Praktikum ini bertujuan untuk mengekstrak dan mengidentifikasi asam nukleat dari bagian tanaman seperti brokoli menggunakan deterjen dan garam. Sampel diekstrak dengan menumbuk bagian tanaman hingga halus kemudian dicampur dengan larutan garam dan deterjen. Campuran disaring dan diekstrak dengan ethanol untuk memisahkan asam nukleat dari komponen sel lainnya.

1. PENUNTUN PRAKTIKUM
BIOKIMIA
PROGRAM STUDI S1 FARMASI
FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS MALAHAYATI BANDAR LAMPUNG
2016

2. PRAKTIKUM 1
ASAM NUKLEAT
1. PENDAHULUAN
Unit terkecil dari suatu kehidupan adalah sel yang merupakan pabrik kecil dimana
bahan-bahan dasar seperti asam amino, lipin dan elemen-elemen dasar lain-nya diterima,
dan senyawa-senyawa baru yang lebih kompleks (protein, lipida kompleks, karbohidrat
dan asam nukleat) diproduksi. Ribuan enzim yang berbeda diperlukan untuk kelangsungan
proses-proses biokimia dalam sel. Setiap sel mem-punyai kemampuan mengandakan diri
dengan kode DNA sebagai cetak biru, bahan-bahan dasar sebagai komponen penyusun
dan dengan bantuan katalis enzim (Kirby, 1990).
Menurut model Watson-Crick, makro molekul DNA merupakan utas ganda dimana
pita-pita komponen dihubungkan oleh ikatan hydrogen. Ikatan-ikatan ini sangat stabil,
namun akan terlepas pada pemanasan 95 o
C sampai 100 o
C dan akan menempel lagi bila
temperatur diturunkan pada 65 o
C. Unit dasar dari DNA adalah nukleotida yang terdiri
dari basa (Adenin, Guanin, Timin dan Sitosin), gula dioksiribosa dan grup fosfat.
Nukleotida-nukleotida itu saling dirangkaikan dengan ikatan-ikatan fosfodiester kovalen
yang menghubungkan karbon 5’ pada sebuah gugus dioksiribosa dengan karbon 3’ pada
gugus berikutnya. Keempat macam basa tersebut tersambung ke rantai gula fosfat .
Gambar.6 Struktur DNA (The National Health Museum, 1999)
Masing-masing basa purin (Adenin an Guanin) selalu berpasangan dengan basa
pirimidin (Timin dan Sitosin). Adenin selalu berpasangan denganTimin sedang-kan Guanin

3. selalu berpasangan dengan Sitosin sehinga menghasilkan suatu model pilih ganda
simetris. Semua basa dari molekul DNA selalu berada di sebelah dalam pilin ganda
dengan gula-fosfat di sebelah luar. Dengan demikian basa-basa pada untaian yangsatu
berada dekat sekali dengan basa-basa pada untaian yang lain. Pasangan-pasangan basa
ini ditautkan oleh ikatan-ikatan hydrogen yang relatif lemah, Adenin dengan Timin diikat
oleh dua atom hydrogen, Guanin dan Sitosin diikat oleh tiga atom hydrogen (Stansfield,
1983)
Sel tumbuhan terbungkus dalam membran sitoplasma yang dikelilingi sel yang
kuat. Untuk mengeluarkan DNA dari dalam sel terlebih dahulu harus meng-hancurkan
membran dan dinding sel tersebut. Cara yang paling sering dilakukan pada bakteri adalah
dengan menggunakan bahan kimia. Selain itu, seperti yang sering dilakukan pada
tanaman, dapat pula dilakukan dengan cara fisik yaitu meng-hancurkan sel menggunakan
mortar dan pestle pada kondisi beku dengan bantuan nitrogen cair. Tepung sel yang
diperoleh melalui cara fisik ini kemudian dilarutkan dengan beberapa bahan kimia,
kemudian disentrifugasi untuk memisahkan supernatan yang mengandung DNA, RNA dan
protein dari sel.
2. TUJUAN
Praktikum ini bertujuan untuk mengetahui penampakan asam nukleat dari bagian
tanaman.
3. BAHAN DAN METODE
3.1 Bahan
3.1.1 Sayuran misalnya broccoli/bunga kol
3.1.2 Detergent bubuk sebanyak 0,7-0,8 sendok teh
3.1.3 Garam meja sebanyak 2,5 sendok teh
3.1.4 Ethanol 70%
3.2 Alat
3.2.1 Beaker glass ukuran 200 ml dan 500 ml
3.2.2 Sendok teh
3.2.3 Mortar dan pestle
3.2.4 Saringan teh
3.2.5 Chop stick (pengaduk/sumpit)
3.3. Metode
3.3.1 Timbang bunga kol/brokoli sebanyak 5 gram
3.3.2 Tumbuk sampai halus menggunakan mortar dan pestle
3.3.3 Tambahkan 5 mL akuades
3.3.4 Tambahkan garam : deterjen dengan perbandingan = ½ : 1, 1 : 1 dan 1 : ½

4. 3.3.5 Diamkan selama 15 menit
3.3.6 Saring menggunakan saringan teh ke dalam beaker glass
3.3.7 Sebanyak 2,5 mL filtrat dimasukkan ke dalam tabung reaksi
3.3.8 Tambahkan ethanol 70% dua kali lipat volume cairan hasil penyaringan
menggunakan chop stick/pengaduk secara perlahan-lahan.
3.3.9 Tunggu beberapa saat dan perhatikan dua lapisan yang terbentuk dalam beaker
glass.
3.3.10 Amati dan catat perubahan yang terbentuk.
4. Pertanyaan Pendahuluan
1. Apa yang dimaksud dengan asam nukleat?
2. Apa yang dimaksud dengan DNA dan RNA?
3. Sebutkan unit dasar penyusun nukleotida!
4. Tuliskan rumus umum dari asam amino.