Oracle R Enterprise のセットアップ

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Oracle Advanced Analytics
Oracle R Enterpriseのセットアップ
～データベースで大量データ分析をするために～
日本オラクル株式会社

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Safe Harbor Statement
以下の事項は、弊社の一般的な製品の方向性に関する概要を説明するものです。また、
情報提供を唯一の目的とするものであり、いかなる契約にも組み込むことはできません。
以下の事項は、マテリアルやコード、機能を提供することをコミットメント（確約）するもの
ではないため、購買決定を行う際の判断材料になさらないで下さい。
オラクル製品に関して記載されている機能の開発、リリースおよび時期については、弊
社の裁量により決定されます。
Oracleは、米国オラクル・コーポレーション及びその子会社、関連会社の米国及びその他の国における登録商標または商標です。
他社名又は製品名は、それぞれ各社の商標である場合があります。

このドキュメントの対象読者
対象
• Oracle R Enterprise(ORE)の環境を構築する人
• ORE環境をメンテナンスする人
前提スキル
• Linuxの場合、Linuxの普通の管理操作 (yumなど)
• Oracle DBの基本的な管理
• Rをさわったことがあると望ましい（知らなくても大概大丈夫です）
3

Agenda
Oracle R Enterprise概要
Oracle R Enterpriseのアーキテクチャ
Oracle R Enterpriseのインストール手順
まとめ
4
素材のプチッチ
http://putiya.com/
イラストわんパグ
http://www.wanpug.com/

製品概観
5
Oracle Data Mining Oracle R Enterprise

Big Data Management System
6
SOURCES
DATA RESERVOIR DATA WAREHOUSE
Oracle Database
Oracle Industry
Models
Oracle Spatial & Graph
Big Data Appliance
Apache
Flume
Oracle
GoldenGate
Oracle Event
Processing
Cloudera Hadoop
Oracle Big Data SQL
Oracle NoSQL
Oracle R Distribution
Oracle Big Data
Spatial and Graph
Oracle Database
In-Memory, Multi-tenant
Oracle Industry Models
Oracle Advanced
Analytics
Oracle Spatial and Graph
Exadata
Oracle
GoldenGate
Oracle Event
Processing
Oracle Data
Integrator
Oracle Big Data
Connectors
Oracle Data
Integrator
B

製品概要
7
ODM/ORE 共通のメリット
• In-Database Analyticsの実現
– データ移動コスト(時間)をカット
– パワフルなデータベースサーバ内で処理
• 堅牢なDBセキュリティによるデータ保護
⽤途
– ⼤量データ,全量データに対する分析
– ⽣データでのリアルタイムな分析
他オプションや製品との連
携で更に⾼度な分析が可能
・Big Data Appliance
・Big Data SQL
・Big Data Connecters
・Spatial and Graph
etc..
ビッグデータ時代の
エンタープライズな
分析基盤を提供

Oracle Advanced Analytics - Oracle R Enterprise
Oracle R Enterprise 製品概要
8
特⻑
• Rでの分析処理をデータベースへオフロード
– データ移動コスト(時間)をカット
– パワフルなデータベースサーバ内で処理
• エンタープライズなRユーザのための機能
– R関数の並列実⾏のためのインターフェイスを⽤意
– Rオブジェクト、モデルをDBに保存、Rからデータベースの操作も可能
– Oracle Data Mining機能をRから呼び出して利⽤が可能
– ⼤規模分析のため並列処理実装されたR関数（オリジナルパッケージ）
デスクトップ利⽤のRの限
界を超え、⼤規模なデータ
セットでの利⽤を可能に

補足: Oracle R Distribution
9
• Oracle は Rのディストリビューターです
– Oracle は Rのディストリビューションを提供しています
• Oracle R Distribution(ORD)はRに対して改善や拡張を⾏った
ものになります
• ORDは無償でご利⽤頂けます
※ディストリビューションとはOSSのソフトウェアなどをパッケージングし利⽤しやすい形態で提供/配布しているものに
なります。Linuxの場合、Red Hat Linux, Debian, Ubuntu, SUSEなどがあります。
http://www.oracle.com/technetwork/database/database-technologies/r/r-distribution/downloads/index.html

Agenda
Oracle R Enterpriseの使い方
まとめ
10
http://putiya.com/

R言語を透過的にOracle Database内で実行します。
Oracle R Enterprise アーキテクチャ
R⾔語の処理を透過的にOracle Database内の処理に変換することで、⼤規模な分析を実現します。
またDB内処理に変換できない部分もDBサーバ上でRプロセスを実⾏します。
R EngineR EngineR Engine Other R
packages
Rの処理をDB内の処理に変換・オフロードします。
Oracle R Enterprise packages
R Engine
Oracle R Enterprise packages
SQL R
結果結果
DBサーバ内で外部プロセスとしてRを実⾏することも可能です
Other R
packages
Rクライアント
• RスクリプトをOracle Databaseで実
⾏するようにスクリプトを発⾏します。
• グラフの描画や処理フローの制御は、
通常のRの機能を利⽤し、クライアン
ト側で実⾏します。
Oracle Database内部での実行
• Rの関数をSQLに変換して実⾏します。
• Oracle Databaseの並列実⾏の仕組みを活⽤し、
⼤量のデータに対応します。
• Oracle Databaseの持つ統計関数、データマイ
ニング機能を内部的に活⽤します。
Oracle DatabaseサーバでのR実行
• データベースが複数のRのプロセスをデー
タベースサーバ上に外部プロセスとして起
動しますので、追加機器が不要です。
• SQLやPL/SQLからRのスクリプトを呼び
出し可能です。
分析者
DB
Oracle DB サーバ
外部
プロセス

全体感：コンポーネント
12
Server SideClient Side
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Client Oracle
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AA

全体感：コンポーネント：OS
13
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AA
OSについてはマニュアルのシステム要件に記載がございます。ORE 1.5の
場合、どのOSに関しても 64 bit版であることが必須となります。詳しくは
下記をご覧ください。Oracle Enterprise Linuxの場合にはyumのレポジト
リがあり、セットアップが少し効率的です。
https://docs.oracle.com/cd/E67822_01/OREAD/intro.htm#OREAD120

全体感：コンポーネント：Rの動作環境
14
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AA
Rの動作環境及び基本機能を提供する部分です。
Oracle R Distributionをご利⽤頂くとスムースですが、Open R を利⽤す
ることも可能です。Open R を利⽤する際にはソースからのbuildが必要と
なるケースがあります。
※マニュアルに記載がありますが、linpackの利⽤やshlibの利⽤などを有効にして
buildする必要があります

