Avogadro adalah editor pemodelan molekul terbuka sumber yang dapat diunduh untuk Windows, Linux, dan Mac. Aplikasi ini memungkinkan pengguna untuk membuat dan mengedit model molekul serta melakukan simulasi sederhana. Avogadro memiliki antarmuka intuitif dan fitur seperti otomatisasi optimasi untuk membangun dan memodifikasi model molekul.

1. AVOGADRO
Avogadro adalah salah satu aplikasi kimia berupa editor pemodelan molekul. Aplikasi ini
dirancang untuk berbagai jenis platform sistem operasi. Avogadro yang tersedia dapat
dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X. Kode sumber sumber tersedia di
bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya
sangat kecil (tidak lebih dari 10 MB). Aplikasi ini digunakan secara fleksibel dalam kimia
komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya.
Dengan aplikasi ini kita dapat dengan mudah membuat animasi senyawa tertentu seperti
yang diinginkan sekaligus melakukan editing dari senyawa yang telah kita rancang. Apa
yang dapat dilakukan Avogadro?
1. Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari PDB (protein data/bank) atau
PubChem (database dari molekul kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis).
2. Inovatif “auto-optimation”, alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun
dan memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.
3. Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.
4. Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.
5. Embedded interpreter Python.
6. Terjemahan tersedia dalam 19 bahasa lebih, termasuk antar muka juga sudah bisa
berbahasa Indonesia, tersisa hanya beberapa bagian saja yang belum
dialihbahasakan.
7. Cross-Platform. Molekul pembangun / editor untuk Windows, Linux, dan Mac OS X.
8. Intuitif. Dibangun untuk dapat digunakan dengan mudah bagi mahasiswa dan
peneliti lebih lanjut.
9. Cepat. Mendukung multi-threaded rendering dan komputasi.
10. Extensible. Plugin arsitektur bagi pengembang, termasuk rendering, tool interaktif,
perintah, dan skrip Python.
11. Fleksibel. Fitur OpenBable yang dapat digunakan untuk impor file-file kimia lain,
input untuk beberapa paket kimia komputasi, kristalografi, dan biomolekul.
Menginstal Avogadro sangat mudah. Apabila Anda belum memiliki aplikasi Avogadro, Anda
dapat mengunduhnya disini. Setelah diunduh, hasil unduhan Avogadro dibuka lalu klik run
kemudian akan muncul kotak dialog seperti dibawah ini.
1. Double klik pada icon Avogadro.

2. 2. Klik kolom next yang terdapat dibawah dan kotak dialog selanjutnya akan muncul
seperti dibawah ini.
3. Klik “I agree” sebagai tanda bahwa anda setuju dan akan muncul kotak dialog
seperti dibawah ini.
4. Pilih add Avogadro to the system PATH for all users dan Create Avogadro Desktop
Icon kemudian klik Next dan akan muncul kotak dialog seperti dibawah ini.

3. 5. Kotak dialog diatas untuk mengetahui tempat dimana software avogadro ini akan di
munculkan. Software avogadro diatas diletakkan di program file yang berada pada
hardisk C dan jika ingin mengganti tempat klik browse dan pilih akan diletakkan
dimana software Avogadro. Setelah sesuai dengan keinginan maka langsung klik next
dan akan muncul kotak dialog dibawah ini.
6. Klik Install kemudian tunggu beberap menit sampai proses penginstalan selesai lalu
klik finish maka program Avogadro telah siap untuk digunakan.
Lalu bagaimana cara menggunakan aplikasi ini? Dalam pengoperasian aplikasi ini dapat
dikatakan tidak sulit, dan disini saya akan menjelaskan langkah demi langkah
pengoperasian aplikasi ini. Pada tutorial kali ini kita akan belajar membuat
pemodelan struktur 2-Methyl 2-Butena dengan menggunakan Avogadro. Langkah yang
harus dilakukan adalah sebagai berikut:

4. 1. Buka aplikasi Avogadro yang telah diinstall. Tampilan awal Avogadro adalah sebagai
berikut.
2. Sebelum memulai, terlebih dahulu pada Draw Setting kita klik untuk menghilangkan
centang pada Adjust Hydrogen. Hal tersebut dilakukan agar lebih memudahkan kita
pada saat menggambar struktur utama 2-Methyl 2-Butena.
3. Kemudian kita mulai dengan menggambar atom karbon dan ikatannya dengan klik
pada Draw Tool .
4. Kemudian setelah struktur utama sudah terbentuk, kita tambahkan ikatan rangkap
pada atom karbon no.2 dengan cara pilih Bond Order Double pada Draw Settings.

5. 5. Setelah itu, klik pada rantai karbon no.2 untuk menjadikan ikatan tersebut menjadi
rangkap dua.
6. Kemudian tambahkan atom hydrogen dengan cara klik menu Build lalu pilih dan
klik Add Hydrogens.
7. Maka akan terbentuk struktur molekul karbon lengkap dengan hidrogennya seperti
pada gambar berikut.
8. Selanjutnya gunakan Auto Optimization Tool untuk mengoptimisasi bentuk
molekulnya lalu klik Start.

6. 9. Maka tampilan struktur molekul akan menjadi seperti berikut.
10. Anda juga dapat mengukur panjang dan sudut ikatan dengan menggunakan
Measure atau F12. Maka akan memperoleh hasil ukuran seperti berikut.

7. Demikian tutorial mengenai aplikasi kimia Avogadro. Semoga bermanfaat!