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Brett K. Beaulieu-Jones, Zhiwei Steven Wu, Chris Williams,
James Brian Byrd, Casey S. Greene
2018/6/10
DL Hacks研究タスク発表
古賀樹
目次
• 論文紹介
• 実装紹介
• 評価
• まとめ
論文紹介
書誌情報
• 著者
• Brett K. Beaulieu-Jones (UPenn, Medicine)
• Zhiwei Steven Wu (UPenn, Engineering and
Applied Sciences)
• Chris Williams (UPenn, Medicine)
• James Brian Byrd (Michigan, Medicine)
• Casey S. Greene (UPenn, Medicine)
• Preprint ( https://www.biorxiv.org/content/early/
2018/06/05/159756 )
書誌情報
• Ian Goodfellow が Twitterで言及
要点
• GAN (Generative Adversarial Network) を用いて個人が
特定できない医療データを生成することに成功した。
これにより医療データシェアが促進される。
• データ生成に伴うプライバシーリスクを差分プライバシー
により定量化した。
医療データ
• 臨床データ (病院での検査結果等)
• 欠損値の多い時系列データ
• 画像データ
• ゲノムデータ
医療データのシェア
• 個人と紐づく医療データは一般公開されない
• 従来の匿名化手法では不十分 (k匿名化など)
• プライバシー / データの質
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評価
• データの分布が似ている
• データの代表値を比較
• データ内での相関係数を比較
• 医者が生成データを不自然だと思わない
• 医者による真偽判定テスト
• 機械学習の学習データとして使用できる
• 機械学習タスクの性能を比較
• 十分なプライバシー保護がなされているか
• 差分プライバシー
実装紹介
学習データ
• SPRINT Clinical Trail Data
• 患者の収縮期血圧、拡張期血圧、薬の処方回数

を12計測分(3ヶ月毎) (3 x 12)
• 患者の治療グループ
• Intensive treatment group
• Standard treatment group
• データ数: 6502 (train: 6000, test: 502)
実装紹介
• ipynbファイルで紹介
評価
評価 (再掲)
• データの分布が似ている
• データの代表値を比較
• データ内での相関係数を比較
• 医者が生成データを不自然だと思わない
• 医者による真偽判定テスト
• 機械学習の学習データとして使用できる
• 機械学習タスクの性能を比較
• 十分なプライバシー保護がなされているか
• 差分プライバシー
(注) Multi-epoch Model (top10)
• 1-500 epochの全てのGeneratorのモデルを保存しておく
• それぞれのGeneratorの生成データでLogistic Regression
とRandom Forestのスコア(treatment groupの分類)が良
い、top5のepochをそれぞれについて算出
• この時ラプラスメソッドを用いて、(0.5,0)-dpとなる

(top5の算出のために生データに触るためプライバシー保
護を考慮)
データの代表値
Paper 再現実験
Multi-epochが最も良い
データ内での相関係数
Paper 再現実験
ある程度傾向が同じである

少々ノイズあり
医者による真偽判定テスト
Paper 再現実験
医者に頼めず
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機械学習タスクの性能
Paper 再現実験
Paper: ほぼ同等なスコア
再現実験: Logistic Regression以外は同等のスコア
機械学習モデルへの変数の貢献度
Paper 再現実験
貢献度は生成方法や真偽によってあまり変わらない
差分プライバシー
Paper 再現実験
Multi-epoch Modelの算出の際と合わせて
(2.5, 10−5
) − dp を達成
まとめ
まと
• GAN (Generative Adversarial Network) を用いて個人が
特定できない医療データを生成することに成功した。
これにより医療データシェアが促進される。
• データ生成に伴うプライバシーリスクを差分プライバシー
により定量化した。

        を達成。(2.5, 10−5
) − dp

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