全体感：コンポーネント：Oracle R Enterprise Client
15
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AA
Oracle R Enterprise Clientには OREの基本パッケージやR関数の
SQL変換wraperとなるパッケージ、⼀部RパッケージのOracle実装版、
ORE独⾃機能、Oracle Data Mining機能の呼び出しなどのRパッケー
ジが含まれます。クライアントサーバ間でバージョンが同⼀である必
要があります
含まれるパッケージ（⼀部抜粋)
- ORE (トップレベルパッケージ)
- OREbase (Rのbase相当)
- OREcommon(OREの共通低レベル機能/DB接続や操作など)
- OREdm(Oracle Data Mining⽤のアルゴリズム利⽤)
- OREeda(探索型データ解析⽤パッケージ)
- OREgraphics(Rのgraphics相当)
など

全体感：コンポーネント：Oracle R Enterprise Supporting Packages
16
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AAOracle R Enterprise Supporting Packageには、Oracle Database 通信⽤のインターフェ
イス定義やOCIインターフェイス、R関数のOracle実装などのパッケージが含まれます。これ
はServer, Clientともに共通になります。
含まれるパッケージ（⼀部抜粋）
- DBI(データベース通信インターフェイス),ROracle(OCIインターフェイス),Cairo(グラ
フィックスのレンダリング),png(png画像の読み込み、書き込み⽤)など

全体感：コンポーネント：Oracle Database Client
17
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AA
Oracle Database Client はOracle Database
のクライアントライブラリを含み、Rからのデー
タベース接続(OCI)⽤のNativeライブラリを提供
します。(実際にはDynamic Linkerでリンクされ
利⽤されます)

全体感：コンポーネント：Oracle Database Client
18
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
ORE
Server
Oracle R Enterprise Server は Oracle R
Enterprise⽤のRパッケージとOracleデータ
ベース内のスキーマ(RQSYS)やプロシージャ、
操作権限などのメタデータ群で構成されます。
これらを⽤いてRオブジェクトをデータベースに格納
したり、埋め込みRによる実⾏などを実現しています。
Rパッケージとしては、ORE Clientに
OREserverパッケージが加わっています。

Agenda
まとめ
19
http://putiya.com/

OREのインストール全貌
• クライアントマシン上のRからDBに接続し利⽤する場合、サーバと
クライアント両⽅にRのインストールが必要になります
– ⼤抵上記の構成になるかと思います
• RはOracle R Distributionを利⽤頂いてもよいですし、OSSの Rを
ソースからビルドして頂く⽅法もあります
• サーバ、クライアントで作業に少し違いがあります
20

システム要件
ORE 1.5の場合
Operating System Hardware Description
Linux x86-64 Intel and AMD
•64-bit Oracle Linux Releases 6 and 7
•64-bit Red Hat Enterprise Linux Releases 6 and 7
Oracle Linux may be running on Oracle Exadata Database Machine.
Oracle Solaris
on x86-64 (64-Bit)
Oracle Solaris
on SPARC-64 (64-Bit)
Intel and SPARC
•64-bit Oracle Solaris 10 update 10 through Oracle Solaris 11 for
both SPARC and x86-64 (Intel) platforms
•Oracle SPARC SuperCluster
•Oracle Solaris Studio (formerly Sun Studio) 12u3 or later
Oracle Solaris may be running on Oracle Exadata Database
Machine.
IBM AIX
on POWER Systems (64-Bit)
IBM 64-bit IBM AIX 5.3 or higher
Microsoft Windows x64 (64-Bit) Intel
64-bit Microsoft Windows
See Section 1.4.1, "Verifying 64-Bit Architecture on Microsoft
Windows".
21
出典：
http://docs.oracle.com/cd/E67822_01/OREAD/intro.htm#OREAD120

ORE インストール手順
ORE Server
[DB Binary Install済み]
[インスタンス作成済み]
• Rインストール
– ORD or Open R ( ⾃⼒make)
• OREインストール
– serverスクリプト
22
ORE Client
• Oracle DB Client Install
• Rインストール
– ORD or Open R ( ⾃⼒make)
• OREインストール

インストール手順全貌
23
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

24
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

25
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

Oracle DB Install/ インスタンス作成
注意点
• Oracle DB インストール
– Advanced Analytics(AA)を外したりしないで⼊れてあげてください
– Oracle DB Enterprise Edition のdefaultでインストールされます
– Oracle DB Standard Editionではご利⽤になれません
• Oracleインスタンス作成
– こちらもAAオプションを外さないでインスタンスを作成してください
– ORACLE_HOME,ORACLE_SID,LD_LIBRARY_PATHなどの環境変数の設定
を忘れないようにしてください
26
DBのインストール、インスタンスの作成に関してはここでは割愛させて頂きます。
別途マニュアルなどをご参照ください

27
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

Rのインストール
概要
Rのインストールに関しては２通りの⽅法があります
Oracle R Distribution(ORD) [楽]
• Oracle が DistributionしているオープンソースのRになります
• ORDのバージョンに合わせた形でのご利⽤となります
オープンソース版 R のbuild [やや⾯倒]
• CRANでダウンロードできるRを⼀部フラグを⽴ててbuildします
• サポートされる範囲で最新のRをご利⽤頂けます
• ⼿順に関してはサーバ、クライアントで同じです
※上記(ORDとOpen Source版R)を両⽅⼊れる必要はありません
28

ORDのメリット
OREではORDの利⽤が推奨されます
• ORDのメリット
– 簡単
– サポートの提供
– 数学関数⾼速化ライブラリの統合
• Intel Math Kernel Library(MKL) (for Win/Linux)
• Sun Performance Libraryの利⽤(for Oracle Solaris)
• ORDの弱点
– Rのバージョン追従性(CRANと⽐較)
29

R, OREのサーバクライアント間のバージョンについて
サーバ環境とクライアント環境
基本的にバージョンを揃える指針での運⽤をお薦めします
• Rのバージョン
– サーバ⽤のRと揃えておいた⽅がよいかと思います
• 埋め込みRの実⾏時にはクライアントのRからサーバ側のRにスクリプトを実⾏させ、結果
を取得する動きとなります。そのため3rd PartyのRパッケージなどでもバージョン差異な
どによる問題が発⽣する可能性があります
• 埋め込みRの実⾏やその他関数の動作確認などの⼿間を減らせるかと思います
• OREのバージョン
– OREのバージョンは同⼀であることが必須要件となります
30

