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MING CHUAN UNIVERSITY
生命科學
生命科學緒論
https://sites.google.com/view/ribowsone/
講 師 : 許綸中
大學通識課程
人生目的不外乎 : 「生得好,老的慢,病得輕,死得安」
Birth生
Aging 老
Sickness 病
Death 死
Joy 喜
Anger 怒
Sorrow 哀
Happiness 樂
基因 人生
為什麼要研究生命科學?探索生命現象最實用的意義
基因體
( 後基因體 : 蛋白質體、藥物基因體 . . . )
網路
資源開放
近代(21世紀)生命科學發展的基石
人類基因體計畫的起源
人類基因體計畫最早的構想由美國能源部
(DOE)發起
到了 1989年 美國國家衛生研究院(NIH)
才成立了人類基因體研究中心
但以當時的技術若要將所有人類的DNA都
定序完成,需要花上 1500年 !
結果 2000年 就結束了 !為什麼 ?
核酸排序解釋
先說26個英文字母,字母的排列組合成單字,單字再排列組
合成句,句子再構成文章。
英文有26個字母 : ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ
BETTER是單字 THAN是單字 BRIAN是單字
BETTER THAN BRIAN 是句子
句子+句子+句子+ . . . =文章
核酸排序解釋
那DNA的語言呢?
DNA的語言有四個字母 : A T C G
腺嘌呤 胞嘧啶
鳥嘌呤胸腺嘧啶
核酸排序解釋
那DNA的語言呢?
DNA的語言有四個字母 : A T C G
DNA的單字 : 只能有三個字母構成
⚫ A、T、C、G 任取三個的排列組合
⚫ 所以單字總共只有64個
核酸排序解釋
就是 ATG、TTG、TCA ……等,所以 A、T、C、G 的排列組合按計
算可排列出 64 個單字(生物學稱:譯碼 code),64 個譯碼(單
字)再逢機排列組合成亂碼(沒文法,不成句的亂寫),在這些亂
碼中如果出現,有功能、有作用的片段(有文法的句子),即稱之
為基因(一段可以讀的出意義的句子)。
我們把 A、T、C、G 定義為 4 個字母(相較英文的 26 個),然後
每三個字母構成的單元稱為單字。
句子+句子+句子+ . . . =文章
基因+基因+基因+ . . . =基因體
核酸排序解釋
細胞
細胞核
染色體
DNA
染色體
人類染色體 有46條 23對
那人類這46條染色體共有多少鹼基對要解碼呢?
人類基因組,又稱人類基因體,是指人的
基因組,由23對染色體組成,其中包括22
對體染色體、2或1條X染色體和0或1條Y染
色體。人類基因組含有約30億個DNA鹼基
對。
人類有46條染色體,位於細
胞核,是遺傳物質DNA和一
些蛋白質纏繞而成。
電子顯微鏡下
的人類染色體
人類基因組含有約30億個DNA鹼基對
A對T、C對G 的配對規則
鹼基對
鹼基對
你能想像這樣的30億組資訊書寫在紙本上,會是什麼樣的情況?
TCAGGGGCAGATCCAGTCCAGCCCGTCCCTCAATAAAGGCCCTGACATCCCAGGA
GCCAGCAGAAGCAGGGCAAGATGGAGCGGAGACGTATCACCTCTGCACGCCGCT
CCTATGCCTCCTCCGAGACGATGGTCAGGGGCCATGGTCCTACCAGACACCTGGG
TACCATTCCGCGCCTCTCCCTGTCTCGAATGACGCCTCCACTCCCTGCCAGGGTAG
ACTTCTCCCTGGCCGGGGCGCTCAATGCCGGCTTCAAAGAGACTCGGGCCAGCG
AGCGCGCGGAGATGATGGAGCTCAATGACCGCTTTGCTAGCTACATCGAGAAGGT
CCGCTTCCTGGAACAGCAAAACAAGGCGCTGGCAGCTGAGCTGAACCAGCTTCG
AGCCAAGGAGCCCACCAAACTGGCTGACGTTTACCAGGCAGAACTTCGGGAGCT
GCGGCTGCGTCTGGACCAGCTTACTACCAACAGTGCCCGGCTGGAGGTGGAGAG
GGACAATCTCACACAGGACCTCGGCACCCTGAGGCAGAAGTGAGAAGGGGAATA
GGAAAATGGCTAGTGAGCAGAGAGACTGAATTGAGAGAGGAGCCTGGAAGAAGG
GTACTGCCTCCCCCTAAGGAGAGCCTCTTAGCTGCTGTGTTTCAAAAGGGAGAGCT
GTCTTTGTTCCCTAATATGATGCAGAATAGCCAGGAAGAGACTGAAAACTTCAGGG
ATCAGATTCCCAGAGAGAGCTGAGCATTCTGGGTACTTACCACCAAGCTGAGGGA
GGACTGTGTGTGGGTAGCCAGGGTACAAGCAGGCAGGTGCTTCAGTCACTGGGC
ACTATGAATGGCCAGAGAGGTTTGCGTCCACAAGGAGGGCTCTTGGTCTCTGAAA
TATAAGAAATGCAAGAAAGAGCAGGCAGGCCTGGATGCCGGGCCCAGATGGCTGT
1995以前多靠人工編輯 就算有電腦,那個時代的也不好用
想要搞清楚一個基因就困難重重了,更別談什麼基因體
基因體
( 後基因體 : 蛋白質體、藥物基因體 . . . )
網路
資源開放
近代(21世紀)生命科學發展的基石
所以才會說 抽掉 電腦、網路,基因體學根本無法存在
人類基因體計畫的起源
人類基因體計畫最早的構想由美國能源部
(DOE)發起
到了 1989年 美國國家衛生研究院(NIH)
才成立了人類基因體研究中心
但以當時的技術若要將所有人類的DNA都
定序完成,需要花上 1500年 !
