‫ية‬‫ر‬‫االسكند‬‫جامعة‬
‫اعة‬‫ر‬‫الز‬ ‫كلية‬
‫اثة‬‫ر‬‫و‬‫قسم‬
‫قم‬‫ر‬‫العملى‬‫س‬‫ر‬‫الد‬5
‫الكائنات‬ ‫من‬ ‫الوراثية‬ ‫المادة‬ ‫عزل‬‫الحية‬
‫لعزل‬ ‫ناجحة‬ ‫محاولة‬ ‫اول‬ ‫ان‬
‫الوراثية‬ ‫المادة‬‫ال‬‫ـ‬DNA
‫عام‬ ‫كانت‬1869‫للعالم‬
Friedrich Miescher‫و‬ ،
‫استخالص‬ ‫تكنيك‬ ‫مازال‬‫الـ‬
DNA‫اساسيات‬ ‫من‬ ‫هو‬
‫الوراثة‬ ‫مجال‬ ‫فى‬ ‫العمل‬
‫ان‬ ‫حيث‬ ‫الوراثية‬ ‫والهندسة‬‫ه‬
‫التى‬ ‫الخام‬ ‫المادة‬ ‫يمثل‬
‫هذ‬ ‫فى‬ ‫العلماء‬ ‫عليها‬ ‫يعمل‬‫ا‬
‫المجال‬.
‫االستخالص‬Extraction
‫التنقية‬Purification
‫الترسيب‬Precipitation
‫و‬ ‫الخاليا‬ ‫جدر‬ ‫من‬ ‫الوراثية‬ ‫المادة‬ ‫حول‬ ‫ما‬ ‫كل‬ ‫تكسير‬ ‫فى‬ ‫يتمثل‬ ‫هو‬ ‫و‬
‫م‬ ‫تتكون‬ ‫ما‬ ‫غالبا‬ ‫التى‬ ‫و‬ ‫هستونات‬ ‫و‬ ‫نووية‬ ‫اغشية‬ ‫و‬ ‫البالزمية‬ ‫االغشية‬‫ن‬
‫السكر‬ ‫عديديات‬ ‫و‬ ‫دهنية‬ ‫جزيئات‬ ‫و‬ ‫بروتين‬.
‫مستوى‬ ‫فى‬ ‫المحلول‬ ‫يكون‬ ‫ان‬ ‫يجب‬ ‫لكن‬ ‫و‬pH‫مناسب‬:
‫الـ‬ ‫يتكسر‬ ‫ال‬ ‫حتى‬DNA.
‫ب‬ ‫ترسيبها‬ ‫لسهولة‬ ‫المحلول‬ ‫فى‬ ‫مبعثرة‬ ‫تكون‬ ‫ال‬ ‫حتى‬ ‫جزيئاته‬ ‫تجميع‬‫ذلك‬ ‫عد‬
.
CTAB-
mercapto
ethanole
EDTA SDS Tris HCl Nacl
8Tris .HCl PH=:‫الـ‬ ‫على‬ ‫يحافظ‬ ‫هو‬ ‫و‬Ph‫الـ‬ ‫يقرب‬ ‫ما‬ ‫هو‬ ‫و‬ ‫مناسب‬ ‫مستوى‬ ‫فى‬
8.
SDS(sodium dodocyle sulphate: )‫بالـ‬ ‫يحيط‬ ‫ما‬ ‫باذابة‬ ‫يقوم‬ ‫هو‬ ‫و‬DNA
‫تكسيرها‬ ‫و‬ ‫البروتينات‬ ‫باذابة‬ ‫يقوم‬ ‫كما‬ ، ‫خروجه‬ ‫لتسهيل‬ ‫الخلية‬ ‫اجزاء‬ ‫من‬.
EDTA:‫تحفيز‬ ‫لمنع‬ ‫الماغنسيوم‬ ‫ايونات‬ ‫مثل‬ ‫الثنائية‬ ‫االيونات‬ ‫بخلب‬ ‫تقوم‬‫االنزيمات‬
‫الـ‬ ‫تكسر‬ ‫الى‬DNA‫مثل‬DNAases‫الـ‬ ‫بتحليل‬ ‫تقوم‬ ‫ال‬ ‫حتى‬DNA.
