pengelolaan spesimen

1. PENGELOLAAN SPESIMEN
UNTUK PEMERIKSAAN
MIKROBIOLOGI
Dani Prasetyo

2. PEMERIKSAAN MIKROBIOLOGI
Mikroskopik
Kultur
Deteksi antigen
Deteksi antibodi
Deteksi asam nukleat
deteksi serologi, ex
PCR, menjadi
juta(amlifikasi)
SPESIMEN YANG BAIK
PENDAHULUAN

3.  Pengelolaan spesimen baik  kualitas
baik
Pemilihan, infeksi kandung kemih, maka
spesimennya urin
Pengambilan misal, ambil darah, setelah
ambil darah wajib dibersihkan.
Pengiriman misal, harus dalam suhu dingin,
kalau lebih 1 jam harus pakai es. Harus
memakai kontaiiner yg thn bocor.
Penyimpanan/pengawetan misal, urin setelah
ditanam, sebelum di kultur, harus dismipan di
kulkas
 Kualitas spesimen baik  hasil akurat
… pendahuluan

4. … pendahuluan
 Pengelolaan tidak tepat :
 Mikroorganisme tidak ditemukan
 Hasil yang ditemukan: mikroorganisme bukan
penyebab
 Perhatikan :
 Spesimen mikrobiologi  organisme hidup  dapat
bermultiplikasi dan cepat mati
 Spesimen tidak lagi representatif bila mikroorganisme
bermultiplikasi selama pengumpulan, pengiriman atau
penyimpanan
 Patogenesitas penyakit, sifat-sifat mikroorganisme
tersangka, dasar mengambil diagnosis yang tepat.

5. Menggunakan alat-alat
proteksi standar (jas lab,
sarung tangan, dll), standar
pangamanan harus sesuai
dengan spesimen.
Wadah spesimen ditutup
rapat dan tidak bocor
Lepaskan jarum
2. …….
1. Utamakan keselamatan dan keamanan petugas
rumah sakit / laboratorium:
PRINSIP PENGELOLAAN SPESIMEN

6. 2. Pertimbangkan kenyamanan dan
keamanan pasien:
Informed consent sebelum mengambil
spesimen
Tepat dalam waktu pengambilan dan
pemilihan spesimen  mencegah
resampling
3. …..
… prinsip pengelolaan spesimen

7. 3. Jumlah mikroorganisme hidup saat kultur
cukup
Jenis spesimen tepat
Waktu pengumpulan spesimen tepat
Volume cukup
Penyimpanan dan transportasi yang baik
Pemeriksaan yang benar dan tepat
Media transport
Sebelum pemberian antibiotika / bebas
antibiotika ± 3 hari
Bakteri anaerob: kontak dengan oksigen (-)
4. …..
… prinsip pengelolaan spesimen

8. 4. Hindari kontaminasi flora normal atau dari
lingkungan
Cara pengumpulan spesimen
Tindakan asepsis
Wadah steril dan tertutup rapat / tidak bocor
5. Komunikasi yang baik antara dokter dan
laboratorium mikrobiologi
… prinsip pengelolaan spesimen

9. SUMBER KONTAMINASI OLEH
FLORA NORMAL
Tempat Infeksi Sumber Kontaminasi
Vesika Urinaria Uretra dan perineum
Darah Kulit tempat pungsi
Fistula Saluran cerna
Infeksi subkutan dan
luka superfisial
Kulit dan membran
mukosa
Miller J. A Guide to Specimen Management in Clinical Microbiology. 1996

10. PEMILIHAN SPESIMEN
 DARAH
 URINE
 SPUTUM
 GASTROINTESTINAL
 LUKA, ABSES, EKSUDAT (PUS), LUKA
BAKAR

11. DARAH
 Waktu Pengambilan
Darah diambil pada saat suhu badan
meningkat
Bakteremia intermiten(bakteri itu tidak selalu
di pemb. Darah) darah diambil 2-3 kali, dari
tempat berbeda,dalam 24 jam (juga menilai
kontaminasi)
Untuk typhoid diambil pada demam minggu
pertama.
Sebelum pemberian antibiotik atau setelah 3
hari antibiotik dihentikan.