結果 2000年 就結束了 !為什麼 ?
預計要花1500年才能解碼所有的人類染色體,除了電腦其他技術也相對落後
人類基因體計畫 | 關鍵的1995年
1995年之前,大學生的報告
都用500字稿紙寫成,1995
之後 ~
⚫ 從人工解讀到序
列自動輸出。
⚫ 從人工比對,到
電腦自動化搜尋。
⚫ 錯誤率大減!
⚫ 研究速度破千倍!
⚫ WIN98之後又
進入網路時代,
資料庫興起,都
加速了發展!
人類基因體計畫 | 從紙本 進化到 IT 自動化
WIN95問世的初期還看不出對科學研究較為明顯的影響,但WIN98以後
阿波羅登月計畫
製造原子彈
曼哈頓計畫
人類基因體計畫
被稱為人類科學史上的三個最浩大的工程 ! 之 時代演進
原本基因體計畫預計要花1500年
近代分子生物學的快速演進發現DNA結構 1953
發明DNA重組技術 1973
DNA聚合脢連鎖反應 1983
發明人類基因治療法 1990
發明複製羊技術 1997
完成人類基因體初稿 1999
宣佈近入後基因體時代 2000
微陣列生物晶片急速發展 2000
21世紀唯一不變的事就是”變 ”
圖中硬幣 是慶祝 DNA雙股螺旋結構 發現 50週年 的 紀念幣
基因體
( 後基因體 : 蛋白質體、藥物基因體 . . . )
網路
資源開放
近代(21世紀)生命科學發展的基石
接下說說,資源開放這個議題
人類基因體計畫 | 公開的基因資料庫,可任意下載運用
圖面上的網頁,是一個可以下載各種生物種基因序列的資料庫
Celera的人類基因專利權爭奪戰!
商業勢力的興起
CELERA 1998年 成立, 是商業性的生物科技公司。
採用全基因體霰彈槍式的定序方法。
以果蠅約137 MB的染色體來試驗霰彈槍式的定序方法。
在短短的三個月就完成果蠅的基因體定序。
1999年 宣布其人類基因體定序總長度已至少涵蓋人類基因體長度的 90 %,
而預定在2003年全部完成。
就曾妄想搶先登記所有的基因專利,那它憑什麼可以這麼想?
Celera的靠山 | 龐大的科技帝國 ~ PerkinElmer
基因體霸業的興衰
PerkinElmer成立於 1931 年是一家美
國的跨國技術公司
⚫人類健康和環境的分析
⚫食品和消費品安全
⚫醫療成像的硬體與軟體製造
⚫藥物開發設備
業務領域囊括 :
⚫診斷儀器
⚫基因檢測和診斷工具
⚫工業應用分析儀器製造
http://en.wikipedia.org/wiki/PerkinElmer
因為CELERA隸屬於一個叫PerkinElmer的巨大集團
Celera投資金額僅3億美元,為國際計劃的十分之一
預計不到五年就是在 2003年全部完成人類基因體定序
而美國國家衛生研究院(NIH)預計2005年完成定序為目標
商業勢力的興起
Celera 想要搶先登記所有的基因專利
如此 Celera就可以坐擁基因資料庫廣收過路財。
這種專利主張的極限有可能發展為,你、我源自父母的基因都得付費,因為我們
用這些基因來活著,這會引發嚴重的人權問題!?所以也迅速引起各界的反對!!!!
Celera的人類基因專利權爭奪戰!
Science Business
當年的爭議性人物~
創始CEO
Dr. Craig Venter
以下引用浩然另類全球化計畫國際
志願者部落格的一段文:
「科學知識與研究生產過程,皆不
應該被少數人或專家所壟斷,既然
科學研究經費大多是來自公民(繳
的稅),科學家和研究者理應回應
公民們的期待,分享成果和經驗,
並讓公民也參與研究過程。」
CELERA 1998年 成立,起步比1989年 美國國家衛生研究院(NIH)晚,雖然發明了更先
進的技術,但難道都沒有用到NIH的研究做為基礎?
Celera的人類基因專利權爭奪戰!
