Ekstraksi DNA udang dilakukan dengan metode standar phenol kloroform. Udang yang digunakan berasal dari kaki renang udang air laut. Prosedur ekstraksi meliputi penggilingan udang, penambahan detergen dan garam, penyaringan, penambahan alkohol 70% untuk mengisolasi DNA. Hasilnya berupa benang-benang halus yang menandakan isolasi DNA berhasil.

1. BIOTEKNOLOGI FARMASI
Dosen Pengampu: Yayuk Putri Rahayu S.Si.,M.Si
OLEH:
Malahayati (202114081)
Roihanah Rohmah ( 202114089)
EKSTRAKSI DNA:
DNA Udang

2. DNA pada makhluk hidup dapat ditemukan pada inti sel (nukleus),
mitokondria, dan klorofil. Pada manusia, DNA ditemukan pada inti sel
dan mitokondria.
DEFINISI
DNA
Deoxyribonucleic acid (DNA) adalah polimer asam nukleat yang
tersusun secara sistematis dan merupakan pembawa informasi genetik
yang diturunkan kepada keturunannya. Informasi genetik disusun dalam
bentuk kodon yang berupa tiga pasang basa nukelotida. Secara
struktural, DNA merupakan polimer nukleotida, di mana setiap
nukelotida tersusun atas gula deoksiribosa, fosfat, dan basa.
Polimer tersebut membentuk struktur dua untai heliks ganda yang
disatukan oleh ikatan hydrogen antara basa-basa yang ada. Terdapat
empat basa dalam DNA, yaitu adenin (A), sitosin (C), guanin (G), dan
timin (T). Adenin akan membentuk dua ikatan hidrogen dengan timin,
sedangkan guanin akan membentuk tiga ikatan hidrogen dengan
sitosin. Kombinasi jumlah dan susunan yang terbentuk antara ikatan-
ikatan basa ini memungkinkan setiap indvidu memiliki cetak biru genetik
yang spesifik dibandingkan organisme lain.

3. Apabila kita ibaratkan suatu tubuh, maka DNA diibaratkan
sebagai otak yang dapat mengatur segala proses di dalam tubuh.
DNA juga mempunyai peran penting dalam pewarisan sifat.
DNA merupakan suatu senyawa kimia yang penting pada
makhluk hidup. Tugas utamanya membawa materi genetik dari
suatu generasi ke generasi berikutnya.
DNA juga merupakan senyawa polinukleotida yang membawa
sifat-sifat keturunan yang khas pada kromosom.
DNA penting dalam hal hereditas. Paket semua informasi genetik
dan dibagikan pada generasi berikutnya
DNA membuat gen dan gen membuat kromosom. Manusia
memiliki 23 pasang kromosom – total 46 kromosom.
FUNGSI DNA

4. Ciri-ciri penting model DNA :
1. Dua rantai heliks polinukleotida melingkar mengelilingi satu sumbu.
Kedua rantai memiliki arah yang berlawanan.
2. Basa purin dan pirimidin terdapat di bagian dalam heliks,
sedangkan unit-unit fosfat dan deoksiribosa terdapat di bagian
luar. Bidang-bidang basa tegak lurus terhadap sumbu heliks.
Bidang-bidang gula hampir tegak lurus terhadap bidang basa.
3. Diameter heliks adalah 20 A. Jarak antara basa yang bersebelahan
ialah 3,4 A pada poros heliks dengan sudut rotasi sebesar 36°.
dengan demikian, putaran heliks berulang setelah 10 residu pada
setiap rantai, yaitu pada interval 3,4 A.
4. Kedua rantai saling berhubungan melalui ikatan hidrogen antara
pasangan-pasangan basa. Adenin selalu berpasangan dengan
timin; guanin selalu berpasangan dengan sitosin.
5. Urutan basa sepanjang rantai polinukleotida tidak dibatasi dengan
cara apapun. Urutan yang tepat basa-basa itu mengandung
informasi genetik.

5. Ekstraksi DNA merupakan prosedur rutin dalam
analisismolekuler.Masalah-masalah dalam ekstraksi DNA masih
merupakan hal penting yang perlu diatasi. Jumlah dan kualitas
DNA hasil ekstraksi bervariasi tergantung dariSpesiestanaman
sehingga mempengaruhi analisis lebih lanjut seperti hibridisasi
DNA, pemotongan DNA dengan enzim restriksi maupun analisis
dengan polymerasechain reaction (PCR). Ekstraksi DNA secara
umum memiliki tahapan-tahapan yang meliputi isolasi dari
jaringan, pelisisan dinding dan membran sel, ekstraksi dalam
larutan, purifikasi serta presipitasi atau pemadatan.
DEFINISI EKSTRAKSI DNA-

6. 3 LARUTAN PENTING ISOLASI DNA
1. Larutan buffer
untuk lisis
2. Larutan buffer
untuk digesti
3. protein kinase K.

7. SUMBER DNA UDANG
Sumber sel yang digunakan untuk ekstraksi DNA
adalah potongan organ udang, yaitu kaki renang (15
jantan dan 15 betina masing-masing populasi)
dengan bobot 5- 10 mg. Metode yang digunakan
adalah standar phenol chloroform. Dengan metode
tersebut dilakukan pengekstraksian selama beberapa
menit. Untuk mengkaji komposisi gen dan
mempelajari proses evolusi yang terjadi, peneliti pada
umumnya melakukan ekstraksi gen yang berada di
daerah mitokondria bukan gen yang berada pada inti
sel.

8. Khasiat Yang Terkandung Dalam Udang
Udang merupakan salah satu produk perikanan yang
istimewa, memiliki aroma spesifik dan mempunyai nilai gizi cukup tinggi.
Udang merupakan salah satu bahan makanan sumber protein hewani yang
bermutu tinggi. Udang terdiri atas udang air tawar dan udang air laut.

9. ALAT DAN BAHAN
1. Sendok
2. Saringan
3. Blender
4. Wadah
ALAT BAHAN
1. Udang
2. Garam
3. Detergen
4. Air mineral
5. Alcohol 70 %

10. 1. Diblender udang 3 ekor dan ditambahi 2 sendok air mineral
2. Dicampurkan 1 sendok detergen dengan 1 sendok garam,
diaduk
3. Kemudian campurkan udang yang telah diblender dengan
garam beserta detergen, aduk hingga tercampur rata
4. Saring campuran tersebut
5. Ditambahi dengan alcohol 70 % secukupnya, aduk rata
Tunggu beberapa menit hingga terbentuk benang benang halus
yang menandakan isolasi DNA berhasil.
PROSEDUR PERCOBAAN:

11. HASIL:
Hasil yang didapat dari perlakuan DNA pada udang yaitu
menghasilkan Benang- benang halus yang mengapung diatas wadah
dalam campuran detergen, garam dengan alcohol 70% dengan
larutan yang sedikit berwarna kecoklatan.
Berdasarkan hasil pengamatan maka dapat ditarik kesimpulan
bahwa ekstraksi DNA udang yang kami lakukan berhasil, karena
menghasilkan benang benang halus yang mengapung pada
permukaan cairan yang berwarna putih dengan larutan sedikit
kecoklatan.

12. THANKS