Mechanisms to correct damaged DNA. Replication errors that have escaped the proof-reading process. Damage that may occur in non-replicating DNA Mismatch repair Excision repair Recombination(post-replication) repair S.O.S. repair

1. Gene Expression
DNA REPAIR MECHANISMS

2. DNA repair
 Mechanisms to correct damaged DNA.
A. Replication errors that have escaped the proof-reading process.
B. Damage that may occur in non-replicating DNA
1. Mismatch repair
2. Excision repair
3. Recombination(post-replication) repair
4. S.O.S. repair

3. Mismatch repair
‫همانندسازی‬ ‫اشتباه‬ ‫ترین‬ ‫ساده‬:‫جدید‬ ‫رشته‬ ‫داخل‬ ‫باز‬ ‫یک‬ ‫اشتباهی‬ ‫شدن‬ ‫وارد‬:‫سبب‬ ‫تواند‬ ‫می‬ ‫رفع‬ ‫عدم‬‫موتاسیون‬‫شود‬.
‫سلول‬ ‫راهکار‬:
1-‫؟‬ ‫است‬ ‫صحیح‬ ‫اطالعات‬ ‫دارای‬ ‫رشته‬ ‫کدام‬
2-DNA‫شود‬ ‫می‬ ‫متیله‬ ‫بالغ‬(‫توالی‬ ‫در‬ ‫موجود‬ ‫آدنین‬ ‫روی‬ ‫متیل‬ ‫اضافی‬ ‫گروههای‬ ‫وجود‬GATC)
3-‫نیست‬ ‫متیل‬ ‫گروههای‬ ‫دارای‬ ‫ابتدا‬ ‫در‬ ‫جدید‬ ‫رشته‬(hemi methylated)
4-‫کند‬ ‫می‬ ‫شناسایی‬ ‫را‬ ‫نابجا‬ ‫بازهای‬ ‫سلول‬.
5-‫میدارد‬ ‫بر‬ ‫را‬ ‫نشده‬ ‫متیله‬ ‫رشته‬ ‫از‬ ‫کوچکی‬ ‫ناحیه‬.
6-‫کند‬ ‫می‬ ‫پر‬ ‫را‬ ‫حاصله‬ ‫شکاف‬.
7-‫را‬ ‫مکانیسم‬ ‫این‬(methyl-directed mismatch repair)‫نامیم‬ ‫می‬.

4. Excision repair
‫پیریمیدین‬ ‫دایمر‬ ‫تشکیل‬(Pyrimidine dimer)‫اشعه‬ ‫اثر‬ ‫در‬UV
‫دایمر‬ ‫تشکیل‬:‫دوتایی‬ ‫مارپیچ‬ ‫در‬ ‫بدشکلی‬ ‫ایجاد‬ ‫و‬ ‫شدن‬ ‫کج‬DNA:‫برشی‬ ‫ترمیم‬ ‫مکانیسم‬ ‫شدن‬ ‫فعال‬
‫اندونوکلئاز‬ ‫توسط‬ ‫برش‬(uvrA,B,C)
‫توسط‬ ‫شکاف‬ ‫پرکردن‬DNA‫پلیمراز‬1
‫؟؟؟‬ ‫فوق‬ ‫ژنهای‬ ‫در‬ ‫موتاسیون‬

5. Recombination repair
، ‫یافته‬ ‫موتاسیون‬ ‫باکتری‬ ‫از‬ ‫دیگری‬ ‫نوع‬ ‫در‬
‫اشعه‬ ‫به‬ ‫طبیعی‬ ‫غیر‬ ‫حساسیت‬ ، ‫سالم‬ ‫برشی‬ ‫ترمیم‬ ‫وجود‬ ‫با‬UV‫شود‬ ‫می‬ ‫دیده‬.
‫ژن‬ ‫در‬ ‫نقص‬recA‫دارند‬:‫است‬ ‫عمومی‬ ‫نوترکیبی‬ ‫مسئول‬.
‫؟‬ ‫برشی‬ ‫ترمیم‬ ‫دوگانه‬ ‫نقش‬
DNA‫دیده‬ ‫آسیب‬:‫بازها‬ ‫شدن‬ ‫جفت‬ ‫در‬ ‫اختالل‬
‫گرداند‬ ‫می‬ ‫مختل‬ ‫را‬ ‫همانندسازی‬ ‫طبیعی‬ ‫روند‬.

6. SOS repair
DNA‫باشد‬ ‫شده‬ ‫شدیدی‬ ‫بسیار‬ ‫آسیب‬ ‫دچار‬.
‫ندارد‬ ‫وجود‬ ‫طبیعی‬ ‫همانندسازی‬ ‫امکان‬.
‫اختصاصیت‬ ‫سلول‬DNA‫کند‬ ‫می‬ ‫حذف‬ ‫یا‬ ‫تغییر‬ ‫موقت‬ ‫بطور‬ ‫را‬ ‫پلیمراز‬.
‫صحیح‬ ‫انتهای‬ ‫حضور‬ ‫عدم‬ ‫علیرغم‬ ‫جدید‬ ‫رشته‬ ‫ساختن‬(‫شده‬ ‫جفت‬)`3‫گردد‬ ‫می‬ ‫پذیر‬ ‫امکان‬.
‫است‬ ‫متعددی‬ ‫اشتباهات‬ ‫دارای‬ ‫شده‬ ‫ساخته‬ ‫رشته‬:error prone repair
‫اشعه‬ ‫از‬ ‫ناشی‬ ‫های‬ ‫موتاسیون‬ ‫ایجاد‬ ‫سبب‬UV‫گردد‬ ‫می‬.

