Kerajaan Misool terletak di utara Kepulauan Raja Ampat. Pada tahun 1443, Sultan Ibnu Mansur dari Kesultanan Tidore memimpin ekspedisi ke Papua dan mendirikan 4 kerajaan Islam termasuk Kerajaan Misool. Kerajaan ini dipimpin raja dan ekonominya didominasi perdagangan, nelayan, dan pertanian. Namun kemudian kerajaan ini mulai mundur akibat konflik internal, kurangnya pemimpin yang kuat, dan pengaruh