CTAB&Mercaptoethanole:‫الـ‬ ‫بمساعدة‬ ‫يقوم‬ ‫ذلك‬ ‫و‬SDS‫نفس‬ ‫فى‬
‫الوظيفة‬(‫بالـ‬ ‫يحيط‬ ‫ما‬ ‫كل‬ ‫اذابة‬DNA)‫االستخالص‬ ‫اداء‬ ‫تحسين‬ ‫كذلك‬ ‫و‬.
NaCl:‫الـ‬ ‫على‬ ‫الموجودة‬ ‫السالبة‬ ‫الشحنة‬ ‫لمعادلة‬ ‫ذلك‬ ‫و‬DNA‫عملية‬ ‫من‬ ‫فيقلل‬
‫المحلول‬ ‫فى‬ ‫مبعثر‬ ‫يكون‬ ‫ال‬ ‫حتى‬ ‫تجميعه‬ ‫على‬ ‫يعمل‬ ‫ذلك‬ ‫و‬ ‫التنافر‬Neutralization.
‫ال‬ ‫تنقية‬ ‫هى‬ ‫و‬DNA‫مختلفة‬ ‫جزيئات‬ ‫من‬ ‫به‬ ‫يحيط‬ ‫ما‬ ‫كل‬ ‫من‬.
‫من‬ ‫التنقية‬ ‫محلول‬ ‫مواد‬ ‫تتكون‬ ‫لذلك‬ ‫و‬:
Chloroform 24:isoamylealchol 1:
‫الـ‬ ‫تنقية‬ ‫على‬ ‫يعمل‬ ‫هو‬ ‫و‬DNA‫عمل‬ ‫طريق‬ ‫عن‬
Aqueous phase‫و‬organic phase
‫الـ‬ ‫يذوب‬ ‫حيث‬DNA‫الـ‬ ‫فى‬Aqueous phase
‫الـ‬ ‫فى‬ ‫االخرى‬ ‫الجزيئات‬ ‫تكون‬ ‫و‬organic phase
‫االخرى‬ ‫الجزيئات‬ ‫عن‬ ‫عزله‬ ‫فيسهل‬.
‫الـ‬ ‫يذوب‬DNA‫فى‬
‫الـ‬Aqueous
phase
‫الجزيئات‬ ‫تكون‬ ‫و‬
‫الـ‬ ‫فى‬ ‫االخرى‬
organic phase
‫الـ‬ ‫فيه‬ ‫يذوب‬ ‫ال‬ ‫محلول‬ ‫بواسطة‬ ‫الترسيب‬ ‫يتم‬DNA
‫من‬ ‫يتكون‬ ‫الترسيب‬ ‫محلول‬ ‫لذلك‬ ‫و‬:
Ethanol or isopropanole 100%
‫يعمل‬ ‫حتى‬ ‫ذلك‬ ‫و‬ ‫جدا‬ ‫بارد‬ ‫يضاف‬ ‫لكن‬ ‫و‬
‫الـ‬ ‫جزيئات‬ ‫جعل‬ ‫على‬DNA‫حول‬ ‫تتجمع‬
‫االستخالص‬ ‫كفاءة‬ ‫من‬ ‫فيزيد‬ ‫البعض‬ ‫بعضها‬.
‫الـ‬ ‫ان‬ ‫وجد‬ ‫حيث‬DNA‫يذوب‬ ‫ال‬alcohols
(‫البعض‬ ‫بعضها‬ ‫عن‬ ‫الجزيئات‬ ‫تبعد‬ ‫المرتفعة‬ ‫الحرارة‬ ‫درجة‬).
