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Genetica Guido Barbujani Dipartimento di Biologia, Università di Ferrara [email_address]
Russell  i Genetica, Edises. € 78
Sei cose importanti ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Variabilità Aa aa AA Fenotipo  Genotipo
Vocabolario essenziale ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Solo se c’è variabilità si può comprendere il rapporto fra fenotipo e genotipo ,[object Object],[object Object],pazienti  controlli
Variabilità geografica. Le quattro varietà di rosella,  Platycercus eximius
Biodiversità della flora
Diversità umana
Biodiversità e attività umane
Variabilità diacronica
Variabilità : il punto di partenza per ogni analisi genetica o evoluzionistica è l’osservazione che un certo carattere, o complesso di caratteri, è variabile
Sei cose importanti ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Eredità Genitori e figli si assomigliano Individui imparentati si assomigliano Individui di popolazioni vicine si assomigliano Individui di specie affini si assomigliano  Perché? Ieri: Perché hanno in comune dei fattori ereditari (geni) che determinano l’eredità di caratteri comuni:  Genetica formale Oggi: Perché hanno in comune tratti di DNA ereditati dai genitori:  Genetica molecolare
Eredità: il DNA       5' -  G T A A T C C T C  - 3'                    |  |  |  |  |  |  |  |  |       3' -  C A T T A G G A G  - 5'                              
Eredità: il DNA       5' -  G T A A T C C T C  - 3'                    |  |  |  |  |  |  |  |  |       3' -  C A T T A G G A G  - 5'    
Eredità: il DNA
Quanto DNA in una cellula? Nell’uomo: 6 miliardi di paia di basi nei 46 cromosomi 1 base    0,8 m μ 6 miliardi di basi    5 m di DNA in 5-20  μ 5-20  μ
Quanto DNA in una cellula? 6 miliardi di paia di basi 1 base    0,8 m μ 6 miliardi di basi    5 m di DNA in 5-20  μ Foglio A4, 60 battute per riga. 30 righe = 1800 basi su ogni foglio, due facciate    2000 basi Se 100 fogli = 1 cm 6 miliardi di paia di basi    15000 cm = 150 m
Il DNA fa l’RNA, l’RNA fa le proteine, e mai viceversa   Più precisamente: l’informazione biologica procede, con pochissime eccezioni, dal DNA all’RNA e dall’RNA alle proteine
Eredità Linea pura:  un gruppo di organismi che si trasmettono una certa caratteristica fenotipica inalterata attraverso le generazioni
Eredità
Eredità Rapporti mendeliani
Fenotipo e genotipo Gene normale  emoglobina A Gene alterato  emoglobina S L’emoglobina S precipita formando cristalli I globuli rossi assumono forma di falce Lisi rapida dei gl. rossi  Disturbi circolatori Anemia  Danni a vari organi Resistenza alla malaria  Insufficienza cardiaca  Reumatismo
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Il contesto ecologico del cambiamento evolutivo La nicchia ecologica che una specie occupa concorre a determinare fertilità e mortalità dei suoi individui
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Evoluzione darwiniana 2. Questa variabilità è, almeno in parte, ereditaria
Evoluzione darwiniana 3. Nel contesto ambientale in cui si trovano, individui diversi hanno fertilità o mortalità diverse Verdi = 5/15 = 1/3
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Evoluzione darwiniana: la nuova sintesi L’evoluzione è il cambiamento delle caratteristiche genetiche di una popolazione, per effetto della selezione naturale, o del caso, o di tutti e due E allora: Solo le popolazioni, non gli individui possono evolversi: la genetica evoluzionistica studia le popolazioni
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La possibilità di estrarre e caratterizzare DNA da reperti fossili ha aperto nuove frontiere in genetica e in sistematica Questi concetti sono alla base dello studio moderno dell’evoluzione
Studiare il DNA antico è complicato
Possible sources of contamination deposition  stasis  excavation/  laboratory museum time     CAUSES aDNA aDNA modDNA  modDNA  modDNA  multiple  burials funer. rites patogens microorg. plants animals archeologists personnel mol. biologists; PCR
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Confronti fra sequenze di DNA -TA G GAACATC A GGC- -TA T GAACATC A GGC- -TA T GAACATC G GGC- Siti variabili Conta delle differenze a coppie
0 10 20 30 10000 20000 30000 40000 50000 Anni fa Differenze nucelotidiche Confronti a coppie (media  ±   3 err. std.) con 2566 sequenze moderne europee 4 campioni dalle Alpi 2 Cro-Magnon 3 Neandertal
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  • 1. Genetica Guido Barbujani Dipartimento di Biologia, Università di Ferrara [email_address]
  • 2. Russell i Genetica, Edises. € 78
  • 3.
  • 4. Variabilità Aa aa AA Fenotipo Genotipo
  • 5.
  • 6.
