Reproduksi bakteri terjadi secara aseksual melalui pembelahan biner atau secara seksual melalui konjugasi, transduksi, dan transformasi. Pembelahan biner adalah pembelahan langsung tanpa tahap mitosis. Konjugasi melibatkan transfer gen melalui jembatan sitoplasma. Transduksi memanfaatkan virus fag untuk merekombinasi gen bakteri. Transformasi terjadi ketika bakteri mengambil DNA langsung dari bakteri lain.