12. Volume darah (jumlah patogen
sedikit)
 Bayi : 1-3 ml.
 Anak-anak: 3-5 ml
 Dewasa:10-20 ml
Pada kasus-kasus:
 Sepsis
 Endokarditis
 Fever of unknown origin
… darah

13. Pengumpulan
spesimen darah
• Tindakan asepsis kulit secara
melingkar dengan iodophor dan
alkohol 70%
• Darah diambil dengan spuit secara
steril
• Tanpa antikoagulan atau dengan
sodium polyanetholsulfonate (SPS)
(Yellow-capped tube) dan
pindahkan darah ke botol media
kultur
… darah

14. SALURAN KEMIH: URIN
 Pemeriksaan semikuantitatif
 Sampel:
 Mid stream urine ( Clean catch urine, urin porsi
tengah)
 Supra pubic puncture – terutama kultur anaerob
 Urin kateter
 Transport :
 minimal 2 jam setelah pengumpulan spesimen
 > 2 jam : lemari es (bukan freezer)

15. Cara pengumpulan spesimen urin
1. Mid stream urine ( Clean catch
urine )
Explain to patients !
urine pertama di pagi hari
spesimen dikumpulkan di
pertengahan urine dikeluarkan
Penis / vulva dibersihkan
dengan air sabun atau tissue
basah steril
Hindari kemih mengenai kulit

16. 2. Urin Kateter
 bukan dari catheter bag
 kumpulkan dari selang indwelling catheter
melalui sampling port setelah dibersihkan
dengan swab alkohol terlebih dahulu
Cara pengumpulan spesimen urin

17. Cara pengumpulan spesimen urin

18. 3. Urine Aspirasi Suprapubik
Spesimen urine paling
baik
Invasif
Tindakan secara aseptik
Dikerjakan bila urin porsi
tengah sulit didapatkan
Cara pengumpulan spesimen urine

19.  FESES
 Feses segar sebanyak + 10 gram/ 1 sendok
teh, taruh dalam wadah bersih, jangan
tercampur dengan urine atau air kloset.
 Feses berdarah atau berlendir, ambil bagian
berdarah/ berlendir, pada bayi melalui swap
rektal
SPESIMEN SALURAN CERNA

20.  USAP DUBUR (rectal
swab)
 Bayi, konstipasi
 memasukkan lidi kapas
steril sepanjang 1 inchi/ 2,5
cm ke dalam sfingter anus.
Secara hati-hati, putar lidi
kapas pada kripte anus
searah jarum jam dan
putar balik lidi kapas.
 Bila tidak langsung
ditanam, masukkan ke
dalam media transport
Carey-Blair.
… spesimen saluran cerna

21.  Pemeriksaan spesimen feses
dilakukan dengan tujuan untuk
mengisolasi Shigellae, Salmonella,
E. Coli patogen, dan dengan
permintaan khusus yaitu
Clostridium difficile, Vibrio, dan
Yersinia.
… spesimen saluran cerna

22. SALURAN NAPAS ATAS
 USAP TENGGOROK
 Tekan lidah dengan spatula lidah, usap lidi kapas
pada kedua tonsil dan faring belakang, jangan
menyentuh lidah & uvula
 Pemeriksaan Difteri(pada tonsil, bakteri membentuk
selaput, ketika di swap akan berdarah) 
pseudomembran

23. USAP HIDUNG
 Cara:
 Masukkan swab sekurangnya 1 cm ke dalam lobang
hidung atau bila ada lesi ambil di pinggir lesi
 Putar swab dan diamkan 10 -15’
 Tusukkan ke medium transpor
… saluran napas atas

24. SALURAN NAPAS BAWAH
 SPUTUM
 Bukan saliva !!!
 Mukolitik dan inhalasi sebelumnya
 Bangun tidur – berkumur – batuk dalam
 Wadah steril

25.  Lain :
Bronchial washing
Bronchial brushing
Bronchoalveolar lavage
Transtracheal aspiration
Tracheal aspiration
… saluran napas bawah

26.  Beberapa mikroorganisme yang
memerlukan teknik isolasi atau media
tertentu seperti bakteri Corynebacterium
diphteriae, Bordetella pertussis, N.
gonorrhoeae, Legionella spp., Chlamydia,
atau Mycoplasma , dokter pengirim
hendaknya menghubungi laboratorium
mikrobiologi terlebih dahulu sebelum
mengambil spesimen.
… saluran napas bawah

27. LUKA / ABSES
 Cara : biopsi(jar. Luka diambil sedikit) (terbaik),
aspirasi(disedot)(ex, bisul yg tertutup), dan swab
 Anaerob : biopsi dan aspirasi
 Aspirasi untuk :
 Abses tertutup
 Luka bergaung dengan cairan di dalamnya yang
tertutup debris superfisial
 Swab :
 Pus diluar dibersihkan terlebih dahulu dengan swab
yang telah dicelupkan dengan NaCl steril dengan
swab baru buat usapan dari dasar ulkus
 Tidak dianjurkan untuk mengambil pus yang
berasal dari drain

