SlideShare a Scribd company logo
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Ohjelmistovertailu
Johannes Pernaa (2013)
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Mallinnusohjelmistot
● Ilmaisia / maksullisia
● Tarvitsee asentamisen tietokoneelle / ei tarvitse
asentaa
● Suomenkielisiä / englanniksi
● Ajetaan verkon yli
● Käyttöjärjestelmäriippuvainen / -riippumaton
● Kuoleva / elinvoimainen
● Ammattikäyttöön / opetuskäyttöön
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Pitää siis miettiä
● Hinta
● Ylläpito
● Kieli
● Koulutus
● Valmis materiaali
● Käyttöliittymän selkeys
● Vakaus
● Yhteensopivuus
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Chemsketch
● Kemian piirto-ohjelmisto
● Reaktioyhtälöt ja mekanismit
● Laboratoriovälineet ja kuvaajat
● Hyvin rajoittuneet laskentamahdollisuudet
● Rakenteen optimointi
● Kuvien ja animaatioiden teko onnistuu
● Ei kunnollista 3D-visualisointia
● Englanninkielinen (http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/)
● Tutoriaali: http://exordio.qfb.umich.mx/CHEMSK_R.pdf
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Avogadro (1.0.3) (1)
● Cross-Platform: Windows, Linux, and Mac OS X.
● Free, Open Source: GNU GPL
● International: Translations into e.g. Chinese,
French, German, Italian, Russian, Spanish...
● Partial Finnish
● Intuitive: Built to work easily for students and
advanced researchers both.
● Fast rendering and computation.
● Flexible: Features include Open Babel import of
chemical files, input generation for multiple
computational chemistry packages
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Avogadro (1.0.3) (2)
● Kuvien tekoon erinomainen
● Pikseli ja vektorikuvat
● Yhteensopiva muiden ohjemistojen kanssa
● Export / Import
● Ei tarvitse asentaa
● Hyvät tukisivustot: http://avogadro.openmolecules.net/
● Paljon valmiita opetusmalleja ja käyttötutoriaaleja
● Ongelma vakaus
● Kaatuu vähän valiä
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Spartan student
● Kaupallinen ohjelmisto
● MFKA välittää Suomessa
● Paljon enemmän työkaluja kuin Avogadrossa
● Selkeä käyttää
● Tasokkaat visualisoinniit
● Enemmän Wavefunction keskittynyt
● Eli rajapinnat muiden ohjelmistojen kanssa eivät
ole niin kehittyneet
● Sähköpostituki ja hyvät käyttötutoriaalit (Eng)
Lähde:
http://en.wikipedia.org/wiki/Cyanide
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Jmol (1)
● Visualisointiohjelmisto
● Lukee lähes kaikkia kemian tiedostotyyppejä
● Alkeellinen molekyylien rakennustyökalu
● Geometrian optimointi
● Käytetyin interaktiivisten molekyylimallien
verkkopohjainen visualisointityökalu
● Wikipedia
● Protein data bank
● Myös stand alone -ohjelmistona
● Ei vaadi asentamista
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Jmol (2)
● Laaja käyttäjäyhteisö
● Kehittyy nopeasti
● Tukipalvelut
● Paljon valmista materiaalia
● Suomenkielinen versio
● Esimerkkejä esim.:
● http://www.edumendo.fi/jmol.html
● http://www.edumol.fi/mallinnus
● http://jmol.sourceforge.net/
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta www.helsinki.fi/yliopisto
Vertailu
● Laskenta A J S
● Avogadro Semi-empirical
● Jmol Molecular mechanics
● Spartan Ab initio
● Piirtäminen C
● Rakentaminen A J S
● Kuvan tekeminen A C J S
● Visualisointi J

More Related Content

More from Johannes Pernaa

Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020
Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020
Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020
Johannes Pernaa
 
Innostava kemian opettaja muuttaa maailmaa
Innostava kemian opettaja muuttaa maailmaaInnostava kemian opettaja muuttaa maailmaa
Innostava kemian opettaja muuttaa maailmaa
Johannes Pernaa
 
Kehittamistutkimus 2017
Kehittamistutkimus 2017Kehittamistutkimus 2017
Kehittamistutkimus 2017
Johannes Pernaa
 
Miksi opiskella kemiaa 2017
Miksi opiskella kemiaa 2017Miksi opiskella kemiaa 2017
Miksi opiskella kemiaa 2017
Johannes Pernaa
 
ChemistryLab Gadolin - Esera 2017
ChemistryLab Gadolin - Esera 2017ChemistryLab Gadolin - Esera 2017
ChemistryLab Gadolin - Esera 2017
Johannes Pernaa
 
Sähköisistä oppimateriaaleista kasvua
Sähköisistä oppimateriaaleista kasvuaSähköisistä oppimateriaaleista kasvua
Sähköisistä oppimateriaaleista kasvua
Johannes Pernaa
 
Verkkokurssin suunnittelu -koontiluento
Verkkokurssin suunnittelu -koontiluentoVerkkokurssin suunnittelu -koontiluento
Verkkokurssin suunnittelu -koontiluento
Johannes Pernaa
 