‫للحف‬ ‫الثانوية‬ ‫الخطوات‬ ‫من‬ ‫لكنه‬ ‫و‬ ‫لالستخالص‬ ‫االساسية‬ ‫الخطوات‬ ‫من‬ ‫ليس‬ ‫هو‬ ‫و‬‫اظ‬
‫الـ‬ ‫على‬DNA‫الحفظ‬ ‫محلول‬ ‫يكون‬ ‫و‬ ‫عليه‬ ‫العمل‬ ‫لحين‬TE-buffer‫من‬ ‫مكون‬ ‫عادة‬
Tris‫و‬EDTA‫الـ‬ ‫على‬ ‫للمحافظة‬pH‫الـ‬ ‫و‬ ‫مناسب‬ ‫مستوى‬ ‫فى‬EDTA‫الـ‬ ‫لخلب‬
DNases.
.1‫النباتية‬ ‫العينة‬ ‫بطحن‬ ‫قم‬0.5‫تكون‬ ‫حتى‬ ، ‫السائل‬ ‫النيتروجين‬ ‫فى‬ ‫جم‬
‫الجافة‬ ‫كالبودرة‬.
.2‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫انبوبة‬ ‫الى‬ ‫العينة‬ ‫انقل‬.
.3‫اضف‬9‫االستخالص‬ ‫محلول‬ ‫من‬ ‫مل‬.
.4‫حرارة‬ ‫درجة‬ ‫على‬ ‫مائى‬ ‫حمام‬ ‫فى‬ ‫توضع‬65‫من‬ ‫تتراوح‬ ‫لمدة‬ ، ‫مئوى‬
‫ساعتين‬ ‫الى‬ ‫ساعة‬ ‫نصف‬.
.5‫لمدة‬ ‫العينات‬ ‫تترك‬5-10‫اليها‬ ‫يضاف‬ ‫و‬ ‫تبرد‬ ‫حتى‬ ‫دقائق‬5‫من‬ ‫مل‬
‫محلول‬24:1‫كلورفورم‬:‫لمدة‬ ‫جيدا‬ ‫الرج‬ ‫مع‬ ‫ايزواميل‬15‫دقيقة‬.
.6‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫عمل‬ ‫يتم‬3000‫لمدة‬ ‫الدقيقة‬ ‫فى‬ ‫لفة‬15‫دقيقة‬.
.7‫اخرى‬ ‫انبوبة‬ ‫فى‬ ‫نضيفه‬ ‫و‬ ‫الرائق‬ ‫نأخذ‬.
.8‫اضافة‬ ‫يتم‬5‫من‬ ‫مل‬24:1‫كلوروفورم‬:‫لمدة‬ ‫الرج‬ ‫مع‬ ‫ايزواميل‬5-10
‫دقائق‬
.9‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫عمل‬ ‫يتم‬3000‫لمدة‬ ‫الدقيقة‬ ‫فى‬ ‫لفة‬10‫دقيقة‬.
.10‫اخرى‬ ‫انبوبة‬ ‫الى‬ ‫نضيفه‬ ‫و‬ ‫الرائق‬ ‫ناخذ‬.
.11‫اضافة‬ ‫يتم‬6-5‫مل‬isopropanol‫لمدة‬ ‫الفريزر‬ ‫فى‬ ‫االنابيب‬ ‫وتوضع‬12‫ساعة‬.
.12‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫عمل‬ ‫يتم‬3000‫لمدة‬ ‫الدقيقة‬ ‫فى‬ ‫لفة‬10‫دقيقة‬.
.13‫فى‬ ‫الرائق‬ ‫من‬ ‫التخلص‬ ‫يتم‬laminar cabinet.
.14‫الـ‬ ‫من‬ ‫تجف‬ ‫حتى‬ ‫االنابيب‬ ‫تترك‬isopropanole.
.15‫حوالى‬ ‫اضافة‬100ul‫الـ‬ ‫من‬TE-buffer‫الـ‬ ‫لعينة‬DNA‫نقلها‬ ‫بعدها‬ ‫و‬ ، ‫المترسبة‬
‫انبوبة‬ ‫الى‬Eppendorv.
