Studi ini membandingkan sapi taurin dan zebu dengan menganalisis sekitar 9.000 SNP pada 317 ekor sapi. Ditemukan 91 SNP yang hanya polimorfik pada zebu dan 13 SNP yang hanya polimorfik pada taurin. 14 wilayah genom ditemukan memiliki frekuensi alel yang berbeda signifikan antara zebu dan taurin, menunjukkan tekanan seleksi. 12 wilayah dengan perbedaan haplotype antara zebu dan taurin mengindikasikan seleksi
2. FILOSOFI
Bunga matahari adalah bunga yang melambangkan
kesetiaan karena bunga matahari setia kepada
matahari disetiap sore, bunga matahari juga
melambangkan semangat dan optimis, kegembiraan
dan keceriaan, persahabatan dan persatuan.
6. Objek
Sapi taurine dan Zebu dari genus Bos
Pembahasan
Sapi termasuk dalam genus Bos, mempunyai teracak
atau jari genap, berkaki empat, tandukberongga, dan
memamahbiak. Sapi juga termasuk dalam kelompok
Taurine,termasuk di dalamnya Bos Taurus (sapi yang
tidak memiliki punuk) dan BosIndicus (sapi yang
berpunuk).
9. Pembahasan
Dalam studi ini, kami menguji beberapa teknik untuk mengklasifikasikan proporsi hewan
yang dapat dilacak ke asal taurin atau zebu. Meskipun breed dari hewan komposit Sanga
taurin dimasukkan, tidak ada SNP yang berasal dari Sanga, jadi kesimpulan untuk breed
tersebut tidak dapat dikategorikan karena bias pemastian yang melekat dalam penemuan
SNP.
Perbedaan antara sapi zebu dan taurin, menggunakan sampel hewan dan SNP ini, tampaknya
lebih pada derajat daripada jenisnya. Mengingat jumlah SNP, mengejutkan bahwa hanya 1%
yang bersifat pribadi, yaitu polimorfik hanya pada hewan taurin atau zebu. Sebagian besar alel
pribadi ini adalah SNP Brahman dan pribadi pada hewan Brahman, bukan untuk SNP taurin atau
hewan taurin. Hasil ini menunjukkan bahwa populasi leluhur sapi besar, sehingga sejumlah besar
polimorfisme telah dipertahankan dan bahwa sebagian besar polimorfisme mungkin purba dan
mendahului pemisahan antara nenek moyang sapi yang mengarah ke breed zebu. dibandingkan
dengan breed taurin (The Bovine Genome Sequencing and Analysis Consortium et al. 2009; The
Bovine HapMap Consortium 2009).
10.
11. CREDITS: This presentation template was created by
Slidesgo, including icons by Flaticon, and
infographics & images by Freepik
Brahman berasal dari Amerika Serikat sebagai gabungan dari
setidaknya empat breed dari India dan Brazil, serta dimasukkannya sapi
taurin ke peningkatan jumlah bers (Briggs & Briggs 1980). Peternak
kemudian mencoba untuk meningkatkan jumlah keturunan zebu dengan
menggunakan air mani dari hewan zebu murni, tetapi masih akan ada
sisa keturunan taurin. Kisaran breed zebu yang digunakan, ditambah
penggunaan asli bendungan taurin, membantu menjelaskan variabilitas
Brahman yang lebih besar.
Analisis substruktur populasi menunjukkan bahwa beberapa hewan
Brahman memiliki residu alel taurin. Ini juga menunjukkan bahwa
beberapa hewan taurin menunjukkan introgresi alel zebu, atau alel yang
sekarang terutama ditemukan pada hewan zebu tetapi mungkin berasal
dari nenek moyang yang sama dari hewan zebu dan taurin. Hal ini
didukung oleh Departemen Industri Primer New South Wales, yang
mengklaim bahwa Brahman dikembangkan dari keturunan empat
keturunan zebu India dengan beberapa infus lokal Inggris. breed (Bos
taurus) pada awal 1800-an di AS (AGFACT A2.3.11;
http://www.dpi.nsw.gov.au/agriculture/livestock/ beef/
breeding/breeds/brahman).
12. Kumpulan SNP saat ini mengklasifikasikan hewan komposit ke dalam proporsi
zebu dan taurin yang sesuai dengan nenek moyang yang diketahui dari Santa
Gertrudis, yang secara nominal 5/8 Shorthorn dan 3/8 Brahman. Perbandingan
keturunan yang menarik adalah Belmont Red, yang menunjukkan proporsi
yang sama dari keturunan zebu dan Brahman. Belmont Red secara nominal
Africander dan masingmasing Hereford dan Shorthorn. Pada sapi CRC Daging
Sapi, sapi Belmont Red komersial digunakan, dan meskipun umumnya tidak
memiliki keturunan Brahman, dan tentu saja ada keturunan Brahman di
beberapa kelompok penelitian 2010 CSIRO, Genetika Hewan 2010 Yayasan
Internasional Stichting untuk Genetika Hewan, 41, 467–477Belmont Red,
tingkat keturunan zebu yang ditemukan di sini (34%) lebih besar
Daerah genom dari homozigositas haplotipe yang diperpanjang
diferensial antara dua populasi menunjukkan seleksi baru-baru ini atau
fiksasi cepat dari alel alternatif dalam waktu singkat, sehingga
mencegah rekombinasi di daerah terdekat di salah satu dari dua
populasi.
13. Kesimpulan
Dalam studi ini, kira-kira 9000 penanda polimorfisme nukleotida tunggal digenotipekan pada 317 hewan seleksi
dari keturunan taurin, zebu, dan komposit untuk mengkarakterisasi perbedaan sistematis antara kelompok-
kelompok ini. Kami mengidentifikasi 91 penanda kelas intra-breed; 78 polimorfik hanya pada hewan zebu,
sedangkan 13 polimorfik hanya pada hewan taurin. Tidak ada perbedaan tetap (tetap untuk alel alternatif
antara dua jenis breed) antara hewan zebu dan taurin. Kami menemukan 14 wilayah dengan frekuensi alel
yang berbeda secara signifikan antara hewan zebu dan taurin yang menunjukkan tekanan seleksi variabel atau
penyimpangan genetik. Kami juga menemukan 12 daerah independen dari diferensial diperpanjang haplotype
homozigositas (EHH), indikasi seleksi baru-baru ini atau fiksasi cepat dari alel alternatif dalam waktu singkat di
salah satu dari dua kelas breed. Analisis genomik fungsional awal dari wilayah ini menunjukkan sifat tanda
atribut tropis termasuk keratin, protein kejutan panas dan gen tahan panas. Kami mengantisipasi penyelidikan
ini menjadi batu loncatan untuk studi masa depan untuk mengidentifikasi wilayah genom khusus untuk dua
kelompok sapi, dan untuk selanjutnya membantu dalam diskriminasi antara sapi yang beradaptasi di daerah
beriklim sedang dan tropis.
