医学統計のはじめの一歩
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第３０回日本急性血液浄化学会のよくわかるセミナーで講演した資料です。
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医学統計のはじめの一歩
- 1. 医学統計のはじめの一歩 第30回日本急性血液浄化学会学術集会 2019/10/27 浜松 川崎医療福祉大学医療技術学部臨床工学科 川崎医科大学附属病院MEセンター ○小野淳一 よくわかるセミナー16
- 2. 演題発表に関連し、開示すべきCO I 関係にある 企業などはありません。 日本急性血液浄化学会 ＣＯ Ｉ 開示 筆頭演者氏名：小野 淳一
- 5. リサーチ・クエッションとは？ クリニカル・クエッション リサーチ・クエッション 臨床現場で直面する様々な疑問のこと クリニカル・クエッションを、具体的かつ 明確で実現可能な研究の形に構造化したもの
- 6. 良いリサーチクエッションの要件 • 真に興味深く • 独自性があり • 切実な問題 • 倫理的で • 実施可能性 • 科学的に測定可能な • 要因・介入が修正可能な • outcomeが改善可能な • 構造化された • 具体的・明確な表記を用いて 研究テーマ を絞り込む 実験計画を 想定する 構造化 する 福原俊一：臨床研究の道標~7つのステップで学ぶ研究デザイン,健康医療評価研究機構
- 10. 統計解析ソフトを選ぼう！ 自分にあった統計解析ソフトを見つけよう R言語とは…？ オープンソース・フリーソフトウェアの統計解析向けの プログラミング言語及びその開発実行環境である （Wikipediaより引用） JMP SASSPSS R言語 107,800円 620,000円/年239,300円 無料
- 12. フリー統計ソフト EZRとは？ R言語 ＋ Rコマンダー →EZR（Easy R） 追加パッケージ （R言語にGUI機能を追加） Rコマンダーの機能拡張を利用 （医療統計機能を充実化） 統計ソフトEZRは神田善伸先生（自治医科大学さいたま医療センター）により開発された （統計解析向け言語）
- 15. 統計解析の実際 1. A群とB群を要約しよう 2. 正規性を確認しよう 3. 2群間に差があるか検定しよう A群 B群 53 110 56 141 63 155 68 54 71 53 57 52 58 49 35 41 63 32 46 20 71 11 64 15 50 52 43 13 57 57 57.0 57.0 平均値
- 16. 統計解析の実際 1. A群とB群を要約しよう 2. 正規性を確認しよう 3. 2群間に差があるか調べよう A群 B群 53 110 56 141 63 155 68 54 71 53 57 52 58 49 35 41 63 32 46 20 71 11 64 15 50 52 43 13 57 57 57.0 57.0 平均値
- 17. A群 B群 データ数 15 15 平均 57.0 57.0 標準偏差 10.4 44.5 中央値 57.0 52.0 最小値 35 11 最大値 71 155 A群 B群 35 11 43 13 46 15 50 20 53 32 56 41 57 49 57 52 58 52 63 53 63 54 64 57 68 110 71 141 71 155 57.0 57.0 並 び 替 え 中央値 平均値 A群とB群を要約しよう 基本統計量
- 18. 統計解析の実際 1. A群とB群を要約しよう 2. 正規性を確認しよう 3. 2群間に差があるか検定しよう A群 B群 53 110 56 141 63 155 68 54 71 53 57 52 58 49 35 41 63 32 46 20 71 11 64 15 50 52 43 13 57 57 57.0 57.0 平均値
- 19. 正規分布とは？ 平均±1 SD ＝68.3% 平均±2 SD ＝95.4% 平均±3 SD ＝99.7% 標準偏差：SD （σ：シグマ） データの分布が平均値を頂点とした 左右対称の山形で表示される
- 20. -1 0 1 35 40 45 50 55 60 65 70 norm quantiles Dataset$A群 A群 frequency 30 40 50 60 70 80 0 1 2 3 4 5 B群 frequency 0 50 100 150 200 0 1 2 3 4 5 6 7 -1 0 1 20 40 60 80 100 120 140 160 norm quantiles Dataset$B群 A群 B群 正規性を確認しよう（グラフを用いた確認） ヒストグラム QQプロット