Micro-centrifuge
‫الصغير‬ ‫المركزى‬ ‫الطرد‬ ‫جهاز‬
Mortar
‫الهون‬
Dry bath
‫الجاف‬ ‫الحمام‬ ‫جهاز‬
Ph-meter
‫الـ‬ ‫درجة‬ ‫قياس‬ ‫جهاز‬PH
Micropipette
Tips --------------------------------------------------------
ependorfe tubes
Chloroform
: isoamyle
CTAB
SDS
Tris
NaCl
EDTA
Isopropanol
or Ethanol
‫ال‬ ‫استخلص‬DNA‫بنفسك‬
‫الفرولة‬ ‫من‬
المحاضرة الأولى - تكنيكات وراثية متقدمة

المحاضرة الأولى - تكنيكات وراثية متقدمة

  • 1.
  • 2.
    ‫لعزل‬ ‫ناجحة‬ ‫محاولة‬‫اول‬ ‫ان‬ ‫الوراثية‬ ‫المادة‬‫ال‬‫ـ‬DNA ‫عام‬ ‫كانت‬1869‫للعالم‬ Friedrich Miescher‫و‬ ، ‫استخالص‬ ‫تكنيك‬ ‫مازال‬‫الـ‬ DNA‫اساسيات‬ ‫من‬ ‫هو‬ ‫الوراثة‬ ‫مجال‬ ‫فى‬ ‫العمل‬ ‫ان‬ ‫حيث‬ ‫الوراثية‬ ‫والهندسة‬‫ه‬ ‫التى‬ ‫الخام‬ ‫المادة‬ ‫يمثل‬ ‫هذ‬ ‫فى‬ ‫العلماء‬ ‫عليها‬ ‫يعمل‬‫ا‬ ‫المجال‬.
  • 3.
  • 5.
    ‫و‬ ‫الخاليا‬ ‫جدر‬‫من‬ ‫الوراثية‬ ‫المادة‬ ‫حول‬ ‫ما‬ ‫كل‬ ‫تكسير‬ ‫فى‬ ‫يتمثل‬ ‫هو‬ ‫و‬ ‫م‬ ‫تتكون‬ ‫ما‬ ‫غالبا‬ ‫التى‬ ‫و‬ ‫هستونات‬ ‫و‬ ‫نووية‬ ‫اغشية‬ ‫و‬ ‫البالزمية‬ ‫االغشية‬‫ن‬ ‫السكر‬ ‫عديديات‬ ‫و‬ ‫دهنية‬ ‫جزيئات‬ ‫و‬ ‫بروتين‬. ‫مستوى‬ ‫فى‬ ‫المحلول‬ ‫يكون‬ ‫ان‬ ‫يجب‬ ‫لكن‬ ‫و‬pH‫مناسب‬: ‫الـ‬ ‫يتكسر‬ ‫ال‬ ‫حتى‬DNA. ‫ب‬ ‫ترسيبها‬ ‫لسهولة‬ ‫المحلول‬ ‫فى‬ ‫مبعثرة‬ ‫تكون‬ ‫ال‬ ‫حتى‬ ‫جزيئاته‬ ‫تجميع‬‫ذلك‬ ‫عد‬ .
  • 6.
  • 7.