ご参考:ORE 1.5 matrix
Oracle R Enterprise Server Support Matrix
Oracle R Enterprise
Open source R
or Oracle R Distribution
Oracle Database (see Note)
1.5 3.2.x 11.2.0.4, 12.1.0.1, 12.1.0.2
1.4.1 3.0.1, 3.1.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.4 3.0.1, 3.1.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.3.1 2.15.1, 2.15.2, 2.15.3 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.3 2.15.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.2 2.15.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.1 2.13.2 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.0 2.13.2 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
31
R Enterprise Installation and Administration Guide - Oracle R Enterprise System Requirements

32
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

OSによって作業が異なります
• ここでは以下について記載します
– Oracle Enterprise Linux(OEL)
– Windows
– RedHat Enterprise Linux (RHEL)
• その他のOSの場合は下記マニュアルをご確認ください
Oracle R Distribution(ORD) のインストール
全体感
33
R Enterprise Installation and Administration Guide
3. Installing R for Oracle R Enterprise
http://docs.oracle.com/cd/E67822_01/OREAD/install_r.htm

yumレポジトリにORDが⼊っています
• Oracleのyum repositoryのaddonsに⼊っています
– OEL7の場合 [ol7_addons], OEL6の場合 [ol6_addons]
– yumレポジトリの設定ファイル(/etc/yum.repo.d内のファイル)内でaddons
のエントリをenable(enabled=1)にすることでパッケージが検索されます
• (OEL7) /etc/yum.repos.d/public-yum-ol7.repo
• enableにしたらyumでインストールできます
Oracle Enterprise Linux (OEL)の場合
34
yum install R
yum install R-core
yum install R-devel
※環境によっては、
latest,
optional_latest
のレポジトリもenableにしてお
くと必要な依存関係パッケージ
を⾃動追加してくれるかもしれ
ません

ご参考：Oracle R Distribution のインストール
OEL RPMパッケージ
• OELはRPMパッケージでのインストールも可能です
• ORD 3.2 の場合
– OEL 6
– OEL 7
35
http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/getPackage/R-3.2.0-2.el6.x86_64.rpm
http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/getPackage/R-core-3.2.0-2.el6.x86_64.rpm
http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/getPackage/R-devel-3.2.0-2.el6.x86_64.rpm
http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/getPackage/libRmath-3.2.0-2.el6.x86_64.rpm
http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/getPackage/libRmath-devel-3.2.0-2.el6.x86_64.rpm
http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/getPackage/libRmath-static-3.2.0-2.el6.x86_64.rpm

Windows の場合
• ORDをダウンロードします
– 下記のサイトからWindowsのものをダウンロードします
※OREのシステム要件（前述)を満たす必要があります
• zipを解凍して以下を実⾏します
• インストールWizardに従ってインストールします
– ⾔語、インストール先、などデフォルトのままで⼤丈夫です
36
https://oss.oracle.com/ORD/
ORD-Rversion-win.exe
(ORD 3.2の場合 ORD-3.2-win.exe)

ご参考：ORD 3.2 for windows インストール画面
基本的に[次へ]を押してくだけです
37

Oracle R Distribution のインストール
Red Hat Enterprise Linux の場合(1/2)
rpmbuildでソースからパッケージをbuildする必要があります
• rpmbuildのインストール (インストール済みの場合は不要です)
• ソース rpmパッケージのダウンロード
– 以下のサイトからダウンロードできます
• rpmbuild準備
38
yum install rpm-build
RHEL 6 http://public-yum.oracle.com/repo/OracleLinux/OL6/addons/x86_64/index_src.html
mkdir -p rpmbuild/{BUILD,RPMS,SOURCES,SPECS,SRPMS}

• ダウンロードした src.rpmファイルを SRPMS に移動
• rpmbuildの実⾏
• rpm -i でパッケージを追加します
– 出来たパッケージは rpmbuild/RPMS/x86_64/ に安置されています
39
mv R-3.2.0-2.el7.src.rpm rpmbuild/SRPMS/
rpmbuild --ebuild rpmbuild/SRPMS/R-3.2.0-2.el7.src.rpm
※OSのパッケージのインストール状
況によっては texlive, lapack,
libtiff などの必要なパッケージのイ
ンストールが要求される場合があり
ますので、適宜対応して下さい。
※場合によっては LANG=C もお試
しくださいませ
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-core-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/libRmath-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/libRmath-devel-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/libRmath-static-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-debuginfo-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-devel-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
※versionによって差異
がある場合があります

• インストールを実施します
– 上記サイトのINSTALLに詳しい記載へのリンクがあります
• マニュアルは以下になります
その他の場合
40

41
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

オープンソース版Rのインストール
Linux ( OEL, RHELなど)
• CRANからRのソースコードをダウンロードします
• ダウンロードしたファイルを解凍します
• 解凍してできたディレクトリ内で以下を実⾏します(linux/OEL)
42
https://cran.r-project.org/
こちらの記載はOREの構築に必要なR
のconfigureオプションを有効化すること
だけを目的としています.
オープンソースのRのビルド手法を保証
するものではありません
./configure --with-lapack --with-ICU=no --enable-R-shlib --prefix=/usr/local/R/323
make
make install
※環境によっては configureの際にパッケージが不⾜してエラーがでることがあります
yumなどで適宜追加してください (gfortran, libXxx-devel など)
例

43
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

ORE サーバのセットアップ
環境変数の確認と設定
• 環境変数を確認、設定します
• その他
– インストールの実⾏ユーザはOS認証可能なDBAグループである必要があります
44
環境変数設定値コメント
PATH 環境依存対象のRが実⾏可能な状態にしておきます。
※yumでインストールした場合、PATHは⾃動的に通っています
※Rを別途インストールし利⽤する場合にはPATH設定が必要です。
※実⾏されるRは右記で確認できます
ORACLE_SID 環境依存対象のDBインスタンスのSID(OS認証⽤)
ORACLE_HOME 環境依存対象のDBインスタンスのORACLE_HOME(OS認証⽤)
LD_LIBRARY_PATH $ORACLE_HOME/libを含む対象DBバイナリのライブラリを含むパスを設定します
R RHOME
R --version

データベースの準備
• データベースの準備をします
– (必要に応じて) 表領域を作成します
– (必要に応じて）OREを使うDBユーザを作成します
※ORE利⽤ユーザや表領域が既に準備されている場合には上記の作業は不要です
※接続ユーザは未作成の場合、serverスクリプトで作成をすることもできますが、表領域は事前に準備して
おく必要があります
45
sqlplus "/as sysdba" << !!
CREATE TABLESPACE oretbs DATAFILE '/oradata/oretbs01.dbf' SIZE 1024m ;
CREATE USER oreuser IDENTIFIED BY oreuser DEFAULT TABLESPACE oretbs
TEMPORARY TABLESPACE temp;
GRANT connect,resource TO oreuser ;
ALTER USER oreuser QUOTA UNLIMITED ON oretbs ;
!!
例

