Sevgili öğrenciler,
İnönü Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü 3. sınıfında zorunlu bir ders olan Biyokimya (BIOL 301/302), iki dönem boyunca haftalık 3 saat olarak okutulan bir derstir. On yıldan beridir öğrencilerimize verile gelen bu notların içeriği her yıl yeniden gözden geçirilip uygun yenilemeler ve düzeltmelerle güncellenmektedir. Geçen yıl olduğu gibi bu yıl da kitap Biyokimya I ve Biyokimya II olmak üzere iki cilt halinde basılmıştır. Kitap baştan sona gözden geçirilerek her cildin sonuna kullanışlı tablo, grafik ve dizinler eklenmiştir. Ayrıca, her iki cilde “Biyokimya ve Moleküler Biyoloji”de yaygın kullanılan birçok terimi içeren bir “sözlük” eklenmiştir. Yapılmış olan çeşitli dil bilgisi ve yazım hatalarının yanında, geniş bir alanı kapsayan ve her gün gelişen biyokimya gibi bir bilim alanı için hazırlanmış olan bu notlarda, varsa bilimsel hataların da hoş görüleceğini umuyorum.
Sevgilerimle,
Hikmet Geçkil Ekim 2010, Malatya
Sevgili öğrenciler,
İnönü Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü 3. sınıfında zorunlu bir ders olan Biyokimya (BIOL 301/302), iki dönem boyunca haftalık 3 saat olarak okutulan bir derstir. On yıldan beridir öğrencilerimize verile gelen bu notların içeriği her yıl yeniden gözden geçirilip uygun yenilemeler ve düzeltmelerle güncellenmektedir. Geçen yıl olduğu gibi bu yıl da kitap Biyokimya I ve Biyokimya II olmak üzere iki cilt halinde basılmıştır. Kitap baştan sona gözden geçirilerek her cildin sonuna kullanışlı tablo, grafik ve dizinler eklenmiştir. Ayrıca, her iki cilde “Biyokimya ve Moleküler Biyoloji”de yaygın kullanılan birçok terimi içeren bir “sözlük” eklenmiştir. Yapılmış olan çeşitli dil bilgisi ve yazım hatalarının yanında, geniş bir alanı kapsayan ve her gün gelişen biyokimya gibi bir bilim alanı için hazırlanmış olan bu notlarda, varsa bilimsel hataların da hoş görüleceğini umuyorum.
Sevgilerimle,
Hikmet Geçkil Ekim 2010, Malatya
Zarla çevrili bir yapı olan hücre, genetik bilgi ve diğer elemanları içerir (ör. protein, DNA, lipid, vd.) Örneğin, bu elemanlardan enzimler aracılığı ile maddeler metabolize edilirler. Bu sayede hücre büyür ve yeni hücrelere çoğalır. Tüm organizmalar hücrelerden yapılmışlardır. Bazıları tek hücreli (bakteri, amip, vs), bazıları çok hücrelidir (insan, hayvan, bitki). Bir kelebeğin zar gibi görünen kanadı ince bir hücre tabakasından oluşmuştur. Kısaca, göz bebeğimizin en diş zarından, dişimize, derimize tırnağımıza kadar her şey hücrelerden oluşmuştur. Yediğimiz hamburger bile hücrelerden oluşmuştur ve kısa sonra onun içeriği bizim hücre içeriğine dönüştürülecektir. Su anda elinizde tuttuğunuz kursun kalemin odun kısmi hücrelerden meydana gelmiştir, vs. Temel hücre teorisi’ne göre; yaşayan organizmaların yapısal ve işlevsel özelliklerinin temel biriminin hücre olduğu ve hücrenin tek başına canlılık özellikleri olan beslenme, üreme ve metabolizma işlevlerini yürütebildiği, ayrıca tüm canlıların da hücrelerden oluştuğu görüşü kabul edilmiştir.
Zarla çevrili bir yapı olan hücre, genetik bilgi ve diğer elemanları içerir (ör. protein, DNA, lipid, vd.) Örneğin, bu elemanlardan enzimler aracılığı ile maddeler metabolize edilirler. Bu sayede hücre büyür ve yeni hücrelere çoğalır. Tüm organizmalar hücrelerden yapılmışlardır. Bazıları tek hücreli (bakteri, amip, vs), bazıları çok hücrelidir (insan, hayvan, bitki). Bir kelebeğin zar gibi görünen kanadı ince bir hücre tabakasından oluşmuştur. Kısaca, göz bebeğimizin en diş zarından, dişimize, derimize tırnağımıza kadar her şey hücrelerden oluşmuştur. Yediğimiz hamburger bile hücrelerden oluşmuştur ve kısa sonra onun içeriği bizim hücre içeriğine dönüştürülecektir. Su anda elinizde tuttuğunuz kursun kalemin odun kısmi hücrelerden meydana gelmiştir, vs. Temel hücre teorisi’ne göre; yaşayan organizmaların yapısal ve işlevsel özelliklerinin temel biriminin hücre olduğu ve hücrenin tek başına canlılık özellikleri olan beslenme, üreme ve metabolizma işlevlerini yürütebildiği, ayrıca tüm canlıların da hücrelerden oluştuğu görüşü kabul edilmiştir.