    8Tris .HCl PH=:‫الـ‬‫على‬ ‫يحافظ‬ ‫هو‬ ‫و‬Ph‫الـ‬ ‫يقرب‬ ‫ما‬ ‫هو‬ ‫و‬ ‫مناسب‬ ‫مستوى‬ ‫فى‬ 8. SDS(sodium dodocyle sulphate: )‫بالـ‬ ‫يحيط‬ ‫ما‬ ‫باذابة‬ ‫يقوم‬ ‫هو‬ ‫و‬DNA ‫تكسيرها‬ ‫و‬ ‫البروتينات‬ ‫باذابة‬ ‫يقوم‬ ‫كما‬ ، ‫خروجه‬ ‫لتسهيل‬ ‫الخلية‬ ‫اجزاء‬ ‫من‬. EDTA:‫تحفيز‬ ‫لمنع‬ ‫الماغنسيوم‬ ‫ايونات‬ ‫مثل‬ ‫الثنائية‬ ‫االيونات‬ ‫بخلب‬ ‫تقوم‬‫االنزيمات‬ ‫الـ‬ ‫تكسر‬ ‫الى‬DNA‫مثل‬DNAases‫الـ‬ ‫بتحليل‬ ‫تقوم‬ ‫ال‬ ‫حتى‬DNA. CTAB&Mercaptoethanole:‫الـ‬ ‫بمساعدة‬ ‫يقوم‬ ‫ذلك‬ ‫و‬SDS‫نفس‬ ‫فى‬ ‫الوظيفة‬(‫بالـ‬ ‫يحيط‬ ‫ما‬ ‫كل‬ ‫اذابة‬DNA)‫االستخالص‬ ‫اداء‬ ‫تحسين‬ ‫كذلك‬ ‫و‬. NaCl:‫الـ‬ ‫على‬ ‫الموجودة‬ ‫السالبة‬ ‫الشحنة‬ ‫لمعادلة‬ ‫ذلك‬ ‫و‬DNA‫عملية‬ ‫من‬ ‫فيقلل‬ ‫المحلول‬ ‫فى‬ ‫مبعثر‬ ‫يكون‬ ‫ال‬ ‫حتى‬ ‫تجميعه‬ ‫على‬ ‫يعمل‬ ‫ذلك‬ ‫و‬ ‫التنافر‬Neutralization.
  • 8.
    ‫ال‬ ‫تنقية‬ ‫هى‬‫و‬DNA‫مختلفة‬ ‫جزيئات‬ ‫من‬ ‫به‬ ‫يحيط‬ ‫ما‬ ‫كل‬ ‫من‬. ‫من‬ ‫التنقية‬ ‫محلول‬ ‫مواد‬ ‫تتكون‬ ‫لذلك‬ ‫و‬: Chloroform 24:isoamylealchol 1: ‫الـ‬ ‫تنقية‬ ‫على‬ ‫يعمل‬ ‫هو‬ ‫و‬DNA‫عمل‬ ‫طريق‬ ‫عن‬ Aqueous phase‫و‬organic phase ‫الـ‬ ‫يذوب‬ ‫حيث‬DNA‫الـ‬ ‫فى‬Aqueous phase ‫الـ‬ ‫فى‬ ‫االخرى‬ ‫الجزيئات‬ ‫تكون‬ ‫و‬organic phase ‫االخرى‬ ‫الجزيئات‬ ‫عن‬ ‫عزله‬ ‫فيسهل‬.
  • 9.
  • 10.
    ‫الـ‬ ‫فيه‬ ‫يذوب‬‫ال‬ ‫محلول‬ ‫بواسطة‬ ‫الترسيب‬ ‫يتم‬DNA ‫من‬ ‫يتكون‬ ‫الترسيب‬ ‫محلول‬ ‫لذلك‬ ‫و‬: Ethanol or isopropanole 100% ‫يعمل‬ ‫حتى‬ ‫ذلك‬ ‫و‬ ‫جدا‬ ‫بارد‬ ‫يضاف‬ ‫لكن‬ ‫و‬ ‫الـ‬ ‫جزيئات‬ ‫جعل‬ ‫على‬DNA‫حول‬ ‫تتجمع‬ ‫االستخالص‬ ‫كفاءة‬ ‫من‬ ‫فيزيد‬ ‫البعض‬ ‫بعضها‬. ‫الـ‬ ‫ان‬ ‫وجد‬ ‫حيث‬DNA‫يذوب‬ ‫ال‬alcohols (‫البعض‬ ‫بعضها‬ ‫عن‬ ‫الجزيئات‬ ‫تبعد‬ ‫المرتفعة‬ ‫الحرارة‬ ‫درجة‬).
  • 11.