OREバイナリのダウンロード
• 以下から該当アーキテクチャのOREをダウンロードします
– Server(必須), Supporting(任意) をダウンロードします
• 展開します
– 必要な場合 Supportingも同じディレクトリに展開します
46
http://www.oracle.com/technetwork/database/database-technologies/r/r-enterprise/downloads/index.html
$ mkdir oreserver
$ mv ore-server-linux-x86-64-1.5.zip oreserver/
$ mv ore-supporting-linux-x86-64-1.5.zip oreserver/
$ cd oreserver
$ unzip ore-supporting-linux-x86-64-1.5.zip > /dev/null
$ unzip ore-supporting-linux-x86-64-1.5.zip > /dev/null
例
$ ls
ore-server-linux-x86-64-1.5.zip server supporting
ore-supporting-linux-x86-64-1.5.zip server.sh tmpcdb.sql

serverスクリプトの実行
• 同梱されているserverスクリプトを実⾏します
– defaultでは対話型のインストールになります
47
$ ./server.sh
Checking platform .................. Pass
Checking R ......................... Pass
Checking R libraries ............... Pass
Checking ORACLE_HOME ............... Pass
Checking ORACLE_SID ................ Pass
Checking sqlplus ................... Pass
Checking ORACLE instance ........... Pass
Checking CDB/PDB ................... Pass
Checking ORE ....................... Pass
Choosing RQSYS tablespaces
PERMANENT tablespace to use for RQSYS [list]:USERS
例
TEMPORARY tablespace to use for RQSYS [list]: TEMP
RQSYSユーザ⽤の表領域を
指定します
※RQSYSユーザは OREのDB側の管理
ユーザで、R呼び出し関連の関数やRオ
ブジェクトなどが実際に配置されるス
キーマになります
RQSYSユーザ⽤の⼀時表領域を
指定します

つづき
48
Choosing RQSYS password
Password to use for RQSYS:
例
TEMPORARY tablespace to use for OREUSER [list]:TEMP
Choosing ORE user
ORE user to use [list]: oreuser
Choosing OREUSER tablespaces
PERMANENT tablespace to use for OREUSER [list]: USERS
Choosing OREUSER password
Password to use for OREUSER:
RQSYSユーザのパスワードを⼊⼒します
※⼊⼒⽂字は表⽰されないです。ありがちな⼆度⼊⼒には
なっていないのですが、分からなくなった場合にはsysdbaか
らalter userでなんとかなります。
OREを実際に接続して利⽤するユーザを指定
します
※作成済みであれば後の表領域などの選択肢はでてきません。
⼊⼒⽂字は表⽰されないです。
利⽤するユーザのデフォルト表領域と⼀時表
領域、パスワードを⼊⼒します
※作成済みであればこの質問はでてきません。

• ⼊⼒した内容と環境変数やRの場所を確認します
49
Current configuration
R Version ........................ R version 3.2.3 (2015-12-10)
R_HOME ........................... /usr/local/R/323/lib64/R
R_LIBS_USER ...................... /app/oracle/product/db/12.1.0.2/R/library
ORACLE_HOME ...................... /app/oracle/product/db/12.1.0.2
ORACLE_SID ....................... ora12c
Existing R Version ............... None
Existing R_HOME .................. None
Existing ORE data ................ None
Existing ORE code ................ None
Existing ORE libraries ........... None
RQSYS PERMANENT tablespace ....... USERS
RQSYS TEMPORARY tablespace ....... TEMP
ORE user type .................... New
ORE user name .................... OREUSER
ORE user PERMANENT tablespace .... USERS
ORE user TEMPORARY tablespace .... TEMP
Grant RQADMIN role ............... No
Operation ........................ Install/Upgrade/Setup
Proceed? [yes]
例
※ユーザが新規作成の場合、ここがNewになります
作成済み、既存ユーザの場合、Existと表⽰されます
※OKであれば returnキーでインストールが開始されます

• エラーなく完了すればインストールは完了です
50
Removing R libraries ............... Pass
Installing R libraries ............. Pass
Installing ORE libraries ........... Pass
Installing RQSYS data .............. Pass
Configuring ORE .................... Pass
Installing RQSYS code .............. Pass
Installing ORE packages ............ Pass
Creating ORE script ................ Pass
Installing migration scripts ....... Pass
Installing supporting packages ..... Pass
Creating ORE user .................. Pass
Granting ORE privileges ............ Pass
Done
例
$ ls
ore-server-linux-x86-64-1.5.zip server supporting
ore-supporting-linux-x86-64-1.5.zip server.sh tmpcdb.sql
※展開する際に記載した server.shの場所にsupportingパッ
ケージを展開していればこの時にsupporting パッケージもイ
ンストールされます

補足：Serverスクリプトがやっていること
• サーバ⽤インストールスクリプト (serverスクリプト)では、概ね以
下の作業をしています
– RQSYSユーザの作成、スキーマオブジェクトの作成
51
余力ができたらまとめてみる予定

52
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

ORE サーバの確認
確認(OREコマンド)
• うまくできていれば ORE コマンドが実⾏可能になります
53
$ ORE
R version 3.2.3 (2015-12-10) -- "Wooden Christmas-Tree"
Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
R は、⾃由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です。
⼀定の条件に従えば、⾃由にこれを再配布することができます。
配布条件の詳細に関しては、'license()' あるいは 'licence()' と⼊⼒してください。
R は多くの貢献者による共同プロジェクトです。
詳しくは 'contributors()' と⼊⼒してください。
また、R や R のパッケージを出版物で引⽤する際の形式については
'citation()' と⼊⼒してください。
'demo()' と⼊⼒すればデモをみることができます。
'help()' とすればオンラインヘルプが出ます。
'help.start()' で HTML ブラウザによるヘルプがみられます。
'q()' と⼊⼒すれば R を終了します。
>
例

ORE サーバの確認
確認(ORE パッケージのロード)
• OREパッケージがロードできます
54
> library(ORE)
要求されたパッケージ OREbase をロード中です
要求されたパッケージ OREcommon をロード中です
次のパッケージを付け加えます: ‘OREbase’
以下のオブジェクトは ʻpackage:base’ からマスクされています:
cbind, data.frame, eval, interaction, order, paste, pmax, pmin,
rbind, table
要求されたパッケージ OREembed をロード中です
要求されたパッケージ OREstats をロード中です
要求されたパッケージ MASS をロード中です
要求されたパッケージ OREgraphics をロード中です
要求されたパッケージ OREeda をロード中です
要求されたパッケージ OREmodels をロード中です
要求されたパッケージ OREdm をロード中です
要求されたパッケージ lattice をロード中です
要求されたパッケージ OREpredict をロード中です
要求されたパッケージ ORExml をロード中です
>
例

