طرح تحول نظام سلامت سرلوحه فعالیت ها و برنامه های این وزارت قرار گرفت که در این راستا چندین نشست، همایش و اجلاس جهت هم اندیشی تخصصی طراحی نظام مذکور در قالب کارگروه های تخصصی و با هدف تدوین دستورالعمل های اجرایی این طرح با حضور روسا، معاونین درمان ، بهداشت، غذا و دارو واساتید دانشگاه های علوم پزشکی کشور، مسوولان و مدیران ارشد وزارت بهداشت و صاحب نظران حوزه بیمه و اقتصاد سلامت با مشارکت معاونت درمان وزارت بهداشت و شورای سیاستگذاری برگزار گردید.
در این راستا ۸ بسته خدمتی سلامت زیر جهت پیشبرد اهداف وازرتی تدوین و از ۱۵ اردیبهشت ماه ۱۳۹۳ اجرایی شد:
برنامه کاهش میزان پرداختی بیماران بستری در بیمارستانهای وابسته به وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی
برنامه حمایت از ماندگاری پزشکان در بیمارستان های مناطق محروم
برنامه حضور پزشكان متخصص مقیم در بيمارستانهای وابسته به وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی
ارتقای کیفیت خدمات ویزیت در بیمارستانهای وابسته به وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی
برنامه ارتقای کیفیت هتلینگ در بیمارستانهای وابسته به وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی
برنامه ترویج زايمان طبيعي
نظارت بر حسن اجرای برنامه های تحول سلامت
تعرفه گذاری خدمات سلامت جمهوری اسلامی ایران در سال ۱۳۹۳