Penelitian ini menganalisis hubungan antara parameter fisiko-kimia dengan afinitas 200 turunan kloramfenikol terhadap protein target ribosom 70S secara in silico. Hasilnya menunjukkan parameter sterik berpengaruh signifikan terhadap afinitas sedangkan parameter hidrofobik dan elektronik kurang berpengaruh. Senyawa KR-197 memiliki afinitas tertinggi.

1. Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur
Aktivitas Senyawa Turunan Kloramfenikol
terhadap Ribosom 70S secara In Silico
Fedora Wikayana Putri

2. Jenis penelitian ini adalah penelitian in silico.
Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis hubungan parameter fisiko-kimia
terhadap anfinitasnya setelah diuji pada protein target secara in silico.
Penulis ingin melakukan optimasi senyawa kloramfenikol secara teoritik dan
membandingkannya dengan senyawa kloramfenikol konfensional secara in silico
Penelitian dilakukan di Laboratorium Komputasi Biomedik dan Perancangan
Obat, Fakultas Farmasi, Universitas Indonesia.

3. Skema penelitian
Docking
200 senyawa
Derivat
Kloramfenikol
π
σ
Es
ΔG
10 Senyawa
Terbaik
Menghitung
parameter
Melakukan
Mendapatka
n
HKSA

5. Penambatan virtual
Highest
avinity

6. 10 besar Senyawa Terbaik Derivat Kloramfenikol yg berikatan dengan Ribosom 70 S

7. 10 Substituen
Terbaik
Senyawa Substituen
R1 R2 R3 R4
KR-197 NO2 OH CHCl2
KR-135 NHCO-C6H5 OH OH CHCl2
KR-144 C6H11 OH OH CHCl2
KR-015 NO2 OH OH C6H5
KR-195 NO2 OH CHCl2
KR-094 NO2 OH (CH2)2C6H5 CHCl2
KR-050 NO2 (CH2)2C6H5 OH CHCl2
KR-102 NO2 OH C6H5 CHCl2
KR-007 NO2 OH OH (CH2)2C6H5
KR-049 NO2 CH2C6H5 OH CHCl2
KR-001 NO2 OH OH CHCl2
Struktur Substitusi Kloramfenikol

8. Log P, HOMO-LUMO- Dimensi Van der
Waals 10 senyawa terbaik
Peringkat Senyawa Log P
1 KR-197 -0.57
2 KR-135 2.03
3 KR-144 3.05
4 KR-015 1.45
5 KR-195 2.06
6 KR-094 4.03
7 KR-050 4.19
8 KR-102 3.29
9 KR-007 1.88
10 KR-049 3.74
Peringkat Senyawa Log P
1 KR-197 -0.57
2 KR-135 2.03
3 KR-144 3.05
4 KR-015 1.45
5 KR-195 2.06
6 KR-094 4.03
7 KR-050 4.19
8 KR-102 3.29
9 KR-007 1.88
10 KR-049 3.74
Peringkat Senyawa Dimensi Van
der Waals
1 KR-197 586,52
2 KR-135 497,59
3 KR-144 501,08
4 KR-015 436,55
5 KR-195 627,29
6 KR-094 513,82
7 KR-050 543,36
8 KR-102 452,99
9 KR-007 498,25
10 KR-049 512,43

9. Kesimpulan
 Uji HKSA dengan cara penambatan virtual berbasis
komputer mendukung penelitian HKSA yang sebelumnya
pernah dilakukan secara konvensional
 Parameter hidrofobik dan elektronik pada 200 model
senyawa turunan kloramfenikol tidak memiliki pengaruh
yang cukup signifikan terhadap afinitasnya dengan
protein target ribosom 70S, sementara parameter sterik
berupa dimensi Van der Waals pada model senyawa
memiliki pengaruh yang signifikan terhadap afinitas
model senyawa.

10. Kesimpulan
 6-[2-(2,2-dichloroacetamido)-3-hydroxy-3-(4-
nitrophenyl)propoxy]-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic
dengan kode senyawa KR-197 memiliki afinitas terbaik
dengan nilai -7.6 melebihi afinitas kloramfenikol
konvensional.
 Setelah dilakukan penambatan molekuler didapat hasil
bahwa senyawa dengan struktur D-threo dengan klorida
pada rantai samping yang masih memiliki gugus nitro
mempunyai afinitas terbaik, lalu parameter sterik
mempengaruhi jangkauan gugus tersebut pada reseptor.