Presentazione divulgativa sul Progetto Microbioma Italiano tenuta in occasione del workshop sui microorganismi organizzato dalla SIP (Soc. Italiana Protistologia) a Pineto (TE), settembre 2016

1. UNO SGUARDO
NELL’INTESTINO
DEGLI ITALIANI
Andrea Telatin, PhD
BMR Genomics srl & Università di Padova (CRIBI)

2. UNO SGUARDO NELL’INTESTINO DEGLI ITALIANI
BMR GENOMICS SRL
PROGETTO “METABLE”
Spin-off dell’Univeristà di Padova
www.bmr-genomics.it
www.metable.eu

3. CHE IDEA ABBIAMO DEI BATTERI
alti e bassi di un’amicizia centenaria

4. • 1660 - Visti con il microscopio
• 1870 - Identificati come patogeni
• 1940 - Primo antibiotico (penicillina)
Nasce la paura dei batteri…
…si diffonde il concetto di igiene

5. Letteratura popolare 1914-1917

6. 1914-1917

7. Qualcosa sta cambiando
(forse troppo)
MICROBIOMANIA?

8. VEDERE BATTERI & LEGGERE DNA
Una coevoluzione di tecnologia e biologia

9. • Ogni organismo ha un genoma
(istruzioni genetiche)
• Ogni batterio ha un
proprio genoma
• Sequenziare il genoma
equivale a leggere il DNA
(come si fa nei test forensi)

10. SEQUENZIAMENTO DEL DNA
• Si diffonde negli anni ’80 un metodo per
sequenziare singoli pezzi di DNA
• Grazie alla robotizzazione alla fine degli anni ’90
un centro di sequenziamento era in grado di
produrre migliaia di “letture” al giorno
• Il Genoma Umano è stato annunciato nel 2003
Nel frattempo si sono sequenziati anche
diversi batteri

11. BATTERI
ISOLATI

12. LA FOTO DI FAMIGLIA
RESTAVA SCONOSCIUTA

13. • Ogni organismo ha un genoma
(istruzioni genetiche)
• Ogni batterio ha un suo genoma
• L’insieme dei genomi dei
batteri di una comunità
si chiama microbioma
• Sequenziare il genoma
equivale a leggere il DNA
(come si fa nei test forensi)

14. Craig Venter “Ocean Sampling Expedition”
2004-2009

15. • Scoperte nuove famiglie di proteine
• Si è capito molto delle dinamiche della
biomassa terrestre (gli oceani sono i
cantieri metabolici più ricchi del pianeta)
• Trovate migliaia di nuove specie batteriche
nel frattempo cambia la tecnologia…

16. BIODIVERSITÀ

17. “LEGGERE” IL DNA
la nuova generazione

18. VENTERGENOMA UMANO

20. “Sono scesi i costi.
Inoltre si ottengono milioni di
sequenze in un singolo esperimento
di pochi giorni

21. UN OSSERVAZIONE
SULL’OBESITÀ

22. CORRELAZIONE ≠ CAUSALITÀ

23. UN ESPERIMENTO
ACCENDE L’INTERESSE

24. 2006

25. Topo normale Topo obeso
Trapianto fecaleTrapianto fecale
Topi normali
Stessa dieta
per 2 settimane
Topo normale Topo obeso

26. Numero di studi pubblicati con la parola “microbioma”
nel titolo o nel riassunto 2007

27. COME STA CAMBIANDO
LA VISIONE DI NOI

29. IL CONCETTO DI DISBIOSI

30. gut feelings?
• Digestione e
assimilazione degli
alimenti, obesità e
diabete
• Sistema immunitario e
malattie autoimmuni
• Ansia e depressione,
comunicazione
nell’asse “intestino-
cervello”
Ogni giorno nuove
scoperte!

31. CITIZEN SCIENCE
un nuovo modo di finanziare la scienza

32. WWW.MICROBIOMAITALIANO.IT

37. RIASSUMENDO
• Il microbioma indica l’insieme dei genomi dei
microorganismi che abitano in un sito
• Il corpo umano non è solo “umano”. Abbiamo
microbiota (pelle, bocca, intestino…) che fanno
parte integrante del nostro metabolismo
• Fra i tanti distretti di interesse, moltissima ricerca
ha evidenziato un ruolo fondamentale del
microbioma intestinale
• Il progetto “Microbioma Italiano” permette di
diventare parte attiva nell’elucidare alcuni aspetti
di questo argomento di forte attualità.

38. GRAZIE PER
L’ATTENZIONE