そのまま • Cochrane Library • PubMed(Advanced) • Ovid Medline • 医中誌 裏でいろいろと気を回してくれる • PubMed • Google Scholar 21
- 24. 網羅的な検索式をつくる 24
- 25. 25
- 29. 構造化された疑問をそのまま検索式に #1 AND #2 AND #3 → 140件 これでいいでしょうか？ 2015/4/3 実施 P: 糖尿病患者 ＃1 diabetes I: 減量手術 ＃2 gastrectomy C: 手術しない O: 死亡 ＃3 death OR mortality
- 31. 検索のポイント1 構造化からの検索式 ※治療・介入に関する検索の場合 Patients #1 健康状態を示す用語 AND Intervention/Exposure #2 介入/暴露を表す用語 http://handbook.cochrane.org/chapter_6/6_4_2_structure_of_a_search_strategy.htm ※アウトカムに関連する用語は入れない！ 必ずしも抄録に書かれていないことがある
- 32. 検索のポイント2 統制語(controlled indexing terms)を使う データベース毎に固有のものがある 例:MeSH (MEDLINE), EMTREE (EMBASE) “gastric resection”や”partial gastrectomy”の MeSHは”gastrectomy” 注意点：そのMeSH wordがいつ作られたかもチェック 32
- 33. つまり 「胃切除術」という概念を検索したいとき “gastrectomy”というキーワードのみで検 索するとMEDLINEに収載されている 抄録の中で、 “gastrectomy”が入っている もののみを検索する →”Reau-en Y procedure”とだけ抄録に書 かれていたら検索できない！ 33
- 36. 36
- 37. 37
- 38. 38
- 39. 39 類似語 上位概念 下位概念
- 41. 再出：PICOを検索式に #1 AND #2 AND #3 2015/4/3 実施 P: 糖尿病患者 ＃1 diabetes I: 減量手術 ＃2 gastrectomy C: 手術しない O: 死亡 ＃3 death OR mortality どこがマズイか分かりますか？
- 42. PICOを検索式に #1 AND #2 AND #3 P: 糖尿病患者 ＃1 diabetes I: 減量手術 ＃2 gastrectomy C: 手術しない O: 死亡 ＃3 death OR mortality ポイント1 構造化からの検索式 アウトカムは検索ワードに入れない！
- 43. 再出：PICOを検索式に #1 AND #2 AND #3 P: 糖尿病患者 ＃1 diabetes I: 減量手術 ＃2 gastrectomy C: 手術しない O: 死亡 ＃3 death OR mortality ポイント2 統制語 統制語を使っていない！
- 44. 再出：PICOを検索式に #1 AND #2 AND #3 P: 糖尿病患者 ＃1 diabetes I: 減量手術 ＃2 gastrectomy C: 手術しない O: 死亡 ＃3 death OR mortality ポイント0 網羅性 ポイント 4 キーワードをORで加える
- 46. Meshの検索画面へ 46
- 49. 上位？下位？ 49
- 50. MeSHの解説を読む Diabetes Mellitus, Type 2 Year introduced: 2005 (1984) Previous Indexing: Diabetes Mellitus (1966-1983) 50
- 53. つづいて検索の実行へ 53
- 54. MeSHにはお経のように [mh]をつける！ 54 Diabetes Mellitus, Type 2[mh]
- 55. こんな感じになります 55
- 56. Iの概念は2つあったので”OR” 大文字 でつなぎましょう ＃2 OR #3 56
- 57. 最後にPとIをつなぎます 57
- 59. 例えばこんな風に #1 Diabetes Mellitus, Type2[mh] #2 dm[tiab] OR diabetes[tiab] #3 #1 OR #2 #4 Gastrectomy[mh] #5 Bariatric Surgery[mh] #6 “gastric resection” [tiab] OR gastrectomy [tiab] OR “metabolic surgery” [tiab] OR “weight loss surgery”[tiab] #7 #4 OR #5 OR #6 #8 #3 AND #7 59 DM 胃 切 除
