Mesin frais CNC memiliki bagian utama seperti meja mesin, spindel, dan panel kontrol seperti mesin frais konvensional. Mesin frais CNC dilengkapi sistem kontrol numerik berbasis komputer untuk mengontrol gerakan alat potong secara otomatis berdasarkan program CNC. Program CNC terdiri dari blok-blok instruksi yang mengendalikan setiap langkah pemesinan.