Kisi-kisi USBN Pendidikan Agama Islam SMP mencakup 4 bidang yaitu Al-Qur'an, Aqidah, Akhlak, dan Fiqh serta Sejarah Peradaban Islam. Materi yang diujikan meliputi ayat-ayat Al-Qur'an, hadis, ketentuan-ketentuan ibadah, dan sejarah peradaban Islam. Soal-soal akan menguji pengetahuan, pemahaman, penerapan, dan penalaran siswa terkait materi tersebut.