Kuliah biokimia membahas tentang pengampu kuliah, buku acuan, penilaian, dan pengertian biokimia sebagai ilmu yang mempelajari proses kimia dalam organisme hidup.

1. KULIAH BIOKIMIA
(PNU2102C, 2 SKS)
Yogyakarta, 24 Agustus 2015

2. BIOKIMIA
1. Dr. Tri Joko Raharjo, S.Si.,M.Si.(MIPA)
2. Dr. Tri Joko, S.P., M.Sc. (PS-HPT)
3. Dr. Ir. Ngadiman, M.Si. (MIKROBIOLOGI)*
Pengampu Kelas-C :

3. Buku Acuan
• J. More and R. Langley. 2008. Biochemistry for
Dummies (Softcopy available)
• D.L. Nelson and M.M.Cox.2004. Lehninger Principles
of Biochemistry. W.H.Freeman&Co.(Softcopy)
• J.M.Berg, J.L.Tymoczko, and L.Stryer. 2002.
Biochemistry. W.H.Freeman&Co.(Softcopy available).
• Albert L. Lehninger. 1995. Dasar-dasar Biokimia. (Alih
bahasa: Maggy Thenawidjaja). Penerbit Erlangga,
Jakarta.
• David S. Page. 1995. Prinsip-prinsip Biokimia.
Penerbit Unair, Surabaya.
• Soeharsono. 1982. Biokimia I dan II. Gadjah Mada
University Press, Yogyakarta.
• Websites

4. Penilaia
n Total Nilai Ujian + Mid + Tugas dari 3 dosen
dibagi 3 (Rata-rata dari Nilai Dosen I + II + III)
 Pengharkatan
A : > rata-rata kelas + 1,5 x stdev
B : < rata-rata kelas + 1,5 x stdev &
> rata-rata kelas + 0,5 x stdev
C : < rata-rata kelas + 0,5 x stdev &
> rata-rata kelas – 0,5 x stdev
D : < rata-rata kelas – 0,5 x stdev &
> rata-rata kelas – 1,5 x stdev
E : < rata-rata kelas – 1,5 x stdev

5. Apa itu Biokimia?
• Definisi:
– Webster’s dictionary: Biokimia
(Yunani)=, artinya “Kimia mahluk hidup;
Kimia yang menjadi ciri kehidupan.”
– WebNet dictionary: “Biokimia adalah
mempelajari bahan-bahan dan proses-
proses yang terjadi dalam tubuh mahluk
hidup; sebagai upaya untuk memahami
proses kehidupan dari sisi kimia.“

6. Tujuan mempelajari biokimia?
Untuk memahami interaksi
molekul-molekul tak hidup yang
menghasilkan fenomena yang
menjadi ciri-ciri kehidupan dan
menjelaskan keseragaman kimia
dari kehidupan yang beragam.

7. Characteristics of Living Systems

8. Characteristics of Living Systems

9. Characteristics of Living Systems

10. Sejarah Biokimia
 Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk hidup.
Enam unsur utama penyusun
sel hidup adalah: C, H, O, N,
P, dan S.
99% penyusun sel adalah C, H, O, N
Unsur
Elektron
bebas
Jumlah Fraksi
H 1 2/3
O 2 1/4
N 3 1/70
C 4 1/10

11. Sejarah Biokimia (Lanjutan)
• Kedua, identifikasi molekul penyusun (monomer)
yang ditemukan dalam mahluk hidup
• Asam Amino
• Nukleotida
• Monosakarida
• Lipida

12.  Selanjutnya memahami mekanisme sintesis biomolekul ,
sehingga membuat mahluk hidup menjadi hidup
Sejarah Biokimia
(Lanjutan)

13. Biomolekul – Struktur
• Senyawa
Pembangun
• Monosakarida
• Asam amino
• Nukleotida
• Asam lemak
Makromolekul
• Polisakarida
• Protein (peptida)
• RNA or DNA
• Lipid
Anabolic
Catabolic

14. Biosintesis
Membutuhkan
molekul
sederhana
untuk
dirangkai
melalui
berbagai
kombinasi

15. Biomolecule
s
• Carbohydrates
• Lipids
• Proteins
• Nucleic acid

16. Carbohydrates
• Composed of carbon, hydrogen, and oxygen.
• Sugars
• Monosaccharides
– Ex. Glucose
• Disaccharides
– Ex. Sucrose
• Polysaccharides
– Ex. Cellulose

17. Lipids
• Fatty Acids
– The building
blocks of
lipids.
biology.clc.uc.edu
courses.cm.utexas.edu

18. Proteins
• Made up of
polymers of amino
acids.
• 20 primary amino
acids exist.
• A polymer of 3 or
more amino acids
forms a
polypeptide.