4. SONUÇ
ÜRETİM
SÜREÇLERİ
Klinik Soru Biyokimyasal Cevap
Klinik Veriler ve
Test İstemi
Örnek Alınması
Örneğin
Transportu
Örneklerin
Alikotlanması ANALİZ
Kalite
Kontrol
Sonuçların
Toplanması
Yorumlama
Raporlama
5. Laboratuvar Testlerinin Kullanımı
Toplumsal taramalar için (fenilketonüri)
Asemptomatik hasta taraması
Semptomatik hasta taraması
Teşhisin konfirmasyonu
Hastanın izlenmesi, ilaç tedavisinin izlenmesi
6. Niye Test Yapıyoruz Hastanın Nesi Var?
Bulmak
Konfirme etmek
Dışlamak
1. Teşhis
2. Prognoz
3. Tarama
4. İzleme
5. Bazal değerleri tespit
6. Karar verme
7. Diyagnostik Test
En önemli sebep; bir hastalığı tespit,
onaylama, kayıt altına alma veya dışlama
için yapılan test veya girişim. Bir kez bir
hastalıktan şüphe edildi mi teşhis
kesinliğini azaltan veya güçlendiren ve
diğer hastalıkların elimine edilmesini
sağlayan testler kullanılır.
8. Prognoz
Test sonucunun normalden sapma miktarına
göre gidişat kestirilebilir. Akut miyokard
enfarktüsünde CK-MB ne kadar yüksekse veya
transaminaz düzeyleri hepatit de ne kadar
yüksekse hastalık o kadar ciddi prognozu da o
kadar iyi değildir.
9. Kan Alınması
Plazma antikoagulan içeren tüp
şelasyon yapan ajanlar(EDTA,sitrat)
veya
heparin(antitrombin III’ü arttırır)
Santrifüj - 3 tabaka
a. plazma
b. buffy coat (lökosit ve trombositler)
c. RBC(eritrosit)
10. Test Sıralaması
Pek çok faktöre bağımlıdır:
1. Acil durum - riskleri olsa da en çok bilgi veren
test uygulanır
2. Zaman varsa - risksiz ve ucuz testlerle başlanır.
11. Test İsteme Sırası
1. Ucuzdan pahalıya doğru
2. Az riskliden çok riskliye doğru
3. Basitten komplekse doğru
Zaman risk ve fiyat kısıtlamalarına rağmen en
effektif test en kısa zamanda yapılmalı
Yani en yüksek hassasiyeti, özgüllüğü ve
prediktif değeri olan test.
Bu her zaman pratik olmayabilir:Bazen pahalı
testi baştan istemek uzun vadede daha ucuz
olabilir
13. Mükemmel Test
1). Doğru
2). Tekrarlanabilir
3). Ayırıcı
4). Acısız
5). Risksiz
6). Ucuz
7). Faydalı
Sonuçlar kullanılmayacaksa bir test
istemenin hiçbir yararı yoktur.
14. Yalancı Pozitif Test
(F.P.)
Bir hastadan istenen test sayısı artıkça artar
Y.P. %’si = 100 - (0.95n X 100)
n – hastaya yapılan test #
Ör., Normal bir kişiden 6 test istenmişse referans
intervali dışı sonuç ihtimali %27 dir
(100 - (0.956 X 100)
(20 test istenmişse % 64 anormal sonuç olasılığı
vardır!!)
15. Laboratuar Testlerini Etkileyen
Varyasyonlar
1. Preanalitik
a. örnek alımı
b. yaş
c. cinsiyet
d. alışkanlıklar
e. altta yatan hastalıklar
2. Analitik-turbidite,
hipoalbüminemi,
çoğunlukla Kalite Kontrol uygulamaları
3. Postanalitik
a. raporlama
b. yorumlama
17. Preanalitik Değişkenler
Preanalitik değişkenler örnek(kan, idrar vs.)
alımına bağlı ve hasta faktörü ile ilgili test
sonucunu etkileyen yaş, cinsiyet, alışkanlıklar ve
altta yatan hastalıklara özgü değişkenlerdirler.