55
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

56
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

57
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

Oracle DB クライアント
メディアの準備
OREクライアントにはOracle DB のクライアントが必要です
• 以下のいずれかを準備します
– Oracle DB Client ( Oracle DB メディアに同梱 )
• DBサーバ上で直接Rクライアントを実⾏する場合にはインストール済みのものを利⽤できます
• Instant Clientに⽐べるとサイズが少し⼤きいです
– Oracle DB Instant Client ( OTNなどからダウンロード⼊⼿/無償)
• 以下から対象のアーキテクチャ、OSを選んでクリックしします
• ダウンロードページでInstant Client Package - Basic (か Basic Lite) と SDK をダウ
ンロードします
58
Oracle Instant Client:
http://www.oracle.com/technetwork/database/features/instant-client/index.html

ご参考：Oracle Instant Client (Windows版)
• Windowsの場合、右記の２つ
をダウンロードします
59
※Linux, zip版, RPM版も基本的に同様の２つ
をダウンロードします

Oracle Instant Client のインストール
• Oracle Instant Clientは以下の⼿順でインストールできます
• basicとsdkのアーカイブを同じインストールフォルダにコピーします
• ダウンロードしたbasicを解凍します
• 同じディレクトリでダウンロードしたsdkを上書き展開します
• 環境変数を設定します
60
Windows
OCI_LIB64環境変数

ご参考：Oracle Instant Client (Windows 版)環境設定 - Windows 7 の例
• Windowsメニューのコンピュータを右クリックしプロパティを左クリック
61
• システムの詳細設定を左クリック

ご参考：Oracle Instant Client (Windows 版)環境設定 - Windows 7 の例
• 詳細設定タブの環境変数をクリック
62
システム環境変数の
• OCI_LIB64 をインストールディレクトリ
(instantclient_<version> )に設定
• Path環境変数に同じインストールディレクトリを追加

63
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

概要
Rのインストールに関しては２通りの⽅法があります
Oracle R Distribution(ORD) [楽]
• Oracle が DistributionしているオープンソースのRになります
• ORDのバージョンに合わせた形でのご利⽤となります
オープンソース版 R のbuild [やや⾯倒]
• CRANでダウンロードできるRを⼀部フラグを⽴ててbuildします
• サポートされる範囲で最新のRをご利⽤頂けます
• ⼿順に関してはサーバ、クライアントで同じです
※上記(ORDとOpen Source版R)を両⽅⼊れる必要はありません
64
再掲

ORDのメリット
OREではORDの利⽤が推奨されます
• ORDのメリット
– 簡単
– サポートの提供
– 数学関数⾼速化ライブラリの統合
• Intel Math Kernel Library(MKL)との統合を簡素化 (Win/Linux)
• Sun Performance Libraryの利⽤(Oracle Solaris)
• ORDの弱点
– Rのバージョン追従性(CRANと⽐較)
65
再掲

R, OREのサーバクライアント間のバージョンについて
サーバ環境とクライアント環境
基本的にバージョンを揃える指針での運⽤をお薦めします
• Rのバージョン
– サーバ⽤のRと揃えておいた⽅がよいかと思います
• 埋め込みRの実⾏時にはクライアントのRからサーバ側のRにスクリプトを実⾏させ、結果
を取得する動きとなります。そのため3rd PartyのRパッケージなどでもバージョン差異な
どによる問題が発⽣する可能性があります
• 埋め込みRの実⾏やその他関数の動作確認などの⼿間を減らせるかと思います
• OREのバージョン
– OREのバージョンは同⼀であることが必須要件となります
66
再掲

ご参考:ORE 1.5 matrix
Oracle R Enterprise Server Support Matrix
Oracle R Enterprise Open source R or Oracle R Distribution Oracle Database (see Note)
1.5 3.2.x 11.2.0.4, 12.1.0.1, 12.1.0.2
1.4.1 3.0.1, 3.1.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.4 3.0.1, 3.1.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.3.1 2.15.1, 2.15.2, 2.15.3 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.3 2.15.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.2 2.15.1 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.1 2.13.2 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
1.0 2.13.2 11.2.0.3, 11.2.0.4, 12.1.0.1
67
R Enterprise Installation and Administration Guide - Oracle R Enterprise System Requirements
再掲

68
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

OSによって作業が異なります
• ここでは以下について記載します
– Oracle Enterprise Linux(OEL)
– Windows
– RedHat Enterprise Linux (RHEL)
• その他のOSの場合は下記マニュアルをご確認ください
全体感
69
再掲

yumレポジトリにORDが⼊っています
• Oracleのyum repositoryのaddonsに⼊っています
– OEL7の場合 [ol7_addons], OEL6の場合 [ol6_addons]
– yumレポジトリの設定ファイル(/etc/yum.repo.d内のファイル)内でaddons
のエントリをenable(enabled=1)にすることでパッケージが検索されます
• enableにしたら以下でインストールできます
Oracle Enterprise Linux (OEL)の場合
70
yum install R
yum install R-core
yum install R-devel
再掲
※環境差異がありますが、latest,
optional_latest もenableにしてお
くと必要な依存関係パッケージを
⾃動追加してくれるかもしれませ
ん

OEL RPMパッケージ
• OELはRPMパッケージでのインストールも可能です
• ORD 3.2 の場合
– OEL 6
– OEL 7
71
再掲

Windows の場合
– 下記のサイトからWindowsのものをダウンロードします
• zipを解凍して以下を実⾏します
• インストールWizardに従ってインストールします
– ⾔語、インストール先、などデフォルトのままで⼤丈夫です
72
ORD-Rversion-win.exe
(ORD 3.2の場合 ORD-3.2-win.exe)
再掲

ご参考：ORD 3.2 for windows インストール画面
基本的に[次へ]を押してくだけです
73
再掲

rpmbuildでソースからパッケージをbuildする必要があります
• rpmbuildのインストール (インストール済みの場合は不要です)
• ソース rpmパッケージのダウンロード
– 以下のサイトからダウンロードできます
• rpmbuild準備
74
再掲
yum install rpm-build
mkdir -p rpmbuild/{BUILD,RPMS,SOURCES,SPECS,SRPMS}