7. Gene expression
TRANSCRIPTION AND TRANSLATION

8. Gene expression
‫پذیرد‬ ‫می‬ ‫صورت‬ ‫ها‬ ‫پروتئین‬ ‫تولید‬ ‫طریق‬ ‫از‬ ‫ژنوم‬ ‫نواحی‬ ‫اغلب‬ ‫ژنتیکی‬ ‫ماده‬ ‫بیان‬.
‫برداری‬ ‫رونوشت‬ ‫مرحله‬(، ‫برداری‬ ‫نسخه‬ ، ‫رونویسی‬transcription)
‫ترجمه‬ ‫مرحله‬(translation)
‫مشخص‬ ‫ناحیه‬ ‫یک‬ ‫محصول‬ ‫هریک‬ ‫شده‬ ‫ساخته‬ ‫پروتئینی‬ ‫های‬ ‫مجموعه‬ ‫زیر‬DNA‫هستند‬.
‫ناحیه‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫موتاسیون‬ ‫ایجاد‬(‫ژنها‬ ‫از‬ ‫یک‬ ‫هر‬ ‫در‬: )‫موثر‬ ‫و‬ ‫کارامد‬ ‫محصول‬ ‫تولید‬ ‫عدم‬
‫سیسترون‬(Cistron)‫؟‬
:‫از‬ ‫ناحیه‬ ‫یک‬DNA‫کند‬ ‫می‬ ‫کد‬ ‫را‬ ‫منفرد‬ ‫پپتیدی‬ ‫پلی‬ ‫زنجیره‬ ‫یک‬ ‫که‬.

9. Transcription
‫مرحله‬1،‫به‬ ‫اطالعات‬ ‫تبدیل‬mRNA‫است‬.
‫توسط‬RNA‫پلیمراز‬.
‫همانند‬DNA‫در‬ ،RNA‫ساخت‬ ‫جهت‬ ‫نیز‬:`5‫به‬`3‫است‬.
‫؟؟‬ ‫چیست‬ ‫ها‬ ‫تفاوت‬
1-‫شود‬ ‫می‬ ‫تولید‬ ‫کوچکی‬ ‫مولکول‬ ‫فقط‬.
2-‫های‬ ‫رشته‬ ‫از‬ ‫یکی‬ ‫فقط‬DNA‫شود‬ ‫می‬ ‫رونویسی‬(.‫نیازی‬ ‫و‬ ‫یابد‬ ‫می‬ ‫ادامه‬ ‫منفرد‬ ‫آنزیم‬ ‫یک‬ ‫توسط‬ ‫تولید‬ ‫پس‬‫به‬
‫ندارد‬ ‫پیرو‬ ‫رشته‬ ‫شدن‬ ‫ساخته‬).
‫تولید‬RNA‫کند‬ ‫نمی‬ ‫تولید‬ ‫زیادی‬ ‫توپولوژی‬ ‫مشکالت‬ ‫ای‬ ‫رشته‬ ‫تک‬:‫ن‬ ‫هلیکازها‬ ‫و‬ ‫توپوایزومرازها‬ ‫به‬ ‫نیازی‬‫یست‬.
RNA‫کند‬ ‫شروع‬ ‫نقطه‬ ‫یک‬ ‫از‬ ‫را‬ ‫سنتز‬ ‫تواند‬ ‫می‬ ‫پلیمراز‬:‫ندارد‬ ‫نیازی‬ ‫پرایمر‬ ‫به‬.
‫پس‬:
‫است‬ ‫همانندسازی‬ ‫از‬ ‫تر‬ ‫ساده‬ ‫ای‬ ‫مالحظه‬ ‫قابل‬ ‫بطور‬ ‫رونویسی‬.

10. Promoters (start signals)
‫کوتاه‬ ‫های‬ ‫مولکول‬ ‫سنتز‬ ‫به‬ ‫منجر‬ ‫رونویسی‬mRNA(‫چندین‬ ‫از‬ ‫مشخصی‬ ‫قالب‬ ، ‫کبلوباز‬ ‫چند‬
‫ژن‬)‫گردد‬ ‫می‬.
‫شروع‬ ‫سیگنال‬ ‫زیادی‬ ‫تعداد‬ ‫باید‬(‫پروموتر‬)‫تا‬ ‫باشد‬ ‫داشته‬ ‫وجود‬ ‫کروموزوم‬ ‫اطراف‬ ‫در‬:
RNA‫کند‬ ‫هدایت‬ ‫نیاز‬ ‫مورد‬ ‫ناحیه‬ ‫در‬ ‫رونویسی‬ ‫شروع‬ ‫جهت‬ ‫را‬ ‫پلیمراز‬.
RNA‫نماید‬ ‫متوقف‬ ‫مشخص‬ ‫ژنهای‬ ‫قالب‬ ‫از‬ ‫برداری‬ ‫رونوشت‬ ‫از‬ ‫پس‬ ‫را‬ ‫پلیمراز‬.
‫؟‬ ‫کند‬ ‫حرکت‬ ‫جلو‬ ‫به‬ ‫برداری‬ ‫رونوشت‬ ‫جهت‬ ‫چه‬ ‫در‬
‫؟‬ ‫کند‬ ‫آغاز‬ ‫رشته‬ ‫کدام‬ ‫از‬ ‫را‬ ‫رونویسی‬
‫در‬E.coli‫بین‬ ، ‫رشدی‬ ‫شرایط‬ ‫به‬ ‫بسته‬ ،5000–2000‫از‬ ‫نسخه‬RNA‫سنتز‬ ‫در‬ ‫پلیمراز‬
mRNA‫درگیرند‬ ‫زمان‬ ‫هر‬ ‫در‬.

