Statstical Genetics Summer School 2023
http://www.sg.med.osaka-u.ac.jp/school_2023.html
Aug 25-27th 2023, Osaka University, The University of Tokyo, RIKENm, Japan
Statstical Genetics Summer School 2023
http://www.sg.med.osaka-u.ac.jp/school_2023.html
Aug 25-27th 2023, Osaka University, The University of Tokyo, RIKENm, Japan
211104 @ BioC Asia 2021 Workshop
Introduction to Bioimage Analysis in R
This workshop covers basic methods of the image processing and image analysis in R using the Bioconductor package “EBImage” and the Orchestra platform. In addition, the image dataset is obtained from ExperimentHub using the “BioImageDbs” package. Using this dataset, we perform a supervised image segmentation using the U-NET model, one of deep learning models, provided by the rMiW package.
このワークショップでは、BioconductorパッケージであるEBImageを使って、Rでの画像処理・画像解析の基本的な方法を扱う。次に、BioImageDbsパッケージを用いて、ExperimentHubからの画像データの取得を行う。さらに、rMiWパッケージが提供する、Deep learningモデルの1つであるU-NETモデルを用いて、教師有り画像セグメンテーション(領域分割)を学び。このワークショップは、Orchestra環境にて実施する。
リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の脂溶性低分子に対する系統的相互作用解析
Systematic Interaction Analysis of Human Lipocalin-type Prostaglandin D Synthase with Small Lipophilic Ligands
1. R note on Mac OS X
Satoshi Kume, Ph.D.
140729 ver 1.1
「R」 とは?
データマイニング(※)、統計計算、およびグラフィックスのための言語・環境である。
多様な統計手法(線形・非線形モデル・古典的統計検定・時系列解析・判別分析など)
とグラフィックスを提供し、広汎な拡張が可能である。
※ データマイニング: 大量のデータを解析し、そのデータの中から情報(相関関係やパターンなど)を
抽出する技法や方法論のこと。
http://www.r-project.org/
index.html
1.「R」のダウンロード・インストール