19. Enzymes
• Are proteins.
• Are considered
biological
catalysts.
– Speed up a chemical
reaction without
being altered.
• Proteins, including
enzymes, can be
denatured.

20. Nucleic
Acids
• DNA and RNA.
– (DNA - deoxyribonucleic acid,
RNA - ribonucleic
acid).
• Is the “hereditary molecule.”
• Contains genes that code for
a certain product.
• DNA is translated into RNA
which is used to produce a
protein or other product.

21. (1) ENERGI
hal yang perlu
diketahui adalah
cara:
- Memperolehnya
- Mengubahnya
- Memanfaatkannya
3 hal yang dibutuhkan sel

22. (2) MOLEKUL SEDERHANA ,
hal yang perlu diketahui
adalah cara:
• Mengubahnya
• Mempolimerisasikannya
• Mendegradasinya
3 hal yang dibutuhkan sel (lanjutn)

23. (3) MEKANISME KIMIA, untuk:
• Menjalankan reaksi kimia secara berurutan
• Mensintesis & mendegradasi makromolekul
• Mempertahankan suatu keadaan steady
state yang dinamis
• Perakitan kembali struktur yang kompleks
• Menggandakan diri secara akurat dan
efisien
• Mempertahankan keteraturan proses
biokimia
3 hal yang dibutuhkan sel

24. Strategi sel #1: mahluk hidup
menggunakan sistem reaksi kimia
berpasangan untuk mendorong reaksi
yang sulit terjadi.

25. Strategi sel #2: mahluk hidup
menggunakan enzim untuk
mempercepat reaksi yang
semestinya lambat

26. Bagaimana enzim bisa
mempercepat reaksi?

27. Bagaimana enzim bisa
mempercepat reaksi?

28. Biochemistry is a Research Discipline
Applicable to the Real World
Medicine/Clinical
- diagnose and monitor disease
- design drugs (new antibiotics, chemotherapy agents)
- protein diseases (Mad Cow, Alzheimer’s)
Agriculture
- new herbicides and pesticides
- transgenic crops
Industry
- synthesis
- detoxification

29. Cakupan (scope) :
 Struktur kimia dalam biologi (biomolecule)
 Interaksi antar biomolekul
 Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel
 Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel
 Mekanisme pengorganisasian biomolekul
dan pengkoordinasian aktivitasnya
 Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi
informasi genetika

30. TERIMA KASIH
DAN
SAMPAI JUMPA LAGI

31. Hubungan antara Biokimia
dan ilmu lainnya
 Kimia Organik yang mempelajari sifat-sifat
biomolekul.
 Nutrisi, yang memanfaatkan pengetahuan tentang
metabolisme untuk menjelaskan kebutuhan
makanan bagi mahluk hidup guna
mempertahankan kehidupan normalnya.
 Kesehatan, yang mencari pemahaman tentang
keadaan sakit dari sudut pandang molekular.

32. • Mikrobiologi, yang menunjukkan bahwa
mikroorganisme sangat cocok untuk digunakan
sebagai sarana mempelajari jalur-jalur
metabolisme dan mekanisme pengendaliannya.
• Fisiologi, yang mempelajari proses kehidupan
pada tingkat jaringan dan organisme.
• Biologi sel, yang mempelajari pembagian kerja
biokimia dalam sel.
• Genetika, yang mempelajari mekanisme
penyusunan identitas biokimia sel.
Hubungan antara Biokimia
dan ilmu lainnya

33. Life begins with
Cell
• A cell is a smallest structural unit of an
organism that is capable of independent
functioning
• All cells have some common features

34. Cells
• Fundamental working units of every living system.
• Every organism is composed of one of two
radically different types of cells:
prokaryotic cells or eukaryotic cells.
• Prokaryotes and Eukaryotes are descended from the
same primitive cell.
– All extant prokaryotic and eukaryotic cells are the result
of a total of 3.5 billion years of evolution.

35. SIFAT BENDA HIDUP
• Kompleks, terorganisasi, dinamis
• Mempunyai fungsi dan tujuan
• Mampu mengekstraksi, mengubah,
dan menggunakan energi
• Menggandakan diri (Reproduction)

36. Unsur dengan berat atom lebih ringan
membentuk ikatan lebih kuat
Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup memiliki berat
atom yang rendah; H, O, N dan C adalah unsur dengan berat
atom relatif paling kecil yang masing-masing mampu
membentuk ikatan tunggal, rangkap 2 dan 3.