11. RNA polymerase (RNAP)
‫سنتز‬ ‫که‬ ‫آنزیمی‬mRNA‫و‬ncRNA‫کند‬ ‫می‬ ‫کاتالیز‬ ‫باکتریها‬ ‫در‬ ‫را‬.
‫بزرگ‬ ‫مولکولی‬(400‫کیلودالتون‬)‫از‬ ‫آنزیم‬ ‫کور‬ ،5‫است‬ ‫شده‬ ‫تشکیل‬ ‫زیرواحد‬:
Β‫و‬`β
α‫مولکول‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫کپی‬ ‫دو‬ ‫که‬RNAP‫دارد‬ ‫وجود‬:
1α‫و‬2α‫هریک‬ ‫که‬2‫دارند‬ ‫دومن‬:αNTD(‫اسمبلی‬ ‫در‬ ‫موثر‬RNAP)‫و‬αCTD(‫تنظیمی‬ ‫فاکتورهای‬ ‫و‬ ‫پروموترها‬ ‫با‬ ‫کنش‬ ‫میان‬)
ω‫اسمبلی‬ ‫تسهیل‬RNAP‫آن‬ ‫سازی‬ ‫پایدار‬ ‫و‬.
‫ناحیه‬core‫رونویسی‬ ‫شروع‬ ‫فاکتور‬ ‫با‬(، ‫سیگما‬σ)‫و‬ ‫متصل‬‫هولوآنزیم‬‫آورد‬ ‫می‬ ‫بوجود‬ ‫را‬.
، ‫کامل‬ ‫هولوآنزیم‬ ‫در‬6‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫زیرواحد‬(‫تقریبی‬ ‫وزن‬ ‫با‬450‫کیلودالتون‬: )
Β`βα1
α2ωσ
‫سیگما‬ ‫فاکتور‬:
‫تمایل‬ ‫کاهش‬RNAP‫به‬ ‫اتصال‬ ‫برای‬DNA‫غیراختصاصی‬
‫تمایل‬ ‫افزایش‬RNAP‫اختصاصی‬ ‫پروموترهای‬ ‫به‬ ‫اتصال‬ ‫برای‬:‫گردد‬ ‫می‬ ‫آغاز‬ ‫صحیح‬ ‫نقطه‬ ‫در‬ ‫رونویسی‬.

12. ‫هولوآنزیم‬RNAP‫گردد‬ ‫می‬ ‫متصل‬ ‫پروموتر‬ ‫ناحیه‬ ‫به‬.
‫اولیه‬ ‫ساختار‬(‫بسته‬ ‫کمپلکس‬)‫گردد‬ ‫می‬ ‫تبدیل‬ ‫باز‬ ‫کمپلکس‬ ‫به‬.
‫رشته‬ ‫دو‬DNA‫شوند‬ ‫می‬ ‫جدا‬ ‫موضعی‬ ‫بصورت‬.
‫گیرند‬ ‫می‬ ‫قرار‬ ‫معرض‬ ‫در‬ ‫کننده‬ ‫رمز‬ ‫رشته‬ ‫بازهای‬.
‫شوند‬ ‫می‬ ‫جفت‬ ‫فسفات‬ ‫تری‬ ‫ریبونوکلئوزید‬ ‫با‬ ‫بازها‬(‫سنتز‬RNA)
‫شود‬ ‫می‬ ‫تشکیل‬ ‫استر‬ ‫دی‬ ‫فسفو‬ ‫پیوند‬ ‫اولین‬.
‫کمپلکس‬ ‫از‬ ‫سیگما‬ ‫فاکتور‬ ‫جداشدن‬.
‫بسط‬ ‫برای‬ ‫تنهایی‬ ‫به‬ ‫آنزیم‬ ‫هسته‬ ‫حاال‬RNA‫است‬ ‫کافی‬.
RNA‫به‬ ‫متصل‬ ‫جدید‬ ‫کوتاه‬DNA‫میماند‬ ‫باقی‬ ‫الگو‬.
‫های‬ ‫رشته‬ ‫اتصال‬ ‫از‬ ‫اتصال‬ ‫این‬DNA‫کند‬ ‫می‬ ‫جلوگیری‬.
‫سنتز‬RNA‫گیرد‬ ‫می‬ ‫صورت‬ ‫مداوم‬ ‫بصورت‬.
‫خاتمه‬ ‫سیگنال‬ ‫به‬ ‫رسیدن‬ ‫تا‬.
، ‫مرحله‬ ‫این‬ ‫در‬mRNA‫و‬RNAP‫شوند‬ ‫می‬ ‫جدا‬.

