Kerajaan Mataram Islam meninggalkan banyak warisan kebudayaan seperti bangunan sejarah (keraton, masjid, makam), seni sastra, dan tradisi keagamaan yang masih dilestarikan hingga kini. Peninggalan-peninggalan tersebut mencakup benda, kitab, syair, seni, serta kebudayaan seperti kerajinan perak Kota Gede dan upacara tradisional.