  • 7. Variabilità geografica. Le quattro varietà di rosella, Platycercus eximius
  • 12. Variabilità : il punto di partenza per ogni analisi genetica o evoluzionistica è l’osservazione che un certo carattere, o complesso di caratteri, è variabile
  • 13.
  • 14. Eredità Genitori e figli si assomigliano Individui imparentati si assomigliano Individui di popolazioni vicine si assomigliano Individui di specie affini si assomigliano Perché? Ieri: Perché hanno in comune dei fattori ereditari (geni) che determinano l’eredità di caratteri comuni: Genetica formale Oggi: Perché hanno in comune tratti di DNA ereditati dai genitori: Genetica molecolare
  • 15. Eredità: il DNA      5' - G T A A T C C T C - 3'                 | | | | | | | | |      3' - C A T T A G G A G - 5'                             
  • 16. Eredità: il DNA      5' - G T A A T C C T C - 3'                 | | | | | | | | |      3' - C A T T A G G A G - 5'    
  • 18. Quanto DNA in una cellula? Nell’uomo: 6 miliardi di paia di basi nei 46 cromosomi 1 base  0,8 m μ 6 miliardi di basi  5 m di DNA in 5-20 μ 5-20 μ
  • 19. Quanto DNA in una cellula? 6 miliardi di paia di basi 1 base  0,8 m μ 6 miliardi di basi  5 m di DNA in 5-20 μ Foglio A4, 60 battute per riga. 30 righe = 1800 basi su ogni foglio, due facciate  2000 basi Se 100 fogli = 1 cm 6 miliardi di paia di basi  15000 cm = 150 m
  • 20. Il DNA fa l’RNA, l’RNA fa le proteine, e mai viceversa Più precisamente: l’informazione biologica procede, con pochissime eccezioni, dal DNA all’RNA e dall’RNA alle proteine
  • 21. Eredità Linea pura: un gruppo di organismi che si trasmettono una certa caratteristica fenotipica inalterata attraverso le generazioni
  • 24. Fenotipo e genotipo Gene normale emoglobina A Gene alterato emoglobina S L’emoglobina S precipita formando cristalli I globuli rossi assumono forma di falce Lisi rapida dei gl. rossi Disturbi circolatori Anemia Danni a vari organi Resistenza alla malaria Insufficienza cardiaca Reumatismo
  • 25.
  • 26.
  • 27.
  • 28.
  • 29.
  • 30.
  • 31.
  • 32.
  • 33. Il contesto ecologico del cambiamento evolutivo La nicchia ecologica che una specie occupa concorre a determinare fertilità e mortalità dei suoi individui
  • 35.
  • 36.
  • 37.
  • 38.
  • 39.
  • 40. Evoluzione darwiniana 2. Questa variabilità è, almeno in parte, ereditaria
  • 41. Evoluzione darwiniana 3. Nel contesto ambientale in cui si trovano, individui diversi hanno fertilità o mortalità diverse Verdi = 5/15 = 1/3
  • 42. Evoluzione darwiniana 3. Nel contesto ambientale in cui si trovano, individui diversi hanno fertilità o mortalità diverse
  • 43.
  • 44. Ma non dimentichiamo il caso Verdi = 0/3
  • 45. Ma non dimentichiamo il caso Verdi = 1/15
  • 47. Evoluzione darwiniana: la nuova sintesi L’evoluzione è il cambiamento delle caratteristiche genetiche di una popolazione, per effetto della selezione naturale, o del caso, o di tutti e due E allora: Solo le popolazioni, non gli individui possono evolversi: la genetica evoluzionistica studia le popolazioni
  • 48.
  • 49. La possibilità di estrarre e caratterizzare DNA da reperti fossili ha aperto nuove frontiere in genetica e in sistematica Questi concetti sono alla base dello studio moderno dell’evoluzione
  • 50. Studiare il DNA antico è complicato
  • 51. Possible sources of contamination deposition stasis excavation/ laboratory museum time     CAUSES aDNA aDNA modDNA modDNA modDNA multiple burials funer. rites patogens microorg. plants animals archeologists personnel mol. biologists; PCR
  • 55.
  • 56.
  • 57. I Neandertal formano un gruppo separato negli alberi che descrivono la variabilità genetica Ma cosa significa?
  • 58. mtDNA sequences of the oldest European Homo sapiens sapiens studied so far Paglicci Cave: 23,000 years bp Caramelli et al. (2003) PNAS 100: 6593-6597
  • 59. Confronti fra sequenze di DNA -TA G GAACATC A GGC- -TA T GAACATC A GGC- -TA T GAACATC G GGC- Siti variabili Conta delle differenze a coppie
  • 60. 0 10 20 30 10000 20000 30000 40000 50000 Anni fa Differenze nucelotidiche Confronti a coppie (media ± 3 err. std.) con 2566 sequenze moderne europee 4 campioni dalle Alpi 2 Cro-Magnon 3 Neandertal
  • 61.