13. Transcriptional Terminators
‫است‬ ‫خودش‬ ‫ماقبل‬ ‫توالی‬ ‫مکمل‬ ‫دقیقا‬ ‫که‬ ‫کوتاهی‬ ‫قطعه‬.
‫تشکیل‬ ‫به‬ ‫منجر‬ ‫توالی‬ ‫این‬ ‫رونویسی‬stem – loop‫شود‬ ‫می‬.
‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫اوراسیل‬ ‫های‬ ‫باقیمانده‬ ‫اغلب‬ ‫ساختار‬ ‫این‬ ‫ادامه‬ ‫در‬.
RNAP‫حدود‬ ‫شده‬ ‫باز‬ ‫ناحیه‬ ‫یک‬ ‫به‬17‫دارد‬ ‫نیاز‬ ‫باز‬.
2‫رشته‬DNA‫دارند‬ ‫هم‬ ‫با‬ ‫سریع‬ ‫خوردن‬ ‫پیچ‬ ‫به‬ ‫تمایل‬.
‫بگیرد‬ ‫را‬ ‫آن‬ ‫جلوی‬ ‫عاملی‬ ‫مگر‬:‫خود‬mRNA
‫هیبرید‬RNA-DNA‫از‬ ‫پایدارتر‬DNA-DNA‫است‬.
‫گردد‬ ‫می‬ ‫محدود‬ ‫ها‬ ‫کننده‬ ‫ممانعت‬ ‫طریق‬ ‫از‬ ‫حباب‬ ‫اندازه‬.
‫مولکول‬ ‫ادامه‬mRNA‫از‬DNA‫شود‬ ‫می‬ ‫جدا‬ ‫الگو‬.

14. Termination
‫که‬ ‫زمانی‬RNAP، ‫گردد‬ ‫می‬ ‫مواجه‬ ‫اختتام‬ ‫توالی‬ ‫با‬
‫به‬ ‫نیز‬ ‫آنرا‬RNA‫کند‬ ‫می‬ ‫رونویسی‬:‫ساختار‬stem – loop
‫فعالیت‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫می‬ ‫بسته‬ ‫حباب‬RNAP‫گردد‬ ‫می‬ ‫ممانعت‬.
‫از‬ ‫تر‬ ‫طرف‬ ‫آن‬ ‫باز‬ ‫چند‬ ‫آنزیم‬stem – loop‫شود‬ ‫می‬ ‫متوقف‬.
‫اتصال‬mRNA‫ضعیف‬ ‫هیدروژنی‬ ‫پیونهای‬ ‫طریق‬ ‫از‬A-U
‫تمایل‬mRNA‫از‬ ‫جداشدن‬ ‫به‬DNA‫الگو‬
‫سنتز‬ ‫پایان‬mRNA
‫به‬ ‫وابسته‬ ‫های‬ ‫دهنده‬ ‫خاتمه‬Rho factor‫؟‬

15. Transcription (Overall)
• One strand of DNA used as a template to
make a complimentary strand of mRNA
• Promoter/RNA polymerase/termination
site/5’ to 3’
• Ways in which RNA & DNA differ:
 RNA is ss
 RNA sugar is ribose
 Base pairing-A-U

16. Transcription

17. Types of RNA(important now!)
• Three types:
mRNA: messenger RNA
Contains 3 bases ( codon)
rRNA: ribosomal RNA
Comprises the 70 S ribosome
tRNA: transfer RNA
Transfers amino acids to ribosomes for protein
synthesis
Contains the anticodon (3 base sequence that is
complimentary to codon on mRNA)

18. Genetic code
• DNA: triplet code
• mRNA: codon (complimentary to
triplet code of DNA)
• tRNA: anticodon (complimentary to
codon)

19. Genetic code
mRNA‫کند‬ ‫می‬ ‫حمل‬ ‫ژنتیکی‬ ‫رمز‬ ‫بصورت‬ ‫را‬ ‫پروتئین‬ ‫هر‬ ‫آمینه‬ ‫اسیدهای‬ ‫توالی‬ ‫به‬ ‫مربوط‬ ‫اطالعات‬ ،.
‫این‬ ‫از‬ ‫هریک‬64‫گروه‬3‫نوکلئوتیدی‬(‫ها‬ ‫کدون‬ ، ‫تایی‬ ‫سه‬)‫خاص‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫یک‬ ،(‫معنی‬ ‫بی‬ ‫کدون‬ ‫یک‬ ‫یا‬)‫ک‬ ‫را‬‫د‬
‫میکند‬.
‫است‬ ‫عمومی‬ ‫و‬ ‫یکسان‬ ‫تقریبا‬ ‫موجودات‬ ‫همه‬ ‫در‬ ‫ژنتیکی‬ ‫کد‬.
‫شود‬ ‫می‬ ‫دیده‬ ‫تفاوتهایی‬ ‫گاهی‬:
UGA‫کند‬ ‫می‬ ‫کد‬ ‫را‬ ‫سیستئین‬ ‫یا‬ ‫تریپتوفان‬ ‫گاهی‬ ، ‫است‬ ‫معنی‬ ‫بی‬ ‫کدون‬ ‫که‬.

20. Genetic code
• Codons: code for the production of a
specific amino acid
• 20 amino acids
• 3 base code
• Degenerative: more than 1 codon codes
for an amino acid
• Universal: in all living organisms

