Dokumen ini memberikan instruksi tentang instalasi, konfigurasi, dan penggunaan sistem GeneXpert untuk tes diagnostik molekuler. Instruksi meliputi persiapan perangkat keras dan lunak, pembuatan akun pengguna, pelaksanaan tes, pemeliharaan alat, dan penanganan masalah.

1. GeneXpert Training
Cepheid HBDC Training Centre

2. INSTALASI GENEXPERT
Persiapan dan konfigurasi sistem

3. Persiapan
• Disediakan
– Sistem GeneXpert®
(GeneXpert + komputer
+ pemindai barcode)
– Xpert® assay
• Tidak disediakan
– Pot sputum
– Jas lab / sarung tangan /
masker
– Pengatur waktu
– Spidol permanen
• Opsional
– Printer
– UPS (Online)
– Pipet 2 ml tambahan
– Vortex

4. Instalasi optimal: menentukan lokasi
terbaik
Hal yang harus diperiksa sebelum instalasi
• Ruangan dengan sirkulasi udara yang baik
• Tidak di bawah sinar matahari langsung atau di bawah
AC
• Meja yang stabil, tidak ada centrifuge di dekat sistem
• Ada ruang 10-15 cm di sekeliling sistem
• Dekat dengan sumber daya
• Temperatur lab yang terkontrol (15-30°C)

5. Instalasi Sistem dengan Desktop

6. Instalasi Sistem dengan Laptop

7. Memulai Windows (Windows XP)
1. Hidupkan mesin GeneXpert®: lampu biru
kecil akan menyala di bagian depan mesin
2. Hidupkan komputer
3. Masuk ke Windows
– Username: cepheid
– Password: cphd

8. Memulai Windows (Windows 7)
1. Hidupkan mesin GeneXpert®: lampu biru
kecil akan menyala di bagian depan mesin
2. Hidupkan komputer
3. Masuk ke Windows
– Username: Cepheid-Admin
– Password: cphd

9. Persiapan untuk penggunaan rutin
sistem
4. Tunggu hingga aplikasi GeneXpert® DX berjalan secara
otomatis
5. Di bagian Check Status, pastikan bahwa semua modul
tersedia
Menu ini akan muncul,
pilih No

10. Persiapan untuk penggunaan rutin
sistem
• Jika aplikasi tertutup (komputer masih hidup),
aplikasi dapat dibuka kembali dengan
menekan dua kali simbol GeneXpert Dx di
desktop, dan ikuti langkah (4) dan (5) seperti
sebelumnya

11. Instalasi optimal: konfigurasi aplikasi
1. Atur waktu lokal di Windows (jangan ganti pilihan negara)
2. Ganti nama GeneXpert di aplikasi dengan memilih SETUP  SYSTEM
CONFIGURATION  ganti “GeneXpert PC” dengan nama lab, negara, dan
nomor seri dari GeneXpert (lihat contoh)
3. Aturlah sesuai dengan kebutuhan (pencetakan otomatis, pemindaian ID
pasien-ID sampel di SETUP  SYSTEM CONFIGURATION (lihat contoh)

12. Instalasi optimal: konfigurasi aplikasi

13. Membuat akun Administrator
(“Admin”)
• Administrator adalah orang yang mempunyai hak akses untuk seluruh
sistem. Administrator dapat lebih dari satu.

14. Membuat akun Administrator
(“Admin”)
Masukkan username
dan password
Pilih tipe
user (Admin)
Klik “OK”

15. Membuat akun Basic
• Basic digunakan untuk pengguna rutin sistem. Akun Basic
berjumlah dapat lebih dari satu.

16. Membuat akun Basic (“Basic”)
Masukkan
username dan
password
Pilih tipe
pengguna
(Basic)
Klik “OK”

17. Masuk ke dalam sistem
1. Pilih User  Login
2. Masukkan username dan password
3. Klik OK

18. Laporan Kualifikasi Instalasi
• Untuk memperbarui status garansi, silakan hasilkan laporan
kualifikasi instalasi ini dengan membuka Reports 
Installation Qualification
• Simpan laporan ini dan kirimkan ke
training@cepheidhbdc.com dengan:
– Nama kontak
– Nomor telepon
– Alamat e-mail kontak
– Alamat fisik sistem

