Dokumentasi dalam penulisan ilmiah meliputi rujukan, nota, kutipan, dan bibliografi untuk membantu pembaca mengenal pasti sumber maklumat. Sistem dokumentasi yang digunakan berbeza berdasarkan disiplin, seperti APA untuk sains sosial dan MLA untuk bahasa. Penulis bertanggungjawab mendokumentasikan sumber yang digunakan bagi menjamin kredibiliti dan mengelakkan plagiarisme.