• ダウンロードした src.rpmファイルを SRPMS に移動
• rpmbuildの実⾏
• rpm -i でパッケージを追加します
– 出来たパッケージは rpmbuild/RPMS/x86_64/ に安置されています
75
再掲
mv R-3.2.0-2.el7.src.rpm rpmbuild/SRPMS/
rpmbuild --ebuild rpmbuild/SRPMS/R-3.2.0-2.el7.src.rpm
※OSのパッケージのインストール状
況によっては texlive, lapack,
libtiff などの必要なパッケージのイ
ンストールが要求される場合があり
ますので、適宜対応して下さい。
※場合によっては LANG=C もお試
しくださいませ
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-core-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/libRmath-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/libRmath-devel-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/libRmath-static-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-debuginfo-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
rpm -i rpmbuild/RPMS/x86_64/R-devel-3.2.0-2.el7.x86_64.rpm
※versionによって差異
がある場合があります

• インストールを実施します
– 上記サイトのINSTALLに詳しい記載へのリンクがあります
• マニュアルは以下になります
その他の場合
76
再掲

• Intel MKLはIntelの数学演算⾼速化のライブラリになります
• ORDではMKLを動的リンクし利⽤することができます
※MKLはサポート無しの無償コミュニティライセンスがあります。
※サポートが必要な場合は別途ご購⼊ください
– Linuxの場合、LD_LIBRARY_PATHにMKLのライブラリを追加するだけです
– Windowsの場合 libOrdBlasLoader.dllおよびmkl_rt.dllの場所をPATHシステム環境に追加
– DBサーバ(Linux/Windows)ではMKLがORACLE_HOME/lib以下に同梱されています
• Sys.BlasLapack()関数で有効/無効が確認できます(ORD)
ご参考：Intel Math Kernel Library (MKL)の統合
ORDのMKL統合
77
R> Sys.BlasLapack()
$vendor
[1] "Intel Math Kernel Library (Intel MKL)"
$nthreads
[1] -1
R> Sys.BlasLapack()
$vendor
[1] "R internal BLAS and LAPACK"
$nthreads
[1] 1
有効無効

78
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

オープンソース版Rのインストール
Linux ( OEL, RHELなど)
• CRANからRのソースコードをダウンロードします
• ダウンロードしたファイルを解凍します
• 解凍してできたディレクトリ内で以下を実⾏します(linux/OEL)
79
https://cran.r-project.org/
こちらの記載はOREの構築に必要なR
のconfigureオプションを有効化すること
だけを目的としています.
オープンソースのRのビルド手法を保証
するものではありません
./configure --with-lapack --with-ICU=no --enable-R-shlib --prefix=/usr/local/R/323
make
make install
※環境によっては configureの際にパッケージが不⾜してエラーがでることがあります
yumなどで適宜追加してください (gfortran, libXxx-devel など)
例

80
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

基本的な作業はRのパッケージをインストールするだけです
• 対象パッケージをダウンロードします
• ダウンロードしたファイルを展開します
• Rパッケージとしてインストールを⾏います
ORE Client のインストール
概要
81

• 以下から対象パッケージをダウンロードします
– Client は必須になります
– Supporting は任意になります
• ダウンロードしたzipファイルを展開するとまたアーカイブが沢⼭で
きます。これがRのパッケージになります。
– windows版は zip のパッケージ群
– Linuxの場合にはtar.gzのパッケージ群
ダウンロードと展開
82
http://www.oracle.com/technetwork/database/database-technologies/r/r-enterprise/downloads/index.html

• Rパッケージたちをインストールします
– 残念ながら現時点ではスクリプトなどはついていません。
– R CMD INSTALL コマンドでインストールしていくことになります
• RStudioがある場合には RStudioの[Tools]から[Install Packages] でファイル指定で
もインストールできます
• ORE 1.5に関しては次⾴以降にコピペ⽤スクリプトも⽤意しました
Rパッケージのインストール
83
$ R CMD INSTALL <アーカイブ名＞

ご参考:ORE Client 1.5パッケージ(コピペ用)
ORE Client (Windows)
• Client
• Supporting
84
R CMD INSTALL OREbase_1.5.zip
R CMD INSTALL OREcommon_1.5.zip
R CMD INSTALL OREstats_1.5.zip
R CMD INSTALL OREgraphcs_1.5.zip
R CMD INSTALL OREeda_1.5.zip
R CMD INSTALL OREembed_1.5.zip
R CMD INSTALL ORExml_1.5.zip
R CMD INSTALL OREdm_1.5.zip
R CMD INSTALL OREmodels_1.5.zip
R CMD INSTALL OREpredict_1.5.zip
R CMD INSTALL ORE_1.5.zip
R CMD INSTALL ROracle_1.2-1.zip
R CMD INSTALL arules_1.1-9.zip
R CMD INSTALL Cairo_1.5-8.zip
R CMD INSTALL DBI_0.3.1.zip
R CMD INSTALL png_0.1-7.zip
R CMD INSTALL randomForest_4.6-10.zip
R CMD INSTALL statmod_1.4.21.zip

ご参考:ORE Client 1.5パッケージ(コピペ用)
ORE Client (Linux)
• Client
• Supporting
85
R CMD INSTALL OREbase_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREcommon_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREdm_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREeda_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREembed_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREgraphics_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREmodels_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREpredict_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL OREstats_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL ORExml_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL ORE_1.5_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL Cairo_1.5-8_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL DBI_0.3.1_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL ROracle_1.2-1_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL arules_1.1-9_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL png_0.1-7_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL randomForest_4.6-10_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz
R CMD INSTALL statmod_1.4.21_R_x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz

ご参考:ORE Client - Clientパッケージの中身
86
Package Name Description
ORE The top-level package for Oracle R Enterprise.
OREbase Corresponds to the open source R base package.
OREcommon Contains common low-level functionality for Oracle R Enterprise
OREdm Exposes Oracle Data Mining algorithms through R.
OREeda Contains functions for exploratory data analysis.
OREembed Supports embedded R
OREgraphics Corresponds to the open source R graphics package.
OREmodels Contains functions for advanced analytical modeling.
OREpredict Enables scoring data in Oracle Database using R models.
OREstats Corresponds to the open source R stats package.
ORExml Supports XML translation between R and Oracle Database.