19. MELAKUKAN TES
Penggunaan Rutin

20. Melakukan Tes
1. Klik CREATE TEST
2. Akan muncul
kotak dialog: Please
scan cartridge
barcode
3. Tekan tombol
kuning pada
pemindai barcode
dan pindai barcode
pada cartridge

21. Melakukan Tes
• Ketika barcode tidak bisa dipindai, barcode
dapat dimasukkan secara manual dengan
menekan “Manual Entry” pada langkah ke-2,
lalu mengetikkan nomor yang ada di samping
barcode

22. Melakukan Tes
4. Masukkan
ID pasien
5. Masukkan
ID sampel
6. Modul
akan
terpilih
secara
otomatis,
JANGAN
DIGANTI!
7. Klik “Start
Test” untuk
memulai
8. Lampu berwarna hijau
akan menyala, buka pintu
dan letakkan cartridge
9. Tutup rapat pintu,
dan start akan
berjalan secara
otomatis. Hasil dapat
dilihat 2 jam
kemudian.

23. MENGHENTIKAN TES DAN
ALASANNYA

24. Menghentikan Tes
Tes dihentikan jika sampel yang digunakan belum diproses secara benar;
untuk menghindari waktu yang terbuang percuma
1. Klik Stop Test
2. Pilih modul
yang akan
dihentikan,
berikan tanda
centang
3. Pilih “Stop”

25. Menghentikan Tes
4. Konfirmasi
pilihan dengan
menekan tombol
“Yes”
5. Detail dari tes yang dihentikan dapat dilihat di Check Status

26. MELIHAT HASIL

27. Melihat hasil
• Klik “View Results”
• Untuk melihat pada satu hasil tertentu, pilih “View Test”

28. Klik pada tes yang ingin dilihat

29. Informasi tes
Interpretasi hasil tes

30. MENGUBAH INFORMASI TERKAIT
TES

31. Mengubah informasi terkait tes
Semua
informasi
pada kotak
putih dapat
diubah
Perubahan
disimpan
dengan
“Save
Changes”

32. Mengubah informasi terkait tes
Pilih “Yes”
Riwayat perubahan
dapat dilihat di
bagian “History”

33. MEMBUAT DATA CADANGAN

34. Membuat data cadangan
• Saat menutup aplikasi, akan muncul kotak
dialog, pilih “Yes”
• Pilih “Database Backup”  “Proceed”

35. Membuat data cadangan
• File akan tersimpan di GeneXpert folder 
Backup dengan nama seperti yang tertulis
• Pilih “Save”, kemudian “OK”

36. MENGEMBALIKAN DATA DARI DATA
CADANGAN

37. Mengembalikan data
• Saat menutup aplikasi, akan muncul kotak
dialog, pilih “Yes”
• Pilih “Database Restore”  “Proceed”

38. Mengembalikan data
• Muncul pesan peringatan bahwa data yang lama akan hilang,
pilih “Proceed” untuk melanjutkan
• Pilih data yang diinginkan, lalu klik “Open”

39. MENYALIN DATA KE EXCEL

40. Menyalin Data ke Excel
• “Data Management”  “Archive test”
• Klik kursor pada baris pertama, lalu tarik hingga ke baris terakhir
• Ketika baris termarkahi, tekan Ctrl+C pada keyboard

41. Menyalin Data ke Excel
1. Buka Ms. Excel
2. Klik kanan mouse, lalu pilih “Match destination formatting”

42. TROUBLESHOOTING

43. Pendekatan troubleshooting
1. Jika ada masalah, lihat pesan error di layar
2. Carilah kode error yang muncul di buku
manual GeneXpert dan ikuti petunjuk yang
disarankan
3. Jika masalah berlanjut, hubungi penyedia
service lokal
4. Teruskan penggunaan tanpa modul yang
bermasalah selama memungkinkan