Tämä on e-kirja 17.4.2016
Tämä on e-kirja 17.4.2016Tämä on e-kirja 17.4.2016
Tämä on e-kirja 17.4.2016
Johannes Pernaa
 
Monialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissä
Monialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissäMonialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissä
Monialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissä
Johannes Pernaa
 
Työpaja: Verkkokurssin laatiminen
Työpaja: Verkkokurssin laatiminenTyöpaja: Verkkokurssin laatiminen
Työpaja: Verkkokurssin laatiminen
Johannes Pernaa
 
Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)
Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)
Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)
Johannes Pernaa
 
Hypekäyrä TVT-suunnittelussa
Hypekäyrä TVT-suunnittelussaHypekäyrä TVT-suunnittelussa
Hypekäyrä TVT-suunnittelussa
Johannes Pernaa
 
Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014
Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014
Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014
Johannes Pernaa
 
Sähköiset arviointikäytänteet S2014
Sähköiset arviointikäytänteet S2014Sähköiset arviointikäytänteet S2014
Sähköiset arviointikäytänteet S2014
Johannes Pernaa
 
Edumol user guide (V 2.0)
Edumol user guide (V 2.0)Edumol user guide (V 2.0)
Edumol user guide (V 2.0)
Johannes Pernaa
 
3d-webprojekti
3d-webprojekti3d-webprojekti
3d-webprojekti
Johannes Pernaa
 
Big data ja sen mahdollisuudet
Big data ja sen mahdollisuudetBig data ja sen mahdollisuudet
Big data ja sen mahdollisuudetJohannes Pernaa
 
Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014
Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014
Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014
Johannes Pernaa
 
TVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjat
TVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjatTVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjat
TVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjat
Johannes Pernaa
 
Sähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluento
Sähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluentoSähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluento
Sähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluentoJohannes Pernaa
 

More from Johannes Pernaa (20)

Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020
Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020
Modernia teknologiaa kemian opetukseen – 2020
 
Innostava kemian opettaja muuttaa maailmaa
Innostava kemian opettaja muuttaa maailmaaInnostava kemian opettaja muuttaa maailmaa
Innostava kemian opettaja muuttaa maailmaa
 
Kehittamistutkimus 2017
Kehittamistutkimus 2017Kehittamistutkimus 2017
Kehittamistutkimus 2017
 
Miksi opiskella kemiaa 2017
Miksi opiskella kemiaa 2017Miksi opiskella kemiaa 2017
Miksi opiskella kemiaa 2017
 
ChemistryLab Gadolin - Esera 2017
ChemistryLab Gadolin - Esera 2017ChemistryLab Gadolin - Esera 2017
ChemistryLab Gadolin - Esera 2017
 
Sähköisistä oppimateriaaleista kasvua
Sähköisistä oppimateriaaleista kasvuaSähköisistä oppimateriaaleista kasvua
Sähköisistä oppimateriaaleista kasvua
 
Verkkokurssin suunnittelu -koontiluento
Verkkokurssin suunnittelu -koontiluentoVerkkokurssin suunnittelu -koontiluento
Verkkokurssin suunnittelu -koontiluento
 
Tämä on e-kirja 17.4.2016
Tämä on e-kirja 17.4.2016Tämä on e-kirja 17.4.2016
Tämä on e-kirja 17.4.2016
 
Monialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissä
Monialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissäMonialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissä
Monialaiset oppimiskokonaisuudet Peda.netissä
 
Työpaja: Verkkokurssin laatiminen
Työpaja: Verkkokurssin laatiminenTyöpaja: Verkkokurssin laatiminen
Työpaja: Verkkokurssin laatiminen
 
Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)
Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)
Tämä on e-kirja ja näin se tehdään (2015)
 
Hypekäyrä TVT-suunnittelussa
Hypekäyrä TVT-suunnittelussaHypekäyrä TVT-suunnittelussa
Hypekäyrä TVT-suunnittelussa
 
Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014
Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014
Forssan Peda.net-koulutus 8.12.2014
 
Sähköiset arviointikäytänteet S2014
Sähköiset arviointikäytänteet S2014Sähköiset arviointikäytänteet S2014
Sähköiset arviointikäytänteet S2014
 
Edumol user guide (V 2.0)
Edumol user guide (V 2.0)Edumol user guide (V 2.0)
Edumol user guide (V 2.0)
 
3d-webprojekti
3d-webprojekti3d-webprojekti
3d-webprojekti
 
Big data ja sen mahdollisuudet
Big data ja sen mahdollisuudetBig data ja sen mahdollisuudet
Big data ja sen mahdollisuudet
 
Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014
Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014
Sähköinen oppikirja oppimisympäristönä - ITK 2014
 
TVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjat
TVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjatTVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjat
TVT-opetuksessa: Sähköiset oppikirjat
 
Sähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluento
Sähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluentoSähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluento
Sähköiset oppimisympäristöt LUMA-aineissa avausluento
 

Ohjelmistovertailu - KMV 2013