Chương 3 của tài liệu trình bày về protein, bao gồm vai trò sinh học, cấu trúc phân tử, tính chất và phân loại protein cũng như quá trình biến đổi của chúng trong thực phẩm. Protein đóng vai trò quan trọng trong các chức năng cơ thể như xúc tác, vận tải, bảo vệ và dự trữ dinh dưỡng. Tài liệu cũng đề cập đến các loại acid amin và cấu trúc của protein, bao gồm các bậc cấu trúc khác nhau.