28. BIOPSI DAN ASPIRASI
Aspirasi untuk :
•Abses tertutup
•Luka bergaung dengan cairan di dalamnya yang tertutup
debris superfisial
… luka / abses

29. SWAB
… luka / abses

30. PEMERIKSAAN MYCOBACTERIUM
Sputum(SPS, Sewaktu-Pagi_sewaktu)
Waktu pengambilan :
Sputum pertama pagi sesudah bangun tidur,
3 kali berturut-turut bila diperlukan
Sputum sewaktu di bawah pengawasan
dokter – pagi – sewaktu
Diwarnai dengan BTA, basofil tahan asam
(3x)
 Alat : Wadah + Penutup ( bersih )
 Cara pengambilan ( sama dengan diatas)
 Jumlah : 3-5 ml

31. Bahan lain
 Waktu pengambilan : sewaktu.
 Cairan Pleura (> 50 cc)
 Bronchial wash ( minimal 40 – 50 cc )
 Aspirat Trakhea
 Liquor ceresbrospinal & cairan sendi
 Jaringan biopsi ( dianjurkan jaringan yang nekrotik ).
 Bilasan lambung ( minimal 50 cc ).
 Urin ( urin porsi tengah bangun tidur, minimal 10 cc,
3 hari berturut-turut).
 Feces
… pemeriksaan Mycobacterium

32. PEMERIKSAAN ANAEROB
 Kriteria spesimen yang baik untuk
pemeriksaan kuman anaerob :
Spesimen yang baik diambil secara tepat
(aspirasi atau biopsi jaringan swab)
Tidak tercemar oleh mikroba yang tidak
diinginkan
Terhindar dari kontak dengan udara.
Menggunakan media transport anaerob (bila
perlu)

33. PENYIMPANAN & PENGIRIMAN ANAEROB
 Spesimen :
 Medium transport
anaerob  thioglikolat
 kantong anaerob
 Sampel penderita
dalam spuit  tidak
dianjurkan
 Jangan dimasukkan
dalam lemari es
… pemeriksaan anaerob

34. Spesimen yang bukan untuk kultur anaerob
Spesimen
Eksudat atau material lain yang diambil dari luka di
permukaan, abses, luka bakar, kista, ulkus
Swab vagina, serviks dan uretra
Spesimen saluran nafas yang diambil dengan swab,
suction nasotrakeal atau orotrakeal, sputum, bronkoskopi
Feses, usap dubur
(kecuali sampel feses dengan permintaan spesifik :
C.difficile, C. botulinum)
Urin porsi tengah atau urin dari kateter
… pemeriksaan anaerob

35. LEMBAR PERMINTAAN
Identitas pasien (nama lengkap, jenis kelamin,
umur)
Identitas dokter pengirim (nama lengkap, alamat,
nomor telepon)
Alamat lengkap rumah sakit/ tempat pasien dirawat
Deskripsi singkat dan jelas asal spesimen
Tanggal dan jam pengambilan spesimen
Diagnosis atau keadaan klinis pasien saat
pengambilan spesimen
Permintaan pemeriksaan laboratorium
mikrobiologi: Aerob, anaerob, Gram
Antibiotika yang telah diberikan

36. PENYIMPANAN DAN PENGIRIMAN
 Wadah yang kuat (tidak pecah/ tidak bocor
/ tidak tumpah)
 Terbaik bila spesimen langsung dikirim ke
laboratorium pada suhu ruang
pemeriksaan/penanaman dilakukan dalam
waktu kurang dari 1 jam.
 Darah  bed site
 Swab  jangan sampai kering

37.  Transportasi > 1 jam
spesimen tanpa medium transport harus
disimpan dalam 4C, KECUALI untuk
pemeriksaan darah, anaerob, cairan tubuh,
swab luka atau curiga infeksi oleh
Haemophilus, Meningokokus, dan
Gonokokus.
Gunakan medium transport  diperiksa
kurang dari 24 jam.
 Medium transport : Stuart, Amies, Cary-
Blair, Pepton alkali, thioglikolat
… penyimpanan & pengiriman

38. Spesimen ditolak atau
diterima dengan catatan bila :
 Penderita memakai antibiotik
 Ada kemungkinan bahan terkontaminasi
 Jumlah kurang
 Penyimpanan dan pengiriman tidak
memenuhi syarat
 Bahan untuk pemeriksaan anaerob tidak
dikirim dalam suasana anaerob.

39. GOOD QUALITY SPECIMENS
ARE NEEDED FOR RELIABLE
MICROBIOLOGIC
DIAGNOSES

40. TERIMA
KASIH