- 62. PubMed検索式について正しいものを全て選べ • PubMedではアスタリスク "*"を用いることで前 方一致検索を行うことができる • フレーズ検索 (熟語検索)を行う場合は、フレー ズを「」でくくる • PubMed Advancedで検索式を掛け合わせるとき にANDやORを用いる場合、ANDやORはアル ファベットの大文字でも小文字でもどちらでも良 い • PubMed Advancedにおいて検索語の語尾の [tiab]といったサーチタグは主にMeSHを用いた 検索のために使用される 62
- 63. 答え • PubMedではアスタリスク “*”を用いることで前方一致検索 を行うことができる →○ • フレーズ検索 (熟語検索)を行う場合は、フレーズを「」で くくる →X “”でくくる • PubMed Advancedで検索式を掛け合わせるときにANDや ORを用いる場合、ANDやORはアルファベットの大文字でも 小文字でもどちらでも良い →X 大文字のみ • PubMed Advancedにおいて検索語の語尾の[tiab]といった サーチタグは主にMeSHを用いた検索のために使用される →X タイトルとアブストから文字列を検索 63
- 64. 統制語について正しいものを全て選べ • 統制語には上位概念と下位概念がある • PubMed検索する際に用いられている統制語は MeSHと呼ばれる • 統制語は更新され付け替えられることがある • 検索したい概念の統制語がないことがある • ぴったり合った統制語があると網羅性と適合率が ともに上昇する • 心不全 (Heart Failure)のMEDLINEでの統制語に heart failure syndrome [mh]がある 64
- 65. 答え • 統制語には上位概念と下位概念がある→○ • PubMed検索する際に用いられている統制語は MeSHと呼ばれる→○ • 統制語は更新され付け替えられることがある→○ • 検索したい概念の統制語がないことがある→○ • ぴったり合った統制語があると網羅性と適合率が ともに上昇する→○ • 心不全 (Heart Failure)のMEDLINEでの統制語に heart failure syndrome [mh]がある→○ 65
- 68. 参考資料 参考資料： • 京都大学医学図書館 "基礎から学ぶ PubMedの使い方" http://www.lib.med.kyoto- u.ac.jp/pdf/pubmed_howto.pdf Last accessed 8/7/2016 • 諏訪敏幸『看護研究者・医療研究者のた めの系統的文献検索概説』第一版 近畿病 院図書室協議会 (2013) 68
Editor's Notes
- 30本弱の論文を読んで、これはいけそう、と考えて基本設計図を作成しました。
- http://pixabay.com/en/portrayal-portrait-crying-cry-baby-89189/
- 系統的文献検索を実施し、その批判的吟味を行うことことを システマティック・レビューと呼びます システマティック・レビューの実施に際しては 構造化された疑問から どのデータベースで どんな検索式を使って文献を検索し どんな条件で該当する文献を選択するか を定義して実施することになります
- みなさん 何だと思いますか？
- それは、全部読むこと
- MEDLINEは一番良く知られた医療系データベースです。 1600万件以上の文献が含まれています。 ただし、これだけでは全ての医学雑誌に載った文献を網羅することはできません。 ついで有名なのがEMBASEになります。 ヨーロッパ系の医学雑誌や薬の開発情報に強いデータベースとされ、2700の雑誌、600万以上のMEDLINEに収載されていない論文が載っているとされます。 Embase includes six million+ records and 2,700+ journals that are not covered by MEDLINE. また、RCTについては、Cochraneの中にも検索用データベースがあります。 日本独自のデータベースといえば医中誌ですね。 この他にも看護系研究に強いデータベースや精神科系の研究に強いデータベースなどいろいろあります。 みなさんのRQに応じて検索データベースを選ぶことになります。
- MEDLINEを検索するフリーサイトが皆さんご存知PubMedになります。 先程もお話したように、有料のMEDLINE検索サービスが使えない場合には、PubMedのadvanced search builderを用いて検索式を作っていくことになります。
- つづいてCochrane libraryに関して、検索式を作っていきましょう https://pixabay.com/ja/%E4%BD%9C%E6%A5%AD-macbook-%E3%82%B3%E3%83%B3%E3%83%94%E3%83%A5%E3%83%BC%E3%82%BF-%E3%83%A9%E3%83%83%E3%83%97%E3%83%88%E3%83%83%E3%83%97-%E3%83%8E%E3%83%BC%E3%83%88%E3%83%96%E3%83%83%E3%82%AF-690680/