ご参考:ORE Client - Supporting パッケージの中身
Package Name Description
arules
Provides the infrastructure for representing, manipulating, and analyzing transactional data and
patterns (frequent itemsets and association rules).
Cairo Supports graphic rendering on Oracle R Enterprise server.
DBI A database interface definition for communication between R and Oracle Database.
png Supports the reading and writing of PNG images for Oracle R Enterprise objects.
randomForest Provides classification and regression based on a forest of trees using random inputs.
ROracle Oracle Database interface for R-based OCI.
statmod
Provides statistical modeling functions, including growth curve comparisons, limiting dilution
analysis, mixed linear models, heteroscedastic regression, Tweedie family generalized linear models,
the inverse-Gaussian distribution and Gauss quadrature.
87

88
サーバ
構築の流れ
クライアント
構築の流れ
Oracle DB
Install
Oracle
インスタンス
作成
Oracle R
Distribution
Open R
build
server script
Oracle
DB Client
Oracle R
Distribution
Open R
build
ORE Client

ORE クライアントの確認
確認(Rコマンド)
• ore関連の関数が実⾏可能になります(RStudio起動でも可)
89
> R
Oracle Distribution of R version 3.2.0 (2012-06-22) -- "Full of Ingredients"
Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.
R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
You are using Oracle's distribution of R. Please contact
Oracle Support for any problems you encounter with this
distribution.
例

OREクライアントの確認
確認(ORE パッケージのロードと接続)
• OREパッケージがロードできます
• oreの基本関数で接続してみます
– OREサーバの環境に合わせてuser,sid,host,password,portなどは変えてください
もし接続できない場合は、何か設定が漏れたりしている可能性があります
90
> library(ORE)
Loading required package: OREembed
Loading required package: OREstats
Loading required package: MASS
Loading required package: OREgraphics
Loading required package: OREeda
Loading required package: OREmodels
Loading required package: OREdm
Loading required package: lattice
Loading required package: OREpredict
Loading required package: ORExml
例
> ore.connect(user="oreuser",sid="ora12c", host="shiva",password="oreuser",port=1521,all=TRUE)

Agenda
まとめ
91
http://putiya.com/

まとめ
まとめ
• OREのインストール・セットアップについて記載しました
• OREはサーバ・クライアント構成になります
– 構築作業はサーバ側、クライアント側で少し違う作業になります
• Rに関しては、ORDとOSS Rが選択可能です
– OSS Rの場合、少し⼿順が複雑になります
– ORDの場合、数学関数⾼速化ライブラリのリンクも楽です
• OREサーバはserverスクリプトによって簡単に構築できます
– デフォルトでは対話型での構築になります
92

Appendix:
OREの管理について
Oracle Data Mining との連携
Oracle R Advanced Analytics for Hadoop
94

全体感：コンポーネント
95
OS
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
DB
Client
OS
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle R
Distribution
Open R
(/w shared
lib,lapack..)※
Oracle R
Enterprise Server
Oracle R
Enterprise
supporting
Packages
Oracle
DB
/w
AA

構築後にある様々なこと
• Rの管理
– Rのアップグレード等のバージョン管理
– Rパッケージの管理(OS関連含む)
• OREの管理
– アップグレード等のバージョン管理
– 埋め込みRが利⽤するメモリの制御
• ORE DBの管理
– データ容量 (quotaなど)
– OREユーザの管理
96
※CRANのバージョンと導⼊済みRのバージョ
ンの差異への対処
※Rパッケージによって必要とされるOSパッ
ケージと他のアプリケーションとの兼ね合い
※OREのバージョンアップは serverスクリプ
トで実施
※埋め込みRで利⽤されるメモリ量などはパ
ラメータ設定で制限を
※OREユーザは表の作成、データのロード、
スクリプトの保持など⾃由にオブジェクトの
作成が可能
※重い処理を流してしまうことも有りえる
※リソースマネージャtとの連携も検討

• 埋め込み型実⾏の際に起動される外部プロシージャの設定情報は以
下のsys.rq_config 表から確認できます
• 埋め込み型実⾏の際に利⽤されるメモリー量などの制御ができます
– sys.rqconfigsetを使います
補足：埋め込み型実行
埋め込み型実行の設定
97
SQL> SELECT * FROM sys.rq_config;
キーワードデフォルト値説明
MIN_VSIZE 32M 最⼩のRベクター・ヒープ・メモリー
MAX_VSIZE 4G 最⼤のRベクター・ヒープ・メモリー
MIN_NSIZE 1M Rコンス・セルの最⼩値
MAX_NSIZE 20M Rコンス・セルの最⼤値
SQL> EXEC sys.rqconfigset('MIN_VSIZE', '20M');

Appendix:
98

機能アルゴリズム応⽤範囲
分類
Logistic Regression (GLM)
Decision Trees
Naïve Bayes
Support Vector Machines (SVM)
伝統的な統計テクニック
幅広い⽤途に利⽤可能
回帰
Linear Regression (GLM)
Support Vector Machine (SVM)
伝統的な統計テクニック
幅広い⽤途に利⽤可能
異常検出
（⾃動検知）
One Class SVM 不正検知や異常値の検出
属性重要度
Minimum Description Length (MDL)
Principal Components Analysis (PCA)
属性の絞り込み、ノイズの低減
相関ルール Apriori バスケット分析/ NBO(Next Best Offer)分析
クラスタリング
Hierarchical k-Means
Hierarchical O-Cluster
Expectation-Maximization Clustering (EM)
製品のグルーピング/ テキストマイニング
遺伝⼦-タンパク質分析
特徴抽出
Nonnegative Matrix Factorization (NMF)
Singular Value Decomposition (SVD)
テキスト分析 / 因⼦分析
In-Database Data Mining アルゴリズム
A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7
F1 F2 F3 F4

ORE 独自関数
ORE 1.5
• モデリング
• predict
packages 関数
OREmodels ore.glm
ore.lm
ore.neural
ore.stepwise
ore.randomForest
packages 関数
OREmodels ore.predict
Class of Model Description of Model
glm Generalized linear model
kmeans k-Means clustering model
lm Linear regression model
matrix
A matrix with no more than 1000 rows, for use in an hclust
hierarchical clustering model
multinom Multinomial log-linear model
nnet Neural network model
ore.model An Oracle R Enterprise model from the OREModels package
prcomp Principal components analysis on a matrix
princomp Principal components analysis on a numeric matrix
rpart Recursive partitioning and regression tree model
• ore.predict対応モデル

OREから呼び出せるDataMining関数
ORE 1.5
101
package ORE Function Oracle Data Mining Algorithm Oracle Data Mining Function
OREdm ore.odmAI Minimum Description Length
Attribute Importance for Classification
or Regression
ore.odmAssocRules Apriori Association Rules
ore.odmDT Decision Tree Classification
ore.odmGLM Generalized Linear Models Classification and Regression
ore.odmKMeans k-Means Clustering
ore.odmNB Naive Bayes Classification
ore.odmNMF Non-Negative Matrix Factorization Feature Extraction
ore.odmOC Orthogonal Partitioning Cluster (O-Cluster) Clustering
ore.odmSVM Support Vector Machines Classification and Regression

