株式会社ブリリアントサービス　飯田啓介

1. 第3回ゼロからはじめるＲ勉強会
Rスクリプトを実行してみる

2. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

3. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

4. 自己紹介
 名前
飯田 啓介
(twitter: menphis_feel)
(facebookの方に主に出現)
 会社
株式会社ブリリアントサービス
 業務
データ解析、マイニング

5. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

6. RはGUIで動かすことが多い
R StadioなどGUIを使うとき
 解析方法をいろいろ検討するとき
 コードを組むとき
 デバッグするとき

7. RはGUIで動かすことが多い
R StadioなどGUIを使うとき
 グラフを作成していくとき

8. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

9. 定期的に結果がほしくなる
解析手段や手順、出力結果が決まる解析手段や手順、出力結果が決まる
定期的に出力したい定期的に出力したい
スケジューリングしたいスケジューリングしたい

10. 定期的に結果がほしくなる
手段はいろいろあるだろう。
 シェルスクリプトを利用する。
 Pythonなどのスクリプトを利用する。
 Rをそのまま実行する。
開発環境に合わせて最適な手段を選択
すればいい。

11. 定期的に結果がほしくなる
手段はいろいろあるだろう。
 シェルスクリプトを利用する。
 Pythonなどのスクリプトを利用する。
 RRをそのまま実行する。をそのまま実行する。
あえてRをそのまま実行してみよう

12. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

13. スクリプトをコマンドで実行する
Rをコマンドで実行するには
$ R --help
Usage: R [options] [< infile] [> outfile]
or: R CMD command [arguments]
Start R, a system for statistical computation and graphics, with the
specified options, or invoke an R tool via the 'R CMD' interface.
Options:
-h, --help Print short help message and exit
--version Print version info and exit
--encoding=ENC Specify encoding to be used for stdin
--encoding ENC
RHOME Print path to R home directory and exit
--save Do save workspace at the end of the session

14. とにかく使ってみる
d<-read.csv("test.csv",col.names=c("Eng","Jap"))
s.eng<-d[order(d$Eng,na.last = TRUE, decreasing=TRUE),1]
png("test.png", bg="white", width=500, height=600)
str_main<-"Test"
str_main<-paste(str_main," ")
str_mtext<-paste("Total Value->", len_y)
hist(s.eng)
mtext(str_mtext)
# for option slave
if (dev.cur() == 1){
dev.off()
}
Rファイルサンプル

15. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

16. とにかく使ってみる
一番シンプルに使ってみる。
 R --option < input.R > out.txt
$ R --save < r_test.R > out.txt
$ cat out.txt
R version 2.15.3 (2013-03-01) -- "Security Blanket"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Rは、自由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です。
…
> # CSV読み込み
> d<-read.csv("test.csv",col.names=c("Eng","Jap"))
>
> s.eng<-d[order(d$Eng,na.last = TRUE, decreasing=TRUE),1]

17. 引数を使う
R --vanilla --args test.csv < r_test.R
読み込むファイル名を引数で指定する。
引数の取り込みコマンド：commandArgs
使い方例
args <- commandArgs(trailingOnly = T)
> help(commandArgs)
trailingOnly: logical. Should only arguments after ‘--args’ be returned?

18. Agenda
 自己紹介
 RはGUIで動かすことが多い
 定期的に結果がほしくなる
 スクリプトをコマンドで実行する
 とにかく使ってみる
 どうしてもPythonを使いたいなら

19. どうしてもPythonを使いたいなら
Pythonを使う理由
 グラフはmatplotlibを使いたい
 Rだけでスクリプトを実行したくない
 やりかたがわからない
 Pythonが好きだから

20. PythonでRを読み込む
さすがPython以下の２ステップで実行でき
る。
import rpy2.robjects as robjects
ret=robjects.r("""
source("r_test.R")
""")

21. ご清聴ありがとうございました
Ｒを共に勉強しましょ
う！