21. Genetic code

22. Prokaryotic Ribosome
‫دارند‬ ‫یوکاریوتی‬ ‫انواع‬ ‫از‬ ‫کوچکتری‬ ‫زیرواحدهای‬ ‫پروکاریوتی‬ ‫های‬ ‫ریبوزوم‬.
‫ضریب‬svedberg:‫است‬ ‫سانتریفوژ‬ ‫متعاقب‬ ‫رسوب‬ ‫میزان‬(‫نیست‬ ‫اندازه‬ ‫نشاندهنده‬)!
‫نیست‬ ‫زیرواحدها‬ ‫جمع‬ ‫نشاندهنده‬ ‫نهایی‬ ‫ضریب‬(30S+50S=70S. )
‫پروکاریوتها‬ ‫در‬ ‫ریبوزوم‬70S‫است‬:
‫بزرگ‬ ‫زیرواحد‬(50S)‫مولکول‬ ‫دو‬ ‫از‬RNA(5S‫و‬23S)‫بعالوه‬31‫است‬ ‫شده‬ ‫تشکیل‬ ‫پپتید‬ ‫پلی‬.
‫کوچک‬ ‫زیرواحد‬(30S)‫مولکول‬ ‫یک‬ ‫از‬RNA(16S)‫بعالوه‬21‫است‬ ‫شده‬ ‫تشکیل‬ ‫پپتید‬ ‫پلی‬.
‫مولکولهای‬rRNA‫ساختار‬ ، ‫کنند‬ ‫می‬ ‫ایجاد‬ ‫که‬ ‫متعددی‬ ‫بازهای‬ ‫جفت‬ ‫طریق‬ ‫از‬3‫همانند‬ ‫که‬ ‫سازند‬ ‫می‬ ‫پایداری‬ ‫بعدی‬
‫یابند‬ ‫می‬ ‫اتصال‬ ‫آنها‬ ‫به‬ ‫ریبوزومی‬ ‫پروتئینهای‬ ‫و‬ ‫کرده‬ ‫عمل‬ ‫داربستی‬.
‫تشخیص‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫مولکول‬ ‫این‬mRNA‫هستند‬ ‫موثر‬.
‫نی‬ ‫شود‬ ‫می‬ ‫پپتیدی‬ ‫پیوندهای‬ ‫تشکیل‬ ‫به‬ ‫منجر‬ ‫که‬ ‫کاتالیتیکی‬ ‫فرایندهای‬ ‫تشخیص‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫مولکول‬ ‫این‬‫هستند‬ ‫موثر‬ ‫ز‬.

23. Ribosomal activity

24. Translation
• Three parts:
Initiation-start codon (AUG)
Elongation-ribosome moves along mRNA
Termination: stop codon reached/polypeptide
released and new protein forms.
• rRNA=subunits that form the 70 S ribosomes
(protein synthesis occurs here)
• tRNA=transfers amino acids to ribosomes for
protein synthesis)

25. The
Ribosome
Transfer
RNA

26. Ribosomes and translation
‫برروی‬ ‫خاص‬ ‫توالی‬ ‫یک‬ ‫به‬ ‫ها‬ ‫باکتری‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫ریبوزوم‬mRNA‫گردند‬ ‫می‬ ‫متصل‬.
‫ریبوزوم‬ ‫اتصال‬ ‫محل‬(RBS)‫توالی‬ ‫یا‬Shine-Dalgarno.
‫انتهای‬ ‫مکمل‬ ‫توالی‬ ‫این‬3`‫در‬rRNA16S‫است‬.
‫دهد‬ ‫می‬ ‫رخ‬ ‫مکمل‬ ‫بازهای‬ ‫توالی‬ ‫بین‬ ‫هیدروژنی‬ ‫پیوندهای‬ ، ‫اتصال‬ ‫محل‬ ‫گرفتن‬ ‫قرار‬ ‫دسترس‬ ‫در‬ ‫محض‬ ‫به‬.
‫ترجمه‬mRNA‫است‬ ‫نشده‬ ‫کامل‬ ‫آن‬ ‫گیری‬ ‫شکل‬ ‫هنوز‬ ‫حالیکه‬ ‫در‬ ‫شود‬ ‫می‬ ‫شروع‬.

27. Translation initiation
‫زیرواحدهای‬ ، ‫ترجمه‬ ‫شروع‬ ‫برای‬30S‫و‬50S‫شوند‬ ‫می‬ ‫متصل‬ ‫یکدیگر‬ ‫به‬.
، ‫ندارند‬ ‫نقشی‬ ‫ترجمه‬ ‫عمل‬ ‫در‬ ‫که‬ ‫هایی‬ ‫ریبوزوم‬
‫گردند‬ ‫می‬ ‫تبدیل‬ ‫خود‬ ‫دهنده‬ ‫تشکیل‬ ‫اجزاء‬ ‫به‬ ‫بالفاصله‬.
‫ریبوزومی‬ ‫غیر‬ ‫پروتئین‬ ‫چند‬ ‫عملکرد‬ ‫به‬ ‫ترجمه‬ ‫فرایند‬
‫عنوان‬ ‫تحت‬initiation factors‫دارد‬ ‫نیاز‬ ‫نیز‬.
‫ترجمه‬ ‫شروع‬ ‫برای‬:
‫زیرواحد‬30S‫به‬RBS‫گردد‬ ‫می‬ ‫متصل‬.
‫یک‬tRNA‫آغازگر‬ ‫کدون‬ ‫یک‬ ‫به‬ ‫آغازین‬
(‫معموال‬AUG‫گاهی‬ ،GUG‫بندرت‬ ‫و‬CUG)‫مجاورت‬ ‫در‬RBS‫شود‬ ‫می‬ ‫متصل‬.
‫واحد‬ ‫زیر‬50S‫گردد‬ ‫می‬ ‫متصل‬ ‫آغازین‬ ‫کمپلکس‬ ‫به‬.