    ‫للحف‬ ‫الثانوية‬ ‫الخطوات‬‫من‬ ‫لكنه‬ ‫و‬ ‫لالستخالص‬ ‫االساسية‬ ‫الخطوات‬ ‫من‬ ‫ليس‬ ‫هو‬ ‫و‬‫اظ‬ ‫الـ‬ ‫على‬DNA‫الحفظ‬ ‫محلول‬ ‫يكون‬ ‫و‬ ‫عليه‬ ‫العمل‬ ‫لحين‬TE-buffer‫من‬ ‫مكون‬ ‫عادة‬ Tris‫و‬EDTA‫الـ‬ ‫على‬ ‫للمحافظة‬pH‫الـ‬ ‫و‬ ‫مناسب‬ ‫مستوى‬ ‫فى‬EDTA‫الـ‬ ‫لخلب‬ DNases.
  • 12.
    .1‫النباتية‬ ‫العينة‬ ‫بطحن‬‫قم‬0.5‫تكون‬ ‫حتى‬ ، ‫السائل‬ ‫النيتروجين‬ ‫فى‬ ‫جم‬ ‫الجافة‬ ‫كالبودرة‬. .2‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫انبوبة‬ ‫الى‬ ‫العينة‬ ‫انقل‬. .3‫اضف‬9‫االستخالص‬ ‫محلول‬ ‫من‬ ‫مل‬. .4‫حرارة‬ ‫درجة‬ ‫على‬ ‫مائى‬ ‫حمام‬ ‫فى‬ ‫توضع‬65‫من‬ ‫تتراوح‬ ‫لمدة‬ ، ‫مئوى‬ ‫ساعتين‬ ‫الى‬ ‫ساعة‬ ‫نصف‬. .5‫لمدة‬ ‫العينات‬ ‫تترك‬5-10‫اليها‬ ‫يضاف‬ ‫و‬ ‫تبرد‬ ‫حتى‬ ‫دقائق‬5‫من‬ ‫مل‬ ‫محلول‬24:1‫كلورفورم‬:‫لمدة‬ ‫جيدا‬ ‫الرج‬ ‫مع‬ ‫ايزواميل‬15‫دقيقة‬. .6‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫عمل‬ ‫يتم‬3000‫لمدة‬ ‫الدقيقة‬ ‫فى‬ ‫لفة‬15‫دقيقة‬. .7‫اخرى‬ ‫انبوبة‬ ‫فى‬ ‫نضيفه‬ ‫و‬ ‫الرائق‬ ‫نأخذ‬. .8‫اضافة‬ ‫يتم‬5‫من‬ ‫مل‬24:1‫كلوروفورم‬:‫لمدة‬ ‫الرج‬ ‫مع‬ ‫ايزواميل‬5-10 ‫دقائق‬
  • 13.
    .9‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫عمل‬‫يتم‬3000‫لمدة‬ ‫الدقيقة‬ ‫فى‬ ‫لفة‬10‫دقيقة‬. .10‫اخرى‬ ‫انبوبة‬ ‫الى‬ ‫نضيفه‬ ‫و‬ ‫الرائق‬ ‫ناخذ‬. .11‫اضافة‬ ‫يتم‬6-5‫مل‬isopropanol‫لمدة‬ ‫الفريزر‬ ‫فى‬ ‫االنابيب‬ ‫وتوضع‬12‫ساعة‬. .12‫مركزى‬ ‫طرد‬ ‫عمل‬ ‫يتم‬3000‫لمدة‬ ‫الدقيقة‬ ‫فى‬ ‫لفة‬10‫دقيقة‬. .13‫فى‬ ‫الرائق‬ ‫من‬ ‫التخلص‬ ‫يتم‬laminar cabinet. .14‫الـ‬ ‫من‬ ‫تجف‬ ‫حتى‬ ‫االنابيب‬ ‫تترك‬isopropanole. .15‫حوالى‬ ‫اضافة‬100ul‫الـ‬ ‫من‬TE-buffer‫الـ‬ ‫لعينة‬DNA‫نقلها‬ ‫بعدها‬ ‫و‬ ، ‫المترسبة‬ ‫انبوبة‬ ‫الى‬Eppendorv.
  • 17.
  • 18.
  • 19.
  • 20.
  • 21.
  • 22.
  • 23.
  • 24.