44. Lokasi pesan error

45. Lokasi pesan error

46. Bagian Troubleshooting dalam
Operator Manual
• Chapter 9

47. Cara mendapatkan System Log Report
(Laporan Catatan Sistem)
• Nyalakan GeneXpert
• Buka aplikasi GeneXpert Dx
• Klik “Report”  “System Log”
• Pada jendela yang terbuka, pilih:
– Date range: “All”
– Modules: “Currently Connected Modules”
– Show: “Errors only”
– Klik “Preview PDF”
– Simpan dan kirimkan ke Cepheid Tech Support support@cepheideurope.com

48. Cara mendapatkan System Log Report

49. Cara mengecualikan modul dari tes
• Klik “Setup”  “System configuration”
• Klik pada pilihan “Select Modules”

50. Cara mengecualikan modul dari tes
• Pilih modul yang ingin
dikecualikan, berikan
tanda centang
• Pilih “OK”

51. Modul tidak terdeteksi
GeneXpert dinyalakan sebelum komputer?
Modul tersedia di aplikasi?  Check Status
Jalankan tes
Periksa kabel Ethernet:
longgar? atau rusak?
Pasang kembali atau ganti
kabel Ethernet
1. Port Ethernet terpasang benar?
2. Pengaturan IP address hilang? Atur
kembali, hubungi layanan teknis
3. Masalah dengan port LAN atau
GeneXpert? 4. Masalah dengan papan
gateway atau modul?
Jalankan tes
-Periksa port LAN
-Kontak layanan teknis Mengganti modul atau
motherboard:
Hubungi layanan teknis

52. Masalah suhu
• Kode error: 1001, 1002, 2014, 4009, dll.
• Penyebab:
– Komponen pemanas bermasalah
– Suhu ruangan tidak sesuai dengan ketentuan
– Kegagalan kipas (rusak atau filter kotor)
• Solusi:
– Apakah masalah terjadi hanya pada satu modul?
– Periksa temperatur internal dari modul
– Periksa suhu ruangan (15-30°C)
– Periksa fungsi kipas
– Periksa kebersihan filter
– Periksa ruangan di sekeliling sistem (10-15 cm di semua sisi)

53. Cartridge Tersangkut
• Cartridge tersangkut di dalam modul GeneXpert
• Penyebab:
– Mekanik modul rusak ketika tes dilakukan
– Kesalahan kelistrikan
• Solusi
– Coba buka pintu dari aplikasi
• Di jendela GeneXpert Dx, klik tombol “Maintenance”
• Klik “Open Module Door”
• Pilih modul, klik “Open Door”
• Jika tidak berhasil, restart sistem dan ulangi langkah di atas
– Dibuka secara manual (tidak dengan dipaksa, sesuai
petunjuk layanan teknis)

54. Pesan Error
• Penyebab
– Klik “Error” untuk mengetahui lebih lanjut
• Solusi
– Untuk mengurangi error, periksa kembali persiapan sampel
yang dilakukan

55. Hasil Error: Invalid
• Masalah: SPC (kendali internal) gagal
• Penyebab: PCR gagal karena adanya penghambat (nanah,
partikel makanan, dll.)
• Solusi: Pastikan sampel yang dikumpulkan bersih dari partikel
sebelum ditambahkan reagen, minta sampel baru jika
memungkinkan
SPC

56. Hasil Error: No Result (Tidak ada hasil)
• Masalah: Tes tidak dapat berhenti dan data tidak berhasil terkumpul
dengan baik
• Penyebab: Masalah kelistrikan saat tes, “Stop Test” dilakukan, komputer
berhenti bekerja tiba-tiba
• Solusi: Pastikan sumber daya berfungsi dengan baik dan stabil, gunakan
“Stop Test” hanya jika diperlukan, jangan buka aplikasi lain saat tes
dilakukan

57. Pesan Error:
Probe check failed: 5006/5007
• Masalah:
– Kendali probe check gagal dan tes dihentikan sebelum amplifikasi
(PCR)
• Penyebab:
– Sampel terlalu kental
– Jumlah sampel kurang
– Terdapat gelembung udara
– Penyimpanan cartridge yang tidak baik
• Solusi
– Pastikan bahwa sampel telah mencair sebelum dimasukkan ke dalam
cartridge, tambahkan 10 menit sebelum dimasukkan ke dalam
cartridge
– Gunakan 2-4 ml dari sampel
– Hindari gelembung udara
– Simpan cartridge pada suhu 2-28°C