- 21. B群 0 50 100 150 200 0.000 0.002 0.004 0.006 0.008 W = 0.82702 p-value = 0.008347 W = 0.95772 p-value = 0.6529 A群 30 40 50 60 70 80 0.000 0.005 0.010 0.015 0.020 0.025 0.030 A群 B群 正規性の検討 Shapiro-Wilk normality test p-value ＜ 0.05 正規分布に従わない A群 B群 35 11 43 13 46 15 50 20 53 32 56 41 57 49 57 52 58 52 63 53 63 54 64 57 68 110 71 141 71 155 57.0 57.0 並 び 替 え 中央値 平均値 正規性を確認しよう（統計解析）
- 23. 統計解析の実際 A群 B群 53 110 56 141 63 155 68 54 71 53 57 52 58 49 35 41 63 32 46 20 71 11 64 15 50 52 43 13 57 57 57.0 57.0 平均値 1. A群とB群を要約しよう 2. 正規性を確認しよう 3. 2群間に差があるか検定しよう
- 24. 統計検定の考え方 帰無仮説 対立仮説 2群間に差を認めない 2群間に差を認める 判断基準：有意水準（P<0.05） 帰無仮説が稀であるか判別する 帰無仮説を棄却 （否定）できない 帰無仮説を棄却 （否定）できる 2群間に差を認めない 2群間に差を認める （P＞= 0.05） （P<0.05）
- 25. 2群間に差があるか検定しよう 対応がある t検定 Student t検定 ウエルチの検定 Wilcoxonの符号付 順位和検定 Man-Whitney のU検定 パラメトリック検定 （母集団の分布が正規分布を仮定する） ノンパラメトリック検定 （母集団の分布を仮定しない） 正規分布 対応がある 対応がない 非正規分布 or N<25 対応がある 対応がない 2群間を比較する
- 26. 2群間を比較しよう B群 0 50 100 150 200 0.000 0.002 0.004 0.006 0.008 W = 0.82702 p-value = 0.008347 W = 0.95772 p-value = 0.6529 A群 30 40 50 60 70 80 0.000 0.005 0.010 0.015 0.020 0.025 0.030 A群 B群 正規性の検討（ Shapiro-Wilk normality test） 帰無仮説：データの母集団は正規分布に従っている 対立仮説：データの母集団は正規分布に従っていない 正規性を棄却できない？ 正規性を棄却できる データ数がN=15（N<25）と少なく、正規性を棄却できることを見逃している危険性あり
- 28. 対応がある t検定 Student t検定 ウエルチの検定 Wilcoxonの符号付 順位和検定 Man-Whitney のU検定 パラメトリック検定 （母集団の分布が正規分布を仮定する） ノンパラメトリック検定 （母集団の分布を仮定しない） 正規分布 対応がある 対応がない 非正規分布 or N<25 対応がある 対応がない 2群間を比較する 2群間に差があるか検定しよう
- 29. Man-WhitneyのU検定 グループ 分類 A -1 A 0 B 2 A -1 B 1 A -1 B -1 B 2 B 0 A 2 A -1 B 2 B 3 B 1 A -1 A 2 A -1 B 1 疾患：A群、B群 蛋白尿（-, ±, 1+, 2+, 3+ )
- 30. 0 1 2 3 Disease A B 0 1 2 3 4 5 6 7 A B -1 0 1 2 3 Disease Uprotein Man-WhitneyのU検定の解析結果 グループ 分類 A -1 A 0 B 2 A -1 B 1 A -1 B -1 B 2 B 0 A 2 A -1 B 2 B 3 B 1 A -1 A 2 A -1 B 1 疾患：A群、B群 蛋白尿（-, ±, 1+, 2+, 3+ ) ヒストグラム 箱ひげ図 最小値 25％ 中央値 75％ 最大値 A群 -1 -1 -1 0 2 B群 -1 1 1 2 3 基本統計量 P=0.0379
- 31. 本講演を終わるにあたり（まとめ） 臨床知見と既存研究（理論）のギャップに注目し、 研究の種「クリニカルクエッション」を持とう クリニカルクエッションを構造化することにより、 「リサーチクエッション」に変換しよう 自分にあった統計解析ソフトを見つけよう 実際に統計解析を行ってみよう 実際に透析解析を行うと苦手意識が少なくなります