OREdmパッケージの利用例
Support Vector Machine アルゴリズムの例
x <- seq(0.1, 5, by = 0.02)
y <- log(x) + rnorm(x, sd = 0.2)
dat <-ore.push(data.frame(x=x, y=y))
# Regression
svm.mod <- ore.odmSVM(y~x,dat,"regression",
kernel.function="linear")
summary(svm.mod)
coef(svm.mod)
svm.res <-
predict(svm.mod,dat,supplemental.cols="x")
head(svm.res,6)
m <- mtcars
m$gear <- as.factor(m$gear)
m$cyl <- as.factor(m$cyl)
m$vs <- as.factor(m$vs)
m$ID <- 1:nrow(m)
MTCARS <- ore.push(m)
# Classification
svm.mod <- ore.odmSVM(gear ~ .-ID, MTCARS,"classification")
summary(svm.mod)
coef(svm.mod)
svm.res <- predict (svm.mod, MTCARS,"gear")
with(svm.res, table(gear,PREDICTION)) # generate confusion matrix
# Anomaly Detection
svm.mod <- ore.odmSVM(~ .-ID, MTCARS,"anomaly.detection")
summary(svm.mod)
svm.res <- predict (svm.mod, MTCARS, "ID")
head(svm.res)
table(svm.res$PREDICTION)

Appendix:
103

• RとHadoopを活用した分析のためのソフトウェア
• Oracle R Advanced Analytics for Hadoopで実現する機能
1. HDFS上のデータへのR言語からのアクセス
2. Hiveを利用したデータ処理をRから透過的に利用可能
3. RからOracle提供の関数を利用し、データマイニングを分散並列処理(MapReduce、
Sparkの開発不要)
• 回帰分析、クラスタリング、主因子分析、相関分析、協調フィルタリング・・・
• MapReduceやSparkの処理を書かずともHadoopの並列分散処理の性能を享受できる
4. MapReduceをR言語で記述
5. Oracle DatabaseとHadoopの間のデータの移動をRから指示
104

対応アルゴリズム
• MapReduceに変換されて実行
– 共分散および相関行列計算 (orch.cov,
orch.cor)
– 主因子分析 (orch.princomp, orch.predict)
– K-means クラスタリング (orch.kmeans,
orch.predict)
– 線形回帰 (orch.lm, orch.predict)
– 一般化線型モデル (orch.glm)
– 低ランク行列の因子分解(Low Rank Matrix
Factorization)を利用した行列補完ｰ協調フィ
ルタリングでの利用(orch.lmf)
– 非負行列因子分解ｰ特徴抽出で利用
(orch.nmf)
• Spark上の処理に変換されて実行
– ニューラル・ネットワーク (orch.neural)
– 一般化線型モデル (orch.glm2)
105
今後、Spark上のアルゴリズムを拡充予定

orch.neural Performance
• Number of obs 155671
Number of columns 46 columns
# hidden Elapsed time Elapsed time
neurons (sec) nnet (sec) orch.neural
10 934.176 44.181
20 1861.812 44.969
30 2634.434 35.196
40 3674.379 39.217
50 4400.551 49.527
• Hardware spec: Single BDA node
MemTotal: 48GB
CPUs: 24 (3058MHz each)
結果
• nnet
– hidden neuronの数にしたがって線型に実行時間
が延びる
• orch.neural
– 1.5GB以下のデータでは、インメモリのマルチスレッ
ド実装を自動的に呼び出す
– 大量データに関しては、 MapReduceを利用
0
2000
4000
6000
10 20 30 40 50
Seconds
Number of Hidden Layer Nodes
nnet
orch.neural

Architecture
Client Host (e.g., laptop)
R engine
orhc
Hadoop Cluster
Software
Java VM
Server Machine (e.g., Big Data Appliance)
R engine
orhc-drv package Java VM
DBMS Machine (e.g., Exadata)
R engine
ORE
libraries
Oracle Database
ORE packages
Hadoop Cluster
TaskTracker
…
TaskTracker
JobTracker
MapReduce
nodes
HDFS nodes
Datanode
Datanode
…
Namenode
ORE packages
ORE client packagesorhc
HadoopとOracle Databaseの間のデータの移動を
Rから指示
→ 計算量の必要な処理をHadoop側にオフロード
可能

既知の問題
• DBにゴミがたまります
• ore.disconnect()をすると消え
るかも。
– ただ、溜まってしまっているものはRから
は消せないかも。
– drop tableで直接なら消せます....
• DM$は、、モデルの残骸
dbms_data_mining.drop_model(ʼモデ
ル名')
– モデル名は user_mining_models
ビューで確認
SQL> select * from tab ;
TNAME TABTYPE CLUSTERID
------------------------------ ------- ----------
DM$PAORE$27_572 TABLE
DM$PAORE$27_623 TABLE
.....
DM$PMORE$39_44 TABLE
DM$PMORE$45_252 TABLE
HOGE TABLE
HOGE01 TABLE
ORE$20_23 TABLE
ORE$20_25 TABLE
...........
ORE$39_39 VIEW
.........
ORE$50_697_V VIEW
ORE$50_700 TABLE
.............
ORE$5_318 TABLE
ORE$5_331 TABLE

ore.randomForest
ランダムフォレスト
• ORE 1.5から Oracleの実装のランダムフォレストがあります
– ランダムフォレストは決定⽊を弱学習器に利⽤したアンサンブル学習器です
– オプションの ore.parallelによって並列実⾏されます
• 簡易検証結果(58列/約25000件)
– ⼀回実⾏しただけなので結構誤差あります
110
ore.parallel 時間(s)
randomForest ( Client上のRオブジェクト) N/A 95.20
randomForest ( ore.pull で取得) N/A 107.16
ore.randomForest (DB表) 1 104.12

Start with a Business Problem Statement
Clearly Define Problem
“If I had an hour to solve a problem I'd
spend 55 minutes thinking about the
problem and 5 minutes thinking about
solutions.”
― Albert Einstein

Be Specific in Problem Statement
Poorly Defined Better Data Mining Technique
Predict employees that leave •Based on past employees that voluntarily left:
• Create New Attribute EmplTurnover à O/1
Predict customers that churn •Based on past customers that have churned:
• Create New Attribute Churn à YES/NO
Target “best” customers •Recency, Frequency Monetary (RFM) Analysis
•Specific Dollar Amount over Time Window:
• Who has spent $500+ in most recent 18 months
How can I make more $$? •What helps me sell soft drinks & coffee?
Which customers are likely to buy? •How much is each customer likely to spend?
Who are my “best customers”? •What descriptive “rules” describe “best
customers”?
How can I combat fraud? •Which transactions are the most anomalous?
• Then roll-up to physician, claimant, employee, etc.

s
114
マーカー

Oracle R Enterprise のセットアップ

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