Современные возможности молекулярного типирования нейссерий

ГУ «НИИ Эпидемиологии и микробиологии» Современные возможности молекулярного типирования нейссерий Глазкова С.Э .

Тесты, которые позволяют дифференцировать Neisseria ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Гипотетический диагноз ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Основные факторы патогенности ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Генодиагностика Neisseria ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

[object Object],[object Object],[object Object]

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КАРТА N . meningitidis ( штамм MC 58)

ГЕНОМ Neisseria meningitidis (2 272 351 п.о.) Открытые рамки считывания- 83% генома Из них 53,7 % выполняют биологические функции Три острова горизонтального переноса ДНК (ОГП А, В, С) 2 содержат гены, отвечающие за патогенность 1- за гипотетические (неизвестные) белки 4 оперона рРНК 50 оперонов тРНК 877 последовательностей с неизвестными функциями 51 IS - элемент, среди которых IS 3, IS 5, IS 30 и IS 110 Две группы IS - элементов еще не классифицированы

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

[object Object],[object Object]

ОСНОВНЫЕ ПРИНЦИПЫ МЛСТ: ,[object Object],[object Object],[object Object]

ПРЕИМУЩЕСТВА МЛСТ: ,[object Object],[object Object],[object Object]

МЕТОД МЛСТ ВКЛЮЧАЕТ: ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Построение дендрограмм филогенетического родства Пример дендрограмм исследуемых последовательностей генов abcZ и fumC по методу UPGMA : Штаммы, предположительно, имеют «аборигенное» индигенное происхождение (т.е,. вполне вероятно, являются коренными в республике)

Импорт последовательности в BLAST

Всемирная база Neisseria MLST

СЕКВЕНС – АНАЛИЗ: Импорт последовательностей на веб-сайт ,[object Object]

СЕКВЕНС – АНАЛИЗ: ,[object Object],[object Object]

СЕКВЕНС – АНАЛИЗ: ,[object Object]

База данных Neisseria MAST

Поиск СТ в базе MAST

Surveillance : Базы данных по статистике

Основные задачи молекулярного типирования ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Какой бы хотелось видеть систему молекулярного типирования? ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Благодарим за внимание! ,[object Object],[object Object],[object Object]

Современные возможности молекулярного типирования нейссерий

Recommended

Recommended

More Related Content

What's hot

What's hot (20)

Similar to Современные возможности молекулярного типирования нейссерий

Similar to Современные возможности молекулярного типирования нейссерий (20)

More from Игорь Шадеркин

More from Игорь Шадеркин (20)

Современные возможности молекулярного типирования нейссерий