19. VERİ YORUMUNDA TEMEL PRENSİPLER
teşhis için tek bir değerden bir çok trend aramalı
anormal laboratuvar sonuçlarını çoklu sebep yerine
tek bir sebebe bağlamaya çalışmalı (özellikle 65 yaş
altı hastalarda)
bir biri ile uyuşmayan sonuçlar ayrı ayrı irdelenmeli
21. 1. Yenidoğan bir bebekte daha ileri yaşlardaki
çocuklarla kıyaslandığında (Hb) ve eritrosit
miktarlarının daha yüksek oldukları
görülmektedir. Yüksek Hb seviyeleri
çocukta anne karnında hakim olan HbF’e
bağlıdır. Yüksek HbF düzeyleri oksijen
disosiyasyon eğrisinin sola kaymasına
neden olur. Bu durum da yeni doğanda
doku hipoksisi ve yüksek eritropoetin
salınımına neden olur.
22. 2. Erişkin düzeyleri ile karşılaştırıldığında
çocuklarda alkalen fosfataz (ALP
osteoblastlarda bulunur) ve serum fosfat
(kalsiyumun kemikte birikmesine neden
olur) miktarlarının aktif kemik gelişim
sürecine bağlı olarak daha yüksek oldukları
görülmektedir.
23. 3. Erişkin erkekte TESTOSTERON, Hb, serum
Fe’i ve serum ferritin’i (kanda dolaşan demir
fraksiyonudur demir depolarını gösterir)
erişkin kadınlardaki seviyelerinin daha
üzerindedir. Erişkin kadın her mens
döneminde bir miktar demir kaybeder. Aynı
şekilde her bir doğum da demir depolarının
azalmasına yol açar dışarıdan takviye demir
alınmaması bu farkın daha da artmasına
neden olur.
24. 4. Gebeye ait önemli test varyasyonları
bulunmaktadır.
a. Eritrosit sayısına oranla plazma volümü üç
kat daha fazla artmaktadır. Böylece Hb
miktarı relatif olarak azalır(dilüsyonel etki).
b. Plazma volümünün artışı glomerüler filtrasyon
hızını arttırır(GFR), bu durum kreatinin
klirensini arttırır ve bazı analitlerin böbrekten
atılması artar. Kreatinin, BUN, ürik asit gibi
analitlerin serumdaki miktarları azalır.
25. c. Östrojen miktarındaki artış; Tiroid Bağlayıcı
Globulin (TBG), Transkortin gibi bağlayıcı
proteinlerin sentezini arttırır. Bu durum kandaki
Total Tiroksin ve Total Kortizol miktarının artmasına
neden olur. Serbest hormon seviyeleri, bağlayıcı
hormon sentez artışından etkilenmez.
HPL’nin(Human Plasental Laktojen) insülin karşıtı
etkisine ikincil olarak, hafif bir glukoz tolerans
bozukluğu ve glukozun böbrekten atılım eşiğinde
hafif bir düşüklük oluşur. Bu şartlar plazma glukoz
seviyeleri normal olmasına rağmen glukozüri
görülmesine sebep olur.
26. 5. Yaşlılarda laboratuar sonuçlarının yanlış
yorumlanmasına neden olacak önemli
varyasyonlar görülmektedir.
a. GFR’nin azalması böbrek yoluyla itrah
edilen ilaçlara ait toksisite gelişmesine meyili
arttırmaktadır.
b. CD8 T Lenfositlerin azalmasına bağlı
olarak oto antikor sentezi artmıştır.
c. Yağ dokusu artışına bağlı olarak insülin
reseptörü sentezi azalmıştır. Bu durum hafif
bir glukoz tolerans bozukluğuna neden olur.
27. 6. Hemolizli kan örneklerinde serum Laktat
Dehidrogenaz(LDH), Potasyum ve Demir
eritrosit içinde bulunmalarına bağlı olarak
normalde olduğundan daha yüksek
seviyelerde görülmektedir.
28. 7. Alkol karaciğerde sitokrom P-450 sistem
aktivetisini arttırır. Sitokrom P-450 sistemi
karaciğerde ilaç metabolizmasında rol
oynamaktadır. Alkol kullanımında
metabolizması bu sistem üzerinden olan
ilaçların serum seviyeleri alkolün etkisine
bağlı olarak beklenin altında olduğu görülür.
29. 8. Simetidin H2 reseptör blokeri olarak peptik
ülser tedavisinde kullanılmaktadır. Sitokrom P-
450 sistemini bloke eder. Böylece
metabolizması bu enzim sistemi üzerinden
olan ilaçların metabolizmasını yavaşlatır ve
toksisite gelişmesine neden olur.
30. Analitik Değişkenler
Testin yapılmasıyla ilgli ör bulanıklık gibi veya
hipoalbuminemi gibi değişkenlerdir. TG yüksekliğine
bağlı bulanıklık tüm fotometrik işlemlerde etkili iken
hipoalbuminemi serbest Ca değerlerini etkiler
31. SONUÇ
ÜRETİM
SÜREÇLERİ
Klinik Soru Biyokimyasal Cevap
Klinik Veriler ve
Test İstemi
Örnek Alınması
Örneğin
Transportu
Örneklerin
Alikotlanması ANALİZ
Kalite
Kontrol
Sonuçların
Toplanması
Yorumlama
Raporlama