- https://infocus.nlm.nih.gov/2016/06/30/pubmed-celebrates-its-20th-anniversary/
- 平成24年度国民医療費の現状より。
- １どうしたらいいですか？と会場にふる。 ２構造化してくださいと。会場にふる。
- Narrative review 都合の良い文献だけをpick upして紹介して、エビデンスが有ると主張してもEBMとはいえません。 やっていることは、お薬セールスマンの人とかわらないですね。 フェアーな臨床的判断をするためには、現存するすべての 関連する研究を総括したのちに、判断する必要が有ります。 その判断に至ったまでの課程を見える化する必要があります。 https://pixabay.com/ja/%E6%AD%8C-%E9%9F%B3%E6%A5%BD-%E3%83%91%E3%83%95%E3%82%A9%E3%83%BC%E3%83%9E%E3%83%B3%E3%82%B9-%E3%82%A8%E3%83%B3%E3%82%BF%E3%83%BC%E3%83%86%E3%82%A4%E3%83%A1%E3%83%B3%E3%83%88-%E3%83%9F%E3%83%A5%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%82%B7%E3%83%A3%E3%83%B3-%E5%A3%B0-531290/
- 問題点の例 他の用語はかんがえられないか？MeSHを使っていない。Free textでさらに追加。 系統的レビューではアウトカムは検索式に加えない。 今回はRCTは少ないかもしれないのでフィルターの使用は不適切 減量手術はGastrectomyのみではない Diabetesのfree text wordのバリエーションを考慮していない(ex. Diabetic patient)
- 言葉の説明 網羅性の高い検索＝該当する研究に関して漏れが少ない 適合率の高い検索＝検索結果の中に含まれる誤った研究が少ない 会場にふる。”さっきの検索式ではどのような問題点があるでしょうか。いまから勉強してもらってまた聞きますね。” Handbook 6.4.4 Sensitivity versus precision
- ポイント： ＃１はP ＃２はI ここに「Outcome」は入らない！ →実際の文献を読んでヒトが判断する アブストラクトにすべてのアウトカムが載っているとは限らないため
- 同じくくりの言葉にしましょう、とか、これはこのくくりの下位にあります。など 例：赤とんぼ ギンヤンマは同じくくり。上位語はトンボ。さらに上位のくくりは昆虫 MeSHは その”くくり”で一括検索できる→網羅的 medline 言い換えると・・・ MeSHは同じ概念に違う単語が沢山有る場合に有効 しかし、注意点はMeSHを作っている人はその分野の専門家ではない ★以下重要！！！！！！！★ MEDLINEでは1976年以前はabstractがほとんどなく、Abstractの中の単語では検索できず、また、1990年代以前はデザインに関するindexがほとんどないため、Publication typeやMeSHでは検索できない ∴ 一つの状態を表すwordはMeSH＋free wordであることが必須！
- 問題点の例 他の用語はかんがえられないか？MeSHを使っていない。Free textでさらに追加。 系統的レビューではアウトカムは検索式に加えない。 今回はRCTは少ないかもしれないのでフィルターの使用は不適切 減量手術はGastrectomyのみではない Diabetesのfree text wordのバリエーションを考慮していない(ex. Diabetic patient)
- 問題点の例 他の用語はかんがえられないか？MeSHを使っていない。Free textでさらに追加。 系統的レビューではアウトカムは検索式に加えない。 今回はRCTは少ないかもしれないのでフィルターの使用は不適切 減量手術はGastrectomyのみではない Diabetesのfree text wordのバリエーションを考慮していない(ex. Diabetic patient)
- 問題点の例 他の用語はかんがえられないか？MeSHを使っていない。Free textでさらに追加。 系統的レビューではアウトカムは検索式に加えない。 今回はRCTは少ないかもしれないのでフィルターの使用は不適切 減量手術はGastrectomyのみではない Diabetesのfree text wordのバリエーションを考慮していない(ex. Diabetic patient)
- 問題点の例 他の用語はかんがえられないか？MeSHを使っていない。Free textでさらに追加。 系統的レビューではアウトカムは検索式に加えない。 今回はRCTは少ないかもしれないのでフィルターの使用は不適切 減量手術はGastrectomyのみではない Diabetesのfree text wordのバリエーションを考慮していない(ex. Diabetic patient)