28. Point
mRNA‫متوالی‬ ‫تایی‬ ‫سه‬ ‫های‬ ‫دسته‬ ‫بصورت‬(‫فاصله‬ ‫بدون‬)‫شود‬ ‫می‬ ‫خوانده‬.
‫متفاوت‬ ‫کامال‬ ‫پروتئین‬ ‫سه‬ ‫تواند‬ ‫می‬(‫شروع‬ ‫مکان‬ ‫به‬ ‫بسته‬)‫کند‬ ‫کد‬ ‫را‬.
=‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫بالقوه‬ ‫خواندن‬ ‫چهارچوب‬ ‫سه‬.
‫موقعیت‬RBA‫کند‬ ‫می‬ ‫تعیین‬ ‫را‬ ‫خواندن‬ ‫چهارچوب‬ ، ‫آغازین‬ ‫کدون‬ ‫و‬.
‫شدن‬ ‫اضافه‬/‫میدهد‬ ‫تغییر‬ ‫را‬ ‫چهارچوب‬ ‫این‬ ، ‫باز‬ ‫یک‬ ‫حذف‬.
‫بود‬ ‫خواهد‬ ‫متفاوت‬ ‫کامال‬ ‫شده‬ ‫ایجاد‬ ‫پیام‬ ‫خصوصیت‬.

29. Transfer RNA, tRNA
‫های‬ ‫مولکول‬ ‫توسط‬ ‫تایی‬ ‫سه‬ ‫کدون‬ ‫هر‬ ‫تشخیص‬tRNA‫گیرد‬ ‫می‬ ‫صورت‬.
‫نوع‬ ‫یک‬ ‫حداقل‬ ، ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫هر‬ ‫برای‬tRNA‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫اختصاصی‬.
‫است‬ ‫مشابه‬ ‫کامال‬ ‫آنها‬ ‫همه‬ ‫ساختار‬:‫زنجیر‬RNA‫دارای‬100–75‫نوکلئوتید‬.
‫برروی‬‫است‬ ‫خورده‬ ‫تا‬ ‫خودش‬‫است‬ ‫کرده‬ ‫ایجاد‬ ‫را‬ ‫شبدری‬ ‫برگ‬ ‫ساختار‬ ‫و‬.
‫دارند‬ ‫پروتئین‬ ‫سنتز‬ ‫در‬ ‫مشخصی‬ ‫عملکرد‬ ‫آن‬ ‫بخش‬ ‫دو‬:
‫گیرنده‬ ‫بازوی‬:‫انتهای‬ ‫نواحی‬ ‫شدن‬ ‫جفت‬ ‫بوسیله‬3`‫و‬5`‫گیرد‬ ‫می‬ ‫شکل‬.
‫است‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫اتصال‬ ‫محل‬.
‫کدون‬ ‫آنتی‬ ‫بازوی‬:‫است‬ ‫کدون‬ ‫آنتی‬ ‫بازهای‬ ‫دارای‬.
‫تایی‬ ‫سه‬ ‫کدون‬mRNA‫کند‬ ‫می‬ ‫شناسایی‬ ‫را‬.

30. Amino acid selection
‫اختصاصی‬ ‫آنزیم‬ ‫کمک‬ ‫به‬ ‫مناسب‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬(‫آمینواسیل‬tRNA‫سنتتاز‬)‫مولکول‬ ‫به‬
tRNA‫شود‬ ‫می‬ ‫اضافه‬.
‫آنزیم‬ ‫این‬‫اختصاصی‬ ‫عملکرد‬ ‫دو‬‫دارد‬:
‫از‬ ‫خاص‬ ‫گونه‬ ‫یک‬ ‫شناسایی‬ ‫به‬ ‫قادر‬tRNA‫باشد‬ ‫می‬.
‫همان‬ ‫با‬ ‫مناسب‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬tRNA‫کند‬ ‫می‬ ‫انتخاب‬ ‫را‬.
‫مثال‬ ‫برای‬:‫کدون‬UGG(‫تریپتوفان‬)‫تریپتوفانیل‬ ‫آنزیم‬ ‫بوسیله‬tRNA‫تشخیص‬ ‫سنتتاز‬
‫شود‬ ‫می‬ ‫داده‬.
‫با‬ ‫مناسب‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫همواره‬ ‫ترتیب‬ ‫بدین‬tRNA‫شود‬ ‫می‬ ‫همراه‬.

31. Continued…
‫هستند‬ ‫دخیل‬ ‫فرایند‬ ‫این‬ ‫بودن‬ ‫اختصاصی‬ ‫در‬ ‫مجزا‬ ‫و‬ ‫مختلف‬ ‫جزء‬ ‫سه‬ ‫بنابراین‬:
‫کدون‬ ‫کنش‬ ‫میان‬-‫شناسایی‬ ،‫کدون‬ ‫آنتی‬tRNA‫و‬‫اسید‬ ‫تشخیص‬‫اختصاصی‬ ‫آنزیم‬ ‫توسط‬ ‫آمینه‬
‫تشابه‬ ‫بدلیل‬tRNA‫آمینه‬ ‫اسیدهای‬ ‫برخی‬ ‫نیز‬ ‫و‬ ‫ها‬(‫ایزولوسین‬ ‫و‬ ‫والین‬)‫ک‬ ‫می‬ ‫بروز‬ ‫اشتباهاتی‬ ‫گاهی‬ ،‫ند‬
(1‫در‬1000.)
‫از‬ ‫را‬ ‫اشتباه‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫تواند‬ ‫می‬ ‫سنتتاز‬ ‫آن‬ ‫در‬ ‫که‬ ‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫ویرایشی‬ ‫مکانیسم‬ ‫نوعی‬tRNA‫کند‬ ‫جدا‬
‫حداقل‬ ‫باید‬ ‫پس‬61‫نوع‬tRNA‫باشیم‬ ‫داشته‬.
64‫کدون‬:3‫فاقد‬ ‫که‬ ‫معنی‬ ‫بی‬ ‫مورد‬tRNA‫هستند‬.
، ‫آمینه‬ ‫اسیدهای‬ ‫از‬ ‫بسیاری‬ ‫برای‬tRNA‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫مختلف‬ ‫اختصاصی‬ ‫های‬ ‫کدون‬ ‫با‬ ‫فراوان‬ ‫های‬.
‫است‬ ‫مرتبط‬ ‫خاص‬ ‫های‬ ‫کدون‬ ‫وقوع‬ ‫فراوانی‬ ‫به‬ ‫این‬.
‫از‬ ‫نادری‬ ‫نوع‬ ‫به‬ ‫که‬ ‫هایی‬ ‫کدون‬tRNA‫شوند‬ ‫می‬ ‫ایجاد‬ ‫کمتر‬ ‫معموال‬ ‫دارند‬ ‫نیاز‬.‫برعکس‬ ‫و‬.
‫از‬ ‫کمتر‬ ‫خیلی‬ ‫تعداد‬ ‫این‬61‫حدود‬ ‫و‬40–30‫است‬ ‫عدد‬.