58. Pesan Error:
Abnormal pressure detected: 2008
• Problem
– Pembacaan tekanan melebihi kapasitas
• Penyebab
– Filter dari cartridge tersumbat (karena kekentalan sampel atau
ada partikel)
– Sensor tekanan gagal berfungsi
• Solusi
– Pastikan bahwa sampel telah mencair sebelum dimasukkan ke
dalam cartridge, tambahkan 10 menit sebelum dimasukkan ke
dalam cartridge
– Hindari partikel padat yang ada dalam sampel
– Gunakan cartridge baru dan tambahkan reagen saja, jika
masalah berlanjut, hubungi layanan teknis

59. Pesan Error:
Module communication loss was detected: 2127
• Masalah
– Komunikasi antara modul dan aplikasi terputus
• Penyebab
– Koneksi kabel ethernet buruk
– Masalah kelistrikan (tidak stabil)
– Titik koneksi antargateway buruk
– Suhu ruangan terlalu tinggi
• Solusi
– Cabut dan pasang kembali kabel ethernet, restart sistem
– Cabut dan pasang kembali kabel gateway board dengan
GeneXpert
– Pastikan sumber daya berfungsi dengan baik
– Periksa suhu ruangan (harus di bawah 39°C)

60. Pesan Error:
Signal loss detected in the amplification curve: 5011
• Masalah
– Sinyal hilang dari kurva amplifikasi
• Penyebab
– Kehilangan tekanan tabung karena cartridge tidak
tertutup rapat, atau katup cartridge tidak berfungsi
dengan baik
• Solusi
– Pastikan tidak ada gelembung udara di dalam tabung
reaksi
– Gunakan cartridge baru, jika masalah berlanjut,
hubungi layanan teknis

61. PEMELIHARAAN ALAT

62. Pemeliharaan GeneXpert
• Harian:
– Buang cartridge setelah pemakaian
– Gunakan penutup untuk mengurangi debu pada mesin
• Mingguan:
– Bersihkan bagian interior cartridge bay
– Restart sistem
• Bulanan:
– Bersihkan batang pengisap (plunger rod)
– Bersihkan permukaan alat
– Bersihkan filter kipas dengan air sabun
– Arsipkan hasil dan simpan di media eksternal
• Tahunan atau setelah 2000 tes per modul
– Kalibrasi modul

63. Alat yang dibutuhkan
• Larutan sodium hipoklorit 1%
• Alkohol 70%
• Penyeka non-katun
• Sarung tangan sekali pakai
• Air bersih dan sabun
• Pelindung mata
• Filter kipas pengganti (tersedia sesuai
permintaan)

64. Prosedur pembersihan
1. Basahi penyeka dengan larutan sodium
hipoklorit 1%
2. Bersihkan permukaan dengan penyeka
3. Buang penyeka yang telah digunakan
4. Tunggu selama 5 menit
5. Basahi penyeka yang baru dengan alkohol 70%
6. Bersihkan permukaan dengan penyeka
7. Buang penyeka yang telah digunakan
8. Ulangi langkah 5-7

65. Perawatan plunger (batang pengisap)
• Dari menu “Maintenance”, pilih “Maintenance”  “Plunger maintenance”
• Dalam jendela yang muncul, pilih modul yang akan dibersihkan, atau pilih “Clean
All”
• Ikuti instruksi, dan pilih “OK”

66. Perawatan plunger (batang pengisap)
• Plunger dari modul yang dipilih
akan muncul
• Setelah pembersihan selesai
dilakukan, klik “Move Up All”
untuk mengembalikan ke posisi
semula, lalu pilih “Close”

67. Membersihkan filter kipas

68. Membersihkan filter kipas
Lepas penutup abu-abu di
bagian belakang mesin
Lepaskan filter (spons)
Bersihkan filter dengan air dan
sabun, keringkan dan pasang
kembali

69. Mengarsipkan hasil

70. Mengarsipkan hasil

71. Menyimpan arsip di CD

72. Kalibrasi modul
• Semua modul harus dikalibrasi setiap tahun
atau setelah 2000 tes
• Kalibrasi dilakukan dengan cartridge XpertCal®
• Dilakukan oleh pengguna