商業勢力的興起
Dr. Craig Venter
(Celera Genomics CEO)
Dr. Francis Collins
(跨國計劃代表, NIH)
2000 年6月美國總統柯林頓宣布所有人類基因組數據
不允許專利保護,且必須對所有研究者公開
Celera 的股票價
格一路下挫
2002年創始CEO
Dr. Craig Venter
被董事會解職
http://www.wikinvest.com/stock/CELERA_CORP_(CRA)/Data/Minimum_Adjusted_Stock_Price/2000
Celera的人類基因專利權爭奪失利!
之後Celera 的股票價格一路下挫,2002年創始CEO Venter也被董事會解職
商業勢力的興起
Dr. Craig Venter
(Celera Genomics CEO)
Dr. Francis Collins
(跨國計劃代表, NIH)
台灣當時的 陽明醫學院 與 榮民總醫院,也組成榮陽團隊參與其中
在此順道一提,當時的基因體計畫,是一個以美國NIH為首的跨國計畫
2001年 2月,NIH團隊與
Celera 公司,分別將研究
成果發表於2001年
《NATURE》與
《SCIENCE》
兩份期刊。期刊的發表只
是像徵性的意義
真正有用的其實是公開
在NCBI讓任何人免費不
限次數,可成批下載又
註解清楚的序列資訊。
免費 與 生物科技的數位化
論文發表只是象徵性的意義,真正重要的是開放資訊!
摩爾定律
不是科學上什麼艱深的法則,它只
是預言積體電路發展的一條線,是
由英特爾創始人之一的戈登·摩爾於
1965 年提出來的,簡單地說,每一
美元所能買到的電腦性能,將每隔
18~24 個月翻兩倍以上,而這樣的
趨勢已經維持了半個世紀,預估將
至少可以持續到 2015~2020 年。
但這個定律目前應該是2017年就不管用了
個人基因體定序 | 從摩爾定律看發展趨勢
所以當電腦價格越低、效能越高、使用越簡便,其普及程度就會越廣,對產
業及生活的影響也越大,所以摩爾定律也用來預測其他產業的發展。
這裡借用吳念真臉書上的一段話,來描述這個時代的變化最為貼切 :
剛剛在一本書裡看到的一段:
1968年NASA最高檔電腦的計算能力大約等同現在的
手機。
那時候一群人用它來發射火箭,登陸月球。
現在我們用它來發射一隻憤怒的鳥去撞無辜的豬。
人類基因體計畫 | 從摩爾定律看發展趨勢
這邊說明一下憤怒鳥ANGRY BIRD,早期很紅的APP遊戲
北七無極限!這是個容許幹很多蠢事的時代
基因體(DNA)定序的價格
過去 Celera 公司投資 3 億美元,選定 5 位代表性人種,預計不到五年就是在
2003 年完成全部人類基因體定序,如果我們以此為據,那就是每個人要花 6
千萬美元,這一看就知道全民基因體定序是不可能的!但那是 2003 年的事
了,現在呢?
但如果要實施依個人基因不同而量身打造個人化專屬醫療
基因體(DNA)定序的價格
按美國國家基因
體研究所 NIH 公
布的資料,在
2007 年之前,基
因體定序價格發
展趨勢還貼近摩
爾定律,在此之
後就分道揚鑣了!
所以就這個趨勢來看,個人化的基因體定序在未來是負擔的起的
基因體(DNA)定序的價格
2014年一月BBC news
報導一台一天能做5個
人,花費只要1000美元
/每人 的機器。按這種
速度發展,未來價格降
到10美元是可能的,這
意味著全民基因體定序
的時代快到了。
現在被稱為次世代定序,就2014年的價格為一個人一千美元
https://youtu.be/aIJT2lRqhwk
千鈞一髮 (電影) : 基因歧視議題
劇情
在未來的人類世界中,有錢人可以選擇優良的基因。
文生天生帶有幾項缺陷:弱視、情緒化及短暫壽命。
但是文生夢想成為太空人,為了達到心願,他假冒
傑洛米進入太空公司。傑洛米因為一次意外導致癱
瘓,將他的優良基因證明賣給文生。文生通過各種
測試,獲得登上太空船的機會。
就在文生要展開宇宙之旅一個星期前,該項太空任
務的指揮官遭人謀殺,所有太空人都是嫌疑犯,文
生被迫接受更嚴格的基因檢驗,真實身份面臨被揭
穿的危機。
接來我們就以這部影片探討 一下人權、歧視的議題
千鈞一髮 (電影) : 基因歧視議題
⚫ 基因歧視未來會是新的社會問題嗎?如果把種族、膚色、身材、美醜 等歧視
拿來比較,其實這些身體特徵也跟基因有關
⚫ 缺陷基因 不一定會導致疾病,也許有其他的健康基因可以互補,或生活條
件的改善 都可避免,事實上很多基因健檢提供的診斷報告,也只是提供發
病機率! 況且沒有任何生物的基因是絕對完美的!任誰都會有缺陷!
其實無論什麼理由!我們都不應該歧視任何人

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