32. Protein synthesis mechanism
1-‫اختصاصی‬ ‫مولکول‬ ‫یک‬ ‫توسط‬ ‫ها‬ ‫باکتری‬ ‫در‬ ‫آغازین‬ ‫کدون‬tRNA‫یعنی‬tRNAfmet‫شود‬ ‫می‬ ‫شناسایی‬.
‫به‬ ‫اتصال‬ ‫از‬ ‫پس‬ ‫متیونین‬tRNA‫به‬N-‫شود‬ ‫می‬ ‫تبدیل‬ ‫متیونین‬ ‫فرمیل‬.
tRNA‫با‬ ‫کدون‬ ‫آنتی‬ ‫ناحیه‬ ‫از‬ ‫که‬ ‫زمانی‬ ‫در‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫دارای‬ ‫ی‬ ‫ها‬mRNA‫محل‬ ‫در‬ ‫طبیعی‬ ‫بطور‬ ، ‫اند‬ ‫شده‬ ‫جفت‬A‫روی‬ ‫در‬
‫گیرند‬ ‫می‬ ‫قرار‬ ‫ریبوزوم‬.
tRNA‫بنام‬ ‫ریبوزوم‬ ‫روی‬ ‫دیگری‬ ‫مکان‬ ‫به‬ ‫تا‬ ‫قادرند‬ ‫پپتیدی‬ ‫پیوند‬ ‫تشکیل‬ ‫از‬ ‫پس‬ ‫تنها‬ ‫ها‬P‫شوند‬ ‫جابجا‬.
fMet-tRNAfMet(tRNAfMet‫متیونین‬ ‫فرمیل‬ ‫دارای‬)‫محل‬ ‫وارد‬ ‫مستقیما‬ ‫که‬ ‫است‬ ‫بفردی‬ ‫منحصر‬ ‫ویژگی‬ ‫دارای‬P‫شود‬ ‫می‬.
‫کدون‬ ‫آنتی‬tRNAfmet‫روی‬ ‫آغازین‬ ‫کدون‬ ،mRNA‫کند‬ ‫می‬ ‫شناسایی‬ ‫را‬(‫شود‬ ‫می‬ ‫جفت‬ ‫آن‬ ‫با‬ ‫یا‬)‫زیرواحد‬ ‫با‬ ‫و‬30S‫می‬ ‫متصل‬
‫شود‬.
‫زیرواحد‬50S‫گردد‬ ‫می‬ ‫متصل‬ ‫کمپلکس‬ ‫به‬.
‫ورود‬tRNA‫ناحیه‬ ‫به‬ ‫ثانویه‬ ‫کدون‬ ‫با‬ ‫متناظر‬A:‫فورمیل‬ ‫بین‬ ‫پپتیدی‬ ‫پیوند‬‫و‬ ‫متیونین‬‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫دومین‬.
tRNAfmet‫گردد‬ ‫می‬ ‫رها‬ ‫محل‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫شده‬ ‫آمینه‬ ‫اسید‬ ‫بدون‬:‫طول‬ ‫در‬ ‫کدون‬ ‫یک‬ ‫باندازه‬ ‫ریبوزوم‬mRNA‫کند‬ ‫می‬ ‫حرکت‬.
‫مولکول‬tRNA‫دوم‬(‫است‬ ‫پپتید‬ ‫دی‬)‫از‬A‫به‬P‫شود‬ ‫می‬ ‫جابجا‬(translocation. )
‫محل‬A‫برای‬tRNA‫است‬ ‫شده‬ ‫خالی‬ ‫سوم‬ ‫کدون‬ ‫به‬ ‫مربوط‬.

33. Protein synthesis mechanism
‫امتداد‬ ‫در‬ ‫ریبوزوم‬ ‫هر‬ ‫حرکت‬mRNA‫یابد‬ ‫می‬ ‫ادامه‬ ‫معنی‬ ‫بی‬ ‫کدون‬ ‫به‬ ‫رسیدن‬ ‫تا‬.
‫وجود‬ ‫عدم‬tRNA‫این‬ ‫در‬ ‫ترجمه‬ ‫توقف‬ ‫سبب‬ ، ‫معنی‬ ‫بی‬ ‫های‬ ‫کدون‬ ‫شناسایی‬ ‫به‬ ‫مربوط‬
‫گردد‬ ‫می‬ ‫نقطه‬.
‫خاص‬ ‫پروتئینهای‬ ‫کمک‬ ‫به‬ ‫حاصل‬ ‫پپتیدی‬ ‫پلی‬ ‫زنجیره‬(releasing factors)‫آزاد‬
‫از‬ ‫ریبوزوم‬ ‫و‬ ‫شده‬mRNA‫شود‬ ‫می‬ ‫جدا‬.

35. Point
، ‫شد‬ ‫دور‬ ‫کافی‬ ‫اندازه‬ ‫به‬ ‫ریبوزوم‬ ‫که‬ ‫هنگامی‬RBS‫روی‬ ‫دوباره‬mRNA‫شود‬ ‫می‬ ‫ظاهر‬.
‫گردد‬ ‫متصل‬ ‫آن‬ ‫به‬ ‫تواند‬ ‫می‬ ‫دیگری‬ ‫ریبوزوم‬.
‫منفرد‬ ‫مولکول‬ ‫یک‬mRNA‫کند‬ ‫حمل‬ ‫را‬ ‫ترجمه‬ ‫در‬ ‫فعال‬ ‫ریبوزوم‬ ‫چندین‬ ‫میتواند‬ ،.

40. Post-translational modifications
‫است‬ ‫دیگر‬ ‫فرایند‬ ‫چند‬ ‫مستلزم‬ ، ‫بیولوژیک‬ ‫نظر‬ ‫از‬ ‫فعال‬ ‫محصول‬ ‫تشکیل‬.
‫کند‬ ‫پیدا‬ ‫خوردگی‬ ‫پیچ‬ ‫صحیح‬ ‫بطور‬ ‫باید‬ ‫پروتئین‬ ‫اینکه‬ ‫اول‬(Folding. )
‫اولیه‬ ‫ساختار‬:‫آمینه‬ ‫اسیدهای‬ ‫توالی‬
‫دوم‬ ‫ساختار‬:‫ت‬ ، ‫بتا‬ ‫صفحات‬ ‫یا‬ ‫آلفا‬ ‫مارپیچ‬ ‫منظم‬ ‫ساختارهای‬ ‫بصورت‬ ‫متوالی‬ ‫آمینه‬ ‫اسیدهای‬ ‫فضایی‬ ‫آرایش‬‫وسط‬
‫شود‬ ‫می‬ ‫پایدار‬ ‫هیدروژنی‬ ‫مانند‬ ‫غیرکوواالنسی‬ ‫پیوندهای‬.
‫سوم‬ ‫ساختار‬:‫خورند‬ ‫می‬ ‫پیچ‬ ‫همدیگر‬ ‫روی‬ ‫دوم‬ ‫ساختار‬ ‫گوناگون‬ ‫اجزاء‬.‫نی‬ ‫و‬ ‫غیرکوواالنسی‬ ‫پیوندهای‬ ‫توسط‬‫پل‬ ‫ز‬
‫مانند‬ ‫می‬ ‫پایدار‬ ‫ها‬ ‫سیستئین‬ ‫بین‬ ‫کوواالنس‬ ‫سولفیدی‬ ‫دی‬ ‫های‬.
‫چهارم‬ ‫ساختار‬:‫شو‬ ‫می‬ ‫تشکیل‬ ‫مختلف‬ ‫یا‬ ‫یکسان‬ ‫پپتیدی‬ ‫پلی‬ ‫زنجیره‬ ‫چندین‬ ‫از‬ ‫ها‬ ‫پروتئین‬ ‫از‬ ‫بسیاری‬‫اتصال‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫ند‬
‫آید‬ ‫می‬ ‫بوجود‬ ‫چهارم‬ ‫ساختار‬ ‫یکدیگر‬ ‫به‬ ‫آنها‬.
‫نیست‬ ‫خودبخودی‬ ‫پپتیدی‬ ‫پلی‬ ‫های‬ ‫تاخوردگی‬:‫مولکولی‬ ‫های‬ ‫چاپرون‬‫شک‬ ‫به‬ ‫که‬ ‫هستند‬ ‫هایی‬ ‫پروتئین‬ ،‫گیری‬ ‫ل‬
‫کنند‬ ‫می‬ ‫کمک‬ ‫ها‬ ‫پروتئین‬ ‫صحیح‬ ‫فضایی‬:
‫تول‬ ‫کامل‬ ‫بصورت‬ ‫پروتئین‬ ‫که‬ ‫زمانی‬ ‫تا‬ ‫نادرست‬ ‫فضایی‬ ‫گیری‬ ‫شکل‬ ‫از‬ ‫ممانعت‬ ‫و‬ ‫تازه‬ ‫پپتیدهای‬ ‫پلی‬ ‫با‬ ‫واکنش‬‫است‬ ‫نشده‬ ‫ید‬.
‫دناتوره‬ ‫پروتئینهای‬ ‫مجدد‬ ‫تاخوردگی‬ ‫در‬ ‫نقش‬:‫ها‬ ‫استرس‬ ‫و‬ ‫حرارت‬ ‫برابر‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫پروتئین‬ ‫محافظت‬.
‫بزرگتر‬ ‫های‬ ‫پروتئین‬ ‫به‬ ‫پپتیدی‬ ‫پلی‬ ‫زیرواحدهای‬ ‫مونتاژ‬:‫باکتریوفاژ‬ ‫در‬