第11回 「データ解析のための統計 モデリング入門」読書会 
空間構造のある階層ベイズモデル 
11.1~11.3 
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@gepuro
自己紹介 
•@gepuro 
•電通大修士2年 
•専攻: 信頼性工学 
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•10章では個体差をモデルに組み込んだ 
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11.1 例題:一次元空間上の個体数分布 
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•全体が均質でない 
•近所どうしは似ている 
というモデルを考える。
まずは、ポアソン分布に従うと仮定 
11.2 階層ベイズモデルに空間構造を組み込む 
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過分散⇒単純なポアソン分布でない 
ポアソン分布に従うと仮定 
•ポアソン分布푝푦푗|휆= 휆 푦푗exp(−휆) 푦푗! 
–平均: 휆 
–分散: 휆 
•データでは、 
–平均: 10.9 
–分散: 27.4 
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過分散なモデルに対して 
•区画푗ごとに平均휆푗が異なる 
–と仮定する。 
•log휆푗=훽+푟푗 
–対数リンク関数を用いる 
•훽:切片, 大域的なパラメータ 
–無情報事前分布 
•푟푗:場所差 
–階層事前分布 
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なんらかの形で場所差を 
組み込んだ統計モデルが必要になる
「両隣と似ているかもしれない」 
⇒「各푟푗は独立」と仮定しないほうが良い。 
11.2.1 空間構造のない階層事前分布 
•푝푟푗|푠= 12휋푠2exp− 푟푗 22푠2 
–第10章で登場 
–場所差푟푗はどれも独立に同じ事前分 布 
–平均0、標準偏差s の正規分布 
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Intrinsic GaussianCARと呼ばれる 
11.2.2 空間構造のある階層事前分布 
•푝푟푗|휇푗,푠= 푛푗 2휋푠2exp− 푟푗−휇푗 22푠2/푛푗 
•平均휇푗= 푟푗−1+푟푗+12 
•標準偏差: 푠 푛푗 , 푛푗は近傍数 
•左右の両端푗=1,푗=50 
–휇1=푟2,휇50=푟49 
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ある区画はそれと接している区画とだけ 
相互作用すると仮定
同時分布の立て方が分からなかったので、 
教えてください。 
↓ 
一階差分を展開すれば、二階差分が出てきます。 
場所差풓풋={풓ퟏ,풓ퟐ,…,풓풋}全体 の事前分布である同時分布 
푝푟푗|푠∝exp12푠2 푗~푗′ 푟푗−푟푗 ′2 
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ある区画jと別の近傍な 区画푗′の組み合わせ
11.3 空間統計モデルをデータにあてはめる 
푝훽,푠,푟푗|푌∝푝푟푗|푠푝푠푝훽 푗 푝푦푗|휆푗 
푝푦푗|휆は平均휆푗=exp(훽+푟푗)のポアソン分布 
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事後分布 
事前分布 
尤度
空間相関のある場所差の 階層ベイズモデルの概要 
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stanを書いたことないので、 
写経しました。 13 
http://heartruptcy.blog.fc2.com/blog-entry-141.html
http://heartruptcy.blog.fc2.com/blog-entry-141.htmlより引用 
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空間相関を導入することにより、 
過分散の問題を解決することが 